XLOC_035651 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_035651
Unique NameXLOC_035651
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_277:106771..133567-

Legend: gene
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>XLOC_035651 ID=XLOC_035651|Name=XLOC_035651|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=26797bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_277:106771..133567- (Clytia hemisphaerica)
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TATTGATTTTAACGAGTTCTCCTTTTAAAAAACGTGTTAAAAAATCTCCC CAAAATTTATATTCAATTTGCTTCACTTTTACAGGAACATCTGATGATAT ATGACGATTTGAAAGAAGAACGGCGTAAACAAACAGAATGGAAACAGACG TATTTACGTTCACAAGTCTCCGTCATGGCGTTCCGACGTAAATTACAATT GTTGCGTGACTATCTACAAGGTGACCATTTTGAAGAACTGATGAAATGCC TTGAAGTGGTAAGGACATTTTTAGAAGAACAAACTACATAGGAACATGAG GCTTCGATGGCTAAAATGTTAAGGATAAGTTAAAAACATCTTTAAACCCT TTAAGTACCGCGGTCATTTTTTTTAAAGAAAATTGCTAGTCTGCGGCTAA GGGGGGGGGGTAGGTAAGGGGAATTAAAGCTAGGTGATAGAAAGGTGCCC AGTAGTAAAACTTCAAATCAATTCGCTAGAGGATAGAACAAAGTAAAGCA GGGCCAAATTTGGAGGTTGTTGGATCACTCGTTGACAAAAAATGGTCAAA AACGGTCAAAATCTTAAAAAAGTGGATTTTTGTCATATTTTTGCATTTTT TTACTTTTTGGCTTAAAATCTCGCTGGAAAGACTCACTTTTGATTTTTTT TGCTTGACCATGAAACCCAATCCAATTCCTACGAGTTGGATCAAAAATGA CGATTTCTAACTCAAACTGGGCATTACAGGAGGGCTTCGCCCTCCTATAT AGCCCATTTCTAGTATACTCGTCATTGGTACTTAAAGGGTTAAGGCAGAT TCCAAGACACTCAATTTCTAGAAGAAGACAACTTAAGCCTGAAAAAATAA AATAAAGATTTCGCATTCCCACCTCCTCCAATTGTTTCATTGATTAGTTA TTAATAAATTTCGCATTGTTATTTAAGGATAAAATAGATAAAATTAGAAG CCTCTGACCTAAAGTTCATCATACTTTGTCTCAAAGCGTGGTAAAGCCCT TCAAAGTGGGTCCATTTTGCCTATTTTGGCTATTTTCAACCTACTTTTCA ACCTGAAAATGAAATCAGCGAAGCTCAAAGTTTCAGAAATGTGCATATTC AACATTTTTGGTTCAATAGAAACAAAATTGGAATTAGATTTTAAAGGCTA ATCAGCTAAAAATTGTCTTTCCAACGAGATATAACTTTTCCTAATACATA CTTTTTCTCCTTCGAGACCAATGTATGAAAATGTGTTGACTGCCAACTTT TTTGAAAAGATTTTGTGAGGCATGAAGATGGAGAAGAATTTCCTTTACAT TTAACCATCGCATTTCTTTATTTTGTAGGGATTGAATGAGCACGAGGAAG ATAAAGACGACGATCAGAGTCAAGATCAAAACCAGAGTAAGTGTTTTAAT GCTAAAGAACTTCAGCAGTGTGAGTAGCCACGAGATTTGATACAGTTAAC CCTCGCTAATTCGAACTCGAACGAGAAACATCACCGTTCGAATTACAGAG AGATTCGAATTAAAGAAAGTATTTCAAGAGAGTTTCTTTTTGACAGGTAC TGTAAACAAGTTCGAATTATAGAAAAATTTGAATAATAGAAGTTCGAATA AGCGAGAGTTTTCTGGACTTTGTCTTTATATGCAAAATGTCGTTCTCGAC CTCTAACTGTTAGCCACTAACTTCATGCTATTATTTGTTACTGACATGGT CTCGGAGTTTTTACCATTCCAATGTCATCATCACCACTCAAGTCTCAATG TCATCGAGAATAATGTCTCAGTGGTAAAGATTCCAAAACATAGACGACCT TGAATTTGCATTTTTTTGATTGGAAGTTTATCGTGGCTTGGATCACGAGA TTTACGTTTGGCTATGTTTCGAGAGATTCCTCTCTCATCTTCGTGCAAGG 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ATTCAGAACATCATTCTACGTATGAAAGGTATTATATTTTAGTAGTAAGT AAGTAGAAAGTCTGCGAACACAGTCGGAGGTGACTCGAAGGCTCCTCTTT CGATAGCTATCTACCCGAAGGTAGGGGAGGGCACCACTCTTTCTCCCTGG ATTTCCCCACTTACCCTTGATCCTTCTCTTAATTGCTGAGCATCAAGTAC CATTTTGAGAATCTTTGTTATGACCTGGTTGAACTCATAACCTTGCAAAC TGTAGCCGGATAATGCTCTACCACTGCACTACGCTATAGTCGCAATATTT TGAATGTACAGTTGAATCTCCATAATTCGAACACTCGTGGGAACACAAAT TTGTTCGAGTTATGGAGTATGGTTTATAAGGCATTTTTAACTAGAGGGAC GAGATAAGGAGACATTTCGAGTTATGATTCAAGTTAAAGAGACTCTATTG TATTTTATTTGCATATTTTTCTTGTATATTGTTCGATTCAGTGATTTTCA AAGAACTTTCTCGAAAATGAAATCAAAGGCCGACTATCATTCCTCTCCGA TGGGAAATTGGCCCGCTCCTTTAGAGCTTTAATGTGGGCGGCCGCCAATC CGCCATCGGAATATCCGATAACTTTCGATTCAAACTAATGGAAATGTAGA GTGCGGTGCTGTATTTCTATTTGTTATTATGAACACCTTCTTTGTTTGAT TCGTTTCTGTATAATGACGTCAGAATGCCTGAAGTTATAGAATTTTGATG TCATTTCCTTGTAAATTCATTACCAAGCTCCTTAAAAGCCTAGAGCGCCG TTAAGTTTGATAGGTGAAGTCAGCTCTAATTTTATTTGTTATTATGAGCT CTCTTCGTTTGATTCGTCTCTGCTTACAACTTTTCATTTCCCTTTCACCC ATAGGAACAAGAATGTCCCCAAGAACTACTATGAATCTATGCCTGCTGAC GCTGGCAATAACGAATTTCTGGAACTCAAATTTGATCAACGTCATCATCC AAGAGGTTATCCAGACACATCCTCTACTACCAAGATCAGTCAACACAAAA CCTATCCGCGTCTATTCGAAACCACCACTTCGTCTCGACCGCAACCCCTT CCTGTAGGGACACCACTTGAAGAGAAAAAGATATGGTGCTTAACATGTGA TGGGGAGGTCACCAAAAAGCCATGTGGTCATTCGAGTCTTGTTGTACAAG AGCGTGAAAAGGAGTTCCCGTGTCCAACATGTAGGCGTGTGTTTAACAAC CGTTCCCATTTGAAGCGACATAATATGATACATTCGGGTGAAAAACCATG GGCTTGTACTTATTGCGATAAGAGGTTCAATCGGAAATCGCATCTGAACC GACACGTTTTGACACACACAGGCGAAAAACCTTTCAAGTAAGATTTGATT ATTCTCCCTTTCGTATTTATCTAATTGCTGTTAGGGATGAGAAATTTAAT GCTTTAAATTCTTCTGTGTGAGAATAGTAGCACCAAAGACTCAAATCCTT GAACTTTCCCGGAACATTCCCGCTTTCTTACCTGGGCTTACCGTTTAAAA ATAGTAGAAGACTCAAAGGCACGGAGAATTACTTTGGTTCAAATTGGAGA CTTCCAAGTTTAGAATATACAGTGTGTTAGTTTTTTTTTCAACTGGGGAC TGGTAGTGAAACGTTAGGCTTCTGCTCATCCTCTAGCGAGGAGTTTCTTT TAGGAAGTATCTATATAGATCTACGATTCAGACTAGTGAAACGTCGGTAT GTACATGTTTCTCTGTAGTCTGATTTGTAGACCTCTACAAAACTGCAGGT AGTATAAGGAGCACGAATCCTTTTGTAAATGTCAGCAGCCTATTGTCTTT GTGGATTGTTTATAATTTTGATATTATNAACTGCAGGTAGTATAAGGAGA ACGAATCCTTTTGTAAATGTCAGCACCCTATTGTCTTTGTGGATTGTTTA TAATATTGATATTATTTTCCCAGGTGTCCATACTGTGGAAAAGGTTTCGC AGACAACAGTGATCTCAAACGTCACAAACAAGTACACGAAAGTACGCCCG GGTTCGTTCCATCTCTTCCCGCCATTCGCCCGCGGCAAGAAGAGCCCGCC CACGCACACCCAGCACCGCCTGTCATTTCGCCCACCTCAATTCAACAAAT GATTTCATCGCACCATTCATCCATCAAAACAGCTGTACCGGTTTTTAGTT CGGCTGCCGGCAATGTCATGATCATGGGTAACAAAAAGAAATCTGAGGCG AAATTCCCGTGTAATAAATGCGGTAAAGTGTTCACGCGGAAATCACATTT AACGCGTCACAAATTAACTCATGATCAAATCAAAATCTATTGCGATTGTG GGCGTCTTTTCAGGCAAAAAGCACACCTTCAAGCACACTTACCAGCCTGT AAACGCAAACGTGAAGCCGTAGAGGCTAAATATTTATCCGAAAACGAAAG TGGTGGTATACCAGGGCGTCATGTAATGTTACAACAAGATTCACCTGCAT CAATGTCTGAAGAAAAAGATTCTCCACAATCGATCCATTTAGGTCATGAC ATTATTAATGAAGAGAGTTTGCCCATGGAATACGAGCACCAAACACATGG TCAACCTTCCCATGATATAAACGAGAATGAGCGTGCACGTGAAGGTGATC TGGCACCAATAGATATTAAGAATCTACCAGTAGGTCTTCCGCCATTAATT CGTGACCCTATCTAATTTATTATTTTGAACTAACTTTATTAGTCGGCACC AATCTATCAAAATGACAAGTACAGTGGACTCCCTCTAATTCGAACTTCTT TTATTGAAATCTTTCTGTAATTCGAACTTAAATCTTGGTCCCTTCAGTTG GAAATCAATGTAAAATGCCCTTTATAATTCGAATATTTCTCTAATTCGAA GAAAAAGTCCCATGAAGATCGAATTAGAGAGAGACAACTGTACTACCTTA ACGGATGGGTAGGTGGTATTGCCTGAAAAGGATATAACTTCCCGATTTGG TTACCTTTACAAGAAGGTCATTTCCAGAGTGCTCAGAGCACCGATCGGAT CACATGCTACCATCCTGGATTTGGAGCCGTTTTGGGAAGTTTTCTACCTT ATTTCCCGTTAAGGTAATACTTGCCATTTCGATATAGTGTTGCCAACTGT TTTATGTCCAGGGTGATAAGTTTTCTGGTTTATTTGATTGGTATTCGCTT GGTTAGTTATGTTCTTTGTCGTCCAGGTGGGATTGGGCACTTAGGCAAAA TTAGATACGGAGACGTGCCGCTGATCAGGGTCCCTTTTTCAGATTCTAGG GATATCTGACAGGGTTCCAAATTTACTAATTTTCAAGATGCGGACCTGTC AGGGTCGATTTTTGGTCATTTTGGACAATTTTCAGGGTGGAAATTAGAAA GTTTTTGAATTTTTCGTCTACTTTAAGCCATTTTTGCCACTTATCAGGAT TAAAATCAGAAAATTTATAGATGTAGATTATATAGATTTTTTGTTCTGAA AGGGTCCCAAATTTACCAAACATTCATATCTGACAGGGTCCACTTTTTAA ACTCAAGTGGTACGTCCCCGTCGGCCGTCAAGGTCAGTGCCCCCCCTCCT GGGTTTGTCATCCTTGCAACCCTTAGCCTACATTTGTCAGGGCTATCCTA TATCCTAAAATTCGCTACCTCAAAATGTTAATTAATTTATATGGTGAGAT ATAGCCTGCTAAGCATTGATTATTGTCCTCCCGTTTGATATTCAACCTGA CCTGAAGTCTCTACTTATGCGTTAATGTACTCTCATGTTCTGTATTTTTC GAAAATAGCGACCACTTTGTCATAGACATATATTTTTTCGGTAGAAAATA TTCGACACTTGTTACCGACGAATAATTTTCGTCGACGGATTTTTTATCAG AGTAATGGCGGCTTTTTAGAGGAATTAAGGCTGGGAAACACCAATGAACT GAGCAATTATTGTAATCATTTTGTCTGAAGTGTAGCACATTAATCCC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00056607TCONS_00056607Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00056606TCONS_00056606Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00056607-proteinTCONS_00056607-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_277supercontigscaffold_277:106771..133567 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.27 1.24 0.38 0.35 1.27 0.92 1.32 1.08 0.56 0.8 0.49 0.59 2.24 2.03 4.34 6.67 1.72 2.61 1.93 2.64 0.83 0.94 1.19 2.02 32.94 17.23 0.76 0.69 2.48 3.18