XLOC_039747 (gene) - C. hemisphaerica

Overview


Name	XLOC_039747
Unique Name	XLOC_039747
Type	gene
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_389:49590..56427+

gene from alignment at scaffold_389:49590..56427+

Legend: gene

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>XLOC_039747 ID=XLOC_039747|Name=XLOC_039747|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=6838bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_389:49590..56427+ (Clytia hemisphaerica)
AAATCAAGATAACAAAGTTTTATCCATTGTTGCACAACTCGAAAAGCTTT
GCTTTGTTGTCTTGATTTGAACTTTCTATCTAAAATTAAAATGGCtactt
tcaaatttcttttcttttaaacataCAGGAACAGATGATAGTTCAACATA
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TTTTAAAGACAAAGGCAAATTTTTGTAAGGTTTAGGTTGTAATTGATCAC
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AAGGTCATAAGACCCATTATCCATACATAAAAATTATAagattgtataaa
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CTAATCTATCATTTCAGTTATCTAGATCATGATTGCTGGTCAagaattta
taaatttcaagaattttttaagtTGTAACATCTGAAAAGGTATTACATGT
ATAaacagtgctgcaaatagggaaatatatattatttaaaacaaatttca
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GATGACTGGATTGCATCATTTTAATCACTAAAACTATTCTTTTAACATGA
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GTCTACACATCACTTTGTTTAGGTCTTGGTTTGATGAAACAAATTGTGGC
AGTTAACAAATCATNTTGATTATtgatatattattattattgattaGTTG
TCAATTGCTAACAATAACACAAGTCTAAGGATAAGCAATCAATTACTGTC
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GGGTAATATTGAGGTACCTAAATCTAAATAGAGTTGTGTATCTTGtatgt
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GAGCAAGTTTTGGATATTgatgcaaaaaattcaaactggcAAATTGCAGA
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GTGATACAAAAAGTAGGTATCATATCATCCCTTCTTGAAGTCAATTAAGG
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GCTGAGGAAGAATATTTGGAGGACAGTGCAGGATAGGGAAGTTTTGGATG
AACATTGTAATGTGTGTTGTGATCGACTTGGTGATCTTTATTGCATGGAT
TGTCACAAATCATTTTGTCATGTATGTGACGATGTCNN

Gene-mRNA-Prot

The following transcript feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00063416	TCONS_00063416	Clytia hemisphaerica	transcript
TCONS_00063417	TCONS_00063417	Clytia hemisphaerica	transcript

The following polypeptide feature(s) derives from this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00063416-protein	TCONS_00063416-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_389	supercontig	scaffold_389:49590..56427 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
7.98	8.95	4.31	0.91	45.74	32.04	40.06	37.67	32.91	38.85	42.39	33.93	33.92	32.1	28.96	29.39	31.2	39.39	26.67	42.13	41.28	39.78	16.48	24.59	33.35	34.99	60.51	46.12	37.11	35.22

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