TCONS_00069583 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00069583
Unique Name	TCONS_00069583
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	1918

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_502:166103..177140-

transcript sequence

>TCONS_00069583 ID=TCONS_00069583|Name=TCONS_00069583|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1918bp
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ctaacaacgtcaaaactt

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_502:166103..177140-

Legend: exon

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>TCONS_00069583 ID=TCONS_00069583|Name=TCONS_00069583|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11038bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_502:166103..177140- (Clytia hemisphaerica)
GAAAAAACTGACAAGATAATCAGAAGATACGAAATATCGTAGACAAAGTC
AGATTCTCTTATCCAGTTCATACTTGTTGATGCTTCTGAAGTAGCTACAT
ACGCATAGTATTGTTTATAGAAGATAAAATTCCTTAGATAACGGCTTCGA
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ACGTTGACTTCCTTACAAATCTTCCTAACTACTTTTGAATTCGAAAAACT
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TTTTCATTTTTTCAAACTTTTTTAATTTTTTTTTATATTTAATGATATTC
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TCTAACAAAAGTAATAGGCTTTTTTCTTTGCTCTAGATTATTTTAAGACA
GACTTTGTTATTGTTACTTTATTGTTTATGTGACTTTTCTTGGGGACGTT
TTACAGATTTTAGACAGCTTTTGTCAGCTACTCTGTACTACCATTGCCTT
TCCAATTTTAATATCATAACTCACCATTTTCTACTGTTACTTTCCAATCA
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GAAATTCTGTCAACAATTCACTTATTTTGGTCATCATAAAAATCTTAATT
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ATATATGAAGCAAGGGCAGCTGCTATTATATTGAATCTGATTTAGTAAAT
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GCGAACTTAGCTTTTTTTTCAGACAGTGCTTTTGATTATGAAGGGTAGAA
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TTAGCCTGTCATGTGACTCCAGCCTTCATACAATAAGCGATCGGAGATCG
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TAATGATTATTCCCAATTTTTTGATTTCCTCTATTCTTAATCCAGTGTTT
CCGTAACTGAAATTTAAATCATCCTATCGGATGTTTGAATGGATGAGATT
TGTACTTTACTTCGATATGAGTTTTGTATTTTGTGGTGAAGAAACCATAC
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CGTTTTTGGATCGTTCGGATTCAAGGTTGCTGTTCAATGATGGCGGGTTT
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TTTGTTATTTTAAGTGATAAGATATACCATGTTGTTGATAGGCTACTGTG
TGTCAATTTTCATCTGCCTTGACATGCTTTTAAAGCGTTTTTGACTTTTC
GAATATACAATACAATAGCTGACTTATTGCGATAACTTTGTTGTCTTCTC
GCTCTAATAGATACAGGGTAGCAATGACCTCACCAAGACTGCTTTTCTAC
CAAAGTTGAAGAATTCAATTTTGATTTTAGTGTTTAGTTGAAATAAAGTT
TAAGTCAGTTATATTGCTTCAGTAGAGATAGTTGGGAAAGACACCAAAGT
CTTAAGCCACTATAGTTAAAGACATTATATGAGATTGGTGTCTTGTATTA
TCAATTTCCTTCAATTTGAATCATAAATCTAGATTTTTGTTTCGGAGATC
AGACAGGCTTAAGACGAGTCAATCATAATAAGAAGTATTAAGTCGACTTT
GTTTGAAATGCTTACTTTCGAGCTTCCTTCCTCGTTGTTCTGTCTTTTTT
GATCTTCTTTTTGGTTTCTCATTTATATAGCTGGTAAAATATTTTGACAA
AACTACTGAATCATCGTACTTTTCCGCTTTAGACCTACGCTTATGTTCGA
CTTTTCCTTCTAGTTACGAAAACTCTCTATAGAGACCTCTTTTCATCAGG
ATATGATACCTAAGTGTGATAAACCTGCAATCGACATTATCTAAGAGATT
GAGTCAGACTCGTGTTTAACTTCCCAATGAGTTAAGCAAACATTTAAATT
TGAGAGACATAAATTTTTTTGTGTTTTTCGATATCAAATTTTTACTCTAG
CGGTTAGTCTATAGGTTAATTCTTGGTGCTAGGATAGTCGGTTTTCAAGT
CTTGTTTTGACGTGGTTGGTTTCGTGTAGTTCTCTAGTGCTATTGCTGTT
AGATAACTGGTTTGAATTTCTTGAATATAAAACTACGAGTCTTTGACCCT
TTTTAAAAGAGACTTGGGTCAGGTTATTACTTTATTATTTTTGAAGTTAG
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CATATGTCTGCTTTTTTACAGGAATTCGTAAGAGCTTTAAAAACAATCTG
AACATCACATTTTCAAAAATGACCTGACCTTTCTTAAATACGAGGCATTC
AACCAACCCGTTTTTGAGCTTTCCCAGCTGGCACACAACGTTGTTTCAAC
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TTTTTTTATAAGAACAAACTATATAAGAACATAAGGCTTCGAGGCCCAAA
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TTCAACACACAGTTCTGATTTCCCTCAGTTGCTTTTGTTTTTGTCCGTGT
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GCAACTTTGATGTAACGTGTTACACAATACTAAAAGAAGTTGAAAAGGTG
ATGAAATTATTTGTAAAGATTTGAATTTGATGAAGAACTTTTACTGAGAA
AAGGAAATATTAATTTCCATAATTCTTGGAGTAGTCTAAGAGTTTAAGCA
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TTGGGGTACTTCAACATTCCCATTGCTTTATGGTGGGTAAGATTTGCTTT
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GAAAATGAATTTCTCTTCATTCGGCTATTCTCTTTGTGTCTTTTCTTCAT
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TATAAGGAACACGTTTATAAGGAACTCGAGGGTGAAAATGGTTCAAAAAA
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TAATATACCTTATTGGGACTAATTTGACCAAATTTTCATCTTTCAAGGAG
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AGACTGAAATTCTCTGTAAAAATAAAGAACTCCAGGCTCAGAGCAAAGTT
AAGGTTCCTTATAAAAAAAAAACGTGTAGTGTTCTGCTACACGAGATCAT
TTTCTCTCACAAAGTTATATTCTTAGACCTCAACATGTTTTTTCTCGGCA
CCGTAAGAAGTTCAAACCTTCTCATGTATGAGAACCATTTTTCTTCTCTT
TCTCGTCTGCTACCTACCCTTAATTCTTCCTTTGAGGTTGTCTTCTGACG
TCTACAAAAGAGTTTGTCTTATAATAGTGGTTACATTGTCTCGAAACTTC
AGTCCTTGTGATGGGTGAAATCGAAAGATTAGCTGAAGATTTCTACACCC
TATCTTTCTCTTTTATCGAGGAAGTGTTATTTTTGGTAAGACGAAACTGT
TCGAATTGTTTTTAAAGACATTGATAATTGCTGGTCGTTTGGGTTGTTTC
GCTGCAATTAAAACGTTTGAAACCTTACTTTGAAGGCAGTAGGAAGTCAA
CGAATCTTGTTTAATTTTACTTAAGATTTTTCAGCTGTTTGCTTTTAGTG
ATCTCTGATTTTGTTTATCGTGGGTTTTTAATCTTGATTACCCGTGAAAT
AGCTTTTAATTGATTGCTAAGTACGTCTCGTGAAGCATCATTTGAGGTTT
TATCTGAAGTCTGGTCAAAATAAAGCAGAGTTTTAAACTGTTGTAATGTT
CTACTTTACAATAGTGAATATTGTGTATTCTTGATGTTTTTTTTTTTAAA
TAACCGAACGCATTTTTAGTATTGGATTTTAAACCTTCGAATACTTAACA
TGTTGTTTAAGCACTTCCTTATCCTCGTCTTTCAGATCATGTTATTAAAG
AAATAGCTTAGTAGAGAAATCCAGGGAGAGGAGGAGGAGGCCCTGGAAAG
CTGAAGGAAAGAGAGCCCTTGGATTACCCTCGACAAGGATGGCAAATTAC
CTTTTTTATTTCTTTTTCATTTCAGATTTCACCGAACTCCTCATTTCGTA
TTTGCTCGCCAAACCAAACGTTCAGCAATAATAACAACAACGACAATAAC
AATATAGTACGAAAGTCCAAGAAACCACATTGGAACACAAGCACTCGCTT
ACATCACATGGACCCTCATTTATCACAAGAAGTCACTATGGATGTTTTCT
CATTAACACGCGAAATCCACACGCCCATCGGCCCGCCCATGAACGCCTCT
GAACGCGCCACAACGCCCAAAGACGATAAACCAATGTTACCTTTGAAGAG
AAGTGATATTTTACCGAATGTAAAAATTTACAATTTGTGGAGTCAACACT
TGTCTAAAGATCAGGTACTATTTAATGTGATTCCTGGCTAAATATAGAAT
TTCTACTTCAAAATTTGAAAAATTACTACACAACTTCAACTAACTCTTTA
ATTTAAAGCTGCATTTTTGTATTTTTGGTTTATCACGTATTATAATTCGA
ATTCTAATAGAGTGTGGCTTTTTCTATCCACTTTTTGATCCATCACTGCA
TCTCTATTGCTAAATCTATGGTATTGGAAGATTAGGTATTGTAAACAAAA
CAAAATTGCCAATTAATTAAATTAAATATATCCTCAGTTCATCAATCTAA
TTATCGCGACAGAGCCGATATATTTTATTGCTTTTTTCCGTTTTGTGCTC
ATGTTTGTAAATTTCTTTCTATTCATTAAATGGAAAAAATTCTCATCTAG
ATTATCCGATTTTCTAACCAGGTTCTTTTGATTGATTCCAAGGAACACAA
ATTTCATTGAAGCGTGAAAACTTTATGTTGAAATAATCAGCATTTTAGAC
CAGAAAACCAGGAGTTAGAACTAATCCGAAAATCACTTGCTAGTATTTTT
GAGACAGGGGTGTTATACCATCAATATGGTTTTCTAACTAACGGCTCTTA
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TGTTTAGCAACAGTAGTTAAATCAGATCTTAAATCCGAAAAATTCACTTC
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AACAAAACTTTGACATGTTATACATTTTCTGTTAGACCAACTATCATTGA
GTCTGAAAATTTAAGAATCGCAAAGAAAAAATTTAATGAAGTAGAAAATT
AAGACTTTTGCGACGAAGAGTATTTCAACTTATTTTATTTTAGCTTATTT
TTGGCGAGAAGAAATATTTTGAAAAAACTTTTGTGGTAGATGGTGTATCT
TTTGCCGAACTAAAAATATATTTTCGGAAAATTTTGAAGATAGATTTATG
GTCATATTCTCTCGATTTATTATAGATAACAGCAGAAGCGGCTTGGAACA
GGTGTCGCTTGATCACCGAAGAAGCGTTGGAGAAGTTTGGTGAACGGTTA
GACTTCTTGGAGAATGTGGCTGCATGGGAAATCACAGCTGAAATCTTATT
GGAATTCCAATCGCTGGAAGAAAAGAAAGGTGAAATAGAGGTCAGTGGTT
CTTCTCTTTTCATCTTTCTATTTTGGCGCATTATCAAATTTCTCTTATAC
ATTTGATGTTGAATTCGGCTAAACAGAATACGTCTTTTGTGTTGACTCTC
TTATTAGAGAAGAAAATAGAATTGGACGTATTTAATTGCATTCTTGAAAA
CTGACAAACAGCTTTCAGGTTTTCAAATATGTTTGAATTAAGCCGAAGCG
GAATGAAAGCCCAGCAAAAGTCTAATGTTTGTTCGCGATGCGTATACTTC
GTACTGATTGTGACATGGTGTTGTTTCTTCTGAAATGAACTTGAATTGAC
AAAGCGCTGATTCTTCAAGACGGACTTACAGCATTGCTGACAGCGACTTA
CCAATGAAAGGCCTGTCTATGCTGATTGGCCAAAAATACAACTCGCTCTC
ATTTTATGCTTAATTCTTCAGGCTGGTTTGTTTGAAGTTGAAGATTACGA
TATTGAAATCAAAGAAGTTGCCAAAGCAACACAGAACGTCGCGCAGTATC
TCGCTCCCATTGAAGAGAGAGAAGAACTCAAAATGAAGATCGTTACTCTA
AGACGACGTTATTTCAAAGTTTTACAAGAATTATGCAAGAAGAAGGAACT
TTTCAGATGGTTGTTACCCTTGTTAGAGCAGTACCGCGACCAAGGATGTG
ATATTAAGAGTTGGCTTGATGTCACGGAGTCACGAACTGAATTTCTCACA
TCAAATTTCAATAATAATGAAATTATTGTCAAAAATGAAGATTTGATCGA
GGTACTTTCCTATGATACAATTTATTACCACAATCTATTTTCAGATACTA
TGACGATATATAGCTTGCTTAAATTAGTTCTCTCTCAAAAGTCTCTAAAT
CCTATCTATTTTCGGACCAATCGCGTGCGGTTGCGTCGCACGGAAGATGC
TACGGATCCGAAGGTCTGGTCCCCTAATATTTGATCTTTTTTTAAGAAAT
TTAAAATCTTTTACTCTCAGGAAATCAAAGAAGAACTTTTCGTGCAAAAA
GATGCTTACGAAGACTTCTTAAATGCCAGTGAAGGAATCATGGATTTGTT
ATCAAGTGATGATGACGTCATCATTCAAATTCGGACAGACCATGACCACG
TGGTCTCAAGATGGGACACTTTGTGTAGCAACATTGAGAAGTGTTTGAAC
AGATTGGTATATGCAAAGAAGGTGTTATCAGAACAATCGAGAACGATCAA
TACCGACCCTGAGAAGATCGAGAAAAAGGTAACATATATCCAAATTCTTT
TTCGAGATTGAGTGAACTTAATAATCAAGACGAGGCTGGACAGTTCTGCT
TTCATGACGGTTGACTGGTGAAAGTCTTGTAATGTCGATCGGCTTTTTAA
AATAAATAAACCATAAGTGATGAGTCATACGTGGTAACAGAGAGGTGCTA
AACCGTTTTCTCTACAAAAACCGTTTTCTCCGAAAAAAGAAATATTTCTC
ATGGACTTATCTCAATTTAATCCTGTCCCTTCTTAACCAATCCAAAAGGA
CTGTGAACTTTGTTTTTGACGATTGCATCATTGTTGCCATTCTAGATTCG
TAACGAAGCAAAACAATGTACTTGTCATAAACCTTTTCAAATCACTCGTG
TTGGTGAAGGGAAATATACATTTGGAACTTCCAAGATTGTGCGGTTAGTT
CGTGTCCATNTCGACGAACTCTTACTACGGTAAAAATGTAGGAAAGATGT
TTATCACTAACCCCAACTCTGTTCGTTTTATAACTTCTTGTAGGTTATGA
AGTTCTTGATGTGTATTTAGAGTTNGTGTTGGTGGTGGATGGGAATATTT
GTACGACTTCCTGTTCAAAGCTGATCCATGTCGTGGTAAGTCCAAACTCT
TTCTCAAAAAATATTTTTGTTCTGATTTCATAAGAGCATGAACATATAAA
CGACTGGACATCCATCTCCTTTGTCTTTTTGTAGAAAGGGCTGCTAGCTT
CATTGCCGCCTCGTTAAAAGCATAAAATGAAACAATAGATTTTGATGATA
TACCACTTGGGAGTACCTTGCTAACAACGTCAAAACTT

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_043342	XLOC_043342	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_502	supercontig	scaffold_502:166103..177140 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.734809	0.421419	0.443224	0.571501	13.314	11.4209	2.62348	3.34972	1.42408	2.46049	1.24752	1.90043	1.56022	0.966516	2.43769	1.00828	0.58396	0.325772	1.58553	2.06909	1.90787	1.12617	0.776428	1.70048	1.01015	2.31575	0	0.373099	1.79962	2.20676

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00069583 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00069583 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00069583 (transcript) - C. hemisphaerica