XLOC_031711 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_031711
Unique NameXLOC_031711
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_167:947391..957819-

Legend: gene
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>XLOC_031711 ID=XLOC_031711|Name=XLOC_031711|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10429bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_167:947391..957819- (Clytia hemisphaerica)
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CAAAATCTGGTCTTTATTATAATCTTGTTCTTTTCAAGTATTAAAGCGAA TCTTTTGTTTTAAGAGGTTTTTCTATCGAAATAAAGTTTGAGAGAGAGCT TAATGTAAGAGGAACCTAGCCTATAGGAGTATTTCTGAACTTCTAAACAA ACACTATATTAGAACCTTGGCTGAATAGGATCATCATCTTCAATTCAAGT AGACTATTTCATTTTAAGGTATTTAAACTCAAGAAAGTTTGCTATTACTT CTATCATGAAGCATAAGTCATATAGTCTATGAACAGCTTTTGGATGTCGT TCTACACAAGGGAAGTTACAAAACAAACTCAAAGTTTCTTTGACAAAACA CTCCTTCATTAATTTGAGTACCTTAATGGATCAGTTCAAGGACTACTAGA ATCGCTTAAGCACAGCATGGGAAAGTTTGTCGATATGTAGCGAGGGTACT TGAAAGTCTAGGTTTTATTTGCACTTTAGATATAAAATACTAATGACAGA ACATTCTACTTTTCATATTTTTGCTTCTTTTATAATTTTAGAAGTAAAAT AATGCAGAAATCAAAGATATCAAATTCGAAAAACTTGACATAAAATGGGT TGTGGCTCCTCAAAAGTTGCTGTTAGTACAGTACTCGTAAATGGCACACA GGACGGCGCCATACTTAAAGATGCTAACGGAAATATCACACAATCAAAAC CTATTGGTTCTAATGAAAAAGAGAGACTTGGCTCTCAGCTAGGATCAAGT AATCGATTAGGTCCTGTTGAAAGTCTTGGTATTTTTCGAAAACGCAAGAA GAATTTGTATCAATCTCTGGATGTCTTTGAACAAATCGATCAACGTTCTG TCACGGTTGGTTTCTTTCAGCTTTCCATCCTAGAACGATTGAATTTTCAT AAAAACGCCCTGTTCAGTTTTGCTACCTTAAGGGAACTTATTTTGGCGGG 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TGGCAGCTATTGGAAGAAATGATCGCCGTTGANAAAAAAATGTCATTCCA GTGAGAATAAGAACCCAGTGTACTTCCCAAAGATGTTGAAAATATAATTA TCTCACCGAAAACAAGTGTTTGGTCGAATTTTCCTCTGGTGTAATAAAGG TAAAAAATTGGTTTCTATTATTTTACAGATCAGCTGGAATTAAAACTGAG CGCGTGGATGGTTGGTCTAAAGGCTACAATTATCAATATGGTCAAAAGTT TGGAGACATGAGTCCGAATCATGCATGGAATGTCGTAAAACTGAACAATG ATTGGTGGCTGCTAGATTCAACATGGGGCGCTGGCTACGTAGACAAAGAG AAGAATTTCGTACGACAGTATAGTGAACATTATTTTCTAACGGATCCTAA ACAATTCATTTTCGATCATTGTCCGACAGACATGCATTGGCAACTATTGG AAGAAATGATCGCCGTTGAACGGTTCGAAAATTACGCTCGAGTTACGAAA CATTTCTTTCGCCTCAAAATGAAATTATTTTCACATCAAAACGGAATTGT TGTATGCGAAACTGGCCGTTTACATCTTAAGTTCCGTATTGATAAAGATA TTCCGATAAAATGTACCGGAAAATTATCGGAAGTTGACGGAGATGTGGAT ACGGATCAATACATTCATGTTTATTCGACAGAAAAGACGCTTCACGTTTT AGTCGATGTTCCTCGCGTTGGACAATTTGATTTGAAAATATTCGCACGAG AACTGAACTCAGAGCAGAGCAATTTGAATTTAGTATGCAGGTATGCGATC ACGTGTACTAATAAATTGGGACCGAGCTCAAGTTTTCCTAGACAATTCAA AAGATGGAGTCCAGGCTTTTATTTACATTCTCCAACTGATGGTGTTTTGT ATAACGGTGAAACGTACAAGTTCCGAATTAGTTTACCGAATGTTACGGAA ATGGCAGTTTGTTTGGGTAAAAAGTATTTCTGCTCTATCGGTCTTTTCAT CACTTATATCACGGATAACATCTGTCTCATCTTCAAACAGTGTCCAATCT TTCATTAATGAAAAGAATGTACCTCCTAGAAACTTTGATGGTTGTCATAG CATTGACAAACGCAGCCCTTTATTTAGAAAAGAAAATTTCAATCGACCTT TCGGAAATTGAAAAAACCAGCGATGTGAAATAAATTTATGGCAATCTTGC TTCTAGCGCCAGATTAGGAGTGGTTCTGTCCTGAATTTTGAGTTGGTCAA AATTCATGGCAAAGAACTAAAATCCTCGACATTTTAATTTCGGGAAAACC GATCAAAGAATACCTTAGAGTGTGTTTTATAGCATTGACAAACGCAGCCC TTTATTTAGAAAAGAAAATTTCAATCGACCTTTCGAAAAACAGTTTTAAA TGTTACAAAATTTGTTTTTCTTGAATGATTTCTTGANGGCTACAATTATC AATATGGTCAAAAGTTTGGAGACATGAGTCCGAATCATGCATGGAATGTC GTAAAACTGAACAATGATTGGTGGCTGCTAGATTCAACATGGGGCGCTGG CTACGTAGACAAAGAGAAGAATTTCGTACGACAGTATAGTGAACATTATT TTCTAACGGATCCTAAACAATTCATTTTCGATCATTGTCCGACAGACATG CATTGGCAACTATTGGAAGAAATGATCGCCGTTGAACGGTTCGAAAATTA CGCTCGAGTTACGAAACATTTCTTTCGCCTCAAAATGAAATTATTTTCAC ATCAAAACGGAATTGTTGTATGCGAAACTGGCCGTTTACATCTTAAGTTC CGTATTGATAAAGATATTCCGATAAAATGTACCGGAAAATTATCGGAAGT TGACGGAGATGTGGATACGGATCAATACATTCATGTTTATTCGACAGAAA AGACGCTTCACGTTTTAGTCGATGTTCCTCGCGTTGGACAATTTGATTTG AAAATATTCGCACGAGAACTGAACTCAGAGCAGAGCAATTTGAATTTAGT ATGCAGGTATGCGATCACGTGTACTAATAAATTGGGACCGAGCTCAAGTT TTCCTAGACAATTCAAAAGATGGAGTCCAGGCTTTTATTTACATTCTCCA ACTGATGGTGTTTTGTATAACGGTGAAACGTACAAGTTCCGAATTAGTTT ACCGAATGTTACGGAAATGGCAGTTTGTTTGGGTAAAAAGTATTTCTGCT CTATCGGTCTTTTCATCACTTATATCACGGATAACATCTGTCTCATCTTC AAACAGTGTCCAATCTTTCATTAATGAAAAGAATGTACCTCCTAGAAACT TTGATGGTTGTCATAGCATTGACAAACGCAGCCCTTTATTTAGAAAAGAA AATTTCAATCGACCTTTCGGAAATTGAAAAAACCAGCGATGTGAAATAAA TTTATGGCAATCTTGCTTCTAGCGCCAGATTAGGAGTGGTTCTGTCCTGA ATTTTGAGTTGGTCAAAATTCATGGCAAAGAACTAAAATCCTCGACATTT TAATTTCGGGAAAACCGATCAAAGAATACCTTAGAGTGTGTTTTATAATA TACATGCCATTATTTTATTTCGTTTGCATTTATTTTCTTGACAGGTGGAA AGAATTCTACATGGGAACGCATTCCAAACAGTCGAGGTGCATTATGGGAA GGTGAAATCACGCTTCCTGATTGGGTGGAACGAGTGAACGTGGTGGCACG TTTTGAAGAAAAAACTCCTTTCTCCAGTCTTTTGGAATACAAAGTCGCTG AAAAGGATTGGGCAATTGAAAATTGTGAAAATGAACATTCATAATATTCG TGATATTCATTTCGTAATGTTTTCTACGGAATCACACCGGCAATTTTTAA ACAATTTTTCTCCAGATTGAATTTACCACTACTGGAAAAAACCGAGGTGT TACCGTAGAAAATATTACGTCATGAATACATCCCCTTCTCACAGACCCGG TAGCATTTTTTAAGCCAGTGGGGATAAAAATAACGGACTAAAACTCGATG GGGATTGATATTCCCATATTTTTTATGGCTGAGGATTTCAATTCTTTTGT TTTTAAGTCAGAAAATTCAGTGGGAATGGGAAAAATAGTAAATATTTTGC AGTGAGGATTGTTTTTTTAATCCTTTTCGGTGAGGACAAAAATTGGAGGA TAATTTTCCACCGGGGGCGATATTTTGGCCAATTTTTCCAGTGGGAAGGG GTCCCAGTGGGTCAATGAGGAAGGGGTGTATGAATATAATGAATCATACA AATTACGAATTTTGAGATGTTTTTTTTATCATTCGTTAATAAGGAAGTCT CTTATATTTGTTAACAAGGAAAGCTACCCCAAGGAACCGATCTCCACGCA AATTTCTATATTTGAATATACTTTAATCTGCAAAATATTCCGGCAAAATT TGCCCCGAGGATGTCTCAGAAGAAAACCGAAGATCAGCTTTTTCTATAAT TTATGATTTTCAGCAGTCTATAAATAATTTCATTTACAGCATTTATACAT AAAAATAATGTGAAAATCTTTCTAAAACTAAGTTGATACATTATTGATTT TTATTGGTCTGGTTATGCATCAGTATACTGAAGTGATTTTATATTTTTAA ATAGTTTAAAGTTTGTTTTAAATATTAATTGGTTTTAAATTTTTGATTGT TGTGCTATTTTTTTTTTAAATTCAAACAATGTAAATAGTTAATTTAGATG CTATTTTTATACATCAAAAGATCAAAGCATAATTGGGAAAGCGAAAACTC AAACTGGTATGATTAATCCAAAAAATATC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00050086TCONS_00050086Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00050085TCONS_00050085Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00050084TCONS_00050084Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00050083TCONS_00050083Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00050082TCONS_00050082Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00050081TCONS_00050081Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00050080TCONS_00050080Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00050084-proteinTCONS_00050084-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_167supercontigscaffold_167:947391..957819 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.58 3.99 2.01 1.01 64.03 49.56 39.31 38.66 30.74 35.01 16.35 29.95 3.93 2.82 2.69 3.55 6.21 5.16 6.97 9.05 5.3 7.1 8.58 7.73 48.02 37.75 17.12 18.89 5.13 4.34