|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00054319 ID=TCONS_00054319|Name=TCONS_00054319|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1738bp
attaAATTGTGTGTAAATTAATGTCATTGCGGTCAAGGATGAGTCCATGC
TCATATCCAAGGGAATGTCGTTAAAAGTCAATGGGCGAAATTACGTTATG
GTCACCAAGAATGCTATTGCTCAAAACCACCCAATTCATGCTTTGAGAAA
GGCCGTTACAAGTTTATTTCGAATAGGGTTTTATCGCTTAAATATGCTAA
GCTTTCTATTCTGCTTATAAAGATGGACGGGTTGAGTAAGGGCACAAAGT
CTTacgtaaaaaaacaaaaagccactaaatttatgacttagagagaAATT
AGAGGTCGCttattttatataatttggtcAGACCTCACAAAAGGAAAAGA
ATAAAACATTTCGTCCCTCACATGTATAGGATTTCTTGATAAGCTTTTTG
TCCTCTTTTTGATGGTGTGAGATGCGAGCATAGACTccattgattgattg
atattaTTGAAATTGTTGTTGCTTGGAGTTGACATAATACATATTGCTGA
AAACTATCGTATTTTGTTGGAAGAATTAGTCTCAACATTAGTTAATACTA
CTCATACGTTAATTTACAATGAGAAGACTTATACTCATCTCGTCCAATCA
TAAACGTCGAAATGAACAGGCTAACAAACAACCAACGCAAAAAGATCGGA
AGTCGAGGTCCAGTCTGAGCAACACTAACTTAACAAGCAGTCAGAACAGC
AATATCAACAACGGCAACAACAAACAGAACATCGCTTCTTATGGCAGTCA
AACGCAGTTCAAAGCTTCATTCACCATATCACGTGATAAAGATGACACTC
CAGCTTGCTTCAAACAGGACGGAGAACGCTTCACAAATGAACAGACCCTG
AAATTATATTCAGCTGCAGACTACACTGTTAAAATGGAAATTGCACCGAA
TATGGAATTATTGTATATCAAATTTGGTGGCGTTGAAACTCCCTTCAAAT
CAACCAATGATCCTGAAAAAGATCAAAAGTCCATCTACCAATTTTTATGG
TCCACTAAAGGGATTGACCCTACAGAAAATCGACATCGAACAGACGTTTT
ATGTTCTATGAAgttcaaaaacttcaaagaaataGAGTTCAGGCTACAAG
TCAAATTTTATACTTTACAGAAAATGAAACATGCAACTTGGGGCGAAAAA
TTGAACAGTATTTCTATGGATTGTACTGCTGGGCGTGGCACTTATcaatc
ttttgttgaaaaaatgaaatatatttaatGCTAATGGGTCCAAGTCGTTC
CTTCATTGGATGCCTgagaaaatttattattttctgCGGTTGGGTTAGAG
ATGTGGCACAGCCAATCCAGATATTGAAATTCTGTGGATTACCTTATTCC
AATATTTGTTCTGCGCAGTTATTTGGTTCAGTTCTAAGCTTGTGATTTAC
GAAGGCTCTGCTGTTTGAATATTCTCACAGAGTAAGATCAAGATACAAAT
ACAGATTGACGTCATGAGTTACTATGGAAACCGTTGTAAACCACTCCTTT
CTCTGGTAGAAAATAGAGTTTGTGTTGTAAACTCATTGTAACCATGTCAA
CCAGCAAAAGAGCCTTGAAGCTGGTTTTATCCaaggataaactttttaaa
aatctatgaTAATATGAACTATAAgtatcttttataaaatgttaattttt
agtTCCAGTTATTTATTTACGATTATATTATCTGacgaaagaaaatattt
ttaccccTTATCTACCTACCCGATTTTCTTCTAATGCC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_242:168714..182712- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00054319 ID=TCONS_00054319|Name=TCONS_00054319|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13999bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_242:168714..182712- (Clytia hemisphaerica)
ATTAAATTGTGTGTAAATTAATGTCATTGCGGTCAAGGATGAGTCCATGC
TCATATCCAAGGGAATGTCGTTAAAAGTCAATGGGCGAAATTACGTTATG
GTCACCAAGAATGCTATTGCTCAAAACCACCCAATTCATGCTTTGAGAAA
GGCCGTTACAAGTTTATTTCGAATAGGGTTTTATCGCTTAAATATGCTAA
GCTTTCTATTCTGCTTATAAAGATGGACGGGTTGAGTAAGGGCACAAAGT
CTTACGTAAAAAAACAAAAAGCCACTAAATTTATGACTTAGAGAGAAATT
AGAGGTCGCTTATTTTATATAATTTGGTCAGACCTCACAAAAGGAAAAGA
ATAAAACATTTCGTCCCTCACATGTATAGGATTTCTTGATAAGCTTTTTG
TCCTCTTTTTGATGGTGTGAGATGCGAGCATAGACTCCATTGATTGATTG
ATATTATTGAAATTGTTGTTGCTTGGAGTTGACATAATACATATTGCTGA
AAACTATCGTATTTTGTTGGAAGAATTAGTCTCAACATTAGTTAATACTA
CTCATACGTTAATTTACAATGAGAAGACTTATACTCATCTCGTCCAATCA
TAAACGTCGAAATGAACAGGCTAACAAACAACCAACGCAAAAAGGTATTG
ACCACTCTGCAATTTTTTTTTGTTTATATTCGTTTATTGTGAGTAATTAT
TTCAAAAATGGACTATTTTTGCCATTTTCGGCCTTGGTCAAACATATTAT
GAGCAACCTTTCTAAAATGAGTGGTAAAGCCTCCCCAAAAATCGATTTCA
GGGTAAAAAGGCCTTATAAAGGGACAAGTAAGAAATAAGGGTGGGTTAGT
ATTTCAAACAGAGAGGTAAAAAAAATTGAATAATATTTTTCTGAAAATGT
ACAATAAAGCTTTTGGTGTGAATTTCATATAAACAATTATTTCCAGTTTT
TAAATCATGTAATATTTTGAAATTAGTATCTAATTTTGCCAATTTTTTTA
TAAAAACACTGTAAAAAGTTGGCTTTCCGAGGGTTGGAGTAAGTAGATTT
TGTGAAAGATTGAGGGCAATAGATGAATTCGTATTTGGTGTTAAGCTTGA
TACTCTAAGGTCCGAAAGGGTCCGGGGAGTGTCCGAAAAAAATTCGAAAA
TCAACAAGCGGTGGAAGAGGTTAATTGGAACCTTAGAGTAATGGCGTAGT
GCAGTGTCAACGGAACCTGGATTTCGATTGGCTTTGGTTAATATCTATTT
GAGTGATCGTAAAGCTATGCATGATTTTACAGTACTTCTATTTAATCGTT
TAGTTAAGTTCAAATCTAGCATTTTTGAGGTTGGGAAGGAGCATCAGGAA
GGAGCACCCTTCACACACCTACCTCTATTATGTGTTCGATTTAAAGTTCA
TGTTTAGTTTGGTAGATTTTTCAATCGAAATAAAAATTAAAGGAAAACTG
TCACGTCATTTCTCAAACTGTTTAAAATTTTTGCTCCTTATCGGAACTTA
TTGAACAAGACTCGATGTTTATCGAGAAAATTTCACTTTCTTCTTGATTT
TACAATTAGAATGAACCGTCCTTTCACCGTCAAAGGCTAGCTGCAATGGC
CCTTATTTTTGGTATGTTTTCTATTAGACTAACTCGATGAAAACTAGATT
CGATCTTCAGGGTTCCGATGCAGCTGAAACTGTGGTTTATTCCTCTCTTT
CCCGTCTATAAAAAAAAACTCATACTCATTTAGATATACGCCTTCAGAGT
AATCCATCTATTTTAATTTAAGTACAAAATCTGTTAGCATAGTGGATGAG
GAAAACGAATGATAAGAATTGTTTATGGATCCTTTTACTTGAGACAATAC
CTTTGTTGTGACTAAATTTCATACTTCAGTTATTTTTGTATGCATTCTTT
TTCCTTCGATTTTCATCTTTTCTTCGAATGATTTTCAGACAGAATCTTTT
ATGCACGTTTTTTAGAAGAACAAACTATATAAGAACATAAGGCTTCAATA
GCCAAAATGTTAAGAACATTTTAATTTTTCTTAGGAAAATGGACAAAAAA
TACTGAAATTGGCGAAAATAAGAACATGTTAAGAATATTTTTAAGCTTAA
AACTCAAAAATTTAAGAACATCCCAAGGCTTTAAATTTTTTGGGATATTC
TTATAAAAAAACATGTATTTTTTTCTCAAGGAATAAAACTAAAATTCAAA
ACAGCAAATGAGAATTATCAGGTCGAATCTACAACATTTTAGAATAAGAG
AAGCTAGAGTCTTCTAAATGTGTTTTTGTATCCTGGTTGTTGTCTAAGCG
TTTACCGGTGTTCGGTTTTAATCCCGCTAGTATGATACACGCTTTTTCTC
GTAAGCCAGTAAATTTTGGCTATGGCTTGGCGGCTCCTACATTTTTTTTT
CCTACATGATGCTCTTTATTCGTTTGTTCTTATGGTCTGGCCAAAACAGA
GCCTTATGTTTTCATAAAATTGTTCTGATAAAAAAAAACGTGTTGTGAGT
GAGGTATTTTCTGGCGTGGTTGCATAATTGATTTTTCGATGTGATTGTAA
TTTGATATTCAAACGTGTTGTGCGTGATACATCCCGAGTTCGTCCTGACT
TCACTTGGAAGTGCGTGGTGAACGGGCAACTGATGTACTTTGCTCTTTGA
GTTCCTAGTTCTGAATATTTACACAACTTTCTGAGAGATTTGGTTCAGTA
GAAAATATGACAAAGTCAATGAAATTCTGTCCGAAAAACTTTTTCGGACA
CCTTATGCGGTGAAACAATCAAATATGACTCGAGACACATAACCACTTCA
AGAGGAATTNTTTTCGGACACCTTATGCGGTGAAACAATCAAATATGACT
CGAGACATAACCACTTCAAGAGGAATTTCTTCATTTCTTCCTCAATTTAG
AACATGCTTTTAAATATTTTACGAGTTTTCTATGCAGGAGCCTTTTGATT
TTCATCGCGTATGTTATGCTTCTCTTGTTGCTAAAGGAGAGAATAATAAA
GCGCTCAAGTGAAGTACGAAAGAGGGGAAATAATACGAGGTGAAAAATAA
AATGCGCTGTTGTGAAAGAATTGGACAGCTTAGCTCTTTTTTATTTGTTG
GTATAATAAAATGTGATTAGAATTTAACCTCCTGCCAATTATTTGTAAAC
TTGTCCTTTTGGATGGACTTTCATCAAATGTAAATGAGGAAAGAAGGACT
TATTGTCATTTCGTCAAGAGGGGAAATATTTTCTTTCTCATTTTCATCTT
TGTTTCACTCTGCATATTCTATTTTTCTATATTCTATTTCTCTTGAAATT
CATCGAAAATGATCTGTTTTTAGTTCAGTCTTACGTCCACTCTTCTTTGA
AATATTTTTGTAGAATTATATTTTCGTTTTCAATATTTTTTCTTTATTTT
CAAAAGTTTTGGTTTTCGTTTGTCTTTTACTAACTACAAGAGAAATGGAA
TTGTCTAAGGTTTTGACAAGTTTTGATAATTTCATTTTTTTTGAAAAATA
TGATGTCAAGATGTGTGTGATGATATGATTGTGTCTGGTGATAATGAGAA
TCGAAACCAAAACCTTCCTCTTTTTCCAGAAAGGAAAGGTCTTGACCTTG
TCAGTTTTCTACTTCTGCAATCACATTTTGGGATGTTTTGAGACCTCCCC
AGTAGATGAATACGATAATGATTTGTTTATATAGATTAACTCCTGAGTAT
TGATTTAAAGTTAAGCCAGAAGATGTAGCCACGTCAAATTGAATTTCTTG
AATAGACTGTAATATTAAGCTTCGAATTAAATTGTAAACCAGTTAGTTAC
ACTTGTTACATGATGAATTGATCTCGTACAGGATAGAAATATTCCACCCA
AAATCGATTTTTGCAAACTTCAACGCAAAAAAAAAACAACAAAAAAAAAC
AGTGAAGCTGGTGCTCTCGTATGAGAGACAGTTCATTTAATGTTTCCAGA
CCATCTAAAAAGAACGACAAATAGCTATTAAAAAGCGACAAAAAGAACGA
CAAATCCTAACCCTAAACCTAATTATCAAAGAACGAAATATTTTGTCGTC
CCAAACCGCGACCTTGTGGTCAGTGACTACCACCCCTACATATTCATTAC
TTTTTGTACTTTACGCTTTTTAACGACTAGTGGTTTAAGAACGATAAATT
ACGCACGCGTATAAGTCTCTGTTTGGGTGAGCTGGAAACATTAGATGAAC
TAACTCATAACTGAAAGTCCCAGTACAATACAGTTATTTCGAACTTAGGT
CAAGCACTATTATACAGTCATCCTATCCCCAAGTATTTTTTTGTGATAAT
TATATCAATGATTAAATATAGACAGAGGCGTATAAATTAGTGTGCTTGTG
ATTTGTTTTGCTCCATTTTCTCGGTTTCAGCGATTTAGAGACAACCAACT
ATTTTTTAATTTTCAAGCATATAGAACGGCTAATTCTTATCAAATGTCTC
ATTTAGGCTATAGTGTGTTTATGGAGGTAGTAAAAATTTTAGCCAAAATA
GCGCAAGACTTTGGCATGAAAACGAGGCAAATTTAATTGTATTCACCATA
AAATAACATTCCATTTTTTTTTCAACTGTCAACTAATCAAAAGTCCAATC
TGACGGAAAAGTGACTTGAGATTGTTTTCCTTAAAAAATATCTTTTAATG
ATAAATTTGAATTTCGAGATTTTTCAAAATATAAGCAAGTTAGCCACTGT
ATAACATACCCCAAATTAATAATAGCTGTTATGAACAAGATCTCTTAACA
CTGTTTGCCCTAGACTGAAATTGCTACAATTTGATTTTGGGCAATTTGTT
GTATTAATTAATCACCCTTATTTTTGAAAGACTTCTTTAAAAAGGCTTTC
AAGGATACCCTACCTAGTTTCGCATAATCAATTATTCTCTTACTAGCTGT
GATATTGACGTAAAAAAAGAGAAGAACTTCTGGCTTTATTTTGTAAATTC
TTCAAAATATTGTCCTAAGTGAGGAGTTTTTAAACGTGTTTATGTTGAAG
AAAGAATCAGCTGACTTGGTTCAGTTGAAGAGTATTTAGTAAACGTTGAC
TAGTAAAGTTGAGTGGTGATTAACGTTGAAAAGATTATTCAGAATTTGTT
AGAAAACTTACCAGAAATAATTCTAAGGATAAGATTGAATACTCCGTACA
TGTGTACAAAATATGATTCGATTTTAAAATTTTTGTGTATATTTTTGCTC
TATTTTTTGACTTTCCATTCTTGGCCGTTTTGTTTTGATTTTTCTCCCGA
CGCTTACCCAGTCCCCCAAAAGTCAACGCGGTCATATTTTGCACATGTGA
AATATTACACACTGTATAGAGAAATTCCTCTCTCTCTTCTTGTTTCGTAA
TGGAATTAGTGAGAAATTCTTACGGTGATTATGGTTAAAAGTTGGTGTGA
AATTTTTCTTGTAATACGATTAGGACGTCAAAATTCGGCTTTTTCTTGGT
TTTCTTTCGTAATGTCAATCTGCTTATGGTTTCATGTTTTTTTTCATTCT
TCTTATTTCTTCAATTTTCAATGATCTTCTCCTCCCTTGGTTTCTCTTGG
CTTTCCTGTTTTCGAATTCTAAAGCCTGTGATCTTCATTTATATTAGAAA
CGTATGTTTGTATAAGAAGAGTCTAGGGTGATATAATATACGTCCAGGGA
TCTGGGTCGAAAAATCGGAGAGAGTTTCCTTTTCCAAGGATGAATATTCA
AGTTAGTACGTTAGTTGTTATAATAGTTAATCTATAAGTATTTTGTAAAT
CTTGAGTGATCAAACTTTGGTTTTTAGGTCTCAAAACAGCTCAAAAGGCA
GTATTTGATCACTTCCTTAGGCTTCTTTAGCACAGAGGGAGGAAACATGC
TCGCCAGTTTTCATACTTGAAGGAGTCTGTTTACATCCAAACACTCTCCC
TTCTCTTTCCCTCTTTCTTTTCATTCCACTAATTATATCAACATTCTCAT
TGAGAAAGATCTTCTCGTCTTCATTTTTTCATCTTTTTCGTTTGCTTTTT
CATACCCCTAAGTAAATATGATTAAGTATAATAAGTGCTTAATCGTGTGA
AATTCAAAATGTGAGCTTCAACCAATGATAGATTGCTTTCTTTTTTTTCC
GTGAAGATAATTCTGTTATCCATTTTCTATTTTTCTTCCTCTCTTTTCCT
CCTTTTTCCAACTTGTCTTATACTTTGTTATGTTATGACTCCCCTGGTTG
GGTGGACCGATGTTGAGCGAATGACTTGGAAAATCTGTTCATGCAGTGCC
TTGCTTCTCTTGTTCACCATGTATAAAGGGCCTAAAAGGACTTGTTGGAC
TTTCCGCTTGTGGTTACTACGTTTCCTTTGTAGTGGGATTAAAGATTCTT
CTTCTTCTTTTCGTGAAATCATCTTCTTTTAAATGGTATTTGCTGGTTGA
TGTTTTTTTCAATCTCTTTTTATTTTGAGCCCAATTAAAGCTTTTAACCA
TTAAGAATAAACCATAAGAAATAATTACAATGCAGCAAATTCTTAGTGCT
TTCCTATTAAATTTTCATTATATAGTCTTCTTTTTTGCAGTCTTTTCTTT
TAGTAAAGGAAAATTGCTACAAGGTATAGTCAGTTAAAATCATTATTTGA
ATAATTGGTTTCAAAACTTAAGTTCAAAATATCAAATTCACGATATTTTG
AATTCATTGTTTCGGAAAGGTGTTTACCTCTTTTATTGTCGTTCTTAAGA
CTCGTTACTCAGACCTCGTTCCCACTTTACTGTTCCGTTTTGCCCTGGTA
TGATTTTCGTTACGGATCGAGTGTGTTCATATTGGTTTCGGAACGTTTCG
GAGCAAGAAAACGGAGCGATTCCGTTCCGATGAAAAAAGTGGAGCGAAAT
GATCTGTTTCGATCTGTTTTGCTTTGTAACGTCTTCTTTTTTGACGTTTC
GAATTCTGACGTTCACACTTGTTTCGGAACCATTTAGTTTNCGTCTTCTT
TTTTGACGTTTCGAATACTGACGTACACACTTTTTTCGGAACCATTTAGT
TTCGGAACGGAACGGAACCGTAACGTCTGAACATGGTCTTCAAACGATAT
ATTAAACAGACTGTAGGTTAGTCCTCAAGTCGACTCGTTCAGTAGAAGAA
TCACCCCGTGCGTCGATCTTCCTTCTCCTCATTTTCTTCCAATGAATAAA
AGAAAACAAAGTGTGAAAAATATGGGAAACTGTAATTTTTATATCGTACT
TAATTTTTAATCTATTCTTCTCTTTTCCCCTCTGTACTCTTCAGCCTCCT
CTCACAAGTCTTTTGAACTGTTTTTCTACTTTACTCTGCATTATTTGCTT
TTTTCCACTCCTTGTTTTGAAGGTTGTCGAGCTGTGCTTTGTAGAAAGAG
TTATGAAGGAATATGATGTTGGGAAAGTCTATTTGGAAATAGGTGGAGTC
TTTGGCCTGCAGGAGCCATCTTTTTGTAGAAAGAATCCCCAAATGTGGTT
TTCTTAAACGAAAAGAAAGATAATAGAGAGAGGAAAGGGATATATTATAG
TAAGTTCAACTGCACTTTATATCAAGGGCAGGCCGTTTTAGTAGCTTTAG
TACTAAATATTTTATAAACCCTAAGATTTTTTTATTCGACTGCAGGAAGC
AAAAGGGAATAATTTTGGATGTTCTTTTCTGATGTATGTAAAAGAGACTT
ATTGTTATGGCTATATTTTCAATATATACTTATCTTCTCATCTCTTATAG
CTTTGAAAAAATGAAAAAAATAATCAGAATATAAAGTTTGGGTTATTAAG
ATCGCGTCAAATAAAATAATCCCACTCTCAAATACTGAATATTTCATTAA
AAAATAGATTTTTATGACTTTTGGGTTTATTTATTGGGGTTGATTTGTTA
TTCAAAGAGGAAAGAGACGTCTCAAAATGGCTTATTTTTAAAAGAGAGTC
CAAATCCGTTCATATGATTTAGTTCTCCCTAACAACAACAGTTCTGTGAC
AGCAATNAAAAGAGAGTCCAAATCCGTTCATATGATTTAGTTCTCCCTAA
CAACAGCAGTTCTGTGACAGCAACAAACTAACCTGCAGCCATGCCTATTA
TGCGAGCATCGGCTGCTGTGCAGTCTGGTGGTCCACCGCCAACTAGACGG
AATAACTCTAATGTGGAAAATCGCAAAAGTACCTTTACTCCTGAAAGTAA
GTATTCATGGTGCAATCCAACAAAATTTAAATTAAAGACTGGATTAGACT
GCATGGTCAGCCCTTGCCCCTACCTATAACAAAGGGAAATGGTGGATTTG
TTTTAGATTACAAATAGTTTTATGAGAGCTGAGTGGAAACGTAAATAAGT
TTGCGACTTTACTTTAACACATCCAAATGGCTAGCCCAGTCTAGAGTTCG
TTGTATACATCCCCTTTGAAAATGATAGAAGATGCAGGATGGGATATGGG
AAACGACGTCTGTAACGCTCGTTTATCAAATTTTTGATAATGTGAACATC
GCTAGCTTGGTACTATAGTTACCTCTCGCTAATACGAACTGGAATGGGAA
TTCCAATCCTTTTGAACAACAGAGGGTAGTACAGGAATACACCTTTTCGA
CTGTGGTCAGGTGCATACCACTTTATTATTTAATTTATCACCATAAACTC
GATCCAATCCTTTTTTTTATACTTTTTTCTATTGTCTTTAGGTGCGAAAA
AAAGACTGGGACGGTTTTAGGGTCGTAAAGCGGACGAAAAAATGCCCGTG
CGGTAATTGGCGGCTACGGTCGAAAAGGTGTATTACAGAGACTTTTTTAC
GAGTGTTACCCTTTGACGGGAATTGGAAATGAGTTCCATTTATAGAAAAA
TTCGAATAATAGAAGTTCGAATTAGCGAGAGTTCACTGTAAGCATAGCTA
ATCTCCAAGCAGATTCTGATACTCCACGCATGCCACGTAGACACTCTAAA
GCTTTTTTCCCATGTACGTAAAATTTTACTTAAGACCTTGAAGGTGGGGA
ATTTCCCTAAGCTTATGTAGTGTTTTAAGGCCTTATGTAAAGTTTGCTTA
CGTTCAAAAAGTTTTAAACGGAAGGAAAAGTCACGTAAGACCCAGCTTTT
TTCACATGTACGTAAAATCTTACTTTAGACCGTACGAAAAATCGTTCGTA
AGGCTGTCCTTTGGGAATTTCCCCGATATTATGTAGAGTTTTTGTTGATT
AAGAGGTTCTTACGTGACTTTTCCTTCCGTTCAAAACTTTTTGAACGTAA
GCAAACTCTACAAAAGGCCTTAAAACACTACATAAGCTTAGGGAAATTCC
CCATTCTTCAAAGTCTTAAGTAAAATTTTACGTACATGTGAAAAAAGCTT
AAAGGCCATAGCTCCGTAACAAAATCTGCCCAGGTTTGTGGGTCTCTTTG
ATCTTTTTCCGTTTGATTCGTGATGAATAAATGAGCTTCTCAGCGCCATG
GCTGGCTAAATGAAAACAAATTTTATACATAAATATTAGAACCCGGTTGC
TTTTGCTTTTGTTTTAAAGCAAATAGCAAAGTCACTATGATTTTTTTGGT
TTAGATATTCGCCAAGCCCCCACGGTGCGCAAAATGGATGATCTGTTATG
AGATTAAGTCATATAGTTGGTTTCATTTTTACAAATAGAAAATTAAATTC
TCAGCTTAAGTTGAGCTAGGATCTGACACTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCT
GTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGT
CTGTCTGTCTGTCTGTCTTTTATAATGTGTATGTCGGACGGAAATGGTTA
TTTAGGTGTGTGGCATTGGGTTGATGGATGTCTACTAAGTGGCAGTTTTT
ACACTAGGCTTTGATAGTGGTAGTATTCGAGCACTTGTTTTGAACTATTT
CCATCAATGATCTTTACCATATTGATTTTGTCGTATATTTTTTCTTTGGA
TTGGTTTCACTAGTTTTGGGTTCAAAATTTTTCTTTTGCAAAGGTGGGTT
TTGGCCTTCATCAACAGTTCTGAATTGCTTTCTTCATGTCCTTCCGTCCG
GCTGTCTGTCTGACTGTCTATCTGTCACAAAAACTTTAGGACAGCCTGGA
GACTTCTAAAATAGTTGCATTTGGCTAAAATTTGGCACACTTTTTCCCAG
GTTGAATTTTCAGGGACGTTTTTTCATTTTTCAAATTTTGATTTTGGGTT
TTCACAAAAAGGAAGCTAAATCTTTGGGGCAATCATTGAAAAAGTGATTT
TGAAAATTTTCACCAAATATGGAATTATTTGATTATACTTTTGCTTTGTA
CATGAGTTTGTCACGTACTCTTGGTAAATCACTGCCACTCCTTTATTCTT
CAAATGAGTAACTCAAAACAAAGACAGAGTACCTATTTTGTCATCATCCC
CTCCTTTTCAATTAATCATCACTAAGTGTCAATAATGATTAATAATTAAT
TACATTCTCTCCCCCCTAATCAACCCATATGGGGCTCTTTTTTCCTTCAA
AAATATGGATATATGACGTCATGGACAAAAGGTTTAATCTTTCGAAATCT
TTCTTAAAATTAATTAATGTCAAAAAGGCTAGTTCATCCTCTTCAAAAAA
AAGGAAATAGCCTTTTTTTTTGAATAATTTCATTGTAAAGCTTATGTTCT
TTTGAGGGGACTAAAACAATAATTTTGATGGGATTGACTGATATTGATTG
ATTGATATTGATTTATGTTTTCACCAAGAAGTGAGCAAATGACTTGATGA
CTACCAAGCTAATGTAACGCTTTTTACTCAATGATGAGTTTTTCTTGACA
ATGTGACATTTGTACACAAAGTAAACATCCAGGAGTGTCTGGTATCAAAG
GCTTTAAAAAGGGCAAAGAAGAAAAAAAGCAGTTAATTCGACATACTTAA
AGATAAAAAGAAGAAAAGGACATACGAGGAAAGAATTTTTTTTATCAAAA
TCGATCAGAATACAGTCGTAGTTATAAAAAAATAAAAATAAAGGAACGTA
GAATTATATAAGAGAAAAAGAATACTAAGAAAAGAATACGAAGAAAAAAC
TTCAAATCATCAAGCAACATATGTGGATGGTTTCCTTTTTAAAACTGATC
GAATTCTTATCCTCGTTTTTATCTGTCCTAAAAAATTCAATTTTTTTGGT
GGTGTTCTGACTGAAAACTGTCTATGACGTCATTTTTGTTTTGACCATTC
ATCAATCAAAGAAAATCATCTCTAGACACAGAAAGTTTATTTGTGTTTGG
TCAGTGGAGTCAAGAGGAGAAAATTTAACTGTTTTTGTGAATTTTGTATA
AAACGTCATCCTTGTTTTGATGTCGGTCGAGGAGGATTAATCCAAATTGA
GTGGCTATACAAACATTGTTGAACATACTCGTGAAAAGAATTAACTTAAG
TCAATATTACTGAGAGACCTCCAAAGAGTGACTTTGTAAAAAAGGAATAT
CGTAATAATTTTTGACAATCTATAGTTGGACGCTGATGGTTTCGGTGGTC
AGTGGTTTCTATAGTGTGTTGAAACAATAAACAACTTTTTGTTTTGATGT
GCTTTTTGTAGATGTGTTGTTGTTCTTGATTTTATTTGCCGTGCAATAAA
TGGCAACGAAAACTGGTAAAACGACTTTTTGCTACTGTATTCGTAATGCA
GGGCTTTAAGAACAATAATTTTAGCGATTCATTGAAATAGTTGCATTTTT
ACCAGTTTTCCTTTTTTTCAAAGGTTTGTTTTTTTCGAGCTTCAAATTTT
CACCGGTAAAATATTTAGGATCTAAAGAGATCTTGTGTGAAACACATTTG
GTGTAACAAAACCTTGTTACTACCTACGGTCATAACGTTTATATAACATT
AAAGTAATGTCGAAACACTCTGTGTCGAATGTGTACTGACCAGATAATTT
AAGAATTTCTGTTCTTTTTTACCAGATCGGAAGTCGAGGTCCAGTCTGAG
CAACACTAACTTAACAAGCAGTCAGAACAGCAATATCAACAACGGCAACA
ACAAACAGAACATCGCTTCTTATGGCAGTCAAACGCAGTTCAAAGCTTCA
TTCACCATATCACGTGATAAAGATGACACTCCAGCTTGCTTCAAACAGGA
CGGAGAACGCTTCACAAATGAACAGACCCTGAAATTATATTCAGCTGCAG
ACTACACTGTTAAAATGGAAATTGCACCGAATATGGAATTATTGTAAGTC
CTGTTACTTCGGCTTATATCTAGTGCTGTTCAGATTATTCAGACATACCA
TCATCAATCAGGTTGACAGAAGTAAGATTTAGACGGGGCTTCATTATCAA
TGTATGAGATTTGTTTTTCTCACATAATCTAGATTTGAGTGGTTAATTCT
TCCCACAGGCTCGAGTTTTCGTCAGTTATCGATTGCGTCAAGCGCTTAAA
CCTGATCAAAGGATAAATGCCATGTTCAGATGAATGAGCTGTTATGAAAT
TCAACAAGAACATTAAAAATCTATTATTTTTACTCTCAATAACACCATTG
AGGGCTTAGAATTTGTGATTTTTTGTCAGTATTAAGGAGCCACCATACAA
ACAGTCCTTAACTTTTTGTTTCGTCTCAGTATCTTGTTTCAAAAGAGATA
TCCTACGTTATGAAAACATTAAATTATGTTTTGGCCTAGACGAGGACTGG
ATATAGCGCACTTGTTTATCAACTTTATGTTAATCATGTTTATATTACAA
AAACTAGAGAGTTTTAAAATCTCCCAAGCTCAATTGAGACGAGATGGAGT
TTTTACAAGCTCTTATTTGATTTGGTTGGTCGTTAACCAGTAATAAAACA
ATTTTGTTACTTTTCCTAAAGAACGCGTCATTTTTATTATTTTAAATGAC
CAATTATTAAAGTATCTTATAAAAACTCCATCTCATCTGGCTCAAATAGG
AAATCCCCACTCATCCTTTTGACCTACAACTTCAAGAAATATAAAATAAA
AACTTTCGCTCTTAGGTATTGCTATTTTCCGGTAGATTTGATACCTTAAC
CTTTGATTTAAGGTCGGCGTATACTTGAGTTAAATGAGTAAACTTCCTCT
TTCACATATTCTTTAGAATACTTCATCCACTTCCAAAAAGGTCATTTCCA
TTTTGAGAATACATCAGAGCATTTTCCCATGGCCATGACTTTAGGATCTA
AAATAATTTCTCGATTTCCCACTTAAATTTTCTTGAGCACTCAATGATTT
TTATTTATCACATATTTTTTCAGGTATATCAAATTTGGTGGCGTTGAAAC
TCCCTTCAAATCAACCAATGATCCTGAAAAAGATCAAAAGTCCATCTACC
AATTTTTATGGTCCACTAAAGGGATTGACCCTACAGAAAATCGACATCGA
ACAGACGTTTTATGTTCTATGAAGTTCAAAAACTTCAAAGAAATAGAGTT
CAGGCTACAAGTCAAATTTTATACTTTACAGAAAATGAAACATGCAACTT
GGGGCGAAAAATTGAACAGTATTTCTATGGATTGTACTGCTGGGCGTGGC
ACTTATCAATCTTTTGTTGAAAAAATGAAATATATTTAATGCTAATGGGT
CCAAGTCGTTCCTTCATTGGATGCCTGAGAAAATTTATTATTTTCTGCGG
TTGGGTTAGAGATGTGGCACAGCCAATCCAGATATTGAAATTCTGTGGAT
TACCTTATTCCAATATTTGTTCTGCGCAGTTATTTGGTTCAGTTCTAAGC
TTGTGATTTACGAAGGCTCTGCTGTTTGAATATTCTCACAGAGTAAGATC
AAGATACAAATACAGATTGACGTCATGAGTTACTATGGAAACCGTTGTAA
ACCACTCCTTTCTCTGGTAGAAAATAGAGTTTGTGTTGTAAACTCATTGT
AACCATGTCAACCAGCAAAAGAGCCTTGAAGCTGGTTTTATCCAAGGATA
AACTTTTTAAAAATCTATGATAATATGAACTATAAGTATCTTTTATAAAA
TGTTAATTTTTAGTTCCAGTTATTTATTTACGATTATATTATCTGACGAA
AGAAAATATTTTTACCCCTTATCTACCTACCCGATTTTCTTCTAATGCC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00054319-exon-scaffold_242-1575043694:182069..182712 | TCONS_00054319-exon-scaffold_242-1575043694:182069..182712 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00054319-exon-scaffold_242-1575043694:170570..170837 | TCONS_00054319-exon-scaffold_242-1575043694:170570..170837 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00054319-exon-scaffold_242-1575043694:168714..169539 | TCONS_00054319-exon-scaffold_242-1575043694:168714..169539 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00054319-exon-scaffold_242-1510915933:182069..182712 | TCONS_00054319-exon-scaffold_242-1510915933:182069..182712 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00054319-exon-scaffold_242-1510915933:170570..170837 | TCONS_00054319-exon-scaffold_242-1510915933:170570..170837 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00054319-exon-scaffold_242-1510915933:168714..169539 | TCONS_00054319-exon-scaffold_242-1510915933:168714..169539 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00054319-exon-scaffold_242-1491911889:182069..182712 | TCONS_00054319-exon-scaffold_242-1491911889:182069..182712 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00054319-exon-scaffold_242-1491911889:170570..170837 | TCONS_00054319-exon-scaffold_242-1491911889:170570..170837 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00054319-exon-scaffold_242-1491911889:168714..169539 | TCONS_00054319-exon-scaffold_242-1491911889:168714..169539 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_242 | supercontig | scaffold_242:168714..182712 - |
Blast
BLAST of TCONS_00054319 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: CNRP1 (CB1 cannabinoid receptor-interacting protein 1 OS=Homo sapiens GN=CNRIP1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 82.0333 bits (201), Expect = 9.954e-18 Identity = 42/140 (30.00%), Postives = 74/140 (52.86%), Query Frame = 2
Query: 761 KASFTISRDKDDTPACFKQDGERFTNEQTLKLYSAADYTVKMEIAPN-MELLYIKFGGVETPFK-STNDPEKDQKSIYQFLWSTKGIDPTENRHRTDVLCSMKFKNFKEIEFRLQVKFYTLQKMKHATWGEKLNSISMDC 1174
+ S + +D P +K DG+RF +T+KL + + Y V+++I P+ +++ I GGV P + + +P+ D + +Y + T+G+ PT++ R + +M F + E QVKFY K H WG + I +C
Sbjct: 9 RLSIALRIQPNDGPVFYKVDGQRFGQNRTIKLLTGSSYKVEVKIKPSTLQVENISIGGVLVPLELKSKEPDGD-RVVYTGTYDTEGVTPTKSGERQPIQITMPFTDIGTFETVWQVKFYNYHKRDHCQWGSPFSVIEYEC 147
The following BLAST results are available for this feature:
|
