XLOC_030190 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_030190
Unique NameXLOC_030190
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_127:31269..54521-

Legend: gene
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>XLOC_030190 ID=XLOC_030190|Name=XLOC_030190|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=23253bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_127:31269..54521- (Clytia hemisphaerica)
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CCTAATATTCTTTCTCATATTACAGGTTCGATTGAAGTGAATTTGACGAA CAGTGATTGGTTCATTGGAAATTACAAAGCGACTGGTTTCTACCGAACAT ATTATGACAAAGAAAATTGGAGGGCTTTGTTGAAAGTTCTGGAAGATAAC CACGAGGTCGGATTTCTCTCTAAGTTTTGATACGCTGCAAAAACACAATC ATCCTTTCTTTTCATTTCGGGTACCTTAAAGGAAGAAATTTTGGCGGGAA TTTAATTTGGCGGATGCCCGAAAAAGTTTTTTAGAGGGAATTTAATTTGG CGGACGGACGAAAAAACTAAATTTGGCGGGAATTTAATTTGGCATTTGCT GAAAATTTTATCCTAAAAATGGCGTAAAGACAGCAAAAAAAATGCAAAAA CACCTTAAAAGAGATCATATTTTCAAAAAGTTTAATTTGGCGGGAATTTA ATTTGGCGGTAGGTGGAAAAAAGAAATTTTGGCGGGAACTTAATTTGGCG GATTCTGGCTAAATCCGCCAAATCCGCCAAATTTTCTTTCCGCCAAAATT TCTTCCTTTAAGGTATACAGTGAACTCTACCTAATTTAAAGTCGAACGTG AACTTTAATTTGCTCGAATTACAAAAAAAAATAGAATCATAGAAACTATT TAGGAGGGTTTCCCTTTGACAGGAAAACTTTTTCGATTTATAGAAAGATT CAACTGCTGTATGTTTTGAGATTAAGATGTTTTCCTTTTTCATCTGTTCT TCAGTTGTTGACATTTATATTTTGATTTTGCAGACTTTATCAGTTGTTGA TCGTGCAAGTCTTTTGAACGACGTCGCTGCTTTCTCTAAGTAAGTTGATG AATAATGTTCCGTTACAGTTTCATGTTGGGATGACGTCATTCTATTGGGT CTATTTCTCCCTTCGATTTTAGGGATCAATAAAAAACCTTTTATGAAAAT CTTCAACAACTTCGTTACCGTACATGCAAAAATCATCCCCTGTGATCGAA AATTTAGGTTTGTTCTTGAATCACGTGAATATGTATTCGATAGCCATCGA TCCCTGGGAGCGAGGTTGTTCCTTTGCTAACTGGTTCCGGCAAATTGGTG AAAAGAAATGAAAATTATTTGAAACAGGTACTTTAATCCATGAACATCTT TTCTCTCTACAGTTTCAATTTCATGGAACTGGCCAGTTCATTGGAGTTCA CGACGTATCTGTCGCAAGAACGACATCCTATTCCCTGGGGTATTGGTCTT GGCCATATTTACATCATCCGTGGTTTGTTCTACGAAACAAACCTCAAGAA ATGCTTTGATGTAAGTTCGCCTCATTTCTTTAAACCGCCCACCCCTTTAT TGCTAATATTTATTTTCGAGAGACGTAAGTCCGAATCGAGCTCATCGTAT TTCATGTATTAAAAGTGTTATCAAAGAAATGGGATTTTTTTAACAGTTAT TCAACCGTTCTCCTTCCTCATTAATTCATCGAACTCACCATGAAATTTAC AAATGAAATTTACTAATGAAGTTCCACATTTTTAGGCTTACATTGACAAG TTGATCAGTCCAGTGCTCGAAGATTTGAACAAAACGCCAAAACACACTCA CCTACAAAAGTAAGTCCAAATGTTGGAAGCAACAAATAATCGTGTCGAAA GCTGTCGAATCACAATGAAACCCTCGAATTACAGAGCCATTCGAATTATA GAGAGTATTTTGCGAGGCCTTCCTGCTGACGCGATCTGAGAATAAATTAG AATTATAGAAAGATTCGAATTATAGAGGTTTGGATTAGCTAGAGGCTGAT GTAGGCTTAAAAAATAACTCAACTGTTTTTATATTACTTTTTACTCTCAT TGCTATAATCGTTGTTCACGTTTGTAGGCTGTTGATCACAAAGTTAACGT CAGCAGCAGTGACCATCAACAAACAACCTCTCACTGATGAAATTGTCGAA AAATTTCTCAAATATCTTGTCAGGGATGGAAAGTATGAACAATTATTTTT GTATATAGAAGGTATAAGAACATGTAACGCAAGGCTTCCTTCTGGATCTC CTGCTCGGTTAGGGATTCGTTAATATCAAAACAAACATGGGAAGTTATCA TGTTTTTGTTGGTCATAAGGTTTAACATCGAATTTTGCGAAACCGTCACC TCATCCAATTTGCAATTATAAATATATACTTAACTTGATCTCTTTTCAGT TACCACATTCCAGCTGACTTGCTTCTCACTGTTTTCTCTGCTGGCATCAA ACACGGCCAAGCTTATGAATGGGACGCTCTGATGAATCGATTCAAGAAAG CCAAATCCCTGATGGAACAATCGCTGATCTTAAACAGTCTCGTGGCCACC ACCGATAAGAAGTTGTTAAAACGGTAAAAAAAACGACAGCCTTCATAATA AGCGGCAGATTCTATTTCACATGCTAGAGTAGATCAAATCTCACGAAATA GAATATTCTGATCACAGTGTTAATGACTAGACTGTCAAGGAGATACCGTC ACTATTTTTCAAACACCTAAACACTGACGTAAAAAAAGGCTAATACCCTC CCCATGTGAAGTTTGGAAAGCATTCGTCATTTTAATTTTTTTTAGTTAGA GAGAGAAGGAATATTCAATGACAGACTTTATTTCTCGATTTCAGATATTT ATCATACGCAACAAATTCGAGTAACATCCCTTCCTTCATGGCTCAAACTG TGCTGAGAGGGCTTTGCGCACACCATGAAAGTCATGCTATGGCTTGGAAA TATGTTCAAGACAATTATTTGGCGTTAGATGCAGAGTAAGTCCTGGAAGA TTTTTTCAAAAACATCAAAAACGATGATATCATATTTGTTTGGTGAACAA ATCGATACAGAAAGTGCTTCATACCAACCCTCGAGTTTAGTCCCCCACTT CAACCCTTGAGTCTAGTCCCCCTTAGTTACTCTAGTTCATGGTAGACGAG AGCGATTCCACAATCTTGTGATAGAAGAAGCCATGATAAAGCTTTTTTTA CTAACATTATTTTTTGTTTGAACGTCTAGGAATTCAGCAGAACCGATCTT GACGAGATATTTGTTGAATTCATGCATGCTTGGGAAAACACAACAAGACC TTGATGAGGTGAGTGTCTCAATGAATCTGAACGTTTTTCATTCATTGAGT GGTCTTGACAAATTATCACTTATGATGATTGATACCATTTCATTCATTAA GATTATTCTTACAAATGTTCCGCCAAAATGTGTTCTCAGTCTCAGAGGCC ATGTTGCTTTCTCTTGACGTCAGATTATCAAGTTTTTCCATTTCACAACA TGGCCAACAAGTTGGGTCTAAATGTCTAAATTTGAAAAGCCCGATCCAGC CAACATGATCCAGACATTCAAACTCTCTTTTTTTCTTCTTTAGGCTGAAG CTTTCGTTAAGAGATATAATTTACAAAAAGACATTGCTGTCCTTCGTAAC ATAGAGGCCATCAAATATAGCATGGAGCTGATGAAAGAAAAAGATTCGGT TGAAAAATGGCTGAAAGAAAGACATCATTTAGAATGTTAGAACAACATCA CATACACAGAGAGAGATATTGTTATTTATGGGATATAGTTAGTTTACTGC TACTGAGTTATGGTGGATGCAACGAGCTACGCGACACAATATTTCAATTC TTCGGCTATCGATCATTTCCTGTCTGAAAAACTGTCATTGGGCTAGACAA GTGTCAACCAACCTCAATGTTGCTAATTCTCATTTGAAAATCCGTTTTCA TTGAAAGCTAGACCTTATCTAATTAACGATCATCTCGATAGTTAAACCCA AACGTTATCGGCTAACGAGTGCTTTTAAAAAACACTTATTCCAAGCATTG CCATAAACTCCCCCAAAATGTGGTACATATTCGATTTCTAGAACGTTGTA AGTTTTTCTTTTCTTTTAAGATTATTCTTTCAGCGTTTATTTTTATTTTC ACCATCTTTTCAATTTCCATTTTCTTCCAAGCTTCATCGACGTTAGTTTA TTTTTTTTAGAAGAGTTTTTTAGAAGGATAAAATATTTTTGCTATCTTTT TTTTTCAAATTTTTGTAAAATATTATTTTTCCAAAATAATGAAATTCTAT TATGGTGAGAAAACCAAATGTTTAGGCTTAGACTTTTTGGTCGTGTCTAT CCTGGGGCAGAATTATTTTTCTACTTTTTTGACCTTTTTTCGAAAAATTT CAGAAAATTCAGCCGGAAAATTAAATTCGAAAAAAAGTTGCGAGTTTGAG CTAAAGTTACGAGCTTGAGCTAAAATAGCGAGTCTGAGCTAAAGTTGCGA GTTTGAGCTAAGGTTGCTGATTCTAATGAGCTGAATCCACCGGCTCGATT GAAAAAGTGAAAAAGTGAAGATACATGTTATGTTGAAGGCCAACGTTTAC TTGAAATGTGTTTTTATATTGCTATATATCAAAGAAATTTCTATATCCGT ATGTTTTGTTATGGATGGTGGAATAATATGAAGATTCTACGTAAATGAAA ATTAATACAACACAAATTTGAATAATGAGGTTGTTACTATAACGAGGAAC AAGAAGTAACGAGCGCTTAAATGGAAGTAACGAGTACTAGACCTAAGTAA CAAGTACTTTAGTCACGAAATTGACGTTCCATTCTTGCTTTTGTCACCAG TTAAATGTTTTAAGATTTATGACGTCATTTCTAGGTTTACTTTTCGGGCA CCTACCTTATCGGCCAAAACTTAGTCGGCCTTAATTTTAGTCGGCCTTAA TTATTAGTCGGCCCTAAGTTTAAGTACCTCGTCAAAATTTAGTCACTTAA GGCCGACTAAATTTTGGCCGCTATATCTTGTGATTGGCTTGTCTGTTTCT TTTCGAATTGCATCGTTATAGTAACCGAAAAATAAGTAGTGATAAACATC AGTGAAAAACAAGATCTAAATAGTTTCTTATTCTCTCGCATTAGGGCACT GCATTAGATCTTCGATGAGGTGGTGGATAAGGGTGCGGGCAATCTCTATG ACAATATTCCGGAACCATGAATATGGAATCGTCTAACACGTCTTCAGAAT ATGTGTCCGGGAAAAACGTCAGGTTATGAAAGATGAAGGGATTTTGTTTT GGAATTTGTTCGAAGTAGCGGCATGGCTTTTTATCGATCGTTTCGAACCA GTAATCATGTGCGACAGCTCCTTCTTCGTAATACTTTTTACATTCTTTCC CTT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00047405TCONS_00047405Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00047404TCONS_00047404Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00047403TCONS_00047403Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00047402TCONS_00047402Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00047401TCONS_00047401Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00047402-proteinTCONS_00047402-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_127supercontigscaffold_127:31269..54521 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
LVRNaminopeptidase Q Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
102.69 102.67 30.16 17.47 350.1 270.23 307.72 302.78 202.59 259.5 123.64 137.68 96.74 92.76 52.23 53.66 89.56 92.55 55.25 75.05 108.49 101.3 80.34 86.33 69.43 50.04 47.88 37.57 22.3 24.47