TCONS_00058187 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00058187
Unique NameTCONS_00058187
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length469

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00058187 ID=TCONS_00058187|Name=TCONS_00058187|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=469bp
GGAGTGTCTTTCTTGATTCCTTATTAGTTATGAATTGAGAAAATATATTG
CAATCAGTTGAAATTTTAAATATCGTAAAAATTGGAAACAGAGCAAGTCA
TCCAGTAGAAGAGAATGTCGGTTTAGAAAAAGAGATAGCATCTCTGGCAA
GCCATCCAAAGACATCCACATCGGCCATGGCATCATCTGAGCATCAATGC
TTGGAAAGTGGCAAACTATTGCCGAAGCACCTCCAAAAAGAGGACAATGA
AAATGTAGCCTCTTTGAAGGCTATTGTTCCTTCACCGACCGAAAGAGTAC
AGGAGACTGTTACCGAAACAGTTCAGGATACTGTTACTGATCCGGTTGAA
GTGAACCAAGAAGTGTATCTAGAAGATCCACCACGACCCGATATTGAGGG
ACTTGATGATGAAGAATATTCTCCAATTATCAATGTGTCATCCATCCTTA
AATTTATGATGTTTTGGAT
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_308:44526..58529+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00058187 ID=TCONS_00058187|Name=TCONS_00058187|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14004bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_308:44526..58529+ (Clytia hemisphaerica)
GGAGTGTCTTTCTTGATTCCTTATTAGTTATGAATTGAGAAAATATATTG
CAATCAGTTGAAATTTTAAATATCGTAAAAATTGGAAACAGAGCAAGTCA
TCCAGTAGAAGAGGTGAGtgttacttttcttttttcgtATGATAGATTAT
CATTAGATCTCCGTTATAAACTTGATGTTAGAGTGGTCAGCTGCCTCATC
CCACGAAGAATTATTCTAGGATAAGACATCAGACACTATTGAGCATCTAT
TACCATCCTGGGGGGGGAGGGGCactaattttctcagtttttctttgaaa
cagaaaatttcccaagcttcttttttcacgcagatttacaagctgaaaaa
tatagtgcactataagtaTTAGGTAAATCATGAGAAAATGCCCtgtcagg
gtaccttttcagcagATTTTGCGTGGCACGTACCGTCGTTttgaaatcga
gtgcccccccccccccccaNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNcccccccccccccgtattACCGTTCTCCATGGGAA
CAAGGCAGGTCGGCGGAGCTCAAAATTCTTGCAACGatacaaatcatttt
cacacGCTCATTTTAGGCTCAATAGAAGCGTATAACTAATtagaataaga
ttcagtctCGGCAGATGttttttaatttagaaattttgcgtaattcacaa
aaatcctcaattttgcgctattttgatgacgtcataaaaattgaaattcc
aataacttttgatagaatcataaaaataatttcaaattttcaccaaagat
gcatttcaatgcaaattttgaaaataattcaaaaatttttaaaatcttga
tgacgtcagcatttttcgaagatttcagTTTTTTGGCAGAAAAGTGacga
cgtcatcaaatttcaataaaatttttttctctgaaaacattaataatatg
catctttggtcaaaatttgaaattattttgatgaaagctCGTTCATGATA
AAATTTTCTAGACCACATTTGTTAAATCAAACTAAGTCTTAAAGGGaata
gcgctatacttatagtaggggtcggagttgctggtagttccatggtatac
tctgaaatatatgctgatgtcagcccgaaagctgattggcttaaccgACA
GTTTTACGTGGTTTGAGAGtatagctaaaactttgttatgttttcaacag
taaacgaaagtgaatgaagacaaaatgtaaacaaaaagattgcaaagaag
ttttcgAATAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNtttggtttttgttatgatccagcactcctaaatactcctccgtat
gggtgtttgtgccaatgctagatcagcatttcataaatataccatgcgtc
gttccctttaaGACCCTAGCACCTTATATCTATTATGTGGATCATTTTCT
TGTTACTTTTGACAATGAAAGTCTAAATGACATTGGTTtgggaaaattgc
aaaattatttcataaattGTATTGCTCAGATATTTTCGAATATTTCAAGT
CCGGCTCTCCGCCGTATAAAGACCGCTACCCAcgcagcattttatggtcg
gtgAATAAGGTGCACGGCGCTTAATTATTGCATGAAATACATAAATTAAT
AAGCCTTCAAAGGCTGTTGCTTTGAGCGcaacaagagttgaaacttttgA
CCACGAGCTTTACTAATTTCCAGTTTTTCAAATTTGCCTATACGCAAAAt
cgtaaattaaaaaaaaatattgcggGTTTTTATTTTTGGTAACGATCAGA
CATTGATTTAACACCCTCCTAAATacgaaattaaatttcaaatttttttt
tttcgaattttttgaatttgtcatCATTTTTGGAAACTTTATAGTTTTTC
ACTGGTAAAGGTCTAACTTGAGAATCTTGAGTAGACGCTATACAAATATC
GGATTTTTTCGGAATCAGTTATTTACTGCAATGAAAAAACTGGATTATTT
CTGCGCCGATTTGCACACCTTTCTTTTCATTAGAGTGACTTAATCTATGa
gctggatgtgcttatttttttgtgaaaactttgagcgtaaaatgttctta
ttgtttttattgatttaaatatatagagcagtgagCTTTGGTTATAAAAA
TTGGTCCCGGACAAGTCGAGCAAACCTGCTCTATTTTAAAGTTGGGAAAT
AAGAGAATTACAGCAATTACAAAATTGTGAATACAGATGAATACAgcata
ttttgaaaatctctttagtttCCAGGCTGGTCATGTTCTTGCAATGTTCT
TATTTACTTTTCCTAAGCCTAAATGTTTGTATGAACTGAGTTCTGATATT
CATATCTGTGTCAGATAATTCCAAAACTGAAGCAAGAAAGAAAAACCAAC
GATCGAAACAGTTTACGTCAGAGCAATCTTTatactaaaaaaataatttt
gacgtcaaattatttttagttcaaTTCAGTTACcagaaaacttttttcac
aatcggaaaaaaataaagatatagtAGAAGTAAGTTTGTTCTTGATTCGT
CTTGGATATGAGTTGAGAAGTATATTGCAATCAGTTGAAAGTTTAtataa
agaaaatagaaaacgaCAAAAGTCTCTCAGCAGGGAAGGTAAGTTGGAGT
TTATTCGATCtgaacaccccttctcacagacccagtaggatttaTAGACT
TTTCAGTAGCTACCTCTTTTTAATTTATCAGAACTAGCTAAAGACCTTTC
GCAGATTGTGAGATATCAAATTCGACGCATTTCACAGGATGGTTTGTTGC
GGGATTGCTGTCTCTGTACTGGTGAAAAGCGTCAAATGCGATATCTCAAA
ATCtgtgagagcgactgtatttaAGAGAACATGAGTATCCAAAGATCCGG
TATTGACCGTATTGGACAGAGAAATGACCGGTTTTCCGGTATTTTGTACT
CTGGGAATCTCGTTCATATTAATTTGAGATTTACGCAATTGGTAATCAAT
ACCTGATATTACGTGACCTAAGGCCGTGATAGTTTTCTAAAATGCTTTAA
GAGATTTTTATTTAGAAGGCAAAATATcttaactcaaaattttaggtAAT
ACTTTTTAAGCCCACTAGTTCGATTGATATGAAACTTTaaagttaaaatt
cactttttagaaagtatgaaaaataagctaaaaataaaaaggggtataaa
ccctttaagtgccaatgtcgagtatactagacatgggttatataggaggg
cgaagccctcccgACCTCCTGTGATGGCCAGTTTGAGTTAAAAATCGTCa
cttttggtctaactcgtaggaatgcTGTGGCACTGAAAGGGTTAAATTAG
TAAAAAAGGGtaaaccctattcggcctaggggggggggctgtttctgttc
ggaggtcaaattattggtaatagctcctgaaataatagagctttttccat
gaaattttctgtaaattcctatcttttatttagcttcaaaataaaaaaaa
aatttactcctAAAAAATTTCACACCTTGAggatgatgacatttctgaca
gtaggttgtcataaaaattgatacttttccaatacaaatttataatttat
gtcaaatatatcgtttaaaccgtaatttatggaatatttaggataaaata
aggcTTTTAAACTcgggcaacttttttctaaagcctttgttagaatacaa
tagctatttataagaacaaaggaaatttttgctcactttgggcatggtga
atgacgtcatcaaagaaattgtttgtcaaaagttaccttgtttgacaaag
atcttgtgtgccaattttcatccaaaaagacccactagatcaaaagttaa
ggggtggtacaggaaaagccccccccccccccgggNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNAGTAACGTTTAACCATAAAACAATATAACACGACT
TCAATATAAATAACTCCAACAATGAAACCATAAAACAAACAATGTACAAT
TTCACTTGTATAATTCCAAGCTCCTCCACAGCTATTATTTAGTTAGTTTA
TTGATAGTCTAAAGGTAAAAGTATcataggttgaatagggttaaataaat
aaaaaagggcTATTACATTAGTAAAAAAGAAGTATTAAATTAGACATTAT
TTTTTAAGACATAAACCTCTTGagagaattatcaaaaactaaTGACCagc
ttttaaaattcaaaaattgttctAAAGTTAATATTCTCAGGGGCCTAATA
AACGAAGGAGGGGTTCGAATAATCTCCAAATGTTAATAAATTGGGAAGGG
GACTTGATTTCCCAAGGGGTTGGGAATTGTCCTTCTAAacaaccccaaaa
taaggtaattatatAGACCAGTCTTCATATTATAGAGAAAAAATAAAGGG
ACTTTTCTTTTGACAGCTGAATAtaggggggtttcaggggtcttaaatac
cgtcataccgacaaaatttgggtcaaataccgtaataccgtcgataAAGG
AAGTCTAATTACCTaattaccgataccggtagaaaattaaataccgtaat
cccgtcatttttttctggtaataccgatttaccgggggaaaaaaggccca
atactgtcgtaccgtaaaagtgaaaaaaaaaacccaatATATGGGGGCGT
TTATTATGCACATAACACTAAGACTGTGCGGATTCCGTAAATCCTCAATA
TAAAGAGCTGCTCTAATAAAGTTAGTTAGTAAAAAATCTTCATCCtagat
taaattttttattttcaaattttaatcagTTTAGAGGTTTTAATTTTACG
TAAGTGTACATTTGTtacatatcagacacatatttcatatcagaacagtg
tctgtctattgtgatattatgcttatataaacaaaaaaaatttttctttt
cctttttctgactaatcttgattcacatccgtgtcaatccaatgtgaaaa
agcttgtgaattaaaagtgatgaataagcaaacgatatcactcttattta
aaagcaaatttttaaatttaataaaatctaTTACTtctcttaaaaaaata
aattaaaaaaaaataaatttaaaagcaaaacctttGAGAACTGTATGCAA
ATGAATTTATGATCCAACTTTGATGAACTATCAATCtctatcaaaaataa
aagtcaCGTCTCAACCTTTTTTACTGTGTAGTATCAGCTTTTTGATAGTT
ACTGATAGCGCCATAAATTCAGCAATATAagtaaagcctgggatacactg
GGACGAGGTTGGGTCATTTATACGATGATTTAAAAGTCACAAGTTCAGAA
cgtcaaattattttcttttaaaatatatttgacgtcaacttttACAACca
tgaaaaagtggaattccaAAAGTTTAAACTTAGTTTAGAATGTTCTATTT
ATTCTGAAGACGTTGCTTGGAAAAGAAAATCGTAATTGCGAATAAATAGA
ATATATTATATAGTGTAACTTTTGCGTAAAACATAACAGTGCTGGCAGGT
TTCTCTTATGGAACAGGTATGGTGGTTTCCTTAGAAACATTTGATCAATT
TGTATAAGTTTCTTCTGTCTGTACATATTTTATTCGAGAAAAATGAGCAG
CTACATTCATATTCTACCAAAGAAACGCAAGTTGTATCCAATTACCTTTA
TTTAGAAAAAGTCCATAACATCATAATATTATCCTCAATTTCGCATCTGC
TTATTTTTCAGACTTGCTCGCACAAAATGTCGACAGAGTCAGTAAAGGAA
TTTACTGACCGAACCATTGCCGAGGTAAGATTTTTGATTATCAGATATCA
TTTCTTTCGTGTTTTAACTAAGTTTATTACTGAGGTTTATGTAGTGAGTG
CAcagtaaaatcttaaaatagaTACTgtatacattttttataagaacaaa
ctataaaagaacataaggcttcgatggccaaaatgttaagaacaagctat
aaacattttaaggcttcgcggactcgaaaacagcctatttcttaggaaaa
tggacaaaaatacataaaaatggggaaaataagaacatgttaagaacatt
tttaggcttgaaagtGAAAAAGCTAAGGACATCCGAAGatatcaaaatta
tcaaaaacgtGTACATCATTTGACTACTTTTTGTCCTCCTGGAACATCTT
GATGTAGAGATGGAAAGATATGGGTTGTtaaagttttctgcagttttccA
CGGTTCCGCGATTGTGAAGAAAACACCTCCTTACCGACGAAATAACTGAG
AGGGTCTCTTTGGGTCTATAAGTTTCATTTAATTATTTTCCTTATCTTGA
ATATGTTTTAAACAaaaccaaaatccaaatttactTTTCAACCATTAGAA
TGTCGGTTTAGAAAAAGAGATAGCATCTCTGGCAAGCCATCCAAAGACAT
CCACATCGGCCATGGCATCATCTGAGCATCAATGCTTGGAAAGTGGCAAA
CTATTGCCGAAGCACCTCCAAAAAGAGGACAATGAAAATGTAGCCTCTTT
GAAGGCTATTGTTCCTTCACCGACCGAAAGAGTACAGGAGACTGTTACCG
AAACAGTTCAGGATACTGTTACTGATCCGGTTGAAGTGAACCAAGAAGTG
TATCTAGAAGATCCACCACGACCCGATATTGAGGGACTTGATGATGAAGA
ATATTCTCCAATTATCAATGTGTCATCCATCCTTAAATTTATGATGTTTT
GGAT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_036667XLOC_036667Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00058187-exon-scaffold_308-1491911889:44526..44638TCONS_00058187-exon-scaffold_308-1491911889:44526..44638Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00058187-exon-scaffold_308-1510915933:44526..44638TCONS_00058187-exon-scaffold_308-1510915933:44526..44638Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00058187-exon-scaffold_308-1575043694:44526..44638TCONS_00058187-exon-scaffold_308-1575043694:44526..44638Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00058187-exon-scaffold_308-1491911889:58174..58529TCONS_00058187-exon-scaffold_308-1491911889:58174..58529Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00058187-exon-scaffold_308-1510915933:58174..58529TCONS_00058187-exon-scaffold_308-1510915933:58174..58529Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00058187-exon-scaffold_308-1575043694:58174..58529TCONS_00058187-exon-scaffold_308-1575043694:58174..58529Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_308supercontigscaffold_308:44526..58529 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	0	0	0	0	0	0	0.142429	0.691225	0.0908768	0.181501	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1.17203	1.04601	0	0	0	0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00058187 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top