TCONS_00062631 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00062631
Unique NameTCONS_00062631
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length144

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00062631 ID=TCONS_00062631|Name=TCONS_00062631|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=144bp
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Run BLAST on NCBI

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Legend: exon
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>TCONS_00062631 ID=TCONS_00062631|Name=TCONS_00062631|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=29631bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_370:280641..310271+ (Clytia hemisphaerica)
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NTTCACTTTTAGCGAATCGAGTGTATAATTAGCAGTTGCTTGAAAAGTTC GTACAAGATTACTTCGCAGtcttatttgacgtcaattttttagtGTGACg acataaatttaaaaaaatatttatgtgTCATGGATGCACACCTCTACAGT CAGATATAAATGCCCTGTAGCTTTCAGTCACGTCACACTAACTTGCTGAC ACTTACATTacttggaataagaatgttcaATTCGCTCCATGCCAGTAAAC TTGTGATCCTTCACAtgaaatggaaaattgtttgttaTGATCGTTTGTGC TCGTTTGCACAGAATCTGATCAAATCACGACACTTTCACATCGTGAACTT TTGATTATAGCTAGCCAAACTTCTTTACGATACGTAACGTAAAAATTTGC TGCTATGATCAAATTCACTAATGGGAATGCACTCAAAAGGACAACCACTT CACAATCGGAAACATACTAATGATATAAAATGTAGCTTTTATGGACATCT TCTCATTTTCTAACACAAAGTTTCCTCCCTTCCTTCCTATAAGAAGTGTA AATCTGCAATTAAGAGTTAAAACTCCGTACTGGTGAATTTGAGTTTAAAA AGAAGTGCGTCTTATTATGAATCAGAGCCAAAGTTCTTCGGAATTTctat ctatttctatttctatttctattatttgattAGCAAAAACTTTATACAAA GTTATTCTCgccaatgtaacaaaaaatatgattaataaaatgaaaaatat taNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCATAGTCCTTATCAAGTTTT GTACGTTTGTATACTCGGTAACGTCTTTTTTTCTTTCGGGTAGCACGTTT ACAATCTCTATTGAACCAAGGTTGGGTGTATCTTGAAGATGTCATTTTTG TTGGAACATGTGCATCTTGAGCTGTCTGAAGAATGTCTTTGAATTGAAAC CATAAAGTGTTTATTGATGTTGCGGTTGATTCAATTTCAATAAGTCTGTT TATCTTATTCTGTACTTGGTCTTTTAAAGCTGTTAAGTTTGCCCTCttcc aaatatatattttgcgTTGAATAGGTTTAATTTTGGTAGGGTGACATAAA ATATCTGATATAACTGCTGTATCGTGATCTCCAAAGCCGGGTAGCGGTTC ACAACGTTCTATCAAACCTGGACGGTTGGTTAGGAAGAGATCAAGTACTG ATTTTTTACGTGTGGTGAAGTTTACGTGTTGGGTAAGGTTTAACGtatca aagagatttaaaaaattttcatttgtctCTTTTGAGTAGTGATTTGTAGC AATTTCTTTTGAATCCCAGTTGATGTCTGGCAAATTAAAGTCTCCGCCAA TTGTATTTGATTATAATGACATAGCTTTCTCCCATAAGCAAATATTGAAC AAAGTGACTGCGATAACTCTCATTCTTACCAACGTACTTTTTGTTGTAAG CACAACCAAAACAAATGACATTCAGATTATTAGAAAATAACATTATGTCC 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CAAATGTTCAATTGTGCAATAAATGACAGATATGTTAGTTTTTATAGATC TATTCTACAGTTATTTCACTAATATATCTACTCCACCGTCGGTTCTGAAA TCTGACGTTTAgattattcttttaaaatttgttcTTAGTTATTTTTAGCC AAATTTCACTTCAAATTATTCCTTTTTGTGCGGCGAATGAACTTGAAAAT ACGGAACAGAAATGTTCACACTTAAACAAATAAATCTAACAAAATAAGGA TGAGAAAGACATTCTGTTCTTTTAAAAACCGATAAGATAAGGAGAGGACT GATCAAATCACATTCTTATAAATCTACGGATCGTTTGAAGGATAAAAATC TCAATGATGGGAAACTTTTTTGAATGTTTCCTAATTAGTTTACAGTGTAC TTCAACAGATTTATTAAGAATACTTTCCTTAAATTAACACTGCACTAATC GTTGTGCTAGTTTTTGCATCTGCAAACACATCCCTGTGTCATAAACCCGC TGGTACTCCagcccaatgaagtataagcccgaagggctaaacaaatccta ccaaagttgcgcggccttgagcggctcgccttgtttttacacaaatgaca gattgaaactaaaatttaccactaaatttcgaaaaaaatatcaatcgtaa acataggaattgctagattcaatctgtcgtcaaaaatacagcgcattttt taagacttcactttttcttgcctgagaaaggttagagattgaactctagc ccttcgggcttcaaactcaatgctccagccccactggaaaatttggcaaa gatttTGTCCCCGataggaaaataccctggaatttcagcccaactgggaa attgactttgatttcatatccATTTGAAACTCAAGGCttaaaaattgcat tccaaAGCCATCCCCGAAATTTTCTATTgccactgaagaaaaaaagttcc accggggctgtgagacaggggtgtgcaAACGTATGAAATATACCTTTCTT TAAATGTACCTCTTATTACCCAAGCAAACAAAGCCCAACAAATCCTCCTC TCCTTCCATCTACACCAAACgtctttttttgttcttttttgtcttttttt gtgtcttttttatgtcttttgagttgtttttttcaatatttgttttattt gacgtcagttttctTTAAGTGACGTTGGTATTCTAAATGACTGTTCATAT GGTGTGGCTGTTTGGCTCACTTGGGTGGAATCCCAGCCTCCTTTACTCTT TCGTATAACAAAAGAATACTGTTGATATGGGAGTCATGTTTGCCCACTGG TATCCCACTTGATTTGAGAATGATCCCAATATTACTATTAAATTTCAAAT ATAAATGGGACAGCCCGGCAATGGGGTGGAAAATGTTCTCGAAAacgtag actatgctatagtcaaAGACAAAttactatctaagaaataagcgcAAAGC ccaagaaaattcgcaaacgggttttttgctACGGAAAGGAGTTTACAGCC GGTAGAGTATGTCAGTCTTTCTttgaaactctcccgccgatttttttccg tataccgacCGCCTTAGCAACTGTAAACTCCGCGCATAtgatattttccc gcctttactatctcTGTAATGGACGATAATATCGTCTATCGAAGACGTTA CATTGCAACTTTTTTGGCGAATGAAGACACTCAAAATAGATCACGTGAct tcaaaaaaaagatttgatctCATTAAACTGAGCTGGCTGGAGGTGTCATG ATCTCAAGGAAATGCCATTTGTATTAAAATTTCGCCAAACAATTTTTGCC ACTCTCTGGCTATATATATGAAttcatatttgtttttttctcagttttcG TGTAACTCAATAACGGCAAATATCGGAAAAACTCTGACCAGCGTAGGCGG 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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_039249XLOC_039249Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00062631-exon-scaffold_370-1491911889:280641..280685TCONS_00062631-exon-scaffold_370-1491911889:280641..280685Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00062631-exon-scaffold_370-1510915933:280641..280685TCONS_00062631-exon-scaffold_370-1510915933:280641..280685Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00062631-exon-scaffold_370-1575043694:280641..280685TCONS_00062631-exon-scaffold_370-1575043694:280641..280685Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00062631-exon-scaffold_370-1491911889:310173..310271TCONS_00062631-exon-scaffold_370-1491911889:310173..310271Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00062631-exon-scaffold_370-1510915933:310173..310271TCONS_00062631-exon-scaffold_370-1510915933:310173..310271Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00062631-exon-scaffold_370-1575043694:310173..310271TCONS_00062631-exon-scaffold_370-1575043694:310173..310271Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_370supercontigscaffold_370:280641..310271 +
Expression
No biomaterial libraries express this feature.
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00062631 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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