|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at scaffold_126:161655..171090+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_030153 ID=XLOC_030153|Name=XLOC_030153|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9436bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_126:161655..171090+ (Clytia hemisphaerica) AGTCGATGGTCTTTTGCTTTATcattcgggtctgtaaaatactacAATGT
AAAGAAAACAACATTCGAAATTGAAAATGGAAACACTTTTATTTATGCGA
TGTTTGCACTGCACCGCCTTTGCTCCTCAACAGACAGAAAACAAAACTTG
GGACGTTTTatgaaaagatattaaattatGACACTGTGTACACAAAAATA
ATGGAGTGTCTCTATTGTAtgttacttttattttaaaaatcacagAGGGG
GCTTCTTTCTCTGCAACTAGAATCTGATCTTTAGACATGCTCTCACTTTT
TTCTGATCTCtaaagttttgtttacaaacattttttaattataaTATTGT
CTTTACAAAAAATGTTATGTACAACAGCTCAGTTCAATCAGTATGTCCTA
tcttgttttgtgtttgtttacAGACAATCTCTTTCCACTCTTTTAGAGGT
TTTAAAGTATATATAAAATGGCAAAAGTAAGAAATAAGAACTTCCTgaca
gaagaagaaaaagatttatttgATGGATTGACTGCAGATGAAATTGCTGA
GTTCAACCAAGATCTTGATGAAAAAGATGTAAGTTAATGACTTTCTTAAA
TCTTTATTTTATGTTTAGTTTTGTGTacagtaccgtgagtggtctaAACA
TATCAGTTCAGGAAATTGCTGAAAATGACAGTGCAGCAAGAATTCTGCAA
CTTTAGCGTTGTCATATTCTGCAATGTTGTCGAATATCGCAGCTTTTCTG
CTGTGAAATTTGACAACGATTGTCCTTTGAAAACCAAGAGAACAGGGTTG
CAGGAGGACCTTGTCGACGCACCAGACTGTCCGGTATATTTGTCcagtgg
caaaaagtatcctttcactacaccggacgcaataagtccggtgtcagtcc
ggtgttgcatacagggaattttggatgccggacatttatgaaacaaaaaa
ttaagaaaCACCGGACGCaccggactggtcatgtccggtgttctgattgt
ccggtgggaaaaaatatccttctctgacaccggacatccgacttccttaa
gtccagtgtagaaattgtccggtggtaaaaaagattctcattttacaccg
gactttcgcgtgtccggtgttcgttaagtccggtgcgtccgtaGGGTCCT
GTTGCAGAGTGACGAAAGGGGTCCCAAAATCATGTGCATTTTGTAGAACA
ATCTGAAAGTAAACTTTtcactgctctaacttgggacggcaattcggcca
ccatttcaccgaacctccaaagtcatttgatttgagttaatgcaGGTTAA
TGAACtgcatatttaaaaaaacacgatttctctttcgcaccgagtagact
tttaaaatcgaaatatgaaaaaaagatcTGTAGTGGCAGGTAGTGGAAAA
CACGCAaatgtctggaacaaagaagaccaaattagtggcaaaacgatgga
gcatttgacgtcactcgcgcagcaagttacacactcgttatttgttaatt
cCATCGGGTGATAGACAGTTAGGCGGCAGttgttctctaattctccaatc
ggtgTCTGGTCATTtggaataaaaacaaaaaagttaaaaagggcgcacta
tcaatgaaagttattgtggcatgttatgacagaaagaatgattgataaac
ttggtggagttatcaaaacaaacttgttgccaaagagatttaacagtgaa
aatacaggccagatatcaacagtcccatgtttcgaccaatcgtcccaagt
tagagcagttgacggtaaagaTTATTAAAATCATTAAGAGAGTtatttat
tattgttattattattattattattatttttatttattattagtTTATTT
AGTAATGCAGGTTAAAAAAAGGCAGTACAAGACTGATGTGGACCTACTAT
CTTACTACTTGCTATTACCTACTGCTTAAAATTTTACTATACAAGAGAAT
ACTAGGAGAACCCACTAAAATGCAAATCTTAAGATTAGTAGAGCTTAGTT
AGGGCCTCAATCATCCTTCTGTTATGctttaaatcaatcaattcaaTTTT
CCAATGATCATATTTTAGTAAAGTACATTTTAAAGAGTTCACTGCAAGAG
ACAAGACTGATTCCCCTACCCTACACACGTTTTTTAGCAAATGAGGCTCA
ACATTTTGTGAGAATTGAAAATGGTTGACCGAGGAATGTAAAATTTAGAA
CTTGTTGGAacactcattttgttttgttcacaTTACTGCTTTGGATGGTC
TGGGGCTAGATGATTGATACCATGCTTATGAAAGTAACCCcatttaatga
aaatggaaaaataaattcttaaaaataagatgatttaacttgaaaatttt
taggaaGATTTATTGCCTGCAGGACTTCGTGGAGAGGACCAAACAACCAA
AGATCCTACTGGACCGTTTGATCGTGAAAAATTGATGACATATTTGAAGG
ATGAGGCAGTATCGCAGCCTGATCTGCAAGATCCACATTATGTacctttt
gaaaagaaaacgagaggaagagttttcaaaaagaaagaaaaatcaaagac
tACAACCCCTTTATTGCCAGACGATCTAAGTGATGTTTTGGACGCAGCAT
CTGAGGATGATTTATTAGAATTAGCAGGTATGCTTTTAGTATTATTTAAA
TGCAACAGAAATTTTCTTCATACACAGCACCGATTCTAGGGTCAGATCTG
GAAGTTATATTTTAAAACTCCACCTTGTTTGGTCAGGTTATGATTTATGC
TTTCATGAATATGCTTGTCTTATCGAGTACGCAACAATAAATAATGCTCA
GTATTGGAAATATTGTTACAATGGACAGAGAATCTTGAAAGAAGCCTTAC
TTCATTGACACAGATCATATAAGActtattttttgagttttttttatgTA
ACAAAATATCAAGATTTATGTGgatatttttttggtttttgcagATGACA
ATCTGTGGAAAGTTTTGTGGTTTCCCAACTGTTGATAAGAagagaaattt
ttctctttctttaagatgtttttattgaattttttataaaGCTTTTTCCT
TTTAAATCTATTCCAAAATGATTCATAATTTAAATCCTTTCTCATTTTCG
TGTAGTTTCATAGGAACATTATAATCacactttttttcaataatatgCAC
ACTTAGTACATTATCCTCACACCTCAGCATTTTACACTAACTAGCAAACT
AAGTTTGTAATAATAAAACTTTGATTCAATATAAATTCCTTTTTAACCAG
TCCAGTTAGAACTTAAAAAATTCAGATATTAGTTTGGTAAATACAACTTT
ACTAATTATTTTTATTCCCCATGAAGTTTCTTTTTgttaaaagaatttat
tttgtctttactcacaaaatggtacaATTAATTTTCAAGTTCAATGGAGt
atatttaaaaatctttgaaagcAAAACTTCAAATTATACGATGACTCTCG
TCCCTGATCTTTCAAATCAGTCACTTTGAATTACAATATCCATACATGTC
TGAAGCCTTTTTTAcaacgtttttgtttttgctatcGATTTTGACCCCAC
AGGACTTTTATCGGGGGTATTTTGCATTAAAAAGCAACAATTTTCTACCT
GCTTTATTCCAAATACAGATACTTAAATCCCCCTGTTGAAAATCATTAAC
ACGTCACAAAATTAATTGCAAAATAGGGAAAAACAGCACTACTCCAAACA
AATTTTCATCAGTCATTATGTAAATTCtacaataaaatataatcatGGTA
CGGTTTCACTtagatttttaatatttatctCCATCATATTTTTAGCTGTT
TTGGGTATTCATGGTATGCTGACACAAAAACAAAGTGAAACAGCTGATGA
AGATAAAACATGGGACTCCTTAAAAGGATCTGGACTTAGGAAATACAAAG
GCGGTAAGAACTTGGAACTTCTTCTCCATATTGTTATGTGTATTTACATA
TATTTTCGGCTATTCTAAGCACTATGTAATACAATAGACCTGGTCCTATT
TTTAAGTTTGATTATAGTAAAAAAATTGCAAGCTGCATATTTCTGACCTT
ATTTTATTACTTACTACACTTATCACCCCACTGTAATTCATATCCCATTT
GATTTATTCTACTTTTATACTAAAAGTCTATCCTAAAAATCTATCCTCAA
GGTATCACCAAAGCCACCAAGGTCAAAGAATACACAGACAACGAGGCAGT
CAATGAGTTGGACATGGAAGAAGCATTGGCTAAGCTGAAAGCCGGTGATG
AAACACTGGAAGAGTTGAATCTGAACAATCACCAAGAGGTCACCGAAGAT
ATTCTAATGGATATTGTAGAGCATCTGAAAAATAACACTTCTCTGAAGAA
ATTACATTTAGCAAACACACAAATGAAAGATCATATAGGCGAGGTAAGGA
AAACATGACTATTTGATAATAATATCCAGGCATAGTCATACCCATACATC
GTCACTTAGGCGAGGATCTAGATGCATTGAGAGCTGAAATTGAGTTAAAc
tgaggaaaattttttttcagggttGCTGCACTTGTTAATTAACCTTTTGC
ATTCACTATGTCTTTAAAACTCAAGTATTTTCCTAGAAAGTCTGCTGAAT
ATTGACCTCTTTTAACTTTAAGCAAAAGTAGTTAAATAACTGTTTGTTGc
attatttgcaaattttttataatgaatgaatgctaaaaaatgcataaaat
gaGTTTTGAAAGCGACAATCAGTCTACTTTTGTCACTTGTTCGGTGGGTC
ACAAACTACCTTTTGATAACATTATTTGCCTGCGAAAGTTTCTCTCACAC
TCTATATGAAGCTTTTCTTATGAAGATATCAATCTAATGAGATCATttca
aaataaggaaaaaagaTTAATTACATTCTAATGGGTGAGCAATTGAACTA
TCATTTAACATAGTTGCATAATTAATTACCACGCGTATTAAAAGTTTAAT
TGTGTTATCATACAATAGAATCTATTAATGACATCTTACACTGAAGagtc
attttactgaccagattCCTGGCTCTTAATCTTTCTTTCTGTCTGACTCC
AGAATTCGAGACGTCAATATTGAACGCTCTTCATAGGTATATCTGGTAGT
TACAACCAAGGGCGAGAATTCAAGTAATTATTTAGATTCATAATAATGTT
AACTGTATCTATTCATCTTTTGTGTTTTTTAGGAACTTGCAGAAGCTCTG
AAATCAAACACCACTCTGgagattttgaatttagaaTCCAACTTTTTGAA
AGCCGAATCCGTGATGGTGAGTCATGCTTGcaagtttttgataaatacat
attttttacaagaacatccaaaaaaattcaGGTCTTCGGATGCTCctttt
gagttttgagcctaGAAATGTTCCTAAAATGAATTTAGTGAGTGTTTTTG
TGCGAACTCCTAAGATATTTGAGtctgtaaaagtaaaaaaaaaatagttc
ttAACTTTTACTTAATACTTTGaccctcgaagccttatgttcttatatat
agcTTGGTCTTATAAAAGACGTGTATTTCATTATGTTTTAAACATTTCCT
TTatatcaaaactttcttttgtaCGATCAAgtacttctattattcgaatc
tttctgtaattcgaactaaaatattggtcctctcAGCTGAAAAGTGTTAT
AAAgtactctataattcgaagaacatttttggtcccttgaagatcgaatt
agtgagagtcaactgtatttcaGTGTTGACAGAGTTTtactttaaatctt
taaaacgtTAAGATGTAAAACATTTGATTAACAATGAGGATTCCGATTAC
GAAATATTTAAACCTTAAATTGGAAATGAAAACATGGTTAAACATAGCTG
CTTGGACTTCAGTGGTTGTCACtgtcatgattattacttctctcatttga
ccgaaattaaTCCGACAATCATTTTCGTattaattcaaaagtcgtgaaag
ttagtactttttctttgtaattgagtgtaatttgcgtgcaagcaTAATTA
ATGCAAAGGGTAATGGGATAGAATTtcggtcaagcaaaaaaataatgtca
atttttagattCTTCATGGTATTCTATTTGGAAAAATCAATACAATATCT
TTGACCTAAATACCACTTTTTAAAGGATGCACATTCTATCTATGCAAGGT
AGATCCATctaagaaaattctttttgtttgcAGGCTCTTCTTAAAGTGAT
AGAAGTAAACGAATCATTGAAAGAATTGAAACTAGCCAACCAGGTAAatt
tacactttctttattGTTACAGGGTTGCTACGCCTGCAAGAAATGTCCGG
AATTAGTAAAAGTCTGGAAATGACTGGAAAAAGTCTGAAATTGGGATACC
TGTCTAGAAAAGTCAGGAATTGGTATACCTGTCTGATAATAATAATCTGG
ACTTTGATGGAAAACTTTCTTAATGGATAAAATGTCTGGAAAATATCGGG
TATTTTGCGAAAATGTCTGGAACATTTTTGGGACTTTCAGttaaaaatct
tgagaaaaggtGGTTTGAGACTAAAAGTCTGGAATTCTCAATTTGGCAAA
CCTGTAGCAACCCTCTGTTAAGAACTTTAGTTAGTTCGTGCCCCTCTCAC
TACGTTCATGGCGATTGTCTTTTAGTAAATCCCTTTCTATTGCCCAAAGA
CCATCTAAAAAATGAGTTTGGTTAAAAGACTCAAATCCCTTTTTTAAAAC
GTTATATTTATGAAATTCAATGAAGAAGGTTACATAAATGATAAGTtctc
aattttaattttcatttttcagtacAATAAAATTGGACACAAAGCAGAAC
AAGCAATGGCAAAATCGTTGGCTAAAAACACGACGATTCTGAGGTTCGGT
TACAATTTCGATTCGAGGGGACCAAGACACACATGTAACAAATACGTCAT
GAGAAATAATGATATAGGTAAAAATTCTTCACTTTTGTTTCCACTTAGCA
TTTGTATATTGGGCTTTTCTAGGGAAAAAACcgccgtataccccctgtta
aGGAGGTCCATTtctctgtggctggaaatgctgtaaccccctgAAATTCC
AGAccatttcaggtttaaacctctctggaattctgaattttagtaggatt
taaaaagcttccCCCATGGAATTCTAGTTATTTTAGACAGATTTTtatat
ctccctatggaattccgccacatatcaaaccttacccccttggaacggaa
atggacctcctcaacaggagTATAcggtttttctggaaaagcgcAATAAT
CTTTATTCCCCTGTCTTCCCCTGTCTTAGTTTGTAAGCTCTATCCTTCGG
TCGATACAAATGCTAATTTTCTTGGTTTTGGTAAACGCAATCTTTAACTA
AAATAGGGGTTTAATTTGAGCTGGTTATTGGTGGTAAGAAACAGTTCGGT
AGATTTGTCATTTAGTATAAAACTTTTTCCATTCAGCAAAATAAATCTAC
GTATTCGCTATAAGTCGACTTTAGTTTATGTGAAAATTTGACATAGAAGT
TTGGTCGTTCTGCGGTACTTCGCTTTTTTCATCATAAGTAAGGGATAACT
CTCTGCTAAAGAGTAGATCCAAACAACTTAAGTTTTATTAAGATCCTTTG
ATGAGAGAGGTATTTCGACAAATCTCTTCAAGTGTGATTTTGGATTACTT
CTAATAAAAATGTGTTTGTTTGGTAGCAGGGGGGTTGTTTGCTTTTTTAC
CGATGAGtctcaaaaagttctttttatAACTAATATgataattttcttga
ttttgccTCTTATTCGAGCCCCCTTCTGAAGCTATTTTGCATATTTCAAT
gatattatgtttttttatagggATCTTTTCTTTCACCTCCAAATGAATgt
gatgattttttttacacCTCCAATAGCTTATAAGAATGTTCCGAttttct
cctctttcttttcCTCAAAAAACACAGACccgaaatataatttttctcac
ttttcgtttattttacagaccgaCAGAAGAGGCAAGAGGCGAAAAGACAG
AATGGAAACTGAGACGATTGAACTGGTATAAAgctttcaagtttttgttt
ttgtttgaaatggaGATTTTTATTTCCCCTCAAAACATCggtggaaaaaa
agaaaaataactttcaaGAACTGCTTTAAATTATTGAATGGATTATGTCC
TAcagtgaaaaaaagaaaaatatatctaGCTAAGAGGTCTATAATTATGG
AATTGAGAATTGGCGATCCCAGAGTATCTgctctttcctttaaaaatctg
aaacacGACTTAATCAGGTTATACGAAACATCCCTTACCCATCGAAAACT
gtaaaaatgaatttatttttaaaaccgAGCGATTCAATTAATTGTTTTGG
AATTGTTTAtagaaattattattattattattgttggAATTTAAAACACT
TTGCTTGATTTTGATTGGATGAAAATTTGGACTGTGGTACGGAGCTATTT
TACCCGGCTTgaagttttaaaatttcattgaaagttAAAATCCTGAtttc
tttgtatattttttaagcttttaaaGCTGTGAAAATCAGTTCCTTCGAGT
TTATTGTTTTCATCTTATCAGAATAAgcccaaattcttatttttcatttc
ttaatGCGAATATTTAACAAGGAGATAAACGCTGAATGTCACATTTGATC
TTCAAGAAAAttcgaagtttttttaaatgttaaGCAATTCTCTTTGTTTT
TGTACTGGAATTGATAAAGTAGAAATGGAATTTAGAATGATTTTAGGTTA
TTTTAGTTATTTTAgacaaattgaaattaaaatgcaATTGAACGtagatt
ttttctttaattttcagaGATAAAATATCAGTGTTACatttattttgagc
aattttgatttttcctctttattataaattcattttAAAGCATCGTGATT
TATTTCACTTGTATATTTCTTAGTTGTAGTGTAGAGGGtgctttaatttt
ttcaattgtttAGGCCTAGATTATATTGACCGATATTGATTTGCTATTAC
ACcttagaattttttaattttagtatCTAATGACTTTGAAGGGATAAGTT
GAAACAGGTTGAAAAAGTTCAAGTAGAATAATTCTATTTCGAAACAAATG
GAATATTTCCTTATATTTCTTGTTTTTACCAACTAAATCTCAACTCTTCT
ATTCCTCTTAATTTCAAGAACCTAAATTATTGTTATAAACATATAATATA
CATTTGAAATTAAAAccattttttaattcattttcggTTGTGAAACGAAA
AATTCGTAACTTAATTTTAGATTGCGTCACAAGTTGTTTAGcggtaaaaa
atgaattttattaggagagatttattatttatcaaagaaagtaaaaaata
taattttaatttttttatcgtttttttgtgtttttgtatgtacaaaacaa
aatataaaatatacccACTTTATTTTtcgttaaaaa
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_126 | supercontig | scaffold_126:161655..171090 + |
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog Name | Description | Organism |
TMOD2 | tropomodulin-2 isoform a | Homo Sapiens |
TMOD1 | tropomodulin-1 | Homo Sapiens |
TMOD4 | tropomodulin-4 | Homo Sapiens |
TMOD3 | tropomodulin-3 | Homo Sapiens |
|