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transcript sequence >TCONS_00052767 ID=TCONS_00052767|Name=TCONS_00052767|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1157bp TTAGGGTTTACAGTAAAAGAAGTTGGAGAATCTTTGATGATCGCTTGCAT TCCACTGATCTTCTTACTCATCATTATCATATCCAAGTTATCGCAAAGAT TTGGCATGAAAAAGatgtaTATGGGAAGCCTGGCTATCCAATCAGTATTA TTTGTCATTTTTCCAACAATCAAATTTGTTCCTTATAAATCTTTAGTTTG GATTCTActcatcatcttcatcttcgTGATTCGTATTTTGTATGGTGCCG CCTTCACGGCCGCCATTGTCATCATCACTAGTTCAGTGCATAAAGATTTA CTGGGTACTGTCAATGGAGTCGCAGTTGCTTTCATGAATATTTCAAGcgC TGTTGCACCATATGCCTACGGGACAATGTATTCGTGTTCGTTGCGTAACA TCAAAGGAATCACCAAAAACACCGATCCACTGGGATTCTCCTTCGATCCA CATTTTCCGTATATCGTTATGTCTGTTGTTTCTCTCGTCGTACTAGCACT TGTATATTTTGttaaagaaattgaattttccGATGATGACGAGAAAAGTA CCGACTATGCATCGACGGCAACGTCATCTTCTTCATCGATAACGTCGTCG TTGGATTCGACGCCGATAAAGAATTCAGCACCACTAGATAACAGTTACGA AAACTCGCTGAAAACAGAGAAATCTAGACTTATCGTTTGATTGACGACCA TATTTTACAGGGAGAGTTGTTCAACCTATCGTGTGCGCTATCAAAATAAA GTCTCTGAAAAGTCTATCACACATACAAAATTTAAAGATTGTACTCTTAC GTGAAAATCCCTACATTGAGGGTCGACTCAGACTGCAGCTTTGGTAATGG TTTTTAATGTGATGGCATCACTGATCTTTATAAAGTGACTATTAAGCTAt acatccgccatctttgatcggaattTTTAGGATGGTATCTTAATAGGGGG CACTACTAGTGAGTTTTCTCTGTCTCACTAACTCGCCAAGCAATAGCAAA CACTGAGTCAGGGTAGCAAGCGATTTCGATTTTTACTTGTGATAAACATT TAAGTCTAGTCTATAGAGTATATGATTTCGATGCAGACAATATCACATGT AATACAATACGCACTAATTATCATTTCCTAATGTACTCCAATTACAATAA ATACCGG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_22:36773..62027- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00052767 ID=TCONS_00052767|Name=TCONS_00052767|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=25255bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_22:36773..62027- (Clytia hemisphaerica) TTAGGGTTTACAGTAAAAGAAGTTGGAGAATCTTTGATGATCGCTTGCAT
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TTCTTCTTCTTTCTGATAAGATACGATTAAAAATTGAATTACGTAACATT
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GACATTTGTTTTGATTTTGTATCCGCTACATACAGTTTGTTTACAAATTT
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GTAATAAACTAAAAGGGTTTAAGCAATTTTGAATACAAAAGTGACCCTAC
ATCGCCTTTCTAATTCTTATTAGCGTAATTTCAAATTTGGAGGGGGGGGG
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GTCGGTCTGAAACTAACGCAACCAGCAATGAAAGTCATAATATTTGATGA
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GCCGCTAAATCCTTTCAAAATTGAATTATATCCAACAAAATAAAATTTTC
GCCCGAACTATAAATTCTGAAAAATATTAAATACCCCTAATTATCACATC
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ACCTTCTATTCCAAGCGAAAATTTGCTATATGAATCACATCTTCAAACCA
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TAGGATCTGAAGTTGATCAAATTACCGCGCACGCAGGAAAGCGTCTAAAC
AGTGGTTGGTTCTTCGGTTTTAAATGTTTATTTTGCTGTTAAATGGGAAA
AAAATTAGTTTGAAAGGTGACAGAAAGGATCTTCATCACTCCTTGACTTT
TAAAAGTAACTATCAAGTATCAAATAAAAGGTCAATAAGTGAGAAGTTTT
TTGCGTCGCGCGGGCGAGAGGAGTGCTCTTTTAGTGAACGAAACTTACCT
TGCAAAACCAAGTGGATATTCAATGATAAAGAGGTACGGAGGTAATCAAA
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AGACGATTCGAATAGAAATACAGTAAAACCTCTAATTAACGGACACTCTA
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CCTAGTCAAATCCTCATAAAAATGTTTCTAAAAGGCGGGCACTCAATTAG
CGGATCCTCTGATTAGCGGACAAATTTCTTCGCACGAAATGGCCAAAACC
CCTATTTTAGCTCTCCAATAGACGATATCGGATTAAGATAAATGCAATGC
ATTCTGGTTTCTAGGGACTCTCAAAGGAATTATAATAGATCAATTATAAT
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TCTAAATCCGATATCGTCTATTAGCAGACATTGAATATCAAACGGGTCAC
AGACGTCCAAAATCGAAAAAATTGTTTTAAATATTTTTATTTCAAGCACT
TATCAATCTTATTATTCAAATTATTTCTACAAATAAGTAATATGGTGGTG
TATTAGTACTGACAATCAAGTTAATTGTATTTTCAATTTTGGTGTTATAT
TTCTAGATTTTCTTTTATTTCTTAAAAACTAAATTGTTGGGTTTTAATAA
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TTGTATTTTCGACACCCTGGGATAGCCTAATTTCAAAATTGGAGCTCCGA
GATCAAAAGTTTCTAAAAGGCGGACACTTCTAATTAGCGGACACTAACCC
CTTTCCCCGATGGTGTCCGCTAATTAGAGGTTCCAACGTTCGACGAATAT
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AAAGAGCATTGCGCGGGGTGGTGGGTGTTGTGCCGCCGTTGGTTGTGTGG
TATGTTTGGGGTATTATAAGGCTTAAGACCCTGTCTGTTTTGGGGCTTTA
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TTTCAAATGTACGTAAAATTTTAAATCGGAAATTTCCCAAGCTTAGGGAT
ACCTTAATATTTCAGCATATTTTCATGATTTCAGTAAAGTTAGCTTGCCT
TCAAGTGGAAACGTTTGGTGATGTGCCTGATTTGTGTTCAATTTATTTTA
TACTTGTTATCTAATAAGAACAAGCTATATAAAAACATAAGGCTTCGATT
GCTAAAATGTTAAGAACAAGTTAAGAACATTTAAAGGCTTTGCAGACTCT
AAAACACCTGATTTCTTGGACAAAATGGAGAAAATAAGAACAACATTAAG
AATATTTTAGGCTTAAAACTCAAAAAGTTAAGAACATCCGAAGGCTTCAA
AAATTGTGGATGTTCTTACAAAAAACGCGTATACACCAGGTAAAATGACT
CACAAATTGGTAGGTTTAGGTTTCTATGAATCAATAAAATAGAATATGTA
TTATTAATAAATTAACCTCTTAGCTTTCGTAATTTTCTTTCAGTCAATCG
CCATGGCATTTTGTTTATCTGCATTTTGTTTTGGAATGGTTCTCGGACCT
GTAATTGGAGGTATCTTTTTTCAAATTATATCTTGAACTACTCGATCTTT
CCTTTAAATTTTCCAATTATTATGTGTGACTGGAGTGGTTTACAATCCGT
GTAATACATTGAATTCTAATTTCTTATGTCACTATAGTATCTTCGATAAA
TATTTTTTACTTGAATTTCCAAAACTTTTTTTTTGAATTATATCAATTTA
AATGAAAATCTTCCTTAATTTCTTTTTAGGCTTCTTTGCTTTCCCGACAG
AGTCATTTCAAAGTTTTCCAAAAGGTAAATTTTACCCATTGTGTACTCTT
CTTCTTCATCAGGGTAGACCTTTTTTTGGCAAAATCAATTTGTATTGTAA
TGTAATTTTATACCTTAGTGCAGTTGACCTCTCTAGTTCTACGTTTTACT
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AATCTTTTTTCTCTTGACTATCAAATTAGAGAGCACAAACTGAAAGAAAT
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AAGCATTTGTACCTGCTTTCTCCAATACGACCATATCAATCCTGAAAGCT
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GTAAACTTCTTTGCTGAAAATTGGAAGTTAAGTTATAATAAAGCTACGCA
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CTGACGTCACAGATAACTAATTCTTAAATAAAATCCCAAAACGTTCTCTT
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CCAAACCATAAGAATACCCTAAGAATACCCTTTAGGGTGAATTTCACTGA
ATTTGATAAGAATACAGCATTTTGTATTTGGTTAACAGAAAAAACTGCTT
CCTTTGTTAGAGATAAATTGAAGCTTTGAGGAAGAAATGTAGTTTTAACC
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TTCAATCGCTCAAAGAGGATACTTCGCAGTGTGTTTACAGGAGACCTGGA
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GGACTTGAAAAACACCAACATCGAAGTCGCCGTGGTGAGCAAGGTGTTGG
GATCGCTTTAAATCCGGACGCATTAACAGCCTGGAAAGCCGCAGGCTCTG
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TATCGGAAAATTTGGACTTAAACACAGAAACAACGCTGGTATTCGATTTT
CAACCTACCTCGAAACCAACAGTCTAGTGGCTCTCACGACGTATTTCCAG
AAAAACGATTACGTAACGTGGACACACCCCCGTTCCAAACTGCCACATCA
AATTGATCACTTCATCACCAGTAAAAGTTTTTTCAACCGATGTACCGATG
CTGGAGTTACGACACCCCTCATTGATAGTGACCACCGTGCTGTTTTTGTC
AAATTGCGTATACACTTGAATTTCTCTAAACGTTTCACTCGACGCCAAAG
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TGTACTGTGAACGAGTCAACAACTTGTATCTGGAGTCAGACGATACCGAT
AGCTATTCTAAACTTGAACGATCTATGGAGCTTGCTGCTCTTACCACACT
TCCTAAAACCATTCGACCACAACCTGGATGGTTCGCTTCCAATCAAACTC
GACTAAATCAGTTAATTAAAGAGAGAAACACTGCTGTATCTCTTAAAATC
CGAAAACCCACGAGGCATTCTAATGACCGCTTGAAAAAGGCCAGAAAACA
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GTAAAGTTACTTAGAAAAGGACTAAATAAACCAAAAGTTTCATCCGAAAA
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CTGAGGTGTTTCGAGACCACTTTCAAAAATTGTATGAACGTGAACCAATC
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TGTCGATCATGATCCTACAGATGATGAGATTACTAAAGCAACACAATCAC
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TCTTTAATTGCACTCCCAGAGACCTTTACTATTCTGAAACAAGTTGTATT
AGAATTTTGGAACACTGAGAAACCACCAGACCAATGGAATGTCGGATTAC
TAAAAGTTTTACCCAAAAAAGGTGATCTGAGTTTACCTGGTAACTACCGT
GGTATCATGTTACTGGAAATAGCCTATAAAATCGTAGCCAAAATTGTTCA
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GATTTCGCCCAGGAAGAGGATGCACAGACGCTATTTTTACTGTTAAACTT
GCATTGAAAAAGAGACGCGAACACAACCAGCAAACGTGGGTTTTATTTCT
AGACCTAGTAAAAGCCTTTGATCGTGTTCCGCGTGATCTTCTCTGGCTAG
TTCTCGAACGATTCGGCGTACCGCCAAAATTACTAAGTGTTATCAAAGCA
CTTCATCACACCATTCAAGTGAAATTTACTGTCGATTCCATATCACACAT
CCTTGATTGTAAAATCGGAGTGAAACAAGGTGATGTACTCGGCCCAATAC
TCTTTTCGATGTACATTGCTGCTATTATGATTACATGGAGGCAAACTCGC
AACCACCCACAATGCATCTTTCGTACCAAAAAGGATTTCGTACTAACTGG
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GATGCCCCTGTTATAAATACTCATTTCGACAGATTCGGCATGGAGATACA
TGCTGGAATTCGTGCCCTTCATGACAAAGCTTCAAAAACCGAAGTATTAT
TTGTTTCACGCCGCAATGCACAACCGATTGAATGTGACCGTGATGACGTA
AATCTCAATGATGAAAAATTCTTCCCTGTCGTAGATAGATTTACCTATCT
TGGATCTGTTATCACTGGCGATTGTTCCGATCGAGAAGATGTGCTACTTC
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TACCTTTTTACCATAGCAATTTAGATGAGAAAGAGGATATTCGCTTCTTA
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CTTAGCTAGCGGCGGTGAAGAAAAGTACAACAATGAAGATGGGCATGGCT
CTTTTCAAGATTCATTCTTCATTGCTAGTCACGAAGAAGATGCAAAAGTA
TCATACAATATCTTACAAAAACCTGATGGAACTTTTGAAAAAATCAAATC
AGCAAGAATATTCAAGGTTTTCAGGTAAATTAAATGATGGTGAATCTTAC
AGCCCCGGTGAAAATTTTTCCTTAAGTGGTGATATCGAAATCCATTCCAA
GCTCAAAAGGTGTTGTGAGGATGGTCTCGGGGATGCTTTATTTAAAGAGT
GTCATTTTTGCCATCAAATCTAAATTTTCGTTAATGAAATTATTCCAGCA
ACAAGAATGCGATGTTATGCAGCATATCTTACATGTGTTTTGGATTTAAT
GTCACTGGTTTCAATGAACTGTACCCTCTGTGGGCCTCCACCAGCACTGA
TTATAGTAAGTAGCATTTGGTGTTAATTTTATACCGATATTAAAGAATAT
CATTGAACATATCTCCTACCATTTTGCTACACAGCATTTTTAAGCAAAAG
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TATCATAAAAACGATTATTTTTAATATACTGGATGCAATCGACCATTGCA
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TCGCCGGGAAAAATCTCGTTATTATCTAAAAATCGTGTGTCAATTTCATC
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CTTGCATTCCACTGATCTTCTTACTCATCATCATCATATCCAAGGTGAAC
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AAAGAGATTCCACTGTATTTTAAACGATGAATTATCTTTGACTCATATCA
AGAGCCACAAAGACGTGGATAATGATTTTTTTTCTAAAAATGATCGAAAA
TAAGAGTGTGTTCACTTTAAGCTTTAGTTAATAGTTTATTGCCCTCTTCT
TAAGGGTTTGTTGAGCTTTTTGAAGATTTATTTATTTACTTTATTTACTA
TCTTCTATTCGATGGTCAATAATCTTGATACTTTTCTCACTTTTCCAGTT
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GAAATGTCGACCCGACCGGGGTTTGAACCCAACAAATGAAAGAGTTTCTG
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TTATGATATGGGTAAAATTGTCCCTTTTTTACACTGACTGAAATTCGAGA
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CTTTATTTATTCAAGATTGAGTTACCTCTCAATTACCAAAGGGTTTAAAT
CCCTTTAAGACCTTCAACTGTTTGTCTATGAATTAGACTAAACTTTGTAT
ATATTCTCCACTGGGAATCAATTGCTATAGTAATGTTTTAGCAAACGTTT
CTCGTGATGTAATTTATGAAAAGGTCTATTTAGCTTGAGCAGTAATTTTA
TTCATTTTTATCTTATCTATTTTCTTCACATTTTATTATTTTCAGCGCTG
TTGCACCATATGCCTACGGGACAATGTATTCGTGTTCGTTGCGTAACATC
AAAGGAATCACCAAAAACACCGATCCACTGGGATTCTCCTTCGATCCACA
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GAAAATCCCTACATTGAGGGTCGACTCAGACTGCAGCTTTGGTAATGGTT
TTTAATGTGATGGCATCACTGATCTTTATAAAGTGACTATTAAGCTATAC
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ACCGG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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TCONS_00052767-exon-scaffold_22-1510915933:61147..61173 | TCONS_00052767-exon-scaffold_22-1510915933:61147..61173 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_22 | supercontig | scaffold_22:36773..62027 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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