TCONS_00052767 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00052767
Unique NameTCONS_00052767
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1157

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00052767 ID=TCONS_00052767|Name=TCONS_00052767|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1157bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_22:36773..62027-

Legend: exon
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>TCONS_00052767 ID=TCONS_00052767|Name=TCONS_00052767|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=25255bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_22:36773..62027- (Clytia hemisphaerica)
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TCATACAATATCTTACAAAAACCTGATGGAACTTTTGAAAAAATCAAATC AGCAAGAATATTCAAGGTTTTCAGGTAAATTAAATGATGGTGAATCTTAC AGCCCCGGTGAAAATTTTTCCTTAAGTGGTGATATCGAAATCCATTCCAA GCTCAAAAGGTGTTGTGAGGATGGTCTCGGGGATGCTTTATTTAAAGAGT GTCATTTTTGCCATCAAATCTAAATTTTCGTTAATGAAATTATTCCAGCA ACAAGAATGCGATGTTATGCAGCATATCTTACATGTGTTTTGGATTTAAT GTCACTGGTTTCAATGAACTGTACCCTCTGTGGGCCTCCACCAGCACTGA TTATAGTAAGTAGCATTTGGTGTTAATTTTATACCGATATTAAAGAATAT CATTGAACATATCTCCTACCATTTTGCTACACAGCATTTTTAAGCAAAAG AAAGATTAACTTTCTCCTCATTAGGTGCAACGCAAGCACAAATCTTTAGG AATTCTTTGTTTATTCTGATTTGTCAGCATAGAGGCGTGTCTCCTTTTTA TATCATAAAAACGATTATTTTTAATATACTGGATGCAATCGACCATTGCA TAAAAAGATGCACAAGGCTAATAAAAGTGTAAATTTGTGTTTCTTAGCAC CTCAAGATATCTTTAAAGGGGAAAATTTGTAAAATTTGAGTTAGGGAGAG CTTTCTCTCTTTTGTGAAAATCTTTACCCCAGCTCCCTTTGCAGTACTCT GTACCAAAGTGTATCTCATGTTTATCGCTTTGTAGTACACTCTGCGCATT GTCTGTTTGATAAAAGATTTCCGTACGGAGACCTCTGCAATGAAGTATGA TTTATAAATAGCAACACTTCTCTCATCGTCTCTCCTCTCTCCTCTCTCAT CTCCGCACTCCATCGCAGCGGTCGGTTTGAAAAGTCTCAAATGAAAAAAG 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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_033358XLOC_033358Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_22supercontigscaffold_22:36773..62027 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
5.71877 1.63322 0.0634658 8.24865e-07 1.637 0.347813 1.47032 2.47927 0 0.751012 0.163912 0.109538 1.29557 1.55761 0.124657 0 1.31724 0 0.540754 0 1.30856 1.07397 3.70522 2.51782 1.09488 1.20136 0.946539 4.16628 2.39017 0.386702
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00052767 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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