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transcript sequence >TCONS_00063893 ID=TCONS_00063893|Name=TCONS_00063893|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1062bp aggAGTAATAAAACCAAACAGAAATTTAGGCAACTAAAGAtgttaagaaa atatttactgTTATATTGGCTGCTAGCTTTTACAGCTAATTATGTGAGTA CAGATGAAGTTGTTGTGAAACGTGAAGAAACTGCAACCAGTTTGAATATC ACCAAGAAAGAATTATatAAATATGGTTTCCAAGTGAAACGTGCAGAACA GATTGAAGGGGTGAAAAGAATAATGAAGATTGACAACTatgaaaaacaat tcaaaatggtTAAATTGCTGGTTGAAAAATTATTCAATGTGCTGTCAACA GCTAAGGTCCAAGTGACTGAATTTGGTTATATTCCTGGTGGTGAGTTTCC TGATGATCAAAGTCAACTAGACGCGTTGGGTCGTGTCTTTGAGAATGTGG CAATGTTTGGAGATCTCATCTTAAGGCTTCCGGATATCACACATAAGCTC TATGACAAGAACCAGGAATGGAAAGTTATCATGACATGGGGTGTCTTCAT GGCCAATGAAAGTGGAATATTCGAAGGCTCAAATGAACAACTTTTGGATC TCATGAGCCAAGAACTAAACATCACTCCACGCGGTGAAGACTACATCAAT CCTTACAAGGAAGAAACCAGAAGGAAAGAAGAAGCTcgaaaagagaaaga gaaattgAAGAAGGAGCGCCAAGcagaacaaaagaagaaagcAAAGCGAG ACAAGCGGAAGAACAGAAAAGGTCCCAAGTTAGGTGGAGGAGGTGGTGGA AGACGAACTGATCTGTAGCAGAGGAACATCACATTTTTAATCGTTGCCGC TGAAGATTTCAACATTGGATAGACTACTGTAAGTCAAACAGTTTTTTAGA TTTGAAACGAAGATAAAACCGGGTCATTCTATCTTTTGATCTGGGAAATA CACTGTAAAACAAAAACAGACAATTTTCAAACGAAACATTTTGTATTATg actttttatcactttttaaggattttttttcggaacatTTTTTAACGGAA TTATAGGatgtcaaaatttttattacaacacGATGTAGAATATTTATAGG GATGTTTTGACC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_404:575728..612611+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00063893 ID=TCONS_00063893|Name=TCONS_00063893|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=36884bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_404:575728..612611+ (Clytia hemisphaerica) aggAGTAATAAAACCAAACAGAAATTTAGGCAACTAAAGAtgttaagaaa
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_404 | supercontig | scaffold_404:575728..612611 + |
Blast
BLAST of TCONS_00063893 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: CC134 (Coiled-coil domain-containing protein 134 OS=Homo sapiens GN=CCDC134 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 126.716 bits (317), Expect = 9.924e-34 Identity = 54/150 (36.00%), Postives = 95/150 (63.33%), Query Frame = 1
Query: 160 ELYKYGFQVKRAEQIEGVKRIMKIDNYEKQFKMVKLLVEKLFNVLSTAKVQVTEFGYIPGGEFPDDQSQLDALGRVFENVAMFGDLILRLPDITHKLYDKNQEWKVIMTWGVFMANESGIF-EGSNEQLLDLMSQELNITPRGEDYINPY 606
E+YK F+VKR EQ+ +K + ++++ +Q+K++ ++++ LF VL ++ +T +P G FP D+ DA V EN A FGD++LR P I H +D N W +++ WG+ N++G+F +G + +L LM+QEL I+ + ++ NP+
Sbjct: 33 EIYKKMFEVKRREQLLALKNLAQLNDIHQQYKILDVMLKGLFKVLEDSRTVLTAADVLPDGPFPQDEKLKDAFSHVVENTAFFGDVVLRFPRIVHYYFDHNSNWNLLIRWGISFCNQTGVFNQGPHSPILSLMAQELGISEKDSNFQNPF 182
The following BLAST results are available for this feature:
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