XLOC_033825 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_033825
Unique NameXLOC_033825
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_233:1357745..1364970+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_033825 ID=XLOC_033825|Name=XLOC_033825|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=7226bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_233:1357745..1364970+ (Clytia hemisphaerica)
agaaaagtgattctgATCAAAGGTATGTTTTGCTATTGCCAAGTAATTTT GTCATAATGTTTCCATGTCAACACTTTGAAGAGAAGTAATACTGCTCTAG TTGGTCTGTGAATTGGggtatatgcatgttagcctccactgatgcAAGTT ACCCTTTTTCACGGTATTGTTATTGAATTGacgaattgaattgaaatgaa gTGTGAAAGAATccttgactttaaaaaaaaaaaaacacttgttCATGAAT ATATGGACGTAAGGTTTCATCTTATTTAAATAATATAATACAGtgacaag taaaaaaaaacaacaacaaacaaagatAGATAACTGGATAAGACAAGGCC AAAGAAAACCCAGCAATTCCACTGTCTATTCTGTCTGCTTATCTGTCTGT GATTTGCGAGTTGTTTTTGGTAAGCGAGACATAGCGTTACTTACCGCACC AAATTGGCAATCAATGTAAAGGAGAGTGAAAAAGTTTTCGTATGAGAGCC AATCAAGTCGTTTTATCAGTTATGCATAAATTATGTGTTTGTCTCGCTTA GACAGTCAAAACAAACGCTGATTTACGCGGgaaacttttttctcctttct atcattcaggcaggtcggTTCAGTTCaggcagcgggcctgactgctttca TTTCTCTTACCTACCCCCCTTAGACGCCACCCACCTTGCTCTTCCTTAAT CCAGCAGcgaaagaaaagaaagagaagactctaagctatccaacaagcta tgaacaagcttctaattccttctagatctcgagatataagcctttaaagt ttgaactagcgattttcttttaaaaactcagaaaaaaatgaccctGGCAC TATAAAGGGTTAAGAACCAGTAATTTAACCCTATTCGTACTAGGGGGGGG GCTCTTTTTGTTCGGAGGTCAAACTATATTGGTAATAGCTCCTGAAATAA TAGAGCTTTTGCCGTGAAATTTTCTGTAAATTCCTAACTTTTATTTAACT TCAAAATAAATAAAAATTGACACCTAAAGATTTTCACACCTTGAGCATGA TGACATTTCTGACAGtaaggtgtcacaaaaattgacacttttccaataca aatttatttttaatgttcaAATATATCAGTTAAACCatatttcattgaat atttaggataaaataggcattttaaactcaggcaacttttttctaaagcc tttgttagaatacaatagtatgagtgacgtcatcaaaaaaaaattgtcaa aagttaccttacgtgacaaggaacttgtgtgccaaatttcatccaaaaag actcACTAGATCTAAAGTTAaagggtggtacaggaaaagccccccccccc ctagttctgaaccgcgcCTAAAAAGCCTAGGTTCAATAGggttaagggct ctggacatacccaatttttcgattttacaccaacttaaatggcaatttct gcattttaaaaagattaatgtataactttttttatatgtcctgttaaacc tacctttttagaattaaaaaatcgaaaaattgaaatgaaaaaattaaacg aagaagaaaacgaagagtttttcgaagaagagtatttcacctttcaaagc cctaatctcggtaaaaatcaaacattttggattttttttggtttaggtga tgtatctatttagtatctaaaaatacaatttcggaaaatttttgtggaag tatcttccctttaaaatttccaaaaaacctcatttttggcaattttctac actaaatttccatacgaaaacagctataacttgggatgtagccaaataga aaatttttccgaaaacatctaaataaagaaattatttgtcattaacttaa aaaaagtttgaaacaataaaatgatttccccaaggagattaagctttttt tgtgaaaagtatatgaattgAGTCGTTATGATATTTTATTAAGatccatg ccacacttattctttaattactcatgatgtagatacttaaattcattttt tcaaaagcagtttgttcttaaacatgtcaaagaagcgaaaacataaggtt ttatcttcaaattctaaaattaatttttcacttTGACCAGCAGAGCCCTT AAATCACTGGGTGAAAAGCTGTCTTcaagaattttccaaatttggaaaat gtcatatttcctgaaatttccaaaaaaaaagtcgtatttcctgaattttc gaaatctgaccttttaatttacaaaaagatctgaaagctgatattttcag atatttcaaaattcgaaatttcacNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTCaaataaaaagtgtttctttcCTGTTA TTATTCCTTATATGGAAGTAATTGCTCTCCTTAAGACTTTATTTTGAACT ATCTTTGCTATGACGTAAATTGAGGATTGTGCAAGGGCCGAAGGCTAGAT AAAATATAAGATAAAATCGAAGCCAAAGATAAATACTGGAATATCCGCCA TGACTTGcaagaaataaaatgaaataactCAAACCCTAAATACGATAAAC AAAGAATGCCTTTTAACCATAATACCTAAACAGCTTCGACTCTATCTTTG AATTTAAACTAAAAACTATAGGCTTTTCGAGCAAACAGTATACAAGAAAA TAACAGACGACAGTAATAAAGTTCGGTTGAACTGTAGCGATATATTTTGA GTAATAAGCTaggatgaaaaaattttaacaaagtAATGGGAATCTTTAAC TAAATCCATTGTATGTACCACGATTGGTGTAACCTGAAAGTAGATAACGG AAAGACAAATGTAACAGATATGTTGTACGTAAGGGTGGGATGGGTGGGCA GTATTTATCTTTGGCTTCGATTTTATCTTATAAAATCTGGATTGCACTGC AGGCCTTCGGCCCTTGCACAATCCTCAATTTTATGACGATAAAATCTCCG CCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNCGAATAGAGGATGAGTGGGTTTGAGTTATGACTTTTATTTCTTGCC AGTCATGGCGGATATTCCAGTATTTATCTGGCGGAGATTTTATCGTCATA AAATCGCATATtagatttgtttattattttcaacaaaagagaGTGAAAGA CTATggtgaaagaaagaaaaatgtggtTTATTATCTTAAATCAATAAACA TAGTGTTGAGCCAATTATATGTGAGTTTTCAATCATgtgacttttgagtg aacatgtgaaaaatttcgattttatttcgttatttttctcgaAAGTTCTT TGTAAGATGAAGTTGTGTGTTGGTTATGAATTTTTAACTtgtaaaattat atattttcttatcatttaatgttttgattttcttttcagaaaaaacaata cttgaaatggaaacaaattCAGCAACCAAACAACGCAACCATGGAATCAT TCTACTGTACCTTCAAGACTTTTAATTGAAGCCTTTGCTCGAAGAAATAT CTTGCAGTcggtaaattaaattgaattctTTTGGATTTCCAATACATCCA ATGGACAGAGTATTGATACATTACGCTTCAGAATGACAGACTTTACCATT CAGATCAGTGGCTTGAAAACTTAATTAAAACTCATATCTCCTTCGCTCCA GACATAAACTTGTAGAATGGGTAAACTAAACATTCATCGGAAATCTCAGA AATCACagttttaatgattttaatgacacTCAACAGATTATTGtacacaa aatttcaaatactGTATGCAAGGTTCTAATAACTAGACTCGACAGGAATT TGATTGATGGTGAGATGGTGGATTTN
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00053609TCONS_00053609Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_233supercontigscaffold_233:1357745..1364970 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.36 0.21 0.39 0 24.14 18.64 66.09 64.36 13.93 17.23 28.93 16.6 11.91 18.24 5.62 4.64 4.52 4.56 38.04 34.47 12.2 14.42 11.02 11.24 3.43 13.19 26.69 17.41 9.62 4.5