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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00054271 ID=TCONS_00054271|Name=TCONS_00054271|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=8476bp CCTCATTTGAAATTAAATGGAAGGAAATTGCACGCTTCAAAACGATCCTT GTTGGATTTTtttaccttggaacaatagaatttccattCCTATTGGGAAT TCGATAAATTTTCTTCTCCACTGTAGAAAGAAGCTCCtcaggggctgtga gacagggaatGTAAAAATGGAAACGTGAAGAAAAGTCATTCCTCCGATGA AGTTTGAAAAGCACCTTGCTTATGGACATTTGACTTGCGAAATATCagtt aaatatttcataaagtTAGCGAAACATCCTCTAGCGGTTTGTCCTCAACT TTAAGGAACACAAAATTGTCTTTGGGTTTTGATGGGATATTACTCCTGGT CACTTGTCCCATATCGGCGTACGGATCACGGGAGTTTTTCCCGGCGTATT TATGTAACGAATGCTTCTTGTCCCCTCGGTCAGGTGCTGAGGAGCCGGTC GATGCGTACGCACTTTCGAGTTTTGAGAACCCCCCACTTGGTTTTGCATG CTCCGTTTTCTTTTTCTGTTCCTGTGGTTTGTCCGGTTTATAATGTGTCC CGGTACTGTCCGAAGTTAAACGACCCATCAAATAATCGGTCATATCTTCA TTATTGACGTTACTGTTAGGATCACCATtttctgtttgttgtttgttctC TTCGCTAGCTTTGTCACCAGACTCTTTTTCTCCTTCTTTTCCTGCTTTTG ATTCGTCAACAGGATTAGGTTTTGACACGTCTTCAACAGGGCTTGGATTG CTGTTCAATGAGTCAGTGGAGACCCCCTTCGAAGAGGGATCTTCTTTTGC TTTCTCAGAGTTCGATTCTGAATTCTCAGCTTTTGACGGATCTTTATCAG 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GTCGCGACAGTTGATGTGACGCTTTCTCCGACATCTAAATAAGGATCACG TCCCTGGTTTACACTTTTTTGGGGTGCTTTAAATTCATGCGTTTTAGAAG CATCATTATTCTTGGAGCTTTCTTGTTTAGCTCGTTTGGTAGGGTTCGGT GAGGAGGCCCCTATCTCCAGGTAAGGATCCGAATTTTTCGCATTGGTTTT CACCTTGGATGCAATCGCTTGCTGCCCAAATACTGGTAGTGAGCCTTTGG AGGTCTCTTCCGATTGGGTAGAATTTGACTTTGGAGCAGAATTTGTCTGT TCTTCGCTAGCCTCGGGAAGTTTATGTCGTAGATTAGCATAAGGGTCGGA AGAAGGGTCTTGTGAGAGAGTTTGAGTTGAGTCGCCTTTTGAAAGTGTTT GACTTGAAACACCATTCATTTCATTCTTGATTTGTGCGTTCGATTTATTG AGAGCACGAAGCAATTCTTCAGTCTTGGCAAGTGCTTGGTCAACTTCTCC TTCTTCGTCTTGTCCTTTCAAATTTGCTTGATTATCCTCTTTCTTCTTCT TGAGAACTTTCTCGTTTCCCTCCTTCAATTTGTCACTCAATTCTTTTACT CTCTCCATAATCTTTGCTCCTTTCTCTTCTTCACCCTCTCCTTTATCCTC CTCCTTCTCTTTATTTGATTCACTCGTTTCATCCTCGTTCGTCTTCTTCA GTGAATCTCCTTCTTCATGATTCGCTTTTTTCAAAACACTATCAGCCAAT GAAACATCTTTTTCCAAACGTGGATCCATGTGTAAAGTTGCGTTGCTACC AGACACTGGACCCGCCATGTTTTGAGTTACATTTGATACAGTTTTGTCAG TCACCGATTTATCAACAACATTCGACTTGCTGTCACTGTCACCCTTCTCA CCCCAGAACTTCGAGCTCTCTCCAACATCTGCGTAAGGATCACTAAATTG 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AATGACATTCCACCTGTGCCTCCGTGCGAGGCATCATCGAAAAGACCCCT CTTAGTACCTGTTTTGTTAGAGACAGCCCTGATCGATCTTTTCAATCCAG CAGATCCCATCGTTGCATAAGGATCTTTGGCCAGTTTCTCATACGATTCC TTTTTGGTCATATATTTGTAGGTATCTTCCTCCTTATTTGGTAGGATAGC TCCTACTTCGACCTCATCAGTTGCCCGACGCCTTCTTCGGCGGGCTGGTA AACCACCTACATCAGCATATGGGTCGTTAACAACCATCTTGGTTTTGGTA GCTTCCTCTTTTTGCTCCTGATGGTGTttctgatgatgatgatgtcTTTT CTGGCCGATGTCTGAATAAGGATCTTTCAATCGATTCAATTGCAACATTg cttcttttgtttctttcttcaaTTTATCCAAAGTGTTTTCGTATTCAAGG ATCTTTGGTTTCAAACTTGATTCAGTCATCTCTGGTGATTGTTGTTGAGC TTCAGCTGTTGATGTGGATGTCATTGCTCTTGTTGCTGCGGACCCTTGGT TACCAGAGAGGATAGAAGTCAATTCTTTAGGCAAACTGACCACAATTCTC ATTCTTTTTCCACGTTGTTCGATTCTAGATGGTGTTAAATGAATTTCTTT ACCACGGTGGGGCGTTTCCAAGGTGCGCCGGCGGAGATCTGCATACGCTG CTTGAAGCTTGTTTTGGTCTTCCTTAGTCATTGGTTCGTCCTTAAAGATA CGATCTGCGATAGTCACTGCAATAGCAGGGTTGTTGGTTATCGCAACAGC TCTGGAGTTTGATCGTTTACCATCTGGAGGCTTCAAATCAAtcgtgattg gttctttcagcTTGGCTAACGGTCCTTTGGGatttaaagtaattttgagT GGAACCCTGGGTAATTTACCGAACAGCTCCACAATAGTACTTGGTTGTTG TGTTTGACCGACTTCGATTGATTCTC transcript from alignment at scaffold_242:1538557..1547626+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00054271 ID=TCONS_00054271|Name=TCONS_00054271|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9070bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_242:1538557..1547626+ (Clytia hemisphaerica) CCTCATTTGAAATTAAATGGAAGGAAATTGCACGCTTCAAAACGATCCTT
GTTGGATTTTtttaccttggaacaatagaatttccattCCTATTGGGAAT
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Gene-mRNA-Prot
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00054271-exon-scaffold_242-1491911889:1538557..1542203 | TCONS_00054271-exon-scaffold_242-1491911889:1538557..1542203 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00054271-exon-scaffold_242-1510915933:1538557..1542203 | TCONS_00054271-exon-scaffold_242-1510915933:1538557..1542203 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00054271-exon-scaffold_242-1575043694:1538557..1542203 | TCONS_00054271-exon-scaffold_242-1575043694:1538557..1542203 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00054271-exon-scaffold_242-1491911889:1542798..1547626 | TCONS_00054271-exon-scaffold_242-1491911889:1542798..1547626 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00054271-exon-scaffold_242-1510915933:1542798..1547626 | TCONS_00054271-exon-scaffold_242-1510915933:1542798..1547626 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00054271-exon-scaffold_242-1575043694:1542798..1547626 | TCONS_00054271-exon-scaffold_242-1575043694:1542798..1547626 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_242 | supercontig | scaffold_242:1538557..1547626 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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