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transcript sequence >TCONS_00068972 ID=TCONS_00068972|Name=TCONS_00068972|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=643bp
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TGGAAAACTACATTAAATTATTATCCCGAATAAAAAAGACact Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_491:125182..144167+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00068972 ID=TCONS_00068972|Name=TCONS_00068972|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=18986bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_491:125182..144167+ (Clytia hemisphaerica)
ATGCAATGCCAACCTGATTATAACTTGGTTGAAGGtaagttttgtttata
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ttgattttttttttcggttaaATAATGACACTGTCTTAAACTTTAGCATG
GTCTACCATTCTAGAAAAAGACCATACCCCTCCCCGTACTACGAAACCTT
TTCTGTGTTTCACGTTATCGCTAAACCGACCTTTTATCCAGTTTCagcca
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gcaaaaaataaaaaaatattcttgctattgttttcgaaagcccgcgaagc
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AACATAGATATGAAACTTGGGGCAAAAAGGGGGAGTTCTAACCGCGTTTA
CAATCTGTTCCTTTTTGTATCCCGTTTCTTGGTTTTCTGGGTTTTagttt
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CAAGCATATAAAGTGAAGTAACTTAAGAAGCTTAAACTTTTCATCATGTC
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AACGTGTAGAGTCTACTtatggctgaactttgctttgctttttgataatt
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AGATTTAAGCcttgttttcttataaaaaaccgtgtTTACCATACTGTTCG
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00068972-exon-scaffold_491-1491911889:125182..125215 | TCONS_00068972-exon-scaffold_491-1491911889:125182..125215 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00068972-exon-scaffold_491-1510915933:125182..125215 | TCONS_00068972-exon-scaffold_491-1510915933:125182..125215 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00068972-exon-scaffold_491-1575043694:125182..125215 | TCONS_00068972-exon-scaffold_491-1575043694:125182..125215 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00068972-exon-scaffold_491-1491911889:141055..141232 | TCONS_00068972-exon-scaffold_491-1491911889:141055..141232 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00068972-exon-scaffold_491-1510915933:141055..141232 | TCONS_00068972-exon-scaffold_491-1510915933:141055..141232 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00068972-exon-scaffold_491-1575043694:141055..141232 | TCONS_00068972-exon-scaffold_491-1575043694:141055..141232 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00068972-exon-scaffold_491-1491911889:143737..144167 | TCONS_00068972-exon-scaffold_491-1491911889:143737..144167 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00068972-exon-scaffold_491-1510915933:143737..144167 | TCONS_00068972-exon-scaffold_491-1510915933:143737..144167 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00068972-exon-scaffold_491-1575043694:143737..144167 | TCONS_00068972-exon-scaffold_491-1575043694:143737..144167 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_491 | supercontig | scaffold_491:125182..144167 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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