TCONS_00056862 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00056862
Unique NameTCONS_00056862
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length4033

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00056862 ID=TCONS_00056862|Name=TCONS_00056862|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4033bp
ATGGAAGATATGAGAAATTTGAACTTGAATTTGGAGTTggtattacaccc
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_284:394904..409474+

Legend: exon
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>TCONS_00056862 ID=TCONS_00056862|Name=TCONS_00056862|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14571bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_284:394904..409474+ (Clytia hemisphaerica)
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TAGTAAAAAAGACTCGTTATTAGCTCCAGCTGCTTATACTAATATTCGTA
AATCGGTAAGCACGCTCGCTTTAAGCACACCTTCGAGTCCGAAATCGCCG
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CAANGCCCGAAAGTACGTCGCCGACAAGTCTCACTATTCGTCGGAACTCC
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TAATTGTTTATCTTCTATCGAATATTACTCTTCAAGTAAAATTATGTGCA
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GGGGGTATGTCATCTTCCAAAGTGATGTTTGAATTTCTTGAACAGAAAAT
GGAGAAACAAAACGAAACAAATAATAATACAGGTAGGTATTTCTCTCAGC
CCCATGTATTGcttttatctttttaatttcaatacAGTACCGTAGTTACC
GTTAACAATCTAAAAGTCCTCTCAGCAATCATGTCAATccgattgattga
ttgaaatctCAGAATTATGATGTAATTGAaccaaatcaaccaatcaatgg
CGTAGAAAGCTTTTGATTGTTGAGTGGACTATTAATGATAAGTACGGTAG
AGCTTTTCCCCAAAAAGCACCCAAAGGGAGGGTTAGACCATgctcagacg
ttacggttccgttccgaaacgaaacggttccgaaacaagtgtgaacgtca
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TTTTCAAAGGAATGGCTCTAAAGATTTTTGAACAATATCTTGTGATAACA
TGCCGTTAAAATTGTTATCAtcaacattttttatttctgagaGTAAAATC
TTGggtaaataatgtttttaccCTCAATAATATTGTATTGTTTTAATACA
ATAGTTAATAGAACGTTAAAATTTGGTTGGGATGAGTTAGGATATGAATT
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TGACCATGTTTTTACTTCTTCAGACTCTGGTCGATCCTCAGGAGCATCTG
CAAGTGACGAAAGTCGAGACAAAGATGAACTTATTGAGAATTTAAAGAAC
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cttaattttgcatttgactcccgtaacaagcaagtaactttggcgcggca
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TGctactacacaatagatttgataactgaaaattcattattttcgaaaaa
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tacggtatttgacccaaaattttgtcggtatgacggtatttaagacccct
gaaccCCCCCCTATATAGGAATATATGAGACatcgatggctaaaatatta
ataagttaaaaaaatgttaagaccTTGTGGGCTCTAGAACattcgatttc
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AGGGATCGGAAATATAAATTCGGGTTGGGATAAAAATGGAAAAGATTGAG
CTTTGACGTTATAAGGACGGGCGtaaaaagatcttgtaaatatacaattt
tctaattatttttactttttcaggtCTTCGACATGACAACCAAGAGTTAC
GAGAGTATATCGACAAATTAGTTGTTTATTTAATGGACAAATATCCTGGA
GCACTGGAATCTAGTAAAATGTATCGGTGATTGGTTGAAATTGTAGTtat
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CATttatgtcatgaatatcatgaataaatatAAATTTCCCAAAAGCCTAT
TACATTGGAGCTGGAGTGGACACTGTGGGTTTGCTTGCGATGAAACTATC
TTgttattttattgtttattgGTTAGCAGAACTGTATCCCTTGATCACAG
TATCTGGTCACTGTATCTGATTtgccttaaaggttttatttttacatgag
tGTTTCCgattcatatcagacacatatctcatatcaggacagtgtcttgc
tattgttatactatgctgatataagcaaaaaatgtttttcttttcctctt
tctgaggAAATTCTttccaatcttgctccacatccgtgtcaatccaatgt
gaaaaaagcttgtgaattaaaattgatgagtaagcaaacgatatcactct
tattaaaaAGTAGCTCTTTTTGTGGGGTTTGATATCAAGGGGTCTTTCTA
CTGGTCAATTTGCAAAGGGGAGATTTTAGGAGCTATTCCATAAAAAATAA
TTACCCTTCGTATTGAGGATTGTCAAAAACATTTTCGGAATTCAGTAAAA
AAGCAACTGAGtcatcaaaagatgaaaaaatttcaattctaTAAAGGCTT
ACAATAATATTATATAAGAGTTCCTATAGTGGTTGGATATTGCAAATCGa
tctgacaatatattgtggacaccttttcaataacAGTTCGAGAAATTGTA
TAGATTCGCAACGTTGCAACATTCCGAAACGTTTTTTCGCAACGCTTCAC
TCAGCACGCGCTTCTTTTTTTCGCAACGTTCCCAATGGAAGTGTGCGATT
ATGAACACCAACTATGACGACCAATTTTCGCAAATAGAAGCAAAATTAGG
CAAAATCTGGCATATTTTAGCAAAGTAGCGTTTCTTCCAAGAATGATAAT
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tgaGTAGTTCTTCAAAATGCACATTATTTTGTGACCTCGGTCCAAGCCCT
GCGATGCTGCTTTTGGTTCATAGGCCAGGGCTGCGAGATTATGCATCGGT
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Ggtattgaatatattttccggggggtagtgaaaaactgctctgtttaggg
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ATTATTTTTACGATAAATTGACAAAGACAATTTTTGACgattcaatttta
atttgccTTTCATTAAGTAACTGACTCTGGATGTACAGACAAAAAAGACC
CTCCCCCAGAGGATCTGAAAT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_035821XLOC_035821Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_284supercontigscaffold_284:394904..409474 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.40375	0.128284	4.58155	2.56306	3.13449	0.279051	13.1565	7.19872	1.55932e-08	3.04934e-06	6.22067	0.297982	2.82288	5.52266	0.0134984	3.87774e-07	1.19097	0.288636	0.000543171	0.100964	9.55863e-08	0.0204612	0.514066	2.50013e-05	5.06723	9.84844	1.84756	6.29547	2.16421	0.304562
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00056862 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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