XLOC_036628 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_036628
Unique NameXLOC_036628
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_306:87504..96617-

Legend: gene
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>XLOC_036628 ID=XLOC_036628|Name=XLOC_036628|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9114bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_306:87504..96617- (Clytia hemisphaerica)
GTTTCAGTCCCTCTAATGGTTACCATAGTTAGGAAGGGGGTTGATCCCAT TTAATTTAAATCCTGAAGGGCTAGAAATGAAACTGTTGTGCGATTGAAGG TAGTTACATCCCACCAAAGTTTTGTGCGCCGCCCTTTGCGGTTTGCATAG AAACGCCAGATTATTAAGCATTTGTTAGCATTTACAAATTACAATAATAT GTCAGCTCGCTGCACTAGGTTCAATCCCTCGTCCATATATTATACTATAC ATGCTCAACAGTGCTCAAACCTTAGTAAAAAAATTTTTTTCAGTGATAAA AATATGTCGCACAAAGAAATTGTATCTGGTATAAATAAATTTACAAAGCA GGGAAAACGTCAATCAACAACTTATCAATCTGAAAGTATCTACACTTCAA AGAAACCCAAAAAGATTCCAAAGACACTTGACTTTAACCTAACAGCCTTT GAAACAAGAGTTGAAAATGTTGACAATGAAATAGATGGATCGTGTCTGAA TCTAATTGGTGTTGGACGGCTGTCAATATCAGCTGATTCTGATGCTGAAG AGGTCAAAGAAAAAATTGTCAGAATTGTTTCAAAAATGAAATATATTCTT CCGTCTGCAAACCTAAACCAATACATGTTCATTAAAAGGAAAGGTAAAGC CAACAAATTTCTACTTGAAGTAACTGATGATGACTATCAATACAATGCAA GTGCATTGAAGAATCTTAAGACTAAGGATGCCAGTACAGTCTATATACTT TATGATAAAAATGTTATTGACGAAGATGCAAAGAAAAAGACCAAGATGAA ACCGTCTGAAAAGCCAAATCAAGCCATCAAATCTTTCAAATCTAAAATCA TGGAAAACAATGACGAAGATGCTGACAGTGACGATTGTTCTTCGAATGAT GAGGGGAGCTCAATTGATTCAATAAAGTCGAAAATTGACAACTTGTTTGC 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ATTATTCTTTTCTTTAGGAGAATATATGGAAACGGAAAATTGAAAATAAA GACCAAATTTCAAGAACTTTTACATTTTGAATGTGTTACAATCGGTAAGG GTTTACTTTTGTTCAGGGACATTATTGTGTCCTAGCAGATTTTACATTAC ACACTTTATTTTATGATAATAGGTTCTATAAGAATATAAGGTTAAAAATT GCCTAAATTGTAAGGATATCTTAAGAATATTCCCAGCATGAGTTTCGTGT AAATTAAGTTTTTGTCAAACACAAAATTATGGAAATCAAAATAAGACAAT ATCTAACTAAAGATATGCCATGAAATAACCCGAGATGAGCTGGAGTTTTT ACAAGATGCTTAACTGATTGGTTATTTCTAAACCATAGGGACGACGCGTT CTTTAGGAAAAGTAATAAATACGTTTGTCTCAACATTTAACGATCAATAG AGTCATCAAAGAGCTTGTAAAAACTCCAGCTTGACCCGAAATAACACAAT GATACTAAAAATATATGCCTTAACATCAACATGTACATGGAAAGTTTAAA CAGAAACTTTTTTCTGATCCTGAAAGATTATAATATTTTATTTTGCTAAA TCATAAGAATACTTCACCGTCAATGAAAAACACTATTTTTATTTTATAAA AAGTGCTTGTTTAAAGCTTACAGTGTTTCTAGAAAATACCCGAAAGTTAT GTTCACTTTTATATATTTTTCTTTTTAGACTTGATCGTTTACAATAAAGA TTGCAAGCTTTTAATGGCAGTCGAAACTGACCTTTTGGGAAATGGGAAGT TTTTAATGGACAGGTAATCATTTTAAATAATTTAATCGTAGAATTTTATA TACATTTATATACATTACATTTACATAGAATATTTCAACTTCTTGTAAAA AGAACCAATATACTTTTGGAGATCAAGAAATTAATGGTGAAAATTAATAA ATAAATAAATAGGTCTGACAGGTGGCTATTAAACTCTTCCTTTATTAGGT TTCTTCTGGCATCCAAGGACAATACCAGATAAAAGGAGCTATAATAGTAA TTAAATGTGTTTACGATATATAATTCTGTTAAGACGTTTGTTTTTCTTTT ATTCTCTTGATTTTGTCATTTAGATTACAAGAAAGAAAACAATCAATGAC AACAACAGCTAGTAAAGCTCTGGTAAGTTTATTACTGTAGTTTGTCTAAA ATAACGCGATGCAGAAATTAAACATTTTGGAAGGCACACACAGAAAATGG GACTGAAAACAATTATTAGATTTCCAATTTCAATTTCAATTTCATCCAGT TACATCACGTGTTAATGCTCGAACAAAATAATAATTAATCGTTTCCTTGG GACATCTAGATTAAATCTACCATTGAAGAAAGACAAAATTTGATGAAATG AAATTACAATGTTCATAAAATTCTTTTCCCAACATTTTTGATGAAACTTA GAAGAATTACCCCCATATTTTGTAACGTCAATCGTTTGAATGACAACATT CGAAAACCCCATTATGCGTGATGTTTTAGACAAATTACATGTTTTTTTAT AAGCATATGAAAATTTGAAGGTCAGGCTCGTCGATATGCTTTGTTCTTAA ACAATAGATCTATTGTTTTAAAGGGTTTAATTTGGGTCTCAGTATGCTTA TAAGTGTTATGATTATAACAAGAAAAACATGTATGGTAACACAGAGATTG GTTGTTGATATTTCCAGATTTATTTTTCCAGAATTTTTGATACAATGGTA TTTTAGATATTCTATTATAATATTGCTCGAGCTTTTTTAATGGTTTGTTT TTAAGGAATAGGTGTCTCGTTACCACGTTGTTGACTTTAGGACAGTTCAG TAAATTCAGTTAAAAGATATGTTAAATTTACACTTTTGTAGGGCTCTCAA CATGGTTCAAAAGGAAAAGGTTTGTCTTTTTTTATTCTTCTTACTTAATA AGTATAATATCTTGATAATTTCCTGTTTTGGTTTTCACCCCACGTAAAGC AGTAACAAGGTTCTTAGAAACAACCCTAGTTGACGTGTTTCAATAATATA CCTTGAGGAAAGTAATTTCGCAAATTTTGCCCTAATCTTCCGTAAGACTA ATCACAAACAAGTAATTCTTGAAAATTTCTGTCCGTCAAATTTACTAAAA ATGATAGAAAAGTCAAGCATATAGCACAAAAAGATAGTAAAAGTGAGCAA ATACGTTTACTATCCAATAACAACTACTTTCCTTCTTTTTAGTCAAAAAA TGGGTGAAGAAACATTTGATTTTTATTTAATTTGCGAAAGAAAATTATTT TCGTGAAACTCAAAAAAGCACTTGATTTGCAAAGTATTCTTCCACGAAAC ACAATTTTGGAGAGCGTAATAATTTGCAAATTAATTCTTCCCTTAAAGAA CATTTATAGTACATCCGTAAATTAATAAATAATATATATATATATTTTTT AGAAGACTTAGAAGGAATCATGAAACGACACCTCGGCACTATTTATGGTC AGCAAAAACTGAAAGATCAAACCATGGTACTGGCAAGAAGAGCTTTTTTT GACAAAAAACGGGGAAGATCTACAGACATTTCTCGCCTGCATATGCTGTT TGTAGGAAACCCAGGAGCAGGAAAAACAATGGCTGCAAGATGCATGGCAG GTAGGTGTCCCTACATTTTTATTAGTACTAGTAAATCGCATGTTTTGAAG TACAATTATCGATTCACGAGTTACAAGGAGAAAATTGTAATTTGTCCGAT TCCGTAGGACGAATATCGATTACCTTAAAGATACTAAATTTCGTCCGTAC TAATTTTCGTGCAGAAAATTTGCGTTAAAGAACAAATTTAGTGAAAAATA AATTCTTAAAAGAAATCTCTTAAATTTCTATTTTTTTGCCGACCGACCGA CCCACATTTTGAAACTGCTTCGCCCGTAAAACAACAAATCAATTTGGACT CGCTTAAATTCAATGAATAAAAGAGCTTTTTGAAAAATTATTTTTTTGTT CTATTGAGTTTTGTTTCCTCTTTCACAACAAAAGAATTAAGGGGTCAAGC CCAAACGTTAGTTCTCCTTTAAAGAAAATAGGTAAAAAATTCGAGTCTGT GTTTGACATTTAAAGTGTAATTCTTCGGAAAGAACAATAACAGATTAATA TTTTACTCAAAATCCTTCTCAACCAATGTGATTTGAGTAATAGTGATTAA ATTTACAATTTCAAAATCAATGGGCTGTTTCAATTTCCTTTTATTTATAA TCACTTTCAGGTATTCTTAAAGATATTGGAATTTTGAAGAAGGGACATCT AGTGGAGGTTCAACGCTCCGAACTGGTGTCCCCCTACATTGGTGGTACAA GCCAAAAAACAAAGGCAGTGTTGAAAAAAGCAAAAGGGGGGGTTTTGTTT ATCGACGAAGCATACCGGCTCAGTTCTGTTGTTGGCAAAGATTACGGTAA GGAAGCCGTCGAAACTTTGATGTCTGAGATGACGGAACCAGATTGCCCAT TGATGATCTTTGCGGGTTACGAAAAGGAAATGATGGAGTTTGTCAATGTC AACTCAGGCCTTCAACGGCGAATTAAACATAAATTCGCTTTCATTGACTT TTCACCCAACGATTTGGAAACCATCACAATAAAAAAGCTGAGCTCTAGTT TTCCACGCTTTCCACCATTCAAGACTGGAGAACTGTTAAACGAATGTTTT CGGAAGCTCTCCAAGGAGGTAATTTCTAAGCACAATGCTGCCCTGTGCAC CGACCTGATCGACCAGATCCAAACCGCTCAGGAATCAAGGTTGCCTCAGG ACTGCTCTGACGCGGACCTTCGAAAAGTCACCGAGGATGACCTAAAGATC GGCATTGAAGCTTTTTTAAAATGCCACGAAGTAAAACCAACGAATGAAAA GTTGGACTCTGGGGATGGCGATATCAATGAGCCAGAGGTGTGTTGGAGAT GTAAAAGAAGCATGAAAGAAGGCTCGGATGATGAATTTACACCACCAAGG GTCGTTCCCGAAATAGTTGTGAATGTAAATGGCTAAAACGATTGAATTTT ACTCGGCGTGTTGTGTTGAAATTTTGTTCTATATTTTATTTTAGGGTCTC TTGTCTCTTTTGTTTCTTTGCGTGGAATTTTTGACCTCGCGAAACTTTAT CTCGCGAAAGTTAATCCGCTTAAAGTATATCTATTAAGCTTTGATGTCTT TTTGCAAATAATAAATAAATAATTACAACAGGAATGCCATGTTATATGCT ATGCTATTTTCAGAGAACTGTCACCATTCTTGTACAGCGATGCCAGTTTT TTTTGTAATTTCTTTTGTTTCTCATAGACAGATAAATTTACATTTCGTCA ATTTGTATCCTTCG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00058117TCONS_00058117Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00058116TCONS_00058116Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00058116-proteinTCONS_00058116-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_306supercontigscaffold_306:87504..96617 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.52 0.59 0.3 0.24 2.51 2.27 0.97 1.22 0.56 1.14 0.77 0.53 0.44 0.56 1.04 1.25 0.76 0.93 0.52 0.83 1.01 1.19 0.53 0.61 0 0.01 0.88 0.54 0.29 0.25