XLOC_035868 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_035868
Unique NameXLOC_035868
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_284:879845..888878-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_035868 ID=XLOC_035868|Name=XLOC_035868|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9034bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_284:879845..888878- (Clytia hemisphaerica)
ATCAAGCTTTCACATGGAATGATTTCGGCGGTAGAATCGTTTTTACACGT
CCATTCTTGTTATAATATTCGAATGATTTTGTTTTAGGAGATTTCATTTN
ATTTACACGTCCATTCTTGTTATATATTCGAAGGATTTTGTTTTAGGAGA
TTTCATTTTTAGTGGGATTCATATATACAATACTTGGAGGCCACGGTATC
ATTTTCTTATTGTTTTAGTGGGTAAAAGACGATAAATATTCTCATAAACT
AAAAAACCATGGCTGCTCCTATACAACAAATTTCAAATGGCGCTATACCA
ATTATGTCTGGTGTTGCAGGAACTCCAGTTCAACAGCCAGCTGTTGTTTA
CCAACAACAACAACCAATGATTGTCGCAGGTGCTGCTCCGATGGGTTACG
CACCACGAAAGCCCTACATCAGGAATCCGAATGAGGAGCATTGGTAANTT
ACGCACCACGAAAGCCCTACATCAGGAATCCGAATGAGGAACATTGGTAA
GGGAGCTTTTGAAAAATTGACTTTTTAATTTATCCATTATACAGTTATAC
TTGAAAAAAAGAGCTCTGGGAAAATAACCATTGTGTCTTCAAAAGACCAA
CTGTATTAGTTCCATAGGGAAAAATTCATGGTTGTTGGACTTGCAAATAC
GTGTGTCAGTGTACCAATCAAAGGAAATTCGTTTTTACCAATGTTACTTT
TTTCTATATCTAAAGAATTAGTAAACGTTTTAAAATCTGTAAAAAGCTCT
CTACTCCCAAATAGTTCTAGATTACCAGACAATCTCAATCAAACAGAATC
GACGATCGAACCAGTCGAATGCAATCGAATCTCAATCGAGCGTCAAAATT
CTGGGTAATATTCGATAGGTTCGATTGTTGTTCAACTGGTTCGATTGTCG
TTCAACTACATTCGATTGTTTGAGTGAAACAAGGCATGTCCTAAATATAT
TTTGCGTGATGCGCACCGCTTCCCGTTATTCCTCCTTAACTCTCATATAT
AGCTCAAAAGAATCGAATCAACAAGAGGATTTCGAAAAGGGTCAGCTTTT
TAACAAAGATTAGTCTCTCTAAGGGTCAGGTCCTAATCAAACGCAATCGA
ACATCAATCGAACGCAATCGAATATCAATTGAATCTGAAAATTGTGAGAT
TCAATCGCGTTCGACAATCGAATTTCAATCGGTCGATTGCGTTCGATTTG
GTTCGACTGGTTCGATCGTCGATTCCATTTGATTGAGATCGTCTGGAGAT
GAAACCCTGCAAAAACCATGTTCAATCTTATCGTTTCGTTGGTATTGGAA
ACCAAGGAAATTCGCAAAAAATTTATTTCTCCCTTTTTTAGCAAAATCTT
TGTCGGAGGTGTTGGTAAATTGACAAATGATGAATCTCTTAGAGCCTACT
TTGGAAAATTCGGAGAAATTGCAGATAGTGTTATAATGAAAGATAAACAT
ACAAATGAGCCAAGGTAAGTGTCAGCATAAACATATAAACAACTGGACAT
CCATCTCCTTTCTTGTATTTTTGAAGATAACACTGCTAGCTTCGTTGCCG
CCTCATTAAAATCATAAAACCTAACAATAAATTTTGGTATACCTCTTGGG
AATACCTTGGTAAAACCTCAAAACTTCAACAAAAGTCTCTGTTGTTCTAC
TCTTCTCAAGTCTTATCTATATCATAACCAAGATAACTGAGGCAAAATCA
TTGTCAGCTTGTCAAAATTCTGACTAATATTTTTAAATTTAGACTCAAAA
GTATGGAATAATTTTAGAGAGTATGGGATTCAAATTATGATAATCTCATG
GTACAGGCTCTCAACTTTGGCGTACTATTTTTTTCATGTCATAAAAAAAT
TATTAGAGTGACAAAAGGGATGCAAAAGTATACACGCAGTTGATAAAATA
CTTATGCAATGTCAAGCTCTATCAATCCTTTTACCTTAGTAATTCCAATA
AAATGAAATTGTGACGGAATATTGTAGAATTTTATATATCAATCAGGGCT
GCAAATAAGCATCGGTCATCGGTCAATGTCCGACTGAAAAAGCCATTTGA
CCGACTGAAAATCATTTGTGTCGGTCATGATGTCCGAATGAAAAAAAAAC
ATTAATTTGAGTTGAAAACAAATCTTTCACACCCCTGTCTCTTTGTCTAT
TATTACTACTCTTTTACTTTCTTTTAGCTTTCAAGAGTGTTTCTAAAGTT
TACTTTGATTTCATGCGTTTTTATTTTTATCGACTTGCTTTCTTTGTAAC
TTTCATCAGTGTTTCTAAGTTCACTTTTTATTGACTTGCTATCTTTGTAA
ACTTTCAAGAGTGTTTATAAGTTCACTTTTTATCAACTTGCTTTCTTCGT
AACTTTCAAGAGTGTCTCTAAGCTCACTTTTATCAACTCGTTATCGTTGT
AACTTTCAAGGGTCTTTCTAAGTTCACTTATATCGCATTGCTTTCTTCGT
AACTTTAGAAGTTCCAAGGTCACTTTTACCTACTCTCTTTCTCCATAACT
TTCAAGACTGTATGATTTCAGAAAACTTATAGACTGAATGACCGACAGGA
TTTAGAGCTTGACCGACAGAATTTCATCTCAGTCCCGACATGATGTCTGA
TTGACTAGAAATATTTATTTGCAGCCCCGATCAATTTTTTAATACAGTGG
GTAACAAAGCTCGCTTCAAAGACACAATGGAAGATAGTCGTCCAGTCGTT
TATATGTTCAGACAAAAAATTTGAGCCTTGCTAACAGTATCTTATGAAAA
ACTTTGTTTTAAAAAACGTTTTAAATTAAAAAAGCAATGGTGAAATGCTG
AGTCAGCAGAAAAGTAAATTGCTGTTTTTGGAAGGAACTTATGCATTGAG
CAATGATCATCTAAAAAAATTACTTTCCAAAACTCCAAAAAAGAGCAATA
ATTGCTGTTTTTATCTCATATACCCCACTGTATATTTTCAGACTGAAGAG
AAAAACCCTTTTCTTTTGTTATTTCATGATATCTTTTACCTGTTCATTAA
TTTCACAGAGGGTTTGCATTCGTCACATTCAAAACACCAGAAGCTGTTTC
AGCTGTCATTGAACAAAATAATAAAGGTGGACATACTCTTGATGGAAAAA
TGGTAGGTTGTAATGTCTGAAAGAAACTCTACATTATATAATGACAAGAA
AAAAATGACGTTTCTATAAGAGAATCATTCTGTGTTTTTTATACATTTTG
GCACACCTGCAATATTGCCAATATATTGAAGTAGTTTTGGTTTCATTTTT
AAAACTTAATTTGGTTGCTTCATACAGAGAAGTAGGATGAAATAGAAAAC
CAGCTTCCTTGACTACCCCATGCCTTTGTTTTAGCTTTATTAATAAGGTT
AGTTTGATTAGGAAAAGTTGAAGAAAAGATGGCTTGTCCTAAAAATGGCT
GGCCATAAAAGTGGATTTGCGTTTTACATTTGTGCACCTACCTGCTTTTC
AATAAGATGTGCGCAATCCCGTGTGAAGTAGCAAATTTTACACCATTTTA
TTGCCTAAAAATTCTCGTTGTAATGATATTGATTTGTTTCAATAATATTT
GGTCCAGTTTCGGGGAAAGCAATCATTAGAATTGTTAATGTTAGGATATT
GTGAGCAAGAAAATAGGTATCTTGTGGTCTGAGTGAGGTGTTCCCAAAAT
ATAAGCCCCTAAAGTTTAAGCCTAATTAGACTCAAACAAAAGACTTCCAC
CACATCACCTCCCTTAAGGGCAAAGGACCTGGTACATGACGAGCCGTGTC
TTCAAGAAGCTGTTTTTCTATCTCATTGCACTTCTCTGCTTCATATCTTT
GATATCTGGGTTGAAAGAAAAATTATAAAAAATTATATTTTGTTTGTATT
GAGCCTTTCACTGACACTGCTGAGATGGATTGAAAATATGTTATTTTGAG
TTTGGAACAGGTTGGAAACATTTGTTTGAGGCTAGGAAGGTCTGGAAGAT
AAAAGAGTTCTTTTTTCTTTCCTTTACATAGTTTATTGAAGTACGAAAGT
TCCAGAGAAAATCTGAGGTGAGATCAAGTTTCTGACTTCATTATTGTTGT
TATTCTTTGAAGGTTGATCCTAAGCCAGCTGTCCCTCAAGGTCCTGGAGT
TCAAAATAAACCCTTGGTAAGTTTTTTAAGTCAGTCGATCTCTGGATCTT
TGATATTAATGCCCTATCTACTTGATTTTTACTGAATGACACAAGATGAG
TCTTAGACTTTTGTTTATTTATTTTTTGTCTCATTACAGTTTTTGAATAT
TTTTCATTTTCAGTATGACCCAGATAAGGCCAACACAACTCTTACTACTG
CCAATGGTGCTGCACAACTTAACGTAAGAATTAAAAATCTTGGTATCAAT
ATTGTTACATTTTGCATGCAAGTCAGTTTCAAATTATGTCTAAATCAGCA
ATGCCCTCAATTGAAGTTGATAAATGCTTTGCTATGACCACTGGTGTTTG
ATCAATAATTTAAATCAAAACTTTTCTTTCTTGAACAGTTTCAATACAAA
GGTCCAATGAAGTGCTCACCAGAAATGAAAGTTTTTGTTGGTGGAATTGG
TATTGGTACAACAGAGGATGATGTAAAGAAATATTTTGAACAATTTGGAA
AGGTAATTTGAACTTTTTTCTCTTCAAATACTCCTTCAAAATTAAAAAAA
CAAGGAATGTTTTGAAAATAAGACATTTAAAAATCTTAATTTCTTATCCT
TCAGGTCCTTGCTGTCGATATGCCTGTTCATCATGTGTATAAATGTCCCA
AAGGTATGTTTATTATTCAGAATTTCGGACTTTATGCCCCTCAAATATCC
AAGTTTACGAAAATCACCATATTTTTTGATCCACACAAAAACAATTAACA
ATGCAAAAAAGTTTAACCCACGCAAATAAATTTTTGAACTTCGCAAAAAA
AAATTTGACCGTCCATAAAAAAATTCTACCCACATGTCCATTCAACCCAA
GCACCCACTCAACCCACACCCGTCAAATCCATACCAGGGTAGAATAACTG
ATTTTAGAGAGGGCTAACTAACTGTGATTTAAAACTTAATCATTTTCCTT
TCCAACAATTTGTTGACTAGGCTATAAAAAAAAAAAAATTCTATCAATTC
ATTTTCTGCTACATCTGGTTGTAATCATACTTACAAATTCCTTAAAATTT
TGTTTTGGTATATATGTTTTTGATAAGGGATATGGTTATGAAGTATAAGC
TTTTCTTGGACGGGTAACTGACCTCAACTTGTCCGTGCACAAGATTACTA
TCATCCCTATTACTATTTTCAGCTTTCTATCTGCTTGAGCCAATTTTATT
TTATATTGATTTATAATTAGTAGAAACCTAGTTGCACACCTTTGCATTTA
ACTCTAGACAAAATATATTGACAGAACTCATATATTTTAGATGTTTAAAT
ATTTACAATTAATGAAAAATAGCCACAGCACAACTTAGCCTGTTTTTTAA
GTAACCAAAATATTATATTTGAGATCAGAATATTAACATTTTGAATAACA
TTTGACATTACTAGAATTTTTGACCTTCAAAATCTAAAAATATATACATC
ATTTTATGATTTTATACTTAAAAGTATTTTAACTAAGAACTTAATAGTCC
CATATGCCATTAATCAATGTTTTTGAATGTATGAATTTACTATGTCTTCT
TTTTAGCAAAATATTTCTAATTTATGATTACCTAATTAGGCTTTGCATTT
GTTGGATTTGAGACATTTGATGTAGTTGCAGCTGTAACAAAAGATCGATA
TCATCAGATAAATGGAAAAACGGTGTGATATAAAATATTTTAATGTTGTT
TTACCAATTATTTTTTCAATTCTTCGTAATTTATAATCAATATTTTTAAA
AAGTTTCAGGTATTTTCACTATTTTGACTGACACTGTAACTAATTTTAGT
TCAGCTCTTTTCAGAAATTTTACCACTATTTTTCTGTTTGTTTCTAGCCT
TAGACTTTAATATTGTTTGAATGTTATTTTGCAATCATTTGTTCAGTATT
TTTGTTTTTCTGAAAAGCTAATTTTTGCTTATTTTTTAGATTTTAAAATT
TGCCTTTTTTCAGTCAGTNTTATATTGATTTATAATTAGTAGAAACCTAG
TTGCACACCTTTGCATTTAACTCTAGACAAAATATATTGACAGAACTCAT
ATATTTTAGATGTTTAAATATTTACAATTAATGAAAAATAGCCACAGCAC
AACTTAGCCTGTTTTTTAAGTAACCAAAATATTATATTTGAGATCAGAAT
ATTAACATTTTGAATAACATTTGACATTACTAGAATTTTTGACCTTCAAA
ATCTAAAAATATATACATCATTTTATGATTTTATACTTAAAAGTATTTTA
ACTAAGAACTTAATAGTCCCATATGCCATTAATCAATGTTTTTGAATGTA
TGAATTTACTATGTCTTCTTTTTAGCAAAATATTTCTAATTTATGATTAC
CTAATTAGGCTTTGCATTTGTTGGATTTGAGACATTTGATGTAGTTGCAG
CTGTAACAAAAGATCGATATCATCAGATAAATGGAAAAACGGTGTGATAT
AAAATATTTTAATGTTGTTTTACCAATTATTTTTTCAATTCTTCGTAATT
TATAATCAATATTTTTAAAAAGTTTCAGGTATTTTCACTATTTTGACTGA
CACTGTAACTAATTTTAGTTCAGCTCTTTTCAGAAATTTTACCACTATTT
TTCTGTTTGTTTCTAGCCTTAGACTTTAATATTGTTTGAATGTTATTTTG
CAATCATTTGTTCAGTATTTTTGTTTTTCTGAAAAGCTAATTTTTGCTTA
TTTTCTAGATTTTAAAATTTGCCTTTTTTCAGTCAGTCATTATTCAGTAT
TACTGTTCTAAACTGAATTTTGAGATTGGTTTATTTTGTTGTAGGTCGAA
GTAAAAGGCTCAGATGAGCAGCAAGCACATTTGAACAAAAAGAAGGCTGA
AGGTATGAGTGAGTACCAGAACTTTCTTATTATTTTAATGATTACCTTTC
GAATGCTCAAATACTGATTCTCGTCTACGGGAAGGGTTTTTTTCAAATGA
CCTTCTTGATTTATTTGCGAATTAAATACCTTAAGGAAAGAAATTTTTGT
GGAACAAGTTTTTGACAAATCCGCGAAATAAGAATATTATCATGATTTAG
ACAGGTTTAGAAAATAACCTATAGTATTAGTGTTTTTGGGGCAGAATAAG
CCATATTTAAACAAAAATTTGTCTCAACCGCAAAATTAAATTCTGTGAAA
CTTCTGAATTTTGAGCTGTGAACTGCGAAATTAAATTCCACAAAAATTTT
TTTCCGCAGAGATTTCTTCCCTTAAGGTAACAACAAACAAGGAATTGAAA
TGAATTTATCTTAAATATTTTGCTTTTTTTTCAGCTATCCGGTATGCTTC
TGCTGGAAGAGGTAGAGGAATTGGATCAGGAAATATTGGAACAGTGACAG
GATACGGTGCATATGCAAACCTTGGTCAACCATTAATCGTAAACCCTGCT
CAACATAGTGTACAATATACAGGTAAGAAGTTAGTTAGCAAAACATATTT
GCTATAAGCCTTAAATATCAACACTGATCACACCTTGGTAAAAGGATTAA
TGAATTATAGACAAAAGTATGTTAATTAGGGTTTAAACTGGTGTAAATAA
TGTTTTTTTTTTTTTTCAACCTGATAAAAAAAGAAATAAAATAATTGATT
CGACAAATCCTTTTGAACCTTCAGTTGCTTTTTCATTACTATTTTGTTTT
TTTCTCAGTTCCTGCTGCAGCAACTGGTGGATATGTGTATGATCCCGCAT
CTAATACGTATTATCAACTCCCTGGAACTGTCGTCGCTGGTAAGACTATC
ACTCAAATTTACCAGATGAATGCACGTCAAAATATTTCAAAACCTTATTT
TATAAAAAATTACTCAATAGTAGGTTTTAAAATAGATCACTCTTTGGTAT
CTGGTCAAAAATATAAGCTCGATAAAATCGCGAAATTTAATCCCCGTTAA
AGTTTATCCCATTAAAGTAGTAACAAAATATTTCTGTAATTAACAGGTGG
TGCAGTTGCAGGTGCAGTGCAAACGGTAGGAACCTCAGTCGCAGCTGCCT
CCCCATACGCTGGTGCAACCATCGCAGCAGGTCAACAAGTCTTAACTTCT
CCACAAGTTGGTCAGCGAACGTTACAAGCAACTGATATGATCCAAGGACT
AGCAGCAGGCTCAACAGTTGGTAAGTGAGTAATCTACGTAAGTCATCTCT
TGAGAATAACTTTTAAAAGTTTGAGTGTCCAAAAGTTCTAAGTAAACATC
ATAGATCAATAACAGTACTTTGTATGTATATGATATTATCAATCATATTA
TCATATTTTTAGCCTTGGGCGCAGCGTATCCAAGCGAAACATCAACCTTT
GGGCCAACTCGACATAACGTGATCGGAGCCAGTGCGCAACAACCGATGGC
AGGAAACACAGTCGCCGATCCTCACGTCGTCTATTCTACAGCAACATCTA
TTTCTGCTGGCGATGCTGCTTTGTCAGCGGCTCGTGGTTACCACCCTTAT
GGAAGATAAGATATTGAACTTCAAAACTGAAAAAAGAGACTTCAATCGTA
CTTTGATCTGTACGTAAAGAAGAAAGCTTTGAAAGACTCGATCTTCACTC
ATGGACAGCGATTTTGTAAATAAAAACTTTTTTAATCTATTGATTGATTG
ATGCTTTGTCAGTTGGTTCTTCGATACGTGATAATCATATTGCTCTTTGG
TGACAATTCGGTTTTATAAATGAAAAGACATTTTATTGGATTTGTCTACG
CCATGCACAATGGATGTAGATATTTTACGCGATAATTTCATTTGAATGAA
CAATTTTTAACGTGAGAACTTTATGGACATGCGCGATATTTCTCTCTTTT
TATTTGAAAGAAAATTTATTCAATGGAATTACAAAATATTTTGATTGTTT
ATCCATTTCTTATTTTTTTATCGGAATTTTCTTTACTTACTATTGAGTCC
ACTTCCACATCAGCTTAGTTTGAGATGTGTAGGG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00056957TCONS_00056957Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00056956TCONS_00056956Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00056955TCONS_00056955Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00056954TCONS_00056954Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00056953TCONS_00056953Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00056952TCONS_00056952Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00056951TCONS_00056951Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00056950TCONS_00056950Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00056949TCONS_00056949Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00056948TCONS_00056948Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00056947TCONS_00056947Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00056946TCONS_00056946Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00056945TCONS_00056945Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00056944TCONS_00056944Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00056943TCONS_00056943Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00056942TCONS_00056942Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00056941TCONS_00056941Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00056954-proteinTCONS_00056954-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_284supercontigscaffold_284:879845..888878 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
125.82	118.51	90.55	80.77	1174.99	895.31	368.95	419.01	320.61	315.23	239.7	209.87	159.3	178.88	207.88	247.85	352.88	317.57	113.13	116.19	238.11	220.63	291.12	271.5	181.72	216.32	162.82	146.49	213.02	255.23