XLOC_033853 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_033853
Unique NameXLOC_033853
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_233:675583..687099-

Legend: gene
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>XLOC_033853 ID=XLOC_033853|Name=XLOC_033853|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11517bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_233:675583..687099- (Clytia hemisphaerica)
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GCCCATTTATTTTGACCCAAGTTTTCTTAGATTTGAATGTTTTTCACTGG GTGAAAGTAAAGAATTTTCTTATAAAATGTTATCTAAGTGTATCAATAAT TTAAAGAATTGGTCTGCCTGTTTTAAACACAATCATAGAGGGACGATACT TTAACCTTGTAGTACTTTAACTAGTACTTATTTTTTGCCCGATTGTTGAT CCTCCATCTTTTACTTTTCTCATATTTTGATTGTAAACGAGACTAAAATA TAATTTCTTCTCCTCTTCTCCTCATTCTTCATTCAGTCGTTTTCGAGTAA GGCTATTCTTTTCTGTTTGAATGAAAATTGTGGGAAGGTCCTTTTTGCTT CAGATTCTCAAAGAACTACATTTTAGGTATGTTTTTCACTTTCTTTATCA AAATTACTAGAGCCAAAAGTTGTTTATTAGCAGTGCCTCTAAATTACTTT ATATATTTTTTGAACCACACCCAATTTCTCTTTCCGGAGAAAATTTTTTG ACATTTTTTATTTCGTTGTTATCACTTTAATAATGGTTGACAATTAGTAC TTGGACATGATTCTTCTTGCTGCCCTGTTAATGATTCATTATGAACAACC TTAGCGTTTGCAAACATGTTGGATGGGCGTTCCAATTCACCGGCAGACGA GCTCACAATCTACTCTTTGGTCGTCATGGAAACTGCTCGAAAGCCGCGCC TCGAAACGCCATAGGAGGTATTTAATCAAGGGAAGACAGGGTGTATAAAA CTCGTACCATATTAATCTGGGAATAACTCAGATAACCTGAAAATAGCATT TTTCAGCTTTTTCAGTTCATGTCATCGACTACATCAGTTAAATCACTAGA TTTAGAAAATCTTTGTAAATTTAGTAAATCTTTGTAGTCAGACGTAGTTT GTCTAGTGTTTTTATCAATTTATCAATGGAGAAAACAATAGTTAATTCTA 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TCGGAAAATGGATTGATTACGCTTTCTTATTGGTACGGATAAAGTCTTAT TAAAATTCAACTGATATAACTTAACTGACTTCTCTTGCGTTCGTTTACTT TCAATCCATCCTTAGTCTAGCATGCTAGACGATTAATTCAGAAAGCAAAA AATTATGAAAAGTGAAAGTTTTAGTTAGAAACTGATATTGTACCGTAACA ATTATCGCATTATCATATAACACCTCTGTCACTGTATTAGATGGATCATA AACGACTGTAGTCTAATCCATCCTTTAAGTTTTTGGAATTGTTTGTCATA CTTTGAAAAGTTGTCTTTTTCTTTCTTAGATTTGTGGAGGTATTCCATGG CAAGTGTATTTCCAACGTGTATTGTCTTCCAAGTCAGCTCACCGTGCTCA AATTCTCTCCTTCGTTGCTGCTTTCGGCTGTATTGTGCTGGCTATCCCTG CAGTTCTGATCGGTGCCGCCGCCAAAAGCGCTGGTAAGAATCGTTTCTTA TATTAGTATATTGGAAGGACTCTTTAGTCGTAACCAAAATATCTGTATCG AGAAGACATTAAAGATGATACATCTCTTTACCTTCAGACTGGGGAGCAGT AAGTGGGGCAGTGGACGCCAACCTTGTGACCAACAAAACCGGAGAGTGGG TGATCACGGATACCAGACTGGTCCTCCCCATGGTTCTTCAATACTTAGCT CCTGGATGGGTGTCTTTCATTGGTCTTGGTGCCATCTCAGCTGCTGTCAT GTCTAGTGCTGACTCGTCAGTTTTGTCTGCTAGTTCCATGTTCGGACATA ATATCTACAAGTTGATCATCAGAAAAAATGTAAGCGAAAAAGAGCATACC TTTGTCTCATTAACCGGTTCAGCTAAATTCCAACAAAGCTGGAATGTGGT ATATTAAATTAATAAAATTTTGTGCAAACTTTTCTGTTTTTTTTTTGTCA TTTGTACTTCTTACCTTAGATAAACTTTCGAATATTATCTTTCAGGCCAG TGCCAATGAAATTATTTGGGTGATTCGTATTGGTATCATCTTTGTTGGTA TCATGGCAACGCTGGTTGGGTTGACGGTCGACAGCATCTACGCTTTGTTC CATTTGTGCTCGGACCTGGTCTTTGTCATCCTCTTCCCACAGCTGGTGGG TGCTGTCCACATCCAAGATGTCAACACGTATGGATCCATATGTGCTTACA TAGTGGGATTGTTCTTACGCATCACCGGTGGAGAAGAATTGATCGGGTTC CCGGCTACTTTTAAATATCCTTACTATGACGAGACGTACAGTAATGGGAA AGGATCACAAAATTTCCCCTTCCGTACCCTAGCTATGATTATTTCTTTCA TCACGCTCGTCTCTGTTTCCAAATTGGCTTATTATTTGTTCGATAATGAA ATCTTGGGTGAAAATTACGATTTTTTAGGCGTTTTGGAGCGCCGACGAAA TCTTGCCGGCAAGAAAGGAAGACGAGGTGAGGATGATGCTTTACCGCTAC AAGAAAAATACAACGGATTCGACGACCCAACTCCTCAACAAATCTAAACG TACGTGTCAAAATGATTTGTCAGACATCGCGTGCTACCAATATGTATCAA TGTAGTTTTCGAATATCTAATGAAAGCTTTTACAAGTTTTCAGGTCTCCT TAATAACCATGTGAAAAATGGCCAAGTGACTAGGACTGTATCCGTGATGA CCTAGTAAAAGTCTGACTGGCTTTTAAAAGACAGCTGGATAGACTGAATA ATGCAAAATTGAAATAAGCGTGATGGAGCTCTTTTGAAACAAGACGCTGA AAAGTTATTAGGGCTGTGTTTAGCATTTTAATTATTTTTTGTATAATCTC AAAAGATATTTTACTTTGTATTTTTAATTTGTACTGTGTATTATCTCATT TACATGTAGGCATTCATGGAAATATGTACGGTACTTCCTATCAAATTTTC TTCATTTTTCTTTGGTTTGGTTAACCTCATTTACAGAAAGAAAGTTTTAT ACTCTTTAGCGCAACAC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00053676TCONS_00053676Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00053675TCONS_00053675Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00053674TCONS_00053674Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00053673TCONS_00053673Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00053673-proteinTCONS_00053673-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_233supercontigscaffold_233:675583..687099 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
SLC5A7high affinity choline transporter 1 isoform a Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
322.11 293.76 464.27 474.83 155.3 117.22 116.15 126.95 114.27 170.41 119.09 117.26 254.67 261.03 49.35 48.86 107.48 153.86 127.5 129.09 208.09 209.18 174.59 171.11 127.6 107.87 176.87 182.74 67.59 81.08