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transcript sequence >TCONS_00054751 ID=TCONS_00054751|Name=TCONS_00054751|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4188bp TTGTGGAAGATGAAATGTTGACCATGTGAAAAAGATGAGGAAACATTCAA TGGGTTATGAATTGAATTGATCATCAAAGGACATCAAGGAAGTTATCAAC TTACAACACTGGTAAAGTTTCGTAATTCGCGTGCCTTGCATCTCAAGTAT GATATCCTAGTCTCATCAGACCCTCATCATTGATACTTTGGGATATGAGA TATGAACAATATGTAATGACGGTAGTTTTATTTTAGTTGGATGAATGATC TACTGGCAGGTAATGGGTCGGTAAGAACGGAGTAGGGAGGAGAAAAACGA ATCAGTTTGACAAGAAAGATAGCAAAGAgttatttgtttacattttaatg taaaagaACAGGAGTTAATCATGCAGTACTTAAGCTTTCCGTTTGCTCTT AATTAAGATCAATTCTTCTTGTTATATTTTTCGGTGATGACGTGATGAAG TTCGAATGATTTATGATATCATGatagaagatttttttttttgcattaga TGCTATTCTGGTATTAATCCAACTGAATGATAATCATTTACAATTTTCCT CCAAGTTACATAATAAGATCTTTTTTAGAGCATTATATTTTTGATACTGT ATCTTTTAAGAAAGCTTAACACTTTATTAAGATCAGCAAGAAGTTTAAAA AGGGTTTGGGTTTTCCTTTGTAAGCGGTTTATGGTTTTTCTCGTCCAACA CAGTTGGAAGTATAGTAACCTCACGAAAGAGTTTTATCTGTAgtgttttg aaaaactttggtgTGGCAATTGTGCGGGGGTGAAATACTTCGTAAGCATT GAAATCAGTTTAATTCGTTTTGATTAATAAACATACCGCTGAGTTTGGAA ATGAATACAGAGCCACTTCAAAATACTGTGACAGTCCAGACTTCGGTTAG CCTTGTGTATCATTTAATCCACTTACTTCAGGCGCCTTTGCTACCCCATT GCTATGAAAATCTTGGACAGAAAGATCAAAAACGAAAGCCACAACTCCCC AGTTCACAGTTGACTAATAATATAGAGAGTGGTAAAAACCACTGAAAAGC TATTTTGGTTATTTGACAAGGGCTCACAAGCTACTGGAAAATTTTTGCAG CGATTCTCTTATCTCGATTGAATTTCGTAACATTTTTGAATTAGCTAATT TCGTTATCCCGGCATTTAATTTTAAATGACTACTTTTACGCGAGAAATGT GAATTTTTCATGAAGGAAGGCTAGTAATTGCTTTGAAATGGTAATTGTTT CGAATAGCAGCTGGGGTACGAAGTATGGGTGTTACAAAATTGGATAGTAT GTTGCGAAATACATTTGGAGGTTGAAAGGCGAGGGTCGAATGTTACTTTT TTCTCTATAATTATTTCAACATTGGAGGATATTGACATCTTCTTGGTAAA ATTTCGATTAGCATTTCTGACTTTTAAGCGAGTAAATTTCCGTACAAGGG GACGATGACATTGCACTGGTTTCCTGGTCATTTCTGACAGCGGAACACGT CAATGAAGCGAGGTATTGTTTCAAATCTATTGTCTCATTAATGATGTAAG ATAAAAGATCGTTTGAAAACAATAGTAGCATCATTTCTATTGTCTGTTTA AATAAATTGGATTCTGTAATTAAGTGGTATGGTTACAATCTTCTTTCTTG TTAAATGTCAGAGCATTTTCGGGAAGAGATCTAATCTAGACATGATTCAT AGAAACTGTTTACTGTGGGAATTTTGAAATGCTCTCTTTAGAATTTGAAT TTCGTTACAAAAATGATGAGCTTATTAATTGGTTCGATCTTTCATGAAAA CTGTTTTATAGGTGGTACAAGAAAAGTTGGCTTGGTTTTATTCTTTTTCG TTTTCATCGAAAGAAGTCGTTACATTTGATGTTCTGctataatttattta ttacGCAAAGATAGGAAACGTTTTATAAACGGGTTGTTGTTTCGTAAGCA AAGAAGTATACATCGTCCGATGTCGACGACGAACATTGATCATTGATTAC TATTTTATTGGACTGTTTTTTACCGGTGTTGtctcataaaaaatgacgtt gCGTCGAATCAGCCGTCATGAATCGCTCTTTTATTATAAAGTCTTTCAGA ATAAGAGAATGTATCGTTGAGTTCGGTTGACATTTTCAATGTTATATTGG TGTGAGTTTTTTTGGTTTAACAAAGTATGACATTTTGTTGAGTTCCATAT GTTTTCTTTTGGAAGCTGAAGAATGTAGAAGCAAATGAAATACGAGTATT TTTTCCTGATCAGAATTTAAGTTGAAGGATTCCCTTTACTTTATGATAGA ACCGTACCTCATGGAGTCTATAAAAAGCCTTCATTCGGGAAATATTATTG GGATTTTATTGACTTTGTTTCCCTTAAAGATCTCATTTCAAAAAGAAAGC TCTCCCTTAGATACCGAACACCTTAGAGAGGGTTTGAAGTCCAATCAACA TTTTTGTGGTTTTCTCCCCTTTTCTTTTTCCTCCAATCTTGAAATTTTAT ATTGCATCCTTGGAAAGTAAACAAACCGATGCTTGAAAACTCTTGGAATT CATAGACAGTGATTTCTGACCTGAAGGATCTTGCTTTTGCTTTCATGTTG TAAGTTATCTTAGAGTATTATCAATCACACTAAAATGCCAGTAAGGTTAT GTAGAGAGTGGTTGTCTCCTGCAGACAAGTGAACAAACGAGACTGAACAG AGAACATTGAAATTCTTCCATTTGCTTAGCTTAACCTTTAGGTGACTTTT AAACCCAACTTAACAGTTTTGATCAGATTTTAATCCTTGTACTATAGACA GTATGATCAAAAATAAAGAGAAGAATACAATAGAGAGAATCGTTTTAATA CTGTGGTGATCGTTTTAAATTGGCAAGTCATAATTTACGCCGGAGACTTC TTCAAATGTAAGTCCAGCTAATTTGATTAGTAATGAAATTACTTGAGCAT CCtatttcaaatcaaatcaacttttattcaatttccatcctctttttctt gttttagaTTCGTTGGCGGCAATTCGGATGTTGGTTTATTTGGTATATAG ATGGTGGGCCTGATATTTAAATTCTTTCGTTAAGCCTGTGAAGTCCAGTT GTTAAGTCTGACTTCTGTTCACTTGAGAGACACATCATCCAAATGTTTGC tgctgatgatgatgatgatgatgatgaaagtttataaaaaaagaaaaaag tttagtCCAATAATCAATAGATACCTTGTCTAAGAAAAGTTCTCTGCAAA GAGAAACGCCTGTCAAAAATTACATGAGATTTAGCACGGAGCTTATCAGT TCTTAAAGCCTGTTTTAAGCTGTCTTAGAGAAACAATGGTCTATGAAACA GAGGCTTGAACATTTTGTGTTGGTgtcaaattattaaaattttcattatt gttTCTAGTTTTAGAGAATGGTTTCGGTTGAATAAGAGATGAAGCACTGG GTGCTTGGAGACACGATTCTATGACGCACAGTCTTCGTGAACACAGCTCG CTGTTTTAGATCACAGCGATCATAGTGGgataatttttcactttttttta tttgagcccaaaattttaatttttttaaaaaatgatgattcATCTTGCTA TCGATTCGAGTTcggttgaattttttttttttttttgagaaaaatattgt tttggaATATTTGAACAAAAACATATTGGTACATACGGGAAGTCGTTGAA ACTGTTAAATTCCCTTGTTTGACGGAAATTAGGGGTTACATTTAATACCA ATCAATCGTGCTCACTGGCTCGTCCTATCATCATttcaaagagaagaaaa aaattctttttggatGGCTCCTTTTGTTATGAAGTGTCTCTCTTGACAGG GTGTATCCTTTTTTTCATACGAATGGTATACTTAATAGATAGTATGTTTA TTTGAATAACATGAACTTTTATACTACGTATCCTGAACGGGGTTCTGGAA GGTGTTCTGTTATATTATGATAACTGTAAACCCTTCActatattttttgt tgttttttctaacAAAGTGTTTGACACTCAAACTTCCATTGTTTCGAACA TTGCAGTGACGTCTAACATAAATAGTTCAGATAAACTTTAGAAGGTTTAT ATCTTGTGGCTTTTACAATCAGTCACTACATAATCGATTTGTTGGAATGG TTAGAATGTTTTTAATGACGGTTATACGACGAACAAAT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_245:65770..75946+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00054751 ID=TCONS_00054751|Name=TCONS_00054751|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10177bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_245:65770..75946+ (Clytia hemisphaerica) TTGTGGAAGATGAAATGTTGACCATGTGAAAAAGATGAGGAAACATTCAA
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TTTACAATCAGTCACTACATAATCGATTTGTTGGAATGGTTAGAATGTTT
TTAATGACGGTTATACGACGAACAAAT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00054751-exon-scaffold_245-1491911889:65770..65828 | TCONS_00054751-exon-scaffold_245-1491911889:65770..65828 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00054751-exon-scaffold_245-1575043694:65770..65828 | TCONS_00054751-exon-scaffold_245-1575043694:65770..65828 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00054751-exon-scaffold_245-1491911889:71447..71538 | TCONS_00054751-exon-scaffold_245-1491911889:71447..71538 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00054751-exon-scaffold_245-1510915933:71447..71538 | TCONS_00054751-exon-scaffold_245-1510915933:71447..71538 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00054751-exon-scaffold_245-1575043694:71447..71538 | TCONS_00054751-exon-scaffold_245-1575043694:71447..71538 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00054751-exon-scaffold_245-1491911889:71910..75946 | TCONS_00054751-exon-scaffold_245-1491911889:71910..75946 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00054751-exon-scaffold_245-1510915933:71910..75946 | TCONS_00054751-exon-scaffold_245-1510915933:71910..75946 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00054751-exon-scaffold_245-1575043694:71910..75946 | TCONS_00054751-exon-scaffold_245-1575043694:71910..75946 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_245 | supercontig | scaffold_245:65770..75946 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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