XLOC_043225 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_043225
Unique NameXLOC_043225
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_498:407733..448349-

Legend: gene
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>XLOC_043225 ID=XLOC_043225|Name=XLOC_043225|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=40617bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_498:407733..448349- (Clytia hemisphaerica)
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TTACGCAAATAGTCCCAAACAAGACACCAGAATGCGGGTAGACTACAATT ACAAGATATGAACCAACCATAGAGATATCAAAGTGCTTTAATAGGCATTA ATAGAAATTCCAGTTTGGACACTGAACTATTTTTCATGCATCACATTATA TAATTATTCATCTTCAGTCTGGTTAAATTTATGCTCTTTTTCGCTAAAAT TTCATTTGAAAGGGTAAATTGCTTTTTATCTTGTGTTTCACAATATATAT GTTCATTTTCCAAAGTGCTTTTAGTGAGGAAAAATCAAGTCAAAGTTTTT TTATTGTAATTAATTTTCTTGCAATTATTTAAGTAACTTTTTGGAAGCAA TAAGACAAATAAAATTGACATGACAAGAATCAAATTAGTCCAAAAATTTA ACCAGTTTATTATTATTTTTTGTTATTACAACGCGACCAGATTTTTGTAT AATTTTTGTTTTTAATGTGTGCTACTTTTTTGTATTATATTGCTATTATT TTTCGCTTTGTTGTGTAAACTTATAAAAAGTTCTTACAAAAAAATTCATG ATATTTTTGATTTTCTGTCATTGATATCATGAATTGCCATTGTTTTAGTC CTTTTTTTCCTTTCCCTCCCTTCTCCTTCATTGTTTTAATATTCAACCTA GCTAGCTCTTTTTGTATCATTGTCAAAACACTTTAGCCCGAGAAGTAATG AAAAACTATATTAGTTTTACCAGCTTCGTTTTGTGTTTGAATGCAATGAA TTTTAAATTCTTTTTCACTAGTAACTATTTCTATTTCTACAATATAATCT GTGACATTGGTTCGAGCATTCCTTGAGGAAAGTATTTTGGCTAAAACTGA AACTTTTTGACTCGACCTACACTGTATCCGCCAAGTCCAAAATGAAAAGT GCTTATAAAGAATACCAAAATACCCGATAATAGAAATATTTTTATATCAC TTTCGATATCAACCACGGCTGCCATTTTTTGTTTGTACTTCTAGTCTTGT GCGCATAGAATAATCAAGCGCTCCGATTGGCTCAGAACTAAAACAATCGA TCGGGCGCAGATATTTCAATAGAACAAAGGGTCGCCTAGCCTATATTTCT ATAGCTGAATAGCGCAATTCTTATCCTCTTTTCCCAAATCTCTGGTACAA TTTAGTTTCTGTTAGAGAATTTTTATTTATTGTGCAATTTTGCATACGAA AGTAAAGGATTTACTGCACTCCCAATCATTCCATTTTCCAGCATAGTCGG CATAGTTCTTGTAAAATGATACACAGTCTTGATTTGCAGCATTGTTTGGC TGTCCGCTAGCGAAATTCTTGTATGTTGCAGTTTTTCCGTCACTCCAAGT GAATGAGCCTTCTACCTGTTTATCAGACATACCTAAAAGAACATAAAAGC TGCTGTAGATTCTCTGCTTCGTGAATACTCAAAGGGTTATTATTAAAAAA AGCCTCAAAGAATATCAAAGATTCGTTCACAAAAGTTAACCGAACCTTAG CTCTGCTACTTGTTGCATCTCCTACAATAAGCCTTAAAAGATATGTAGAA TAAGAATGTCTCCAGGTTCAGCATTGAAATTTTAAACTCTACAACCTCTT TTTACAGATCAGGTAGGACTTTTTCAACTAACAGGGATAAAAATAACGAA CTGAAACTCAATGTAGGTTTAAATTCCAAAGCATATTAAGTCGGGATGGA AAAAATAGCATGCATTATTTTGCAGTGAGGATGATTTTCGACTGGGGGGG GGGGGGGTTTTTGGGGGGGGGGGGGGCGATATTTTGGCCATTTTTTCCAT TGGGTCTGCGAGAAGGGGGATGTCACTCTGAAAACTTTCTATTTTGTATT CGTTGAATTCTAAATAAACTTTCAACCAAGCGTCTCTTGTTAGTTACAAA TTAAACTTACCTATCCAGTAATCATTTCGTCCACCAGTTGTCAATCTATA CACAAAATCATTCTCCTGCTTGCTCTTAATACTTGCCAAGTGATCTCCTT TTGAAATGCAATATAACTCTGCATTATTCCATGTCTTCTTTTGATTTATG TACGCATAGAAATCCCCTGAATACTCCGTCCAGCCACTATCACATCCCAC TGTTTCGAAAAAAAGTAGAAATCAAAAGTATTTTCATGCATATTTGACCT AGTTTATACTTTATGACTTTATTTATGTGTGTGATATTATGTAAATTTAA TTGGATATTTCAAAGCTTTGATATTTTGTAATATTTACATCTGAACAGAT CCATTTTCTAAGTAAAAGGACCTAAAAGGTTTTTTACTCACCATTCTCAA CTCGCGAAACAGCTTCCACTTGTTTTCCGCTCTTGTTGTTTCTAATCGTG CAGCGATAAGTTCCCTCTCCACGAACAGAAGTTTTGACCGAAATCAAGTT CGGTGTTCTAGTTGTCTCTTCTTGGATAAGTTCAATGGATCCTGCCCGGG TAATTTTACCGGACATACTTTGGCTGTTTCTGTATGCTGAACAGTGGATC TCTGCAACTTGACCTGCTTCTAGTTTGATAAGTACTGGTGACGATTTTTC AATTTCGATCACCTTAACTTTGAGTTGGATGTTCGCTTTTGTTTTTCCTG AAATTTAATCAATAATGAATTGTATATGAATATCCATTGTTATGCATTAT CAAGATTTATTTCTCCACAGGGAGGGAGGCACACAAGGTCAATGAACTAC TTAAGGGTATGTTGTTCAAAATCAAAAAAATGGGCTTTTCCCGAAAACAA TTTTACCCCCCACCATTGAGGATCTTGATTTTTTGAAGTATCGAACCCGG ATATTCTACTTTATTAGTAAAGATATCCACTCTTAAAGAATATGCTCAAC CCCCTGGGTATCCTTTCTTATAAAGATGCTTACCCCCGATATCGTATTTT TTACTTGAAAAGACACTTTCCCCCTGGATATCCGCTCCCTTGTTGATATT TAACCCCCTGGATATCCACTTTTGAGCAAAAATAAAATTTTAAAAAATCT AAAAACTCTTTTCATCTAATTTAAGACAACGAAAATTTCACCGTTGTATC TTACCAAGGAAGTTTTCAGCTTCACAAACATAAAATCCCTCATCTTTGAA CTGGATATTCGATATCTTCAAATTGTCTCCTTTAACTGTGAAACGACCGG CTGGCAACGGCCAAAAGATTCTTTTCCATATGATTTTTGCTGGTGGATTT ACTCGAACGTCACATTTTGGGAAATCGAAAGTGATTCCTTCAGGTGCAAA CACTAAAGTCTCTTTACTGAGAATTTGTGGCTTTGCTAAAAAAGTATACA GAAAAATATGATCAGATGAGATGGAGTTTTTATAAGATACTTAATAATTG GTCATTTGAAGTAATAAAAATGACGCGTTCTTTAGAAAAAGTAATAAAAT CCTCTGATAACGAAGTCCAGTCAATAATCTTCATCATTTATTCGATCTGC TTATCACTATAGCCCCCTTGTTTACTGGCAACCCCAGTAATCTAGGACTT TCAGACAGTCCTTCGATTGTTTTCATAGTCAGCTGCTCGGCTAACTATGA ACTGAACGGAATATTGAAAGGAGAGGGGGGGCTCAAACAACGAACCCCTG GTATGTAACGCTGACGCCTTAAGACTACTCGGCCATCGCTTCTTTTATCC TTAATTCATGATATGCATCACTGCAATGTCACTATTTACCCAGCAGCTGA TCGGTTAAAAGTGACTTAAAATCAGACAATGCGTCACTTACAACAAATCA GCTGTTGGGTCCGTGATGTAATGTTAGAATTTATTGCAATGGTGCATATA AACCCAATTTTTCATTTGTCACAGGAGACAAGCCAAACCACCGATGCCAG GATTTCAACCAGGACAACCAAGTTAACCAAGACCAACCAGACTTGCCAAC ATTACTAATCAATAGTATTTTAAATTAGATTTTCTGTATAAAGTACGATA AAAATTTGATATTTTTATATAAAAGTAATATCACGACAGGAAAGGATTGC TCTGTTTCCGCTCAAGATAGCACCGCTTTGGGTATCCCTGTCCCTCCCTA CCCAAGTACACTTGCTTCAGCCTCCCCAATTTTTAGAAATTCAGACTTTT GCTCAAATTCCTAGCGAGCTGGCACACAACGTTGCTTCAAGGTTCATCGA ACGTTCATAACGTCCATTTAACGTTAGAGGAACGTTGAAACAACGTTGTG TAACAGCTGGGTAGCGAGCTTTTACTTATTTTCAGTTTCCCCATTTTTTC AGTTCTTCTCCCGCGTCTCTGTAAGTGTAAATTTGCTTAAGCTTTGTTTC CTGGGTTACCTAGTCGGAGGGGATAATTCATGATATTCATGATGTAATAT TTCATGTGGAAGCACTCAAAAAGCCCCGGACGTTTGCTACTAGTTTGTTG GGTGGCGAACGCCCTTATCTGGCACCCGATGTAGAAATTTTCTTCCGACA CGCTAAAGCTCTGAAGGTCGGGAAAATTTTCAACATCTGGAAGAAATACA TTACGGAATTTCGCCTG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00069368TCONS_00069368Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00069367TCONS_00069367Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00069366TCONS_00069366Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00069365TCONS_00069365Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00069364TCONS_00069364Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00069363TCONS_00069363Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00069368-proteinTCONS_00069368-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_498supercontigscaffold_498:407733..448349 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
22.34 19.93 39.04 38.41 38.62 30.25 33.17 34.49 22.72 23.27 20.52 21.61 15.29 14.3 18.33 19.25 20.85 25.32 13.43 16.62 17.64 18.33 21.92 22.99 23.06 23.56 11.97 10.93 17.23 17.9