XLOC_041677 (gene) - C. hemisphaerica

Overview


Name	XLOC_041677
Unique Name	XLOC_041677
Type	gene
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_457:82429..91563+

gene from alignment at scaffold_457:82429..91563+

Legend: gene

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>XLOC_041677 ID=XLOC_041677|Name=XLOC_041677|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9135bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_457:82429..91563+ (Clytia hemisphaerica)
atcaaaaatacggggcatattttaaggcttcaatttttcttgcctgagaa
aggtttagagattgacctctaacTCAATGCCCCGGGGGATATGTCTACCC
CGTGCATTTCCGCTGTTTTTATTAAACTGTTGGGACTCGATAAGTCAAGA
GACGGACAGTTTAAATAAGAGCGGTAAATTTTGGTTTGGAGAAGGCTTGC
TTTGCTGcgattttattcattttattcatcatcataaccagccATGCAAC
ATAAATGCAGCAGTGTCAGGGTTCCATGTATCTAGCCAGTAGCCATCACT
ACAAAGAGGACAAAACAATCAGTTGGCGAGGAAATGCCGCATTCGAAATA
AACTTAAATGGTAAgagcttatttttttcttcattttaaaaaccCTGTCA
AGAGTTGAGACAATCTCGATCTCTGTCAATCGAGCGGAATCAATATCGAA
CATGCAATCGACAGTCCAGCTCACTACAGTATGCGATTGggccattctat
ttttaaaccatacaggcTCCCCAGCAGTTTGCANACAGTATGCGATTGgg
ccattctatttttaaaccatacaggcTCCCCAGCAgtttgcatgaatgcg
tgaaaattgaaaaaacttgtgtGAATATGAAAATCTActttttgattgca
tgaatAGACGTTATCTACAGACGATAACTAATCAAAACGGGGAGAAGACA
AACCGTGGACCCCCGATATGgacccccaatatggaccccaatatggacca
ccAATATGGACCCCTAATGGACCCCCTTTAAATGGCGAGAAAAGCATTGT
GGGTATTTCCCAACATTAAATAGGTAGTTATTTGTGCTATATTAGTCGTT
CTATATACTATAAACATATTACAACAGTTATAGAGTTACATGATACATTC
TGTTATTTAGACATAAATTCAGTTCGTTCAGGGTGATTTGTTCTATTGTT
AAAATGTTGACATAATGttgatatttgagaaaaatattgacagaatcata
aaatatgacgTCTCTTaagacaaaaacattcaaaatattaTACCGAAagt
gatgtagatagtgtgaatggatataaaaagacaccaatcagaagcttgtg
actTCTCAGAGAGGGTTGTTTTAGAGTGACAAGCTTGACCAGATAGTTTA
TTGTTATTTTCATGACAAAATGACATTTGctaatcaaaataatattgaat
tcTTTAAATATGACATCTGTTAAGACAAAATCACNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAATTTTCTTCCTATTTtgtctttgc
cgacctaaacaagctacttaggacggctttgccgacctaaaatgacctct
aggtcagcaaaattttgccggcctATGGCCGGTTTTGGTCGGCACTTAAG
TGCCGAtatgattttgtctgaattcacaGGGCTGAAATGTATTCATAAGA
GCGAGTGAGTCAAGGTTATGAAATACGAGGGAGTATGTCATTTACAATGA
AAAAACTGtatgaaaacaattttgcttaTAATGAGTATTTCGGCTTCCAT
AAAACGTTTTGGACTGGTTGTATCAGCCTGGACCGGTCCATATCGACCTA
GATCTGTCTTACATTGGCCgaatatcattgtttttattttaacagttttg
taaCTTGACAAAACTGGACCTGGTCATTATTGGCCGAGAcagacagataa
aaaaattaactccattaagaattagtgaaaagtttaagtttaagcaaata
aaaacaaaaaagaatggTAGATGCTGTGAAATCCAGCAAAGACAGCACAA
ACAGGGTTGTGATCAACCTGGCACTCTTGAGAANAAAAAATtaactccat
taagaattagtgaaaagtttaagtttaagcaaataaaaacaaaaaagaat
ggTAGATGCTGTGAAATCCAGCAAAGACAGCACAGACAGGGTTGTGATCA
ACCTGGCACTCTTGAGAAGTGTGAAGCTCCTTGTTGGTGcaggggggggt
cagtgtaccagaaggtggcatgtatcctggggtgggaaggtgtttgagaa
aaaaatttgtcatgtactacctgtgtactataattggggtgttgggtcca
aaatcgaatttgttttttattacctgtgtaccaaaataagGGTGTTGGGT
CCAGAATCGATGTTAAAAGtgtggaaacaaaaaggttcagaaattatctg
ctaaaatagaaatgtaaagttgttctattataaattgatcaagccaagtt
tgtccaagatcattcttccaaaattcttaaaatgaatagcataccgcagt
gaatctaaaaatagacattgatttttctgtttgaccgaaattcaatccca
tccaGTCCCATCACCCTTCGCGTTAACTACGCCTGCATGCAAATTACACT
CaactacaaagaaaaagtaatgactttcacgactttttaaTTAAGANCTA
CTAGATCCCACTGAAATACTCATgcatttccacatggtctcgcgtaactt
ttgaaaagtttgttttctcacgcattttggatttttgataaaattttcct
gtttttccgatttttggaaaaaagttttcccaaatACCCGAGTTCCTGAT
TTTCTGAGAAAGGGTTTTCCCGAGCtcccaatttttggaaaaatgtttct
ttattttccGGATTTTTCTAGGTAGTGCCCGGTAATAAATGGGGGGCATG
Tgatagttttgttttttttccaggtactacccggtagtaaataggggtat
ggggtggtttttggatttttccatgtagtattgtgtacttcaggggtggg
tgggtgtcaagttttgaaaaNgttttgggatttttccatgtagtattgtg
tacttcaggggtgggtgggtgtcaagttttgaaaaataccttgtagtaca
catacatgccACCTTCTAGTACACCGACCCCCCCTGGTTGGTGTTGTTGG
AATCCAGCAGAAACATTCGAAGCGTTGAAGACTTTGGATCCAACTGGAAT
TGGACATCTTCCATGACAATTACTTCAAAAATTGCAGACTTGAGGTCTTG
GCAAATAACCTTGGACCAGCTGTACGCCTGGTTTGGAATCGGCGTGCAGC
TGAGCAGGTACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NAAAAATAATCACACAGAATGGCACTGATGTCCTTATACATAGGATCAGA
AACACATCTATCTTGTAATATCTTCAACAAGAAATTCCTACCGAAACATT
ACACTGCTTCGCGCCAGGACAGAACTGATGGCAAAGGAGGTATTATCATC
ATTTACAAAGAAAGCTTGATAGTCAAAGTAATCACGTCGAAAGCAGGAGA
AATTGTATCCattaagataaaaacatttgaaaaacctATTTTAATCACAG
CATGTTATCGTACGATGTATAATTCCAAAGAGCAGAACCAGGAACTAATT
GACAGTTTGAGAAAGATAATAGTAAAACACAAAAACATATCTGTGTGGGT
TGGTGGTGACTTTAACCTACCAGACATTGATTGGCATTCAAGTGAAATCG
GCGTCCACCAAGTATGTAAAAGAACTATGAATAtgctatcttttttgaaa
ataaccttGACAATGAATCAATaataaactttgaaataaacCAAGTACTC
TCACCTCAAGAAGATGATGAAAGTTGACCGTTGAGACTGATCGAGATCCT
CTTGCTTCTTGTCCATGAGTGTCATGAGATTTGAAACAACTTAGCCAGCT
ACTAGTGCGAATCAGCTTTAACATTTAATAAAATAGTTCACAGTACGCTT
CGGAAGAGGTGGCGCAATATAAGGGAGATAACGGCTGATGTAATAATTAA
AGCGCAGCTCGGCGCATACAAATTCTTGTTTCGGATTTTCTAAGTCAAAT
CGGGAAAATCGGAATTAGACTGAGGAGTCTTAACGATGACGACgaccagc
gggaaaaaaatcgcggaacagatttgaagggtcaccagGGCTGACCAATA
ATCTcgttaaaaacttaaaaaagacgtagagaaaaattaaattttacttt
ACCATACTACTTCTAACGAAgtttaaagtcacccatagcatttagctatc
atcttctttcttttttataaaattctcaaaagaaaacttaaaattaaaGC
AAGCTGGGGGTTTATATCTAATTGAGTTGTTCATCTTCGATTTACAGGTA
ACTGAAAAAAATCGCatttcaatttacttttgaagttaaagtcagaaaaa
tttaaaacttaaatttttaacattagaaagaaaaaaactacTAGCTCAGA
AAATTTATACTTTTGaggtataaaaatttgttgaccaattaaagagaatg
tgtcaagaaggATGTACACATACTTAAAATACCTAAAGACCAGTCTAGTT
TCAGGTACCTGAAGCAACAAGCTCAATGTCATCAACAGGAAAATTGATAT
ATTAccctttgtttttataatttaGAATGTGATGGGAAGTGGAAAGTAGC
AGCTATCACTCAATGATCCGTTCATCAATCACCNN

Gene-mRNA-Prot

The following transcript feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00066629	TCONS_00066629	Clytia hemisphaerica	transcript

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_457	supercontig	scaffold_457:82429..91563 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
98.66	92.54	45.08	39.42	36.95	36.19	26.37	24.89	11.97	14.26	8.73	9.36	8.99	7.17	6.23	5.76	9.88	9.74	4.36	4.89	4.73	4.25	93.54	76.89	40.43	28.5	9.1	10.02	35.2	47.83

You are here

XLOC_041677 (gene) - C. hemisphaerica