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Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at scaffold_295:16128..23128- Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_036354 ID=XLOC_036354|Name=XLOC_036354|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=7001bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_295:16128..23128- (Clytia hemisphaerica)
TTTTCGATCGCTAAAAAAGATAGGTAAAAAAGGTAGGTAACTTTTTTTTA
ATGGCCCCAAAATGTAGTTTGCAATTTTAGCGATTTCTCGAGATCTCTTT
AAAATATGAACACAATTTTTTTACCACAATTTGGATATTTGATTGAGTGA
GAGGGTTTTGGGCATAAATTTGTTTGATAAATTTTTTACAATTCACCCCT
GGTTGTTAAAACGCAGGTTTGGGGCCCCCAAATGTTAGGTGTAGTGAAAA
TTTAATTATGAAGCCCAGTGGTAATAGGGGGAGAAACTATGAACATATAA
GAGTTGTGTGTTGTGATGAGAGAAAGAACATGAGTGAAAAAAGGAAGAAA
AGTGGTGCAGAAAATTAAAAAAAAAAAAACAGAAAAGAAGACTAGAAGAA
GAGTCAGCTCTAAGAATTATAGTTTGAATAGCAGACCTCTATAGATATAC
TTCCTATAACAAACTATTTTCGCTAGAGGATGAGCAGAAGCCTATAAGAA
TTTAGTATTAATTTTTGATTTTCACCTTCATGATGGTAAGGCTTTTCGGC
AGTCAGTGCATAATTTCAGAAAAAAATCTATTAGAATAAACATCAGATAT
ATCATCTTTTAACAAGAGAACTGCTTTATTCTTCTCATTCTCATTCTTCT
CATTCAAGTTTCGCCTCAAAATTTTCCGCTTTCGATTAGTAGTGGTAAAG
ATAAATAAGAGGGTAAAACGTACTGGGTTTGTTTTGTTATCTCTTGTTTA
TATGCGCAAATCTTCTATGGCTGTTATTTTTTGGTCTATGGTATTTCTTA
TATAGTTCTTACATTACGTCATTGTTTTTGAAATACGTGCCATTGAACAC
GCATACATGATTCTCTTTTTAATATGATAGGGGCAGTTGACATGTATAAG
TATAAGTTTAGTTTTGCCTTTTGATCTATGGTTGGCGAATCACAAAATGT
TATGTTGGGTATACACCTATTTTGCTATCTTATATCTAAATCATGTTTTG
GGCAGGAGTATATGGAATGTACGTAGGGTAAACACCTATTTTACTACACA
AACATCCGATTTCTTAGTAAAATGGGTAAAAATGGTCGAAAAATGGCGAA
AATAAGAACATATTAAGAACATTTTTAGGCTTAAAACCCAAAAAAATTTT
CTAGCGAAGAGGTGTACATTGCACGCTTGCACTTTTTTATAAGAAGCATT
TTACATGAACAATAATGAGGCTCAGAATGTCTAAAAAGTAACAGCAGCTA
AAAACAATGCTTAGATTGAAATGACTAATTTTTAAGGCACATGTTAAAAA
ACAGGATAAAAAAAGAATTTGAAGTTCATAGTTTAAAAAGATTAGAACAG
ACTAGTCTCCCCGGAACTTACAAGTCCTGATTAAAAATGCGTGTAATTTA
GAAGCCTGTACTGAAATCCTGTTTCATGGTCTTTGCTTGCTGCTTGTCCA
GTCAGTACAAATCTTAATTACCCATCAATGTAGTTTCTCAATCTACTAAT
GACTGTTTAGGTCGTTTGGGAGTGATTTCAAGCTAAATAATATAGTTGTC
CTTAGAGATTAATGGCATTAACGTCGTTTTGATGTGACGCTGACCTAACC
TGACCCGCTCAAGGTCAAATGCACATAAATTAGTGGTTTGCATTAAAATA
ATGTCTTTTTAAGGGAAGCGTTTTATGCTTAGTACTAACAACTTTAAGAC
CGATCATGTTCAAAATTGAATTCTGTACAATTTTTTTCATCCTATACTTT
CAGAGAATATGTAAATAAAAAATAAACAAAATATAATCATGGATGTTGAT
GAGAAAACGCCCTTGGGTGAAAAAGACGCCAAACCTCAGACCGCCCAAAC
GCCACAGACCGCCCTTCAGAACCGCCCACAAGGACCAATTAACAAGCAAG
ATGCTAACTTCTTATGTGTCGTATGTAGTGACCGCGCCTCTGGCTACCAT
TATGGTGTTCCAGCCTGCGAAGGCTGTAAGGCATTTTTCAAACGTAGTTT
ACAGTCTAAAGATTTGAATTATAAATGCCCGGCCAAAGGGAATTGTGTGA
TTGATAAGATGAGTCGTAAATGTTGTCAAGCTTGTCGATTAAAGAAATGC
CAAGATGTTGGAATGTCCAGAGAATGTAAGCTTGTTTTCCTTCCTTTCTT
TTAAAGTAAAATCTCTTTATGGCGTGCACCGCAAAACTGATATACGATTT
TTTGGAATTTTTTTTCGACCGTGAAAATAAGTTTTCACTAAATTAGTTGC
CTCCCCGTTTTCTCAAAGCAAAGGTAACGAAACCTTTTTATAAAAGACTT
ACAGAGATGATTGAAGATTATCATTATCTCCATCATTTCTGAATTTTATT
GATTATCTCCCTAATATTCATTGTTCAACGATTCAATCATTTTTCATTCA
GTTCTTGGCAGTAAAACCAAGAAGGTGAAAGGAGAACGTGGCAAAGATTA
TAGCAAGCCTTCCAAACAAAAGAAAACAGAACAGAGTGAGCAAACTGAGA
ACTTAGTGGAAAGTACAATAAGTGCGAAAGAAGTCGAGCTGGAAAACATG
GTTGATAAATTAAATGTTCTCCATTCTGAATACTTCCTGAAAATCAAAGA
TAAATCAGAACCCGGACAGGATGTTAAAGAACAATTGTGTACAACTGTCG
GACAACAATTAATACGGATAATTGACTGGGCTAAGAAACTGCCAGGGTAT
TGCCAACTAGCTATTAGTGATCAAGCCATTTTGTTACAAGCTGCTTGGGT
AGATTTGCTTGTTTTGAACTGGCTTTATTTCTCAGTGATCTCCGAAGGTG
GACTTAACATTTCGAGATCATGCCATATTACTAAGGATGACGCTAAAGAA
TTGGGATTCGATAATATTCATTCACACATTGTTTTATTGATTGATCGAGC
CAAGAAATATCGAATAGACGAAGAAGAAGTTGCATGCTTGAAAGCCATCA
GCTTAACGAATGCTGGTAAGTCAATTTCCAAGGCTGATTTTTCTGATTCT
TTCAGTTTGATTTTGGGATTGCCGTTTAATTTCTTGCAGGGGTAAATCCA
CTAAGAATTATACTTTCCCTAATTTTATTTTTAAACAGCCAAAAATATTA
TCTGCTGTCATCCTCAGAATTTAGTGAAAATCGTTGTGTCAAAGTGACCT
AATTAAGAAGGAGATGCTAAAGTCCAGAACGATTGTAATTGAAGTAATCC
TTGTGATAACACTTAAATTCTCTTGACACAGATTTCAATCCAAATATTAG
CGTAATAACAGAGTGATTCTACCATATCGTGCTTAAAAAACGAATATATT
TTCTCCACCTGGGTCAAACCAAGGTCATGAGTTCAATTTTTAATATTGTG
AAAGTTGAAGGGCTGCCATCGAAAATATTAAAATAAATAAAAAACTTCCT
GAGAGCCAGACGTTTTGTCCTGACTCAGCTCGATGTGAAAGTTTTGTGGT
TCTTTCATCCTGTTTTTGATACACTCACTTATCTTAAGTGCTTTTTTCGC
GTTTTTCGAATTCTAGAGTCACGAAATGACATTGTTAACCGGAAAGTTTC
ACTTTTTTGTCAAAGGAATAATGATGCAAGTTCTCATCACAAATGCTTTG
CAAGGAATATTGTCAAGCCTTGTTTTTGATAAGGAGTATGACGCAAAGAG
AAACTAAAAAAAAGTCCATTCAAGAGCGCTAAAATCTATGATTCCTAAAG
TTTTTTTTTGAGAGAGAGACAGTCCTTCCGATGAACGGAGCAGACCCTAT
CCAGGACAGCATTCACTATCCTAGAATAGGGAGATCACTGTGTTTACCTG
ACTCTGCCAACTCGTGCTTATGACACATCGAGTAGCTGGTGTATAGTTAC
TATACTCGAACGACTCGTGGTCAAACCTGACAAGTATTAGCAACCACACC
ACAGGGTCAGGCAAAGTTTTTTGAAAATGGAGAAAAAGAAAAAGAACTCT
TTTTGTTCATAGGCGCAACGATGGCCTTTGGACTGGAGATGGCTCGTTGA
AATATTTTGAAACAGTTTCTGCTCCCTATCAACTGAACATTCTTAAGACT
TGAAATCTAGTTAAAACCTTTCTTAATTCTTGTCTGAACCCTAAACAGAG
AAAGAACATGGTCAGGAATGGAATCTAAAATTTCTTTTTTTTTCATCTTT
GATTTTAGAGTCGAGCAGCCTTGAGGGTCCAGACAAAGTGAACGACCTTA
TCACGCAATTCAGCNCCTAAACAGAGAAAGAACATGGTCAGGAATGGAAT
CTAAAATTTCTCTTTTTTTCATCTTTGATTTTAGAGTCGAGCAGCCTTGA
GGGTCCAGACAAAGTGAACGATCTTATCACGCAATTCAGTTCAGCCCTCC
AATACTATACAGCGACCCGACATCGTGAAAATCCACAGAAGTTCGCTAAT
CTCGTCTTGATTTTACCGCAACTAAAATATTTAGTGAATCAATTGATCGA
ATTCTTGTACACTATGAAAATTAACTGCTCGGGTCCTGCGTTGACAGATC
TGGTCATTGAAATGTTGGAAGCAAAACAACGGTTATAGAGAAAGTGATAG
TGAATGTTTTGTTTTGAGATGGATATTGGTGCTGAGGCTTTGAGAACCTT
CCTCGAACGAATTCAAAAATATAGTGAGTTTGGTCCAAAATTCGCGCTAT
CGGTACCTTAGAGTCGTATTTTTACTCCAAACTGTAAGATGAAATGAGCT
CGAAAAGATGAGTTAAATATGTTGACTCCAATAATCCGTTGCTTGAAAAT
CGGAAATTCTTTTCAAACAATATATCGCATGCTAACGGAGATATGAAGAC
AGAATCTTAAATGAATAAGATAAAAATGAAAGCCTGCAATCATTAAATGT
GATTGTCTCATCAGGGAACATGAATGTGTGGAGGGAAACACCTTCCATAA
ATTTGAAAAAGTGTGACCTTGTTCCAAAAATGACGATAAGTTACAGAATA
GAGCGTATTTGTTTTGATATGCTCATAAACCCAGCTGACACACAATGTTG
TTTATATTTCAACATTTATAACTCTAATTTAACATGGGTCGAGCGTAAGT
AGCGTTCTATGCCTTCTGAGAATTTTTTAAATCTACATCGCTTTTCATAA
ATTATATCGGAAACAACGTTTACCTCGTTTTCAAAAAATTGCTATGGTGA
TTGATTCCCAGAGGAGTTCACAAGAAGTTTACTATATTTACAATAATAAA
ACTTAATCACCTTGGTAATGGTTTCAAAACGAGGTAGTCGTTGCACTCAA
AATAATTTATGAAAAAGCCTAATACAATAAGTATTCATCTGATCTTGTTG
GACGTTCTTCTACACAAGAAAATAAGGCCAGAATTTTACCGCATAATACT
GCAAGAAATTAGCTCAATCATATTACGTTGTTCAAATTTTACAATTGGAT
GAAGATAATCCATCAATTAAAACGAATCTAACATTAGATTGGTTACATCC
ACAGATTTCTGAAGAAATTGNTCGTATTTTTACTCCAAACTGTAAGATGA
AATGAGCTCGAAAAGATGAGTTAAATATGTTGACTCCAATAATCCGTTGC
TTGAAAATCGGAAATTCTTTTCAAACAATATATCGCATGCTAACGGAGAT
ATGAAGACAGAATCTTAAATGAATAAGATAAAAATGAAAGCCTGCAATCA
TTAAATGTGATTGTCTCATCAGGGAACATGAATGTGTGGAGGGAAACACC
TTCCATAAATTTGAAAAAGTGTGACCTTGTTCCAAAAATGACGATAAGTT
ACAGAATAGAGCGTATTTGTTTTGATATGCTCATAAACCCAGCTGACACA
CAATGTTGTTTATATTTCAACATTTATAACTCTAATTTAACATGGGTCGA
GCGTAAGTAGCGTTCTATGCCTTCTGAGAATTTTTTAAATCTACATCGCT
TTTCATAAATTATATCGGAAACAACGTTTACCTCGTTTTCAAAAAATTGC
TATGGTGATTGATTCCCAGAGGAGTTCACAAGAAGTTTACTATATTTACA
ATAATAAAACTTAATCACCTTGGTAATGGTTTCAAAACGAGGTAGTCGTT
GCACTCAAAATAATTTATGAAAAAGCCTAATACAATAAGTATTCATCTGA
TCTTGTTGGACGTTCTTCTACACAAGAAAATAAGGCCAGAATTTTACCGC
ATAATACTGCAAGAAATTAGCTCAATCATATTACGTTGTTCAAATTTTAC
AATTGGATGAAGATAATCCATCAATTAAAACGAATCTAACATTAGATTGG
TTACATCCACAGATTTCTGAAGAAATTGAAAGAATATTGCTACTATTGTT
TTCGAAAACCCGCGAAGCTTCTTATCGGTCAAGCGTTGAAATTATATTGT
AATGTTACGTGACCTAGGTAGGATTTCCTACCTAACCTCGGCACACTTTT
CAGCCAAAGCACGACCTCTAGCCCGCCGGGCTTTATAAATCTTTGGTTAC
ACCCCCTGTAAATTCTTGCTCGCTATACTCTACGTAGTTTTTAGGCTATA
GCTATACTGATTCCCCTCTTTAATTTGTATATATTTATGCTCGATTTTCA
ACTTTTACATTTTATTTACAGTTTTTGAATTTTTTTTCAAATCATCGGGG
AATAGTATTTGGCGTGTAGCCATGATAAAAATGTAACGTTGCTCTTTGCT
AAAAGACAGTTGACAGTTGGGCGGGGCGCTTTTATATACACGTTCCTCTT
TTGAGGGGCGTCCTTCGATTTGTAGAGGGCCTTTTGGCCCTTTCGAGCAC
CTGCGTCTTTTCTTTTTTTTCTCGCATAGATTGGTCGAATGTTTTTAAAA
TGAATCAACAAAAACAAAACTTAGCATGAAACTCATTCAAAGCTACATTT
GTAAGCTTAATTTCCGCCTAAACAGTTTTGAAATGATCTGCGCAATCTAG
CCTCGTATTGACAGGTCGATAAGTTCAGGGACTTCTGCCCGAAAGTCCTT
GCTTTTCCAACTGGAAATTTGAAGCGCAAATAAGGATCAACTGGAATACT
T
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_295 | supercontig | scaffold_295:16128..23128 - |
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
| Ortholog Name | Description | Organism |
|---|
| RXRB | retinoic acid receptor RXR-beta isoform 1 | Homo Sapiens |
| ESRRA | steroid hormone receptor ERR1 isoform 1 | Homo Sapiens |
| ESRRG | PREDICTED: estrogen-related receptor gamma isoform X3 | Homo Sapiens |
| ESRRB | PREDICTED: steroid hormone receptor ERR2 isoform X4 | Homo Sapiens |
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