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Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at scaffold_17:105684..124308+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_031902 ID=XLOC_031902|Name=XLOC_031902|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=18625bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_17:105684..124308+ (Clytia hemisphaerica)
AAGAAAGGAAACAAACGTTCAAGGAAGCAAGTAGCGAGAGTGTCCAGGCA
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CTACCGTGGTTTTTCTAATTCAACGCGtggcaataaataattattttcag
cgCTACGCGTGAAAAACTAGAGAACAATTAATTACGATATTCAAGTGTTT
TAAGTACGCGTTAAAGGCTTGTGTAATATATATTACATTACATATAGATT
GTATAATGTATTAACAAGCATTAGCTGATTTGGAGGAGCCAGAGGAGGAT
GACGAAGATCCCTTtaatttgtgtttttgaaagaaagaagtttatcaaaa
ataaaactttcctGTCTAATATTTCTTGTCCAAGGCTTGATCACGCGTAA
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AGAGTAAGATTAATTacgatttttcgccaaaaacAGGGTACGCGTTAAAT
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CCTATTCCCCTGTGCATTAATCCGATTAATACAGTGATTTGTTTGTGTGA
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CCATCCAGATAGTTTTTCGGTCGGTGAATAGTTGTCCACCAACTGGTGGA
AAATTGGTCGTCAGAATAGTCATCTGGCCGTCGAAATACTTTATTACACg
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CCGCGAAAAACGATTTTGGAGCTCAACCGTGAAATTAAAATGCCgggaaa
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tgcaaaaaaatgcaataatCAAGACAAAATTCTCTTGGGCCGCGAAATTA
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GTAGagtcttttttgcaaaaaaatgcaataatCAAGACAAAATTCTCTTG
GaccgcgaaattaaaatgcCGCGAATTacaattttgagcaaaaaaatcgc
gaaattaaaatgaTCGCAAGATTTTCATGCCGCGAAATTTTCATGCAATA
AAGTAGTCCGGACGGCGGAGATCTTATATTCGGCCGGCAGAAAATTTACT
GTCGGAATAGTCACCGACCGTTGGAATAGTCATCCGGCCAACGGAAAATT
GGCCGTCAGAAAAGTTATACGGTCCGCGGAAATAGAGACCGAGCTAGATT
AGCACCCGTTTGAATGCAAATTGGCAAGAATcaacttttgttattttgtt
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TTCACTACACTGTTTCTAATCCtgtaaattttgtttaaaagaaaacttaa
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GAGTCCTCATTTTATCCCCTCTATTCTAAGGTCCCACCACCCCGCCTCTT
AATTTCGGAATTTATGTTTGTGACCCCTAAGGCCGATGGTCGTCAAATAA
TGCTGAGTGGGTGACCTTTATAATCCCCgtattgcttttttgaaaaaaag
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gaggcgaatctttaacccttctcagacAACATAAATTGAACCACttatta
tttcccatccaaaactcATCATTAAGACGGATtatatctagtggttcctt
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atccggcgtttgtatgaaaaccacgcgcgggcgttttggacgggaaataa
gtggtttcatttcccatccaagattCTCGACTCTCCCTTTGGGCTAGAAC
TCAATGAATACCCAGCCTtctaatttgttaaaaaaattggtACCCCTTTT
ATACATTTGTATACCTCTTCGGGTAGCTTATTCTCACATTCCGGGATTCA
CTGAGAAACAAGACGCTAATTATAACCTCGAATAAGGACAAAACAATGAT
TTTTGGCACTGCAAGCGATCATatagtctgtacacaaacccgattTCTAt
ggataatttcaaaattcattgtcgtactaccttaagggaagaaattttca
cggaACAAATTtctgcggaatttaattttgcggtttttcggcaaatccgc
aaaattaaattccgcgaaacacgactattttcaggatttaaaaaaatcac
ccaaaaattggtatttttagggcaaaataggccatattatgaacagaaaa
ttctctcaaccgcgaaattaaattcccgcgaaacttcagaattttgagct
gtgaagcgcgaaattaaattccgcgaaaatttcttcccgcaaaaatttct
tcccttaaagtacgctacgatattatcgtgagatacactctggtacacag
AGTAGCGATCATACATACAGAAAATTAGCACAATCAATCGCAATCGATCT
TAATCTATAACAATCAAATTCAATCGATGGCTAAGCGATAATAAAAAATC
GATACCAAtcgataataaaattttacgttCCTATCAATTGGCCATCAATT
AGTAATCGATCGATCATCGATTACCAATGACTTTTATCGATTGACATCAA
TTAAATCGACAATCGATGTTATTGATTAGGTACGCCTGGGAAGgcggtca
tcaaaaaattgttctacAGTATTCGCGCCACCCGCccacatcaaattttc
cgctgattttccggtgcggggatgcggaaaaaaatctgggaaaagcaatt
tgttcttttaaagtatagttttttttgaataaaatcatcgaaagggtaat
aaactttttactgcactaaaatcaatttgtcatttaccCAAAAGATTCTC
TCGATCATTtgcgatccaatgaggggttaTCCATTGCTTAATAATCtttc
tcaaactcgagatattgaaatttttaggttttgatgacgtcatccgaCCC
AAACAGTGTTGCTGGAATCCCTCcgatccttggttagaaaaagctatacc
tgtttacttttttcttgccagattcaacaagccatcaaccaacaaaattg
atactgacatcaaaaaattcacacaacctttccactagacacttctaaat
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ggaattCCTCTGGGAGTTAGTAAGTTGGGAAATGTAAAGTTATGTAATAG
GTAATACATTatttttccgggggttaaacgtataaataaaattgaaatgg
tttgtttttttcttcattatatatttaaatttccattatcaaaattctag
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taaacacttacaaaagctaTTATTACTTACCATTTTTACCCCCGCTTTTT
AAACAGCATCTTCTGTGGGCGTGATATCAGGTGGAGACAAAACGCCCTCA
TCGTAAGATTCTTGGGTTgtcttattgtttgttccttttgtcgagtctgt
cggtcctattgttcatgctaaatccatacacaaagacgtcaatgtttggc
ggcatacctaaaaataaaaacaaaaagattatcataTTATTCTTGCATGA
ATTAAGCTACCTTATacgtcattataaaattatacaaaacgaaaGCGAGT
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atcaatattcttcgaaggaagaatttgccaaacaaacccctagacaaaaa
gatgtattttgaggtttggaatggatcctgcgaagatgaaaaaattttga
ctaggcatttttttggcaaagccaaaaactctaatttttttcttccctca
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gctggtgttttccgtaaatctgagaatcgcgataagatcctcactgccaa
aatgccccaatttgaatatatatatagtatgcagtatgcagtgctgacga
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GGGGTCAATGACCTCCCGcttcctttccaatctcgagatatcgcattttt
cttgttttgatgacgtcatcaagtaaAAACGCCTGAAATtacgccaaaat
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GCATGTGATTGAAAATTATGAATACCCaagcatttttctaaatattaccA
GCAAAGTCAGGCATAAAGTACCCTTACTGCTAAGGATGATTGTGAAAAAT
CCCtaggtaggaaattaaaattgtagggtgaaaagtttacttttgaaaag
tttactACAGATTGCACATGATCATGAGACCCCTtatcatagcgtcagcc
tgggtttaggtcccaggcaaaaattatgtcccccctgagttttaatTCCC
CCCAaaaatttatgtattttttggtagcccccaggacttttgaccctata
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AAGCATTGTCAAACTTTACAGCAGAAAAGCTGTGATATTTGATAACGTTG
TAGAATTGGACAACGTTTAAGTTGAGGAATTTTGCAGCGCTCTCATTATA
TGCAATTTCCCAAACGGATTAGACACTCTGTAAAGGAACGAGTTacaaca
atagaccttttctccTCATGTCTGAGAGTTTAAAGCTCccattgttttga
aattgtctTCAAAAGTTTTAGATTATCGATGTGGAAAAATGTGAATCGTG
AAAATTAAATCAACTTAGAGTAATATTTCACATATACAACAAGCTAAACA
ATCAATAAATAATCTCCCAAAGGCAACATACACATAACTTgaatatcaaa
ttttctttctgccTAAATTTATTccttttaaccctattagccccaacgGG
GGGGGGGGGNTATGCAATTTCCCAAACGGATTAGACACTCTGTAAAGGAA
CGAGTTacaacaatagaccttttctccTCATGTCTGAGAGTTTAAAGCTC
ccattgttttgaaattgtctTCAAAAGTTTTAGATTATCGATGTGGAAAA
ATGTGAATCGTGAAAATTAAATCAACTTAGAGTAATATTTCACATATACA
ACAAGCTAAACAATCAATAGACTTCTATAATCTCCCAAAGGCAACATAAC
TTGAATATCAAATTTTCGTTCTGCCTAAATTTATTCCTTTTAACCCCATT
AGGGGGGGTAGGATCTACCACACTGGtgttcttttgtgtatatctcggag
aaaaagttttgaaacaatttgaaactttctgacttaaTTAAtcaaatctt
attaagagtgcTTGTGCAaatttttagggtcataggtcttctagatcagg
ttttatgactttattgtgtaacatgacataaaaccaaAAGCTAAAATTGG
ttataactcaaaattttaaaattgcaataacttttgaactattgatccaa
tcatattcaaattttgacaggtgaTAGGTATTAAcaatatcaatttttaa
aaagatacaaaatttttttgaaaatgacgacgtcatcatttatgacgtaa
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ttgcttttttctgacaggtggaaattttgtgatgacgtcatcaccttttg
GATGAGGTCATCAAAACTTGTTTACTTCCTGGAAGTTTGTGTCATAATGG
AGAACATCTCTACCAATTTttatggccatagctcttctagagaTCAATAA
TAATTGAGGATGGTAGATTCTACCCTGGggctacaaaaatcaaaaaaggc
tGGGGTTAATAGGGTTAAGTATGAAAAGTTTTATGCACACAAGCTTTATt
accaattaaaaaaaacttttaagaatggtgtttttagaccattttttgta
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aaATACAACATAAAATGATTTTCCAACTTCCACTGACCTAGCCTTAGATA
TTTCACTGAGCATTCAAAATGGATGTTGACAAGAATTTGAAGAATGGTTT
GAACCAGTCTTCTTCCAAAGACAGATATGGTATGGCTGACTCAACCAaac
caaatcaaacaaaaagacttgtcataaaaaattttaaatgtaaGTGAAAC
TGAGAATGCCCAGTGTTTCTTTTCGTATTATCAGAGTTTTTTAAGAGCCT
CTGAAAATTATCTGTGCCAACATTTCTGGCTGTTAAAATCTGTACAGCCA
ttggaaataaattttttcaatttcaagtctGAAATCTTTGTCATCTTTAA
GGAAAAGGCTTGTGTATGAGCCATGCAAATTTTTATGAGTATATCCCTCC
AACAAAGGATCAGATTGATAAAAAATGGCTCTGGAAGTACTTCAAATGTA
TAGTGTGCCACACCCACATTAATTTTAACACCAATTTTATTTACAGCAAA
ACCAACCTTGCCCTCAAACTACAAGGAGGTTACATGGGAAAAGTTACGTG
AAGCTGTAGTGGCTATTCATAATCAACAATCAATTTCCTCCTCCCTGGAA
GAACTATACAAAGCTGTTGAAAACTTATGTTCACATGATATGTCTATGAA
CCTTTATGATCGATTGAAGAATGTTTGTGAAAATTATGTGAAGTCGATCA
TCAAAGACTTCATATGATATCTTTTCATTGTTCTAAAGTTCTGATATTTA
CACTTTTGTTAAGATGTGTGAAAAGTTCAGCATAATAGGGAACAAATATG
TTTTAATTTAGTTCAGgaatgtattttcattgtttcccAAATAAGTTTTA
TGCTTGAAAAGCTGTTCTTTGCTAACATTTGAGATATTTGATATTGCCTT
GCAACAGTGTCTTCGTGAAAAGGTTTTGACACCCAAAGTAGGTTTGAAGT
TTGGAGGATTTATTTTTAAGTTATTTCCTTAACATGATGATTTACTGATG
GGATGGATAACTTTATGTATCTGAAGAAGATGAATGAACTATGGGAGTCT
CATTGCAGACAAATGGTGTgtagttttcatttttctatatcATATATTTA
GCTATAAATTTCTACTTCTGCAGATTAACACAAAGGACATTTCCATAATG
TTTTAGATCAAGCTAATTCAATAAACTACTTTATTCAACAACCTTTCAGA
CAATGATTCGCAGTATCTTTCTGTACCTTGATCGTGTGTATGTGCTGCAA
CACTCCACCATACTCTCCTTGTGGTAAGTAGTCacacttttcatttttca
cttaCATATTATGTTGAATCTTGACTAAgcacttttttttatctataatC
AAATGCCACAAGCACACACTAAAAACACTACAAACACTAAAGGCTTAATC
TTTTACTTCCCTAGGGATGTTGGCCTTCACTTGTGGCGAACACACATCCT
TGGGAACAATTCCATACAAACGAGAACTGTTGACAGTCTCCTCTTTCTCA
TTGAAAAAGAAAGGTTAGTTACATATCAGGATGGGATGTTCAACAGTTGT
ACATAACTAGAAACTGTTATATGTAAGAAAGAGATGGTGGAAACTGTTAT
ATCTAAATGCAGTCCTAGCCAAaacaaataatgaaattttgttaaTGTGT
ATTATATTGATTTCTTTTATCAGAAACGGTGAAGCTGTAGATGGTGCTTT
ATTGAAAAGTTTGCTAAGAATGCTCGCAGATTTACAGGTATATACTATGA
CCATTTCGACATTCATAATGTGTATTAAGATTGAAATGACTTATGACACT
GAAATACTTGCATTTACTTATAACGAAAATTGTCTTTTGaaattgttctt
ttgttttcagatGTACCAAGACGTATTTGaggagaggtttttgcaagctA
CAGATTTGTTATACTCAGCTGAAGGACAGAGATTTATGGGTGAAGTAGAT
GTACCCAACTATTTGAAACATGTTGATAAACGTTTGAAAGAGGAATCGGA
TAGATTGTTACACTACTTGGATATTGGAACGCGGAAACCTTTGATATTAT
GTGTAGAAAACCAACTGATAAGCAAACATATTACTAATATATTAAATAAA
GGTTTTGAAAGCCTTATGGACACAAACTCTTCTGAACATTTGAATGTGAT
GTATGCATTATTTTCACGTGTAAAAGATGGACAAGATAAACTTTGCGAAT
ATTTTGGAGGTTATGTCAAGGTAATTTAATTATCCTCTAAACTGTTTTTG
AATTTCTCAAATCGAAATCAAAGTTTAAGCCTAAACTGCCACCATTTTTT
TGAAGAGATTTATTTGATTCAATTCCTTTTTAGGTCAAAGGGTTATCTAT
AGTACAAGACGTGGAGAAGGACAAAACAATGGTTCAAGAACTGCTCgact
tcaaagaaaaactggatAATTTTATTGAGGGAGCattcaagaaaaatgaa
aaatttgtcaGTGCTATGAAGGTAGGTAAtgctttgtattttatttttag
ctTTGGTTGATTTATTCATGCAGAagttgtcatttgaaaatttggatgGA
TGTGAAACCTTCCAACTTTCTTTATTTGTACAGGACTCCTTTGAAGTATT
TATAAACAAACGACAGAACAAGCCGGCTGAATTAATCGGTAAGACTAACT
ACAATGCTATTACGTTTTTAGTACTGCTCTTCTAAAATTGGGTTTACTGC
CTTAAAGGAAAGTTTAGTGTGAAGGGTATATATTATTTATACGtagattt
ctattttatttttgttatatttGATCTTTCGTTAAAAACCAAATAATGGA
AAATATTGCATTGTCTCTTGCAGTGAAAAAAAGTCGTGATGCCGAGTATA
AACTACTTCGTCACCTGAATCGTTAGATAAATCGTTTGTAAGACTGTGGA
AGAGAGTAAAATTATAAtagcaacaacaacaaaaacaacaaataacAACT
TCTGCTAGTTGAAAACCTAAATATATATGCCTGAATTTACATATTGTAAA
TAACGGACGTGTCAATAATTCAGATTTATATCTTCATCTCCACAGCTAAA
TTTGTAGATGTCAAACTAAAAGCTGGTAATAAGGTATGGTACACAttatc
aacatttttatttcatgtattcattcaaaattcatgtATTCAATTGATAG
GTTCTTTTATAGGTTCGTTTGTAGTTTACACCAGCGCAAACAATACTTTA
GGCGATGTGAATCATTATTGAAAGAATAAAGTAATTTTTGCTCTTTGTAG
GAAGCAAGCGAGGAGGAGTTGGAGATGCGCTTGGATAAAATCATGATTCT
CTTCAGGTTCATTCATGGTAAGGTCTTCATCACTCAAGTACCATTACTTT
GTATCACTAGATTTCCCTTGATAGTTCAAAATAAAACCGACCTTTTGTAG
ATCCCTCCAGTGTTATTGTCACGATCACAAAAATACAAACTTTCTTAGTT
TGCATCAATAATCTagactaaaaaaacttttcagcaaATATCAAGAGATT
ATTAAGATATGACTTGAAACCAGTTCAATTTGCTTCACAATAGAAAAGTC
TTCTCTATTTTGGTCATATGCACTGACATTCACAACACGATTCCTTTTTA
CTTTACAACAGGTAAAGACGTTTTTGAAGCATTTTACAAGAAAGACTTGG
CGAAACGATTACTCCTGGGTAAAAGTGCCTCTGTGGACGCTGAGAAATCC
ATGTTGTCTAAATTGAAACAAGGTAATGTTTTCGGTGGAATATCGTGTAG
GTTTTCTAATTTACGATCGGGGAAATCTTCATGCTTTTCGAGTCTTTTTA
CTAGGCACTAGCCTGTTTTGAAGTTTCGTCGTaactttgagaattttttt
acatgcACGTTGGACTAGAGTCTAGGCTGTTTCTCGGGCATCCTTTTGTG
TATAATGTCGTTTAATTTCTAATTGTCAATGCAATGTGATTTCTTTAGAG
TGTGGTAGTGCATTTACCAGCAAGCTTGAAGGGATGTTTAAAGACATGGA
ACTATCTAAAGACATAATGAACACTTTTAAACAGGTCTGCTTTTTATGAA
GAATTTATAAGTTACTGTAGTCTCAtcttacgttttttgattaCCTAACC
AGCCCTCCTGTTTGGCAATCCAGACGTGTGTCTactttttaaagacattt
ttacCAATAAGTTAAATAAGTTGTTCTTCTTCTCTGCGTTTTCCAGCACA
TCTCAAGTCAAGGAGATGCACCAAACATTGATTTAAACGTCAATATTTTA
ACAATGGGTTACTGGCCCACTTACACCCCAATTGAGGTCAATCTGCCAAA
CGAAGTAAGTGAAAAGGAACTTTCATTTCTTATTTAGGATTAACTTAATA
AGTTGCCTTGGAGAAGATGTGAGATGAAATAAGAATTATCTTTTCATAAT
ACGGAAATCTGTGATACGAGACACCCTGTAAACACATTTTAAAGAGTTGA
TAAATGTTACTTTTCTTCTCTTGTAGATGGTTCGGTtgcaagaaatattt
aaaacgtTTTACTTGAGCAAACACAGTGGTCGCAAATTACAATGGCAAGC
TACTCTCGGAAGTTGTGGTGTCAAAGCTGTCTTTGAAAAGGTAATACGTC
AATGAAATGTTTTCTGCTTTAATAGAGCAATCAAATCGCTGTACCCTTAT
TTGATCTCTGTAATTGATTTTTTGTCGATTCTCTCTATCTGTAATTTGAC
GATTAAAACTTGTTCATTCTCGTTGTTTAGAGCAACCATGAACTGCACGT
GTCATTGTTTCAAACAATGTGTTTACTTCTCTTCAATGACGCGGACGAAT
TGTCGTATGAAGATATTCGGGACGCCACCGGCATCGGTCAGTAATCAATT
CTTTTTTCGAGACCTTTGGTCTTTGGTTCGAagctttatttttatctttc
acCTTAGGGGGTCATTATTTTACACGTTTTATTTTAACTGTTTACACGAG
GAGTTATCTTTTTATCTTTCAGAGGAGAATGAACTTAAACGAACTTTACA
ATCGTTAGCGTGTGGAAAACTACAGAGTCGAGTGTTGAAGAAAAAACCAC
CGGTATGTATCATTTACCTCTATTCCTCTCGAAACATCTTATGGATTAAT
GTGTGGTGTGTTTATCGTTTTCTGATTTGCCCGAAAGAATCAGGTGTTGG
AGTGCCATTTGAAATGCATGCAACGTATTGAATCCTCCCGTCTACTTTTT
TTCGAACATTGTAGGGCAAAGATATAAATGTGAAAGACCGGTTTTTCTTC
AACGAATCATTCACACTCAAATTATATCGCATCAAAATCAACCAAGTACA
ACTTAAAGAAACGGTAAGCGTTGACACTTCTCACAGTTATACACTATTTA
TTCTGATTACCTACTGACCAGTTAACTCCTTTACATCAAGTCAGCTGTCA
AtctgaaaatctctttagtgtGACTATCATCTCTACTTCTTTGTTTGTCC
AAGCACGCAGAACTTATGGGATGTCTAGTTTGACAGTTGCTTCAAACTAT
CGCTTTGGAAGATTATTTGGCAGGTCTAAACTACAGTGAGCTTCGGTAAA
GTATAAAGTTCGATTGCGTCTTTTCCTTATCTTTATTAGCAAATACTTAT
AATTCCATTAATGGCATTTTCAGGCTGAAGAAAATCAATTAACAAATGAG
CAAGTCTTTCAAGACCGTCAATACCAGGTAAGAAAATCACTCTCGAAATT
TGtcgcaatttttcaaattatattaAGTATGCTAGAAAATAATACgataa
aaagcaaacaaaatgaaattttcgtACGCCATATTCatacaaatttctca
aaatttttgcaAGCGATAAGTCACAGTTAATTGTGAAATGGTATTTTGAA
AGCATGATACTTTTTGAACCTTCTAGATTGACGCAGCCATAGTTAGAATC
TTGAAAACACGAAAGACGCTATCGCACACTTTATTGGTGACTGAACTTTA
TAATCAACTCAAATTCCCTGTTAAAGTAAGTAGAATGTGATATTGGAAAT
TTTAGAGTCATGTCGAATCATCTGCTTTCGTTTCTACTGATACTCACGTT
TAGGAATGTGTTACAAAATCGCAATCCGGCTATACAAAGAAAAGTATAAT
CCTctatagtgaatttttaatatttgccacttacaaaaaaggaatttctg
CCCGATGTATCGGACAAAactttgacatgttatacattttctgttaggcc
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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_17 | supercontig | scaffold_17:105684..124308 + |
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
| Ortholog Name | Description | Organism |
|---|
| CUL4A | cullin-4A isoform 1 | Homo Sapiens |
| CUL4B | PREDICTED: cullin-4B isoform X1 | Homo Sapiens |
|
