XLOC_002257 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_002257
Unique NameXLOC_002257
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000039:219380..244830+

Legend: gene
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>XLOC_002257 ID=XLOC_002257|Name=XLOC_002257|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=25451bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000039:219380..244830+ (Clytia hemisphaerica)
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taaaatttgattattGTCTTGACACACTCTAAACATTTGTTAACCCTCCA TTCATTAGAGAATGACAGGCATCACGGTCAATGGTCTGACGAAGGATGTC ATCGAATCACAACAACCAACATCACTGGCTTCATCAAATGCCAATGTGAT CATCTCACCAACTTTGCATTGATCATCAATTCTGACCAGGAATTTTACAA TCCATACGCAATTCAGATTGTGACATACGTTGGTTGTGGGATTTCAATCG CTTCTCTCTTCGTCACTCTTCTGGTTTATGTCTTCTTCAGGTAAGAATCT CTAACAGCCAGAAAGGGTTATTATTATTGACTCTTGGATGGAAAATGAGG CCACTTTTTCCCATCTGAAACGCGTGAaccgcgtggtttttacacaaaca cccgattgaaagtaaaatcgtAAAATCTTTCGCTAGATTTAGGAAAATAT AATGTGGTAGAACAAAGAAATCATCTTTTGAGACCAAGACTTTTAATTTA AGGTTCTAACTAACTTCTCACTGGAGTTATGTCGACCAAATACTCTGCTT TCAGGGGGCCCCTTTGGAATTTTGTAACATAAATTTGATCGAGTTACTTA CACACTTACTTTTATAAAAACCTGTCAATTACTTTCAATATCTGTTAAGC CGTTCCCGGCATTGGTAGATAATATCGTGCTTTTAATGTCTAAAATAGTT CTAAAAGGGTTCTTTGTGACGCAGTGCACGTGAAAAGATGACCCCCAAAG CAGGTCAACTAAAGATCCTGGAATTTATCTTGCCTGACAATTGCATGCAA TTCATTTGATTTATTCCAGGATATTCAAGAAGGAAATATCTTGGGAAATC AGATTTATGAAATGTTTAATTGCAACTCCCtgataaattatttttagttt gtcttttgatttcccaaagctttctttctatttttttttatggTGTCCGA CCGATGTCCGGTATTTAAGCCTGAACATCAATTATGTTTTTTCCTGCTAT GTTATGTGCCTTGTCACCTGTTCCTTCtaaaaagattatttttgtttgtt cttttgGTTCTTCCTGTTGGCTTATGACTATGTCAAGTTGTTTTGTTTTA ATATCTGATGGTATTGCGCGGGAGGGTAGTTGAAATCATCATTCCCTAAT CACTTTAATACCCGTTatcaaagaaatatatttttcaataatattataat ttttttaactgcTGTGGACAAAGTTTGCTCTTTGCATAAGAGAGCTTGAG GCTGATTATAAATTTGTGATATCAGATACAATTAATCTTCCCGTTTCAGT AAAATCAATCGTAAACTTGCACCAAAGTTGTTAATCTGTTTATCATCGTC GCTATTGATTCTtctcatcattttcatcatcggAGCTGAACGAAACGCCA AGACGTACCACGTGTGCCAGTTGATGGCCGTTTTGATTCACTATTTCACT CTTTCCACTTTCTGTTGGATGGCCTGTGAAAGCTTCAACTTGTATCGAAA CttcattaatattttcaaaCGGACCCGTAACGAGAATGGTATACTGGTGA AGATGTCGCTTTTCTCTTGGGGTGAGTCTCTCCTAACCTTTGTAGATAGA ATCTGAACTTTTTGCTTCtcctttaaagtttaaagttctcaaacaaatga aaatgaaaatttccccTAGCCCTCAAGTAATTAATCTTTCATTTTTTCGT TATTCTTTCTTTACGTCAGTCTGCATCATCGAAAACACATTTCGCTTCCC ACCTCCTCCTTCCTGTAAACTTCATTCATCATTCTAACTTCACTTGTTTT TCTCTCCTCTCTTGTATAGGTGTTCCTCTAGTCATCGTTGTCATTACCAT GGTAACAAGCCTCGAAGAATATGGCAACGCATATGTGTAAGTCTTTTACT CTCCCCAAGGCTAACCAAGTCGTAATATGGTTGTCTTAGCTCATTCTCGA CTTTTACCGAGGTTGTACATCAAACCTTTTAAAtttcatcttattttttt tctagatgTGTTGTGCACGGATTCAGTTTTTACTATGGTGTTCTTTTGCC CGTTGGTTTGATCACCCTTGGCAACTGGATCGTCCTAGTCCTTTCCCTCA GGGGTATGCGAAGAGCGAAGATTCTGAAACGAAGTCGAAGAAAACGCGAC CAAGAGAATCAACAGTGGTTACATTTCGTACGCGCCGCTACTTGTGCTAC CATCTTGGGTTTGACGTGGACGTTCGGTATTTTAGCAGTGGGTTACCTAA AGACAACTTTCCAATGGTTGTTCTGTATTTTCAACTCGTTGCAAGGGTTC GCCATATTTTTGCTGTTTGTGGTGAATAACAAGGAAGCGAAACGCGAGAT CTACAAATGGTACAAGGGAGAACGATTGAATAGCGATAGTGCTGAACTTT CGAGTACTGGAAAACCTGCCtcaaatttttgaatgaaatatgCGAGTGAA CGAGTGATCATGGAAAAATCTCTATGAGTAAATATTTTGAGAATTGAAGa caagaaactttttttcaaatcagCAATGTTTTGGCTAAAACTCGTGTAAA TTTCTTTCCACGAGAGTTTCTCCCATTTGAAAtagatattttttcataag aagttTTCTTAACCAGACAAGTAAAAAAATTAGTAATTCCTTCCTGTTTT A
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00004017TCONS_00004017Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004018TCONS_00004018Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00004017-proteinTCONS_00004017-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000039supercontigsc0000039:219380..244830 +
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
ADGRG5probable G-protein coupled receptor 114 isoform 1 precursor Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
2.21 1.87 1.94 1.42 0.29 0.28 0.37 0.53 0.39 0.71 0.55 0.27 0.55 0.8 3.13 2.29 0.8 0.72 0.41 0.29 0.41 0.52 1.33 1.58 1.1 1.47 0.28 0.13 0.92 1.01