XLOC_034473 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_034473
Unique NameXLOC_034473
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_244:94689..118897+

Legend: gene
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>XLOC_034473 ID=XLOC_034473|Name=XLOC_034473|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=24209bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_244:94689..118897+ (Clytia hemisphaerica)
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CTTCCAAGAGAAACAACCCAACTttatgaaaatcaaacaaaaccAAATGA ATGATGTCATCTTTAAAGTTTGTTTCGTTGCGCAATACGTTAAAGCTTTG TTACAAACACCTGGTTTACACGAAGATGGTATGTTTTTTTGTGCTATCTG ATTTGGCTTGTCTGTAAACACACCCGACATTTACGgaaattgcaaaaata attttgccGTACTACTATTTATTTTACGCCATATATGTGATAAGTTACAG ACACGCTGTGTACAAGCTGAGTAGATTTGGTCAACGTATAATGCACATGC ACCCAGTTGAATCAGGTTGAAAAAGTAGAGTTCTAATGAATTAAAAAGTT ACATTGGGTAAATTTTCTTTGGAGAGGCCATTTTTATAACAATTTACAGA GGGTCCTTCACCACTGATTATTAGTTTATAGAAATCATTTCTTTGGAGAA ACATAGTTACATTCTATGAGCCTAAAATTCTAAGTGTGTACTTTGTTTTA AAAGAGGTCTAAGATTATGATCTGCATTTGTCTCGTCAAATCATGATTAA AATACTGATTTAGCAATGAAATATTTCTAATTCCTTTTCACAGATCAAAT GCAAGAAGGAGAAAATGAAAGTGGACAGGATGATGAAAATGTTGAATATC TGGTGAAAGCATGGAAATATGTCCAATCAATGATCGGGTAAGATAACATC AATTCTCATAGAAGTAAAACTACCTCGGCAAAGAAGAAAGGTCTATAGTG AATTTTTCGGTCaaagtttatgttttttttattagctCAAAGCTGTTTTA ATTCTCATTTTTCAGACCCGACAATCAAGTGGTTAATGGTCATGTGTTGA AAGAACGTGTGACGTCATCATTGTTACCATTCCTTCGATGTTCAGCCATC TTCTTTCACCTTTTGGTGGGCGTGTCAATGCCGGAAGATTTGAAATTAAG TATGTCATCTTCCCTTTTATTGGAACCAATATAGAATTGGCGAATGCGGA ATTATCATCAATACTGCgataatcggatatttcaatagACGATGCATAAG GATCCTACCGGGTCTATGGGAAGGAAAGTGTCATAAACCTCAAATATAAT TTTCTTTAGAAACGATGACTGATTCATTGGAGATGTCTTCGTTGTTGAGA TACATGAACTTACCAACGAATTTGTCTGAAGCTTTGTCATTCGATAAATT ATTCAATGACCCAACCATCAAGCTAATGGTCGACAGGTATTCAATTTTAT TGCTctgtgaaaaaaatgatgagaaaaaaaacattctttcaTAGGATATC AACAGATAGATCGTTCGAATACCTAGAATGAGCAGAAACTTCGTAACTCG AATTTCGAAATAGGCGCCGTACataaaatcacgaaaatttaaaatattca atttatTCTAAGAAATACGGGTTATAAGTAGATTAGCTTGTTTGACCAGA CACCTGATGAAAGTATTTGCTTTCAGCACGCTTTTTTTCAACTTCCATAc tacatttcaaaaatttagtatAATGATTGATATTCTTTACCCTTCAGATG GTGCAGTGACATCCGAAGAGAACAACTCAAACTCGTCAGACCGTAAGTTC TGATTTTATTCTTTCTTTCTCTTGATGTTATTCAACAATTTTACAGATGC CtcacaaaaatgcgggagagccCCAAGTCGGAAAAATTTCCCGATAATCC AGTTCTtccaaatcgggaaatcgggggaATTTTCCCTCGAAATCCGATTT TGTCGGAAATTGGGGAAATCGGGGAATTTTTCGtcctaattttcaaaatc agaattttttttcaggaaatcggaaaatttttagaaatgcgggagatgcg ggagaaaatcttgaaaatgtgGGAGAAAACGTTGGTATGCGGGAGTCTCC CGCCCAATGCGGgaaagttgacagctatgatGCATCGCTTTGATATTCGA TTGAAATTATAGGGACATAAATTCGTGAACTTGCTCTAGTGTAGTATAGT CTCTCAGCATAATACTCAAAGCATAGGTTTCTGCGAAagttttcgcaaat ttgagaagaaattttttatatatacacaatttatttattttttcttcagg aTAAAAGATTGTTATTTATCATCGAGACGTCTTGTAGACCTCCCTGAGCA GTACAGTACACTTATCAAGAGAGCATCCGGGTTCAAGTATGCTGATATTA AATTCCGATGGTTATTTTTGCTGTTATTAATATATTATTTATGACATTGA TTCAGGAGACTCCTTAAGTATGAATGAAATATCCACATCGTTAAAGATCT TAAACACCCTTGTAACAGTGACCTGATTAGATCCGCCCCAGTGGATGATC CGATGAGAAATATTGCCAAAAATGGCCTAACTTTAAGTAAACTCATACTC AATTGAAATTCTATAACctattcaaaatttggaaatttatgGTCTTACAC CGGCCACCGGTATTAATTTTGGCAAGccggtcaaaatcgaaaaacaaaCA TATTGATAAATTCTAGGAAAAAAAGACTCACCAAATATACTCAACAACTC TGACTCGCACAACTATAACTCGATAACTCACTGGGGTGAGAGAGATTTTC ATCGGTGTAGGGAACTTCAGACTCAGTTGATTTTTTATAGCTACCCCGGT AGAATTCAAAATGAGACAGAGGTGTTTCTAAGGAATAAGTAACTAAGTAA GTccgcgaccgcagtcggaggcgacccgaaggctcctctttcgatagcta tctacccgaaggtcggggagggcgccactctttctccctggatttctcca cttatccttgatccttctcttagttgctgagcatcaagcagagaggcatc aagtaccattttgggaatctttggtatgacccggctgggggttgaaccca caaccttgcgaaccgtagccggatgctctaccactgtactacggtcgctc tCGCTTTTTAAGGAAAAGCAGCCTTACACTATTTGAAAATTCTGGTTCCT TACGATGAGAGATTGTGAGAACTATGACTCGCACAACTATAACCTGAAAT TTATTCTCCTTTCAAATCACAAACCCCTTACCTTATAAACGACACTTTTT TACgcaaatttcatttctttgacTTCATTCCGTTTCTCTTCAGATGCCCG ACAGTAGGAGATACAAGCCGTTCACCAGCCTTGTGCCTCATCTGTGGTGA AATGATTTGTAGTCAATGTTATTGTTGTGTCAATGAGAAAGGGATGCCAA ACCAATCATTTGGTGCCTCTGCCGTTCACATTCAGCAATGCGGCCAGGGC GTTGGGGCGTTCCTTAAGATCAGAGACTGTGAAATTTATTTATTGTACAA TCAGAGGAAGGGCGTTTTCATAGCAGCGCCCTACTTGGATTCCTATGGTG AACCAGATCGTGGATTTCAGtaagttttcttcttttttcttgattAAGGT AATTTCTATTGAAAGCATTCTAAGGTCCCAAATAAGCCTTTTAAAGGACG TCTTTTTTACCATCTTCATACACAGTATATTTAAACACAAGAAAGAGCAA ATTTGAAAAGATTCTTATGCTACTTTTGCTCTTTGTATGTCATCTATAAG ATGATGTCTTTGTTAAGATTAGCATTTTTTAGGTCTCACAGTCAAAAGTT AAGCTAAACATACTGAGCCGAGGAAATTTTCTCAAAGTAGACACCAAAGA CAAGGGGATGAAAATATAAACcagattttttgatttgattaccAAAGTCT TAAAAACGCCTTTTCTTTATTCTCAGCCGAGGCAATCCGTTGTTTTTGGA CAAAGGAAGATACGAGAGGATACAGAACTATTGGTTAAAACATAAAATAC CTACCACTATTGTTCAAGCTATGGAAAAGAATCGAAATTTGCTTGCTTTT GATTGGAATATGATTTGAAGATGGTAGATTACAAGAGGGGATATGGAAAG AAAAAGTGATGCTAGCATTCGGAGCTTTCGCTTTGGATTCAGTTGTAACC AACGAAAGGTACCTCGTGAGAAAACTACAATAGAGGTGTTGAAATGTGTG ATTCATTTCACGGTATTTATGCGCGAGGTCGTTGATTTATCTGCGCAGTA AGTACTCTTTCACATAACTTTGCAGCGTGAAAATTACCTAATGGTGGATC AAATAAGCTTCCGATTTCCGGACCaagtaaaattttcagtgaCCATCTCC AATTAGAGTTTGCTGTTCTATATGGCCTATCAACTGAATATCAacaggaa aaaaaaaca
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00054714TCONS_00054714Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00054715TCONS_00054715Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00054716TCONS_00054716Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00054716-proteinTCONS_00054716-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_244supercontigscaffold_244:94689..118897 +
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
UBR1E3 ubiquitin-protein ligase UBR1 Homo Sapiens
UBR2PREDICTED: E3 ubiquitin-protein ligase UBR2 isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
6.05 5.31 2.94 2.63 19.63 14.78 16.76 18.79 12.33 14.19 10.28 9.93 11.21 11.1 7.16 9.66 13.04 13.34 7.92 11.69 11.21 11.26 10.22 12.23 18.19 19.2 9.64 8.52 10.8 10.31