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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00006353 ID=TCONS_00006353|Name=TCONS_00006353|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3333bp cgtttcagtcattgaaaatgataataattagctgtctaaatgaacTTTTG TTGtatatataaaggaaggttgaatttcaataaggaagaaaatttgttga aaaaagccaaaaaatctggcAGAATTCATAGAAAtgcatcaaatatgggt ttcgaggtacatccagccttacataaactttatccagtctagagccaaaa atctgaggaaaatttcggtaaaagtaaaataaattgactttgataaagat tttaaaccctttcgacccttcagtatCAAAActtatgtgtttagttactg aagAATGCTCTAAATCATGTAAAGGCTGTTGCAATTGCCcattctaaaat aaaaatttgataagctgatttttaacgttttcaagTACTTTCTGAAAGTt actttatttttattaaatggAGCATAACTCTCGATCTAATtaatcgaatt caataaatgacccatcaaaatttaagtttgtttatctttcttctttctga tgAAATAGGAATagttcttttagaatttttagatttcgagaaaatcagtt tcaaagagagaaacttttttgtggcacacccggtagatAAAATTTTGGCC ACAGAACAAGTTGACTTGTTATTGTCTCTAGCAGAGGGATTTTATGCAAA ATAACGGTTTGGCTGAAAAAGGTCTTAAATTCTGATTGGGGcactgtttt tatttgaaattttcatcataCATTCAAAATACAAATGGCTCAAATATATC TAAATTTGAAGCGTATATATTTAAGTCAAATATAtagtttttctaagaaa aaatcCATCATTTTACACCAACAGATATCTTTGTAGGGTGAAAATTTGTG TTATTTGTAAAAAGGCAGGACTACCCAAAAAATAATCGCTATTTTGTTAA AAACTGAGAAAAGGGTCTATCCAGGTGATGTCaaccaaacaatcaaacaa tcgaacttgtaatcaaacttaatcgaacttatCGAACGCTAACTGTTCAA TTACCAAACCAAATTAAACAGTAATCAAATTGagaaattatttcaattta tGTTTGATGTGTTCGGCTTATAGTATTTGCTTGTATCCTCCATTCTTGCA GTGCACAATTTTAATGACCAGCGTTTTCTAATCTATCATCTAATCTGTTT CGCTGTTGATGTTTGAACCACTTGTACTTGTACTTGTACTACATTAACCG AAATTAATTGAACAGAAAATCTATAAATCAAACAGTAATCAGTTTGAAGA TTCGGTGAAGTTTGATTACTGTTcgatttgtactagtaataacatggttt agagggtgatttgggattaataacccagAGGtttattgaaaacatttcaa aatagcccgaacgTAGTGAGATTTTAATACTACTCAGTACCACTAATACA TGTGTTTTTACCAATAATGTGCTTTTTTATGCATTATCAGTGCATCACAA AGTGCGGAAGTCCATCAAAATACcagcttttttcaaactttgtctcgttt acccaaacacTGCAATCCCGCATGTCTAAAagctcaagactagaaccccc aatacaaGCATTTTGGCTGACTGAAAAAAAgttatcatcatcaattttgt caatttacaGAATCGTTTACTAGCaactttctgaaattttcattttttgg ttgtgcttcatttaaaAGATAATGAGGATGAAAAATTACCATTAATCCAT CGAGCAAAAGGTTACTCCAACTAGTCCACGAAAAGTGCTTGCGCTTCAAA TAGAATATCCCACAAATTAATATAAGCATAAACTGATAAAATCCTTTTTT ATTCTTGGTGACGTCAAattcgatcctgacttgacagtAAGAATAATGGA GGACCAAATTTGTCAATGTacaatttttacaaataaacctaaaagtatgt aatattaatccATCATTGATttctatatctttatttttcacaaatgcaaa attgatattttgtaTATCTTGATTTAAGGAAATAtctgattgtcaatgcc aaaaaaTACTTCTTTACTTTAAGAACATTCTGTGTTGCTTCGACACACac cccccggattgttttagttgTTTGAAAGTATGACAAAAACACGCCTATAA TAATTATACAATATTATATATTGTTGTTCACATGactaaaagttaaaaat ctcaaaattagtaccttacaaattttaaatttttactgtggtggtcatct ttgagattTAAGATGGCCCTTTTTTCATGTAGAGAAATAGTCAATGTTTT TCATaagacaaaaaggccaatctcaAAGGTAGAACAGAattgcaagattt ccaattttccaagacacatgttttgagattgaacctttattTTGGTCATA TGAACGACGTAATGATGATCCTGACTGAATATGAGGgctcaaaaacaaaa cacacagTTTTTCCCAAGCTGACTGATCAACAGTTTAAATTAcctaaatt attgtggaagttaACGCTTAAGACGAataatgtttgggaaatcaaaaccA GATGGTACTAACTGAATGTTTGATTGTgatcaaagtaatcaataatgatc gataataatcgaaggtGGTCAGTTACAACCTATCGATTGCAGTGGTGACA TTCTCATTTGACTCTaaattatggcattttcttctTTCTACCATTTTCCA GGAGATGCCAACCAAAACCCTATCAAACCGATTTTCGTAATTGAACCATC GAAAGAAATCGAACAATTAGGTGTTAGATTACCGAACCTAATTGAACAGC GATCGAACTATACCGAAAAATCTTCAgttcgattaaagttcgattacttG TCGCAATTTGATTAAGTTCAACCAATttttttgtagctcaaatggttcca gTTATTGCTAGCGCAACAGCTCTAGCCTAAACGATCCCCAACGATAGTTG GATTAGCAGAAAAGAGTTGTTCATGCGCTGTGAAATGATTTGTGAATGAA AACTATAAATCAAATACATTGAACATcaatcaaactaattgaactTTACC AGAATTTCTCGGCttgatgactgttcgatttggtttggtAATCAAACACC TATCGTTCGATTTGTTCGATCATTTTGATTACTGTTCGATTTCTTTCGAT CATATTCAGTTAGGGAAGGCATCCAGGATCATGCCATCTATccgccagca aaaactaaatgacacttgtaaacttaagtttcttatcattttccatcgaa aacaaccaaaacattACTACCTGCCAAAGCCGGAGACAAAAGGTCTACtg taatgtcgacatccctgaTTCTTCTTATTTCAAGCCCTTTCATTAAAGAT AGGAATGATAGGAAGGTCAGGACCACTCTGTTt Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000066:252580..255912 Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00006353 ID=TCONS_00006353|Name=TCONS_00006353|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3333bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066:252580..255912 (Clytia hemisphaerica) aAACAGAGTGGTCCTGACCTTCCTATCATTCCTATCTTTAATGAAAGGGC
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00006353-exon-sc0000066-1491911889:252580..255912 | TCONS_00006353-exon-sc0000066-1491911889:252580..255912 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00006353-exon-sc0000066-1510915933:252580..255912 | TCONS_00006353-exon-sc0000066-1510915933:252580..255912 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00006353-exon-sc0000066-1575043694:252580..255912 | TCONS_00006353-exon-sc0000066-1575043694:252580..255912 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000066 | supercontig | sc0000066:252580..255912 . |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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