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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00052967 ID=TCONS_00052967|Name=TCONS_00052967|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=746bp TGGGGTAGTCGTTGTAGTTGTTGTAGTTGTcgtggtcgttgttgtggttg gagtggtcgttgttgtggtgggagtggtcgttgttgtggtgggagtggtc gttgttgtggttggagtggtcgttgttgtagttgttgttgttgtggttgg gatagtcgttgttgtggttggcgtggtcgttgttgtggtaggcgtggttg ttgttgtagttggcgtggtcgttgttgtggttggggtagtcgttgttgtg gttggggtagtcgttgttgtggttggcgtggtcgttgttgtggttGTAGT GGTTGGGGTAGTCGTTGTTGTGGTTGGCGTGGTGGTTGTTGTGGTAGGGG TGGTCGTTGATGTGGTtggagttgttgttgttgtggtgggAGTGGTGGTT GTTGTGGtcggggtggtcgttgttgtggttgggggggttgttgttgtggt tgtaGTAGTCGTTGTCGTGGTTGGGGTTGGGGTTGGAGTGGTTGCTATTA TTGTTGTAATAGTCGTTGGTGCATTTGGGCTGGTCGTAAATGAAGTTGTG CGTGTATCCAATGTCGTTTCGAGGTCTGCAGTTATAACCGCTTTTGATGG GGTTTTCCATAAGTAATAAATTCCTTGAACATAATTGCCCTACAATTGAC GGATGTtaattagattttaaaattctgAGTGTAGTCTTATTCGCATTGAG GGGGAGGGGGAGTTTTAAAATCTCTTGAAATAgaaatgttctaaac Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_222:302796..303913- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00052967 ID=TCONS_00052967|Name=TCONS_00052967|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1118bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_222:302796..303913- (Clytia hemisphaerica) TGGGGTAGTCGTTGTAGTTGTTGTAGTTGTCGTGGTCGTTGTTGTGGTTG
GAGTGGTCGTTGTTGTGGTGGGAGTGGTCGTTGTTGTGGTGGGAGTGGTC
GTTGTTGTGGTTGGAGTGGTCGTTGTTGTAGTTGGCGTGGTCGTTGTGGT
GGTGGGAGTGGTCGTTGTTGTAGTTGTTGTTGTGGTTGGGGTAGTCGTTG
TTGTGGTTGGCGTGGTCGTTGTTGTAGTTGTTGTTGTGGTTGGGGTAGTC
GTTGTTGTGGTTGGCGTGGTCGTTGTTGTAGTTGTTGTTGTGGTTGGGGT
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GTTGTTGTGGTAGGCGTGGTTGTTGTTGTAGTTGGCGTGGTCGTTGTTGT
AGTTGTTGTTGTGGTTGGGGTAGTCGTTGTTGTGGTTGGCGTGGTCGTTG
TTGTAGTTGTTGTTGTGGTTGGGATAGTCGTTGTTGTGGTTGGCGTGGTC
GTTGTTGTGGTAGGCGTGGTTGTTGTTGTAGTTGGCGTGGTCGTTGTTGT
GGTTGGGGTAGTCGTTGTTGTGGTTGGGGTAGTCGTTGTTGTGGTTGGCG
TGGTCGTTGTTGTGGTTGTAGTGGTTGGGGTAGTCGTTGTTGTGGTTGGC
GTGGTGGTTGTTGTGGTAGGGGTGGTCGTTGATGTGGTTGGAGTTGTTGT
TGTTGTGGTGGGAGTGGTGGTTGTTGTGGTCGGGGTGGTCGTTGTTGTGG
TTGGGGGGGTTGTTGTTGTGGTTGTAGTAGTCGTTGTCGTGGTTGGGGTT
GGGGTTGGAGTGGTTGCTATTATTGTTGTAATAGTCGTTGGTGCATTTGG
GCTGGTCGTAAATGAAGTTGTGCGTGTATCCAATGTCGTTTCGAGGTCTG
CAGTTATAACCGCTTTTGATGGGGTTTTCCATAAGTAATAAATTCCTTGA
ACATAATTGCCCTACAATTGACGGATGTTAATTAGATTTTAAAATTCTGA
GTGTAGTCTTATTCGCATTGAGGGGGAGGGGGAGTTTTAAAATCTCTTGA
AATAGAAATGTTCTAAAC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00052967-exon-scaffold_222-1575043694:303780..303913 | TCONS_00052967-exon-scaffold_222-1575043694:303780..303913 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00052967-exon-scaffold_222-1575043694:302796..303407 | TCONS_00052967-exon-scaffold_222-1575043694:302796..303407 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00052967-exon-scaffold_222-1510915933:303780..303913 | TCONS_00052967-exon-scaffold_222-1510915933:303780..303913 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00052967-exon-scaffold_222-1510915933:302796..303407 | TCONS_00052967-exon-scaffold_222-1510915933:302796..303407 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00052967-exon-scaffold_222-1491911889:303780..303913 | TCONS_00052967-exon-scaffold_222-1491911889:303780..303913 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00052967-exon-scaffold_222-1491911889:302796..303407 | TCONS_00052967-exon-scaffold_222-1491911889:302796..303407 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_222 | supercontig | scaffold_222:302796..303913 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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