TCONS_00061627 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00061627
Unique Name	TCONS_00061627
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	11884

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_36:1240492..1280995+

transcript sequence

>TCONS_00061627 ID=TCONS_00061627|Name=TCONS_00061627|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11884bp
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TCATCAGGTCCTTCAGAAGCTCCGGCAACTCTTGCTTCAACAGATGCCGA
ACACCCAGAAACATTTGTAGCTCAACTCGATGAACTGAAAAAGAGCCAAG
AAGAACAGTACATCTTATTGTCAAAGaaatacaaagaaaacaaagacaaa
ctGAAGTTTCAGCAACAACAAGAACTCAAGGAATACTATCAACGACAGTC
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gtggtggtggtggaCCTCCTGAAGATGATGATGAACCAGGATCATTCTCC
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CTCGCCATTATTCCCCCAATGACACTTCGTCCAGTACTGCGTCTGCCTCA
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TTTCGATCCTGGTCATCCGAAGTACTTGGAAATGTTGAAGTTGCAATACG
CTACCAATCATCGCTACCTACAGCACACCATGGTTGAGTATGGTTATGAT
CCCAAAGAGATTGACACTTTCCACCAGAAATACCTAGCTGAGATTGACGA
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AGCTATTCCAAAGGGTTGAATTCAATTGATAGTGCTCCGTCGCTCATGTC
GTCCCGATCACACGACTCCTTACACAACATTAAACTACCGCGTAACGATC
CGTACTTAGTACACCCGAGAGGCGGCCCCTCATCAGGCAGTCGCTTCCCG
ATGCATTCTCGTGATTTCCCGCCTTCGTTACCGCCCGATCTTCATAGTAA
AGACCACGCGTTGACCAGGCGCCGTTTAAAAGAACACTTACGTGAGAAGC
AGGACGCGTCGTCGATTAAGACGTCGATGGATTATCACCAGCACGAAGAT
AAGATTCAAGAGGAGACAGCTGAAGACGTCGCCAACGAGGAACGGAAGCG
TGCCTCGCGTGACGAGGACGCCTACCATCACCGTAGCTCGGAACTTCACG
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CGCTCTAACGGTCTCTCGTCACGATTTAACGGATCAGATACAAAGTTGTA
TAGTTCGAGTTCCAGTCTTCACACTTCGAACCCAAGGTTGATGGGCTCTG
AACCACGCCTTTATTCATCAACAGAAGCACGTGAAAGAGAAACGCGTGAA
CGCGAGTCTCGCGAGAGAGAACGTGACAGATTACATGGTTCCAATCCACA
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ACAGCTCTGACCCAAGAATTAGCACGGGGTCGGATCCTCGTTTGAGTGGA
CATTTTATTGAACCTAATAAATCTACAAAACACATGACAGGTCTTGTGTA
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AATATCAGAACTACAGACAGTGCATAGTGAACAACATACGTTATTGTTTG
GTGGGGGTGCCAGTTCAAGAGGGAGCTCAAATTTACGTTGTTTCACCAAG
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GCATACCGCTAACGCCGCCCGAATGGCGGCCGGTTGTGTCATTGAGCTCG
CCTTCAAAGTCGCCTCGGGTGATCTCAAGAATGGATTTGCTATCGTTCGG
CCGCCCGGTCACCACGCGGAGACTCATCAAGCCAAAGGGTTCTGCTATTT
CAATTCGGTTGCTATAGCAGCGAAATTATTGTGTATGAAGATGGCAGTTG
AGAGAGTCATGATCCTGGATTGGGATATTCACCATGGTAATGGTACACAA
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TGATGAGGGAAGCTTCTTCCCTGGGACTGGCAAAGCTGAAGAGtgTGGTG
CTGGCATAGGAGCTGGAACCAATATAAATATTCCTTTCAATGGTGGATTG
GATCCGATGTACGGCGATAAGGAATATCTGGCGGCGTTCCGGTCAATCGT
CTTACCCGTTGCCAAAGAATATAAACCGGACATCATCCTGGTGTCGGCCG
GTTTCGCAGCTGCCGACGGCCATTCTCCCCATCTTGGTGGTTATAATGTT
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ATGTCTGGAGAAGGCTGTTCAGATACAAGGAAAATACTGGCCGGGTGTCA
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gaaaaagaagaaaatgagacTGTCAATGCACTCGCCTCACTTTCCGTCCG
CGTTGTGCAACAGAATGGGAAAGGAGCTGAGACCAGTGAAAAGAAAGAGG
AAAGCCCTGCCAGCCGACAAGAGGAGCCGATGGCGATGGATGAAAATTAA
AGACCCGTCTGGTCCTGAGTTTATACCCTGCTATCCGATCACCTCCCCTT
GATCAACCGTCGCAGATTGGAGTCGTGAGTTTAAATTTACTGACCGaata
tgttttattttgttccttAATAAGGCTGGTTCACCACGTTTGTCTGACTT
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GGACAAACATGGGCATTATTTTGGTAATGGCGGATAAAAATGGAAGAAAt
gtctcttttcaaaacaacttATTGTTACTGCCGGGTAaataaaagaagtt
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ccATGGATTTCAGTTGATGATACACGCGGACATGCTTTTGACGGAGATAA
TATACCCACTGGTGTGTCTTCCGTGAAcacttttttattgaaataacaTG
TTCACCTTATTTTTAGTCCGTTTTAGGTTCACCCCACCCTCGTAATACAT
TGTACATATCTATTAGTAGTCATAAACCGGTTTTAaacttttagcttttt
ttatatTAACAGATTCAAATACACGCGGACTAGGGCCCTTTTAGGCCAAT
AAATTAGCAACACCAAGGCTAAAGGGCCGATAAGTTAGAAGTGAGTATTT
GTAGCATGCGTAACTTCGTAGTTTAAACATTAAGTTGATTTCTAAGAGCA
AAGATACCGAAAGATATGGGCTAAATGCTGTCGAAGCCTCAAAATAACTT
CAAAAGGATTGTTTTGCTTGTTACTCTCCAAAGTGCTATTGAGTGTGAGT
CAGGTCTAAGCGCAAGTCTATTGTGTTCTGAATATAGCTCATATTGATCA
AAAACGACATTATAATTTGGCACGGGACTCTGTTAAAAGTTCAGTTTTGA
CTTGTTTTGTATTGAACGTATACACGCTTTGTGCATCTCCATCTTGGTAT
GGAAGTGACGGACCTACACACTAGACTTGAGTCATGGCAAGCCTTTACGA
TGTATTGTAGCTGGTTGTTTCGACGTTCGTTTAACGTTGAATAGATGCCA
TGAACGTTTAATGAACATGTTTTTGACGTTTTGTGCCGGCTTAGTTTGCG
CCAATAGAAGTAACGATCATGTTTAGTTTAATTCCCGCAAAGCTCTAGGT
ATATGATCGTTTTTTTAATCGGTTTTTCTCGTACATCGATAAACTAAAGG
GTATTTATTGACACGAACTACGGCAGTGTATTTGACTCGAACCGACTGAA
TCACAATTTGTATTTGTCAAACGTCTTTCCTTTGTGGATATTTgagagaa
tttgaaaaatacacaTCCTCTTTGCACAGGCTGCCACCAAACACAACACT
TACTGACATCAAAATTGACATGCGGCAGGGTTGTGAAAATGTCGAGTACT
ATTTATCTTTGTTGATTGATGTTGCTTCGCTTGTATATACATACAACATG
AACATTGCATTTTTACGACAATTGGACAGGTTTACATTTGTTGATATCAA
TCATCAGTGAGAAGTTTTATGAGAGGTTTCAGATGTATTTGCGTTCAAAG
TTGATgtgttttcatttgtttaatGCGAGAATGGTCTTTCAGTCTTTGCG
AAGAAATTACCCTAGCTAGGTAACCGTAACCACTTCTAGGGGTTTTATGA
CCTATTTCCCTATGCTTCAGGATGATTGAGAGGCATTTGTTACTTCAAAA
CCCAAAGCGATGACTGAAGATGTATGCAACCTTGAGGTTTTTCAATGACC
AGTTTTCTATGTTTTAGAATGATTTAGCACTTGAAACCTCAAACTCGAAG
TTACCTAACCCGGTATTCTTTTGGTCTACTGCATAGGAAGACGCGATTTT
ACACTTATCTGTACACTTTGACCAAATCTAAACACTGTCTTTAAAAGCCT
TGATGCTGTCAATTTACATTGATACATTGCGTTTTCTTTGTATCATCAAA
GTTTGTTTTAGCCTAACTAAATGATCGTCTTTTAAAGGCTCCTGGATGAC
GATTTAACATCACATGCATGGCAAACACTCTTCAACATCTTAAGCATACA
TCAACGGAGAGAAAAAACACTTGACATTTTCAAATACTGATATTATTGTC
TGACTTGTTTTAACACTACCTACTAAACTCGAACGCGACAGGAAATCAAG
GTAGAGAGGGTTTTTATAACACAAAAATGTGCGTGAGTGTTGCTTTGATT
TATATGCTTTGATGATGACTGTTGACTCAAAAAATctgatgaaaagaaat
tttgacggCTTTTGATTTGACCCTATCTGTGCTTTCTTTCTCCGCCTGGC
tgtcaaatatttctttttcttgtcataggaaaacacttgacaaaaaaTTA
CTGTCGGTTGTAGTTAGAATGTGCTTTAAAATGGCGTTGCGCTCCCTGTA
TACATATCTGACGATATAAGCAAAGGACATTTTATAAGGaaatttctttg
attgtaagttGTATTCTTGGACTGTTTCTTGGAAAAGGGCTTTAATACAA
CGATATCAGAATCCTAGCTTCTTGTTCTTTGCAGGTCAGGGTTTTTTGTA
GGTTACTGATATCCTCAAACATTGATGATGCTCCTAGTAGGCTTTGTAGA
GATCTGTGATTAAGGCAAAACAGCTTTTGTGGATAGTTTGAAACCTTTTT
ACGAGCTCTTTGAGTTTTCATATAATCCAGTTTGTCTGTATATACAGTTT
TTACTCTCATATTGCTTATTCAATATTTACTAGTAGTATTATAGTTTCAt
tcaatattttactttttttaagaatttatcgttgcaatttaaattcaaaa
atttttttccaccaCAACCATACGTAGAgaaatatattagaaaaatTATT
TGGNTTAACACTACCTACTAAACTCGAACGCGACAGGAAATCAAGGTAGA
GAGGGTTTTTATAACACAAAAATGTGCGTGAGTGTTGCTTTGATTTATAT
GCTTTGATGATGACTGTTGACTCAAAAAATctgatgaaaagaaattttga
cggCTTTTGATTTGACCCTATCTGTGCTTTCTTTCTCCGCCTGGCtgtca
aatatttctttttcttgtcataggaaaacacttgacaaaaaaTTACTGTC
GGTTGTAGTTAGAATGTGCTTTAAAATGGCGTTGCGCTCCCTGTATACAT
ATCTGACGATATAAGCAAAGGACATTTTATAAGGaaatttctttgattgt
aagttGTATTCTTGGACTGTTTCTTGGAAAAGGGCTTTAATACAACGATA
TCAGAATCCTAGCTTCTTGTTCTTTGCAGGTCAGGGTTTTTTGTAGGTTA
CTGATATCCTCAAACATTGATGATGCTCCTAGTAGGCTTTGTAGAGATCT
GTGATTAAGGCAAAACAGCTTTTGTGGATAGTTTGAAACCTTTTTACGAG
CTCTTTGAGTTTTCATATAATCCAGTTTGTCTGTATATACAGTTTTTACT
CTCATATTGCTTATTCAATATTTACTAGTAGTATTATAGTTTCAttcaat
attttactttttttaagaatttatcgttgcaatttaaattcaaaaatttt
tttccaccaCAACCATACGTAGAgaaatatattagaaaaattatttggtt
ttttgttaattttttcagttttataCAAACAAAATGTACATAACCTTTTT
ACTTCACCCTTCTCACGCTCTTACTATTGTAACGTGGCGGGTTGGCCGCC
CCTTCATTGGTGCAGTCTCGCCCATTCATTCCCAAGGaagattttttaat
gaatttttctttttattgatgATATTATATAGATATTGGAGAGAATGTAT
TTCTCCTTGTTATTGAATTGGAGGTACGATTTATAACAGAAAAAAGGTGC
ATGTAAAAAGATAACCctgttgaaagaaaaatttcctTCCCCCTCATTCT
ACCACTTTGCGCTTGTGATGTGATAATCAGCTGTGGAAATCTCGCGCATG
CGTGTAACAgctcaaaaacaacaaaagcacGTGTGTTTTTAAAGCTCGAC
ACATACTACAAATATTAGATGTCAACTCAGTATTGGCTTGttattaggga
gataataatTTAAAGGGACAGATGGCGCAGAGGAAAACCACAAAGGTGAT
TTACATCTTTGTAATGTTTACATGTTAAACATAAGCAATAGTGTTTTTCT
CATTCTTGTGATTATCTCCGTAATATCACGCTTGCattgttattcaaaat
aatagcGCGGAATTTGTAAATGATGGGGCTTTATTGTCTTTTAGGATTAT
TAAATGTTGAatacttataaataaaaaaagagagaatGGCCGGCTAGTCG
ATATCAGTGTGTTATGTGAAGGCCATATacacgaaaaaatattttcgagg
ATGAAACATTTGAGCTTGTTATAGCAAAGaaaagagaggaaatttttCAC
AAGAGATATATGagaaacagaattttttttctttgatttaattTGTACTG
CATACTTACTTCAATATAGTTATGGTTTTAGTTGAGGAAATACATTCTTG
TACTACTACGGCAGGTAGTAGCGATTCTGAATATGACAGTGGTGGAGGCG
GTGGACCCACAATGAGCCGTTGCGTTACGAGATCGATGTCTGCGAGTATA
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TAATTTATGTTATACCAAACTCACCACAATTAAAACTCGGGAAAGGACGA
AAAGGAGTCGTTGTACTAGTCGTAGAAAAATTcgtaataataaaaagaaa
aaatataccgTCAATGAATCGCGGATTGAATTAACGGACTTGAGCGAAGA
AGTTTTGATTGCGATTTTAGAGCATGTACCGGCTACTGGTCTAGTTTCTA
TGAGTAAAACTTCCTGGCTATTTCATCGCATCTGTCACACGGACACCCTT
TGGAAGCATCGCTGTAAgATCGATTTTAACTTACAAACGAAATGGGCGGA
ATTCTCACACTTGTATTTATACGAAATGTTTTTCAAAGCGAACACCCTAC
GTGAtgatcaaaatttctttaaaccCGTCAGTCAACTCAAAACATCGGTT
ATCGTATGGTATTTAACCAACCCCTCACCTCCGTGTCACGTGGTCGGCCA
CCTGACTGCCAGTCAAGTCAAATCAATATGGGGTATCACTGAAGAAGAAC
TGGAAGAAATGTATTTCGATGATTCAGAGGACAGACCAGATATGTTCCCG
TTATGTCATTATGATTGGAGCCGGTTATACCAAGTTTTCTTACGTAAACA
CGGCGGCGTCATCCCCATGCAGAATTACGTCTTAAAACGATGTTTCCGTA
ACAGAGTGGCTCTAGAAGACCATTACAAATTATCTTTACATNCGTCATCC
CCATGCAGAATTACGTCTTAAAAAGATGCTTCCGTAATAGAGTGGCGCTA
GAAGATCATTACAAATTATCTTTACACGCATCGAGAAGACAGAAATGGTA
TCAATATTTAGAGGACCGTGACGTCGGGAATCGGGAAGCTCTCAAAGCAT
TAACGGAACACATGCCGAAAGTCACATATATTTACATGCTACATCAGATT
ACAGCAATGTACATTGAGGGTAACTTGAAAGGTGGTTTTCAAACAGTCAA
AGCGTATGCTGAATTTTGTGGCAAATTTCGGTCCTGGATGGAGGAGAAAA
GCATGAAGCTGTGGCCTCCAAGGATTGGAGAAATTCTTGCGCAGGACTAC
AGGATAGCATTGGACTTTGTTAACAAATGTTTGGCAAGTGAAGCTGAGGA
GAGAGAACTGGACGTTGAATCTTTCATGAGCAAAGCATGTCCTTTCGTGC
AAATGTTACACGAGGTATGGACATGGCAAAATCAACACGGTACGGCGTAT
AGGAAAGAACATCGATCATCAATGATAGTCAGGAGGCACGAATGTTATAG
aaaatatttagaATTCGGACGAGCCGAAGATTTCCGTAAACTGCGCATGT
ATTTCGAACGACGTGAAGTACTTAGTCACTGGCTGAAGGAGAATCTATGG
TTAATCTCAGTTCTTGGCGAGGGCGTTGTCCGCAGTTTAAGACCGCCCAT
GTTGGCACCCGATTACTCCTTCCCAGTATTAGGCACTGATCAAGTAGCTT
GTCTTGTACAAAGatttctcGAAACTGGATTGTTTTCTGACTTCAACAAA
ATTCGAATGAAACTCTCCGAACTTTCATCAATGCAAATTCACGGACTCTT
CAAAAAATCACAAGCACTAGAACTTTCCATTATGAATGAAATGAACCGCC
CTGATTCATTCACTTTAAACGAAACCAGCCGCATACAACAACAAAAACCA
TTTCCACCGCATGGCAGGCCGCAACATATGGCTCCGCATACCGGCCTCCA
CCCACAGCCTGCCCCTATTTCGACGGGCGGCGCTTCCTCACACATGTTTT
ATCCGCCACATCAACACAATAGATTTTTTCAATGCCAATCGCACCCGTTC
AGGTGATATTATTACAGATATAAAAAttagattattttttattatctttt
agaaaaaaatttattcacttGTCCGTGAGCAGAGATTGAAATCGGTTTTC
TTATTTTGCTATTTAACATTACTCGATAAAAGACTTGAATAGCTTTTACC
GCTTGGTTTTAACCCCATTGGCAAAAAATACTAAGGTTAAGGATAAGCTA
TTTAACAGGGTTAAATCAAATAACACGGGAAAGGTTggatttctttttta
ctttcctattcaaaatgttgtttttttaagtttgttaaaaagcaaaataa
gATGTTAAGGATTTCAATAGATAAGAGAGATTGTGTGTTGTGTGCGTTTT
AGCATTTTTAACAAATCACTCACTAGTCACTGCTaaatatttgatttgat
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CTTATGTCCTTAGAAAAACAGGATTGAAAAGCATATAAAAACACATCATA
TTATTAACAAAAGTCTTATCGCGCTTTAGATTTCATTATTTgtcaagaga
aaaaaattcgactttttttcttttaacctACTTTTCACTAAGCAAACCCA
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CAATTTgaacttttttgatttgatgaCGGACGGAATGGCTTTTTTTAAAA
CACCCCGGATCTTTTTTACACAAAAGTGTCGAGTTTATCCTTTTGAAACC
GTAAAATTTTCAGAGTGTTTGAATAAGCCCGGTCGTCAGATATCTGTTGA
ATCTAGCTCTATTAGAATCTTTATGAAACTAAATATCTCAAGAACGTTCT
TGTAATAAAACCTCAATGTTTTCACTCTGACTCAAATACGAACTGTGAAA
TTCGTGCCGCCATACCTCACTCACATCTCAATCGAATCTCTGGTTATCTC
CGTCAtaatatacacgcttttttcatACGCGGTTTATGACAGGTCTTGAT
ATTATGGAGATAACGATAAtataaaaggaatttttttctgTGGTAATTTA
TTATATAGTATGCTGTGTTTGTTAATATTATAACTTAGATATGTTTTTTG
GATGCTGAAGCTTTATTTGTCTTCATATTTAAAATGTCAGAATTGTTGCT
GATGACTCAATTGAAACGCctttattataaaaaatatctttaGTGCTATC
TAGGTAGGGTTATTTATAATACACTTGCACCGCTTGCACTGCCTTATCTG
CTCCTATCCTTGAGACCCACTCTTACTCGCTTAATCTCATAATTTCCTCG
CGCAATCAGCTTATCGCGGCAATTAGagtagtgtttttttttctacacga
gaattttttttatttaaagggGGGTTAAGGTTAGAGATAAAACTTAATCA
AGTTAAATTCTAAAATCGAGACTTTTTCAATGAGTAATATCAACCATGAC
CTTATGGAATGGACAAATAATTCTTGTAAAGCAAACTAATCCCAGGGGAA
GTCTCGTaactttttttgctaaattcgcGATGAAAAATGCGATCTTTCAA
TAGGGTTTTAacgcattttttttaaattgagtcATGGTAATAGGTAGATT
GGAAAATTGATGGACAACGAGATTTATTTCAGCTTTTTTTATTGTACAAA
TTTTTTGTCCTTGTATGAAATATGGACAGAGTAGAGTATATATTGTGTAT
AATAGCATATTAttatttcaacaaaaagtttataaagaaaatgttttcgg
gtaaattatgtcaaaataataTTCTATCTTTTTTCTTTCGCCGTCCCTTT
TTCTTATGACCTCGATATGTCATGGAACTCATTTAATGCTGAATGGAAGA
TTAGGAAGCAGGTTAAATTCAAATCTTCTCAAAA

transcript from alignment at scaffold_36:1240492..1280995+

Legend: exon

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>TCONS_00061627 ID=TCONS_00061627|Name=TCONS_00061627|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=40504bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_36:1240492..1280995+ (Clytia hemisphaerica)
tcagcctcaaaaaaataaaaccataaaaataatcaataatGAGCAGCCAG
TCATCAGGTCCTTCAGAAGCTCCGGCAACTCTTGCTTCAACAGATGCCGA
ACACCCAGAAACATTTGTAGCTCAACTCGATGAACTGAAAAAGAGCCAAG
AAGAACAGTACATCTTATTGTCAAAGGTAAGGCCTGTCGGACTGTCATAG
ATAGCTAGCTTCAAGACTAAATCTCTATCGATCTTTTAACTTTAATTTCA
TCGTATGATGGGAAGGCAGAAATCCCGGCTGTCGAAATTCCACGCACAAA
CCATCTATTCATAGGTTGGTCCTAGTAACTGTTTCTAAGCTTAACATCTG
TTAAATTCATTTCTTGTCATTTAATTGCTaaagaaatacaaagaaaacaa
agacaaactGAAGTTTCAGCAACAACAAGAACTCAAGGAATACTATCAAC
GACAGTCCGTGTTAGGGAGCAGTAACAAAGTGCCCTCACGCCATGATTAT
CCGCCCACACAAATACCACCGCCCTATTATCATGGAGAACCAATACCACG
AAAGGTAAGTTTTTGACTCTCCGATGATTTTTAACTGATTTCATTCGACT
CTCCATTCGGATTTTTTAGTAGATTTTATAATATTTCCTGCTCGAATTAG
TTTTATAGTCTGTGCGTGCATTCGATGCAGGTTCTGTGCCTGCATTCGAT
GCAGGTATTTTAGAGATGTTTTCAACCAAGTATTTGTATCAGAaggaatg
ttttctcttttctgaatatTTACAATGTtacatttctaaaaaaaggggcT
GCCCGTCGAGGTATTGCTTTTTGTATGGAAAAATATCATCTAAACATATT
ATATCCGGCTATTAAGAACAGCGCATAAAATAAAAGTCAGTACCCTTTCA
ATAAATCTTTACAGCAATGTAACATTCTTTATTCATGAGCGTCGGGAGCC
ATTTTATGTGTATTATATATACTAGAAGTATGAAACCTTCAACTATTCAA
ATGGAAACACAGAGaacaaaacccacaaaacaaaatatatagGTAGTAAC
TTGGTGGTCTTTAGTAGTATCCTTCGTGAGTGACCATGGCTTTATACTGT
ACGACAAGACATTTTGTATTTCCAATTTCAAATGTACGTATTAGACCAGA
TTAGACCTGAGTATCGTATCGCTTGGCTTGAAACGTGATTTTAATGTTTC
GTGTCTCAAGGTTTTAAGTTCTCTCTATGCATAGAAGTCATAATGATACA
CTTTTTAGTATCACGGAATCGTTTTGAAAGTAATACACAGATTACCGTTC
AGGCGAACGTTGCAAAAAACTAGAACGCTCTTTAAGCAGCTTTAAGCTCT
aaattactgggctatccatgTAAAATTTCGACTCTTATCTATTCATCTAA
ATATTTACAGGGCGATTATTCATCAATCACAAAAGGAGCATCCATGTTCG
ACGATCTGCCAAGTAAGTTGTCTGCGTCTGAATACACTTATCAATTCTAA
GGGGGGTGGGATCAAATTTGCTAGGGTAAAAGGAGGTCAAAATGTCTCTG
TCTATTAGAAAAACAACTGGtacatttgacgtcaattcttCTCGATAAAC
TCCTAGCGTTTTATGGGATAACTGGATCACCTCTTTTTACAGACAATAGT
CTGTCATAATCTCAATGAAATACATAAAGAGGCTGCTTTTCCGTCTAAAG
AATATGAATAtatcaccaaaatttcaagaactTGTATTGATTTGCTGAGC
GAAATCCATTTTCTGTCTAAAACCAAAAACCTTGCTTTAACAACTGCATC
TTAAGCCTAAAATGTGGTGAAAATTCCTTTTCCCGCCAGATTTCAAAATG
TATTATCTTTAATGTTTAATTTGTTTGTTTCTTTCCCTTTTCTTCAGCAC
AAGCAGGTGGAGGCGGTAGCGGAGGCGGGTTGAACGCCCTTGTCAAAGAG
CGTCTCCGTAAGAAAGCAATAGACAACATTAACAAGAAGACACACTTTGA
GCATGTCGATCACAAAGACCCATCGATGCCGCCACCGAGGAGGATACCCG
ACGATTATAACCGATGGTAATAAATTGTTGTGTTATCATCTTTTCAACTA
CCTTATCCAGCCTTTATACGCCTCCCGCCTTGGCATTGTCTACGCCCTAA
TTGGCAAAATTGGGCGTATTTAATGAATGGATGTCCAAAAGTGGGCTCTC
TCGGGAGAGGTAGACCGGCTATATgtagagtataattttctcCCCAAGAA
CCATTCGCGAATTTATGTATCGAAGGGTATCACGGAAGTGAAGTCgacgc
aaaacaaagtcgatgtACTGCTCTATATcacctttgctcacctaaacatt
CGAATCCAAAGGTTCAAATAACCGGTTAAATATTTAACTGACgatattaa
ttttttctttcttcttcataACAGGGTATACGAACGATACGAAGGTTCAG
GGggaggtggtggtggtggaCCTCCTGAAGATGATGATGAACCAGGATCA
TTCTCCTTGCGCAAAGCTGGTGAGTTCCCTCCCAGGCCCTAATAATTTCA
CCTGTTAATGAATAATCAGCCGAGCGTATCCTGGATTTGCGGAATATTCC
CATAATCGCAGTGTGTCGCATCACCCTGAAAATGTGGTGACTTTGCTTAC
TATGATGTAATATAAGTGTTATGCAATAATACCGTAATCATCACGGGATA
GTCAGTTTCAGAAACATTTTACTAACAGCGTATTTCTTTCGTAGAtacat
aaaatttttgattttatttaattttttctttacagaATCTGAACCGAACC
TTCGTGGTCGCAATCAACTCAAACTTCGCACAAACCGTTATAAACCACAC
ACCGATCACCATCCACTCAATCCTCGCCATTATTCCCCCAATGACACTTC
GTCCAGTACTGCGTCTGCCTCACGCCATCGAGAGGCGGTCTCTCCACCTT
ACCGCCCTCCTCTAGAAAAGGTCTTCCACCCTGGTCCGAGAGGCGTGCCA
TTGTTTCAATCGCCTTCTTTACCGAATATTTACAAGACTTCGCGATCACA
AGTTCATTTCCCTTCTTCTTCAAGTGTGAGTTCTCTTATTAACTCAGAAT
TTAACTAACATTCTCGAAAAACTTCTTTTGCatgtaccagacgaccacgg
cttttcTTCGACATTGTTCCATCTGTAACTCCTCTGCAATCCCCCAGGCT
CCATGGTAGACGCGACGCAACTCTAAACTTTTGGAGCTTCTGCATTATCG
TATTTACTTTAAAACGCAAAAACAAACGTTAAGCCAAATGTGTTACTCGA
ACTATTTCGAGTATGATGGTGTAGCGTATTATAATCTCGTTACTAATCTT
TTTCTGCTTTCTCATTTTCAGTCGATGATGGGCAGTAGTGGTTCATCTAG
TTCCGAAATGAAAGCGCCTTTCGATCCTGGTCATCCGAAGTACTTGGAAA
TGTTGAAGTTGCAATACGCTACCAATCATCGCTACCTACAGCACACCATG
GTTGAGTATGGTTATGATCCCAAAGAGATTGACACTTTCCACCAGAAATA
CCTAGCTGAGATTGACGATAGCTCAATGTCGGACGTGGAGCGCGTAAAAC
AACTGTTAGAATCGCAAAACAAACTTTATTTACATTTAGCTGAGAGGCTA
TCCTCGCCATACAGTAAAAGCTATTCCAAAGGGTTGAATTCAATTGATAG
TGCTCCGTCGCTCATGTCGTCCCGATCACACGACTCCTTACACAACATTA
AACTACCGCGTAACGATCCGTACTTAGTACACCCGAGAGGCGGCCCCTCA
TCAGGCAGTCGCTTCCCGATGCATTCTCGTGATTTCCCGCCTTCGTTACC
GCCCGATCTTCATAGTAAAGACCACGCGTTGACCAGGCGCCGTTTAAAAG
AACACTTACGTGAGAAGCAGGACGCGTCGTCGATTAAGACGTCGATGGAT
TATCACCAGCACGAAGATAAGATTCAAGAGGAGACAGCTGAAGACGTCGC
CAACGAGGAACGGAAGCGTGCCTCGCGTGACGAGGACGCCTACCATCACC
GTAGCTCGGAACTTCACGCGGCAACCAAAGCCGAAAGCACTAACAACACA
TCTGTGTTTGACTCGAGCCGCTCTAACGGTCTCTCGTCACGATTTAACGG
ATCAGATACAAAGTTGTATAGTTCGAGTTCCAGTCTTCACACTTCGAACC
CAAGGTTGATGGGCTCTGAACCACGCCTTTATTCATCAACAGAAGCACGT
GAAAGAGAAACGCGTGAACGCGAGTCTCGCGAGAGAGAACGTGACAGATT
ACATGGTTCCAATCCACACTTACACGGATCCAACCCACACTTGCACAGTT
CCAGTTCCCGACTATCTGGGTCCAACCCGAACATCCATGGGCCTAGCTCT
CGGCACAATGGGTCAAATTCATATCTCTACGGATCGAACCCTAGACTTTA
TAGCTCTGCTTCTAGACTCCATTCTTCAAACTCATCGCTACATAGGTCag
actctggatcaaaaatgaACAGCTCTGACCCAAGAATTAGCACGGGGTCG
GATCCTCGTTTGAGTGGACATTTTATTGAACCTAATAAATCTACAAAACA
CATGACAGGTCTTGTGTATGATACTATTATGTTGAAACATCAGTGCCAAT
GCGGTGGTAACTTTCCGCTTCACCCAGAATGTGCTGGCAGATTGCAAAGT
ATCTGGGCTAGATTACAAGAAACGGGTGTGGCGAATCTGTGTGaagtaag
tatttttttaacGGAAATTATCCGCTTTTTCTAGTAGCCTGCGAAATACC
TGTGAAATCAGTCAATTTCAAAAACAGGTAATAAATAGTGCTGTAGTATA
GAAGCTCTAATAGTGGCTCATGGTTTAAACTCACCTTTTTATGATATAAA
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AGCTTTTTTTATTGTACAAATTTTTTGTCCTTGTATGAAATATGGACAGA
GTAGAGTATATATTGTGTATAATAGCATATTAttatttcaacaaaaagtt
tataaagaaaatgttttcgggtaaattatgtcaaaataataTTCTATCTT
TTTTCTTTCGCCGTCCCTTTTTCTTATGACCTCGATATGTCATGGAACTC
ATTTAATGCTGAATGGAAGATTAGGAAGCAGGTTAAATTCAAATCTTCTC
AAAA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_038655	XLOC_038655	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_36	supercontig	scaffold_36:1240492..1280995 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.0959222	0.0347519	3.33591e-06	0.313052	0.00762014	0.279005	0.00907629	0.00592008	0.618369	0.0985882	0.022112	0.517513	1.50559	0.896194	0.315345	1.04077	5.24918	1.38861	0.47943	0.00012387	1.05387	0.092701	0.105114	2.93736e-05	0.259348	0.000557464	1.17446	3.33738e-06	0.00351209	1.33547

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00061627 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: HDAC4 (Histone deacetylase 4 OS=Homo sapiens GN=HDAC4 PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 496.508 bits (1277), Expect = 4.746e-148
Identity = 244/423 (57.68%), Postives = 310/423 (73.29%), Query Frame = 3

Query: 2160 EPNKSTKHMTGLVYDTIMLKHQCQCGGNFPLHPECAGRLQSIWARLQETGVANLCEKIRPRKATISELQTVHSEQHTLLFGGGASSRGSSNLR--------CFTKLPCGGTGVDDDTIWNETHTANAARMAAGCVIELAFKVASGDLKNGFAIVRPPGHHAETHQAKGFCYFNSVAIAAKLLCMKMAVERVMILDWDIHHGNGTQQMFYDDDRVLYVSMHRHDEGSFFPGTGKAEECXXXXXXXXXXXXPFNGGLDPMYGDKEYLAAFRSIVLPVAKEYKPDIILVSAGFAAADGHSPHLGGYNVTAACFAYMTKQLMELRNGKLVLALEGGYDLQSLCDSSEQCIRXXXXXXXXXXXXXXXMTKPHDNAVKCLEKAVQIQGKYWPGVKRAASLVNSSQNSAKRLEKEENETVNALASLSVRV 3404
            EP    +  TGLVYDT+MLKHQC CG +   HPE AGR+QSIW+RLQETG+   CE IR RKAT+ ELQTVHSE HTLL+G    +R   + +         F +LPCGG GVD DTIWNE H+A AAR+A GCV+EL FKVA+G+LKNGFA+VRPPGHHAE     GFCYFNSVA+AAKLL  +++V +++I+DWD+HHGNGTQQ FY D  VLY+S+HR+D+G+FFPG+G  +E G G G G N+N+ F GGLDP  GD EYLAAFR++V+P+A E+ PD++LVS+GF A +GH   LGGYN++A CF Y+TKQLM L  G++VLALEGG+DL ++CD+SE C+ ALLG     L E+ L  +P+ NAV+ +EK ++I  KYW  ++R  S    S   A+  E EE ETV A+ASLSV V
Sbjct:  645 EPPTKPRFTTGLVYDTLMLKHQCTCGSSSS-HPEHAGRIQSIWSRLQETGLRGKCECIRGRKATLEELQTVHSEAHTLLYGTNPLNRQKLDSKKLLGSLASVFVRLPCGGVGVDSDTIWNEVHSAGAARLAVGCVVELVFKVATGELKNGFAVVRPPGHHAEESTPMGFCYFNSVAVAAKLLQQRLSVSKILIVDWDVHHGNGTQQAFYSDPSVLYMSLHRYDDGNFFPGSGAPDEVGTGPGVGFNVNMAFTGGLDPPMGDAEYLAAFRTVVMPIASEFAPDVVLVSSGFDAVEGHPTPLGGYNLSARCFGYLTKQLMGLAGGRIVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLGNELDPLPEKVLQQRPNANAVRSMEKVMEIHSKYWRCLQRTTSTAGRSLIEAQTCENEEAETVTAMASLSVGV 1066

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00061627 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00061627 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
HDAC4	4.746e-148	57.68	Histone deacetylase 4 OS=Homo sapiens GN=HDAC4 PE=...	[more]

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TCONS_00061627 (transcript) - C. hemisphaerica