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transcript sequence >TCONS_00052751 ID=TCONS_00052751|Name=TCONS_00052751|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=637bp CTTGGCGAGTTAGTGAGACAGAGAAAACTCACTAGTAGTGCCCCCTATTA AGATACCATCCTAAAaattccgatcaaagatggcggatgtaTAGCTTAAT AGTCACTTTATAAAGATCAGTGATGCCATCACATTAAAAATCATTACCAA AGCTGCAGTCGACCCTCAATGTAGGGATTTTCACGTAAGAGtacaatatt taaattttttatgtttgatcgacttttctttgttttgatagcGCACACGA TAGGTTGAACAACTCTCCCTGTAAAATATGTTCGTCAATCAAACGATAAG TCTAGATTTCTCTGCTTTCAGCGAGTTTTCGTAACTGTTTTCCATGGGTA CTGAATTTTTTATTGGCGTCGAATCCAACGACGACGTTATCGATGAAGAA GATGACGTTGACGTCGATCCATAGTCGGTACTTTTCTCGTCATCatcaga aaattcaatttctttaaCAAAATATACAAGTGCTAGTACGACGAGAGAAA CAACAGACATGATAATATACGGAAAATGCGGATCGAAGGGGAATCCCAAA GGATCGGTGTTTTTGGTGATTCCTTTGATGTTGCGTAACGACCATGAGTA AATTGTCCCGTAAGCATATGGTGCAACAGCgctgaaa Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_22:36940..59348+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00052751 ID=TCONS_00052751|Name=TCONS_00052751|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=22409bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_22:36940..59348+ (Clytia hemisphaerica) CTTGGCGAGTTAGTGAGACAGAGAAAACTCACTAGTAGTGCCCCCTATTA
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TGTTGCGTAACGACCATGAGTAAATTGTCCCGTAAGCATATGGTGCAACA
GCgctgaaa
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00052751-exon-scaffold_22-1491911889:36940..37071 | TCONS_00052751-exon-scaffold_22-1491911889:36940..37071 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00052751-exon-scaffold_22-1510915933:36940..37071 | TCONS_00052751-exon-scaffold_22-1510915933:36940..37071 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00052751-exon-scaffold_22-1575043694:36940..37071 | TCONS_00052751-exon-scaffold_22-1575043694:36940..37071 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00052751-exon-scaffold_22-1491911889:58844..59348 | TCONS_00052751-exon-scaffold_22-1491911889:58844..59348 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00052751-exon-scaffold_22-1510915933:58844..59348 | TCONS_00052751-exon-scaffold_22-1510915933:58844..59348 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00052751-exon-scaffold_22-1575043694:58844..59348 | TCONS_00052751-exon-scaffold_22-1575043694:58844..59348 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_22 | supercontig | scaffold_22:36940..59348 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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