XLOC_036304 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_036304
Unique NameXLOC_036304
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_293:103203..129165-

Legend: gene
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>XLOC_036304 ID=XLOC_036304|Name=XLOC_036304|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=25963bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_293:103203..129165- (Clytia hemisphaerica)
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CCCTTTAGCCTTGAGATTCATATAAAATGCACTCCGTGATCCGAATCTTT CTCTAATTCGAAGAAAATTCTTGTTCCCTAGAAAATCGAATTAACGAGAG TCAATTGTAGTTAAAAGAGCAAAATATTCCTCCTTCATTTTGTCATTGAA TATGTTTAAAAATGCTTTTTTTGTTTAGAATTTTGCAAAGACTTCAAAAA TTACAATTCCATGTACGCTCTAATAAGGTGAGTTTTTTCATATCTCATTT TATGATTAGTCGGTATTTGACTCCACAAATGTCTTTGAAGAGGTCGAAGG TATCTGTTTTTCCAAAAAAGTTTTTTTTCTTCGACCAAAATATGATTAAT CAAAGATTGGATGTCATCCGAAAAACATCCATCCATACTGCCATCTACCA AGGTATCAAAAAGCAAACAAATTACAATCTAAGTCACATTATATCGTTAT TTCCGATAATATTGATGTCTTTTGCAATGGTCACCAGAGCTCTCGGCTAT TCTGTAACACAACGTCCAATCAAAGCAAAATCTAATTATTTTACTTTCCT GTTTCAGTGGGCTGGAGAACACAGCAGTCAGTCGGTTGAAAAATACTTGG GAACGGCTCCCACAAAAACATGATAAAATATTCGAGGTTAGAACAATTTC TTTTTTCGTCTGGCTCATTTCTGAAAGCGTTAGAATTTTCTGAAAAAAGT CCGACGTGTTTATCTTTTTTTTGAATTTCGGACACCGGCAACTTGATATA CTTATGTTTGAATTATTCCATTTGAATCAACGTTCATTTTAGCTTTTTGG TTTGGCTTTGGCGAAGCTAAAAAAACTAGAAAAAACAGACTAATCTCATT TACCTATCACATGGTATATTTCAGGAATTGAAAGATTTGATGGACCCCTC ACGTAACATGTCAAAATATCGAAATATGTTTACTGGTGAACGTTGCTATC CGCCTTTGGTAAGATCCAACCTAATCATGCTATAATGGACTATTCCATTA AATTTCCATACAGGGGAGTGGACGAACATTTTCAAGACAAAAAAGATTCT TAGAAATGTGTGGATACCCCCTGGAAAATGGTAAAACTTGCAAAAATAAA CCTTTGAGAAAATTTATTTTTATACTTTAAAAGTACGAACTAAAATCATT TTCGCCCTCTGAAAATTTTAGAATAACATTTTACCCCCTTGAAAAACGAA AAAATACTCCTTTATACCCCTTGAATATTCTTCAACGATAACCCCTGGAA ATCTTCGTCCGACCCCCCCCCTGTATGGATATAAAATGGAATGGCCCAAT AATTATGTTGTATTTGGGAATGTTAAAACGCGGCGATGCTCATCTCTCAC TCACAGCTTCCCTGCCCTTACTTTGTCAGTCAGTTTTCTACTTCTCACGG CCCTAAAACAAACTTACATTTTCGTTATGTAATTTCATTTTCATCTTCAG ATCCCATGGTTTCCTATCGTCAAGAAGGACATCACATTTTTGCATCTGGG TAATAAAACACACGTCGATGGTTTGGTCAACTTCGAAAAACTACGTATGA TCGCCAAAGAAGTTCGACGTGTTTGTAAATTCTGTGCCATCGGATACGTA AGTTATGAACAGTGTTTTTTTTTTGGAAAAAAAAAAAGACGCCCTCGCCA AATACCTTCGAAATCATGATGATAGCTTTATGTTTTTCGGCAAAAATGAT AAATTTTGATCTGCAATCCAGATTGTTGGTATATTCTTCTTTGAGTCGGT TCTGCTATAAGAGGGATAAACCATTTTACGCAGGTTGTCCTTAAATCTGG AAAAACAAGGCAAAATTATTTTTCTTGATCGGAATCGCAGCGTATTTATA ACGGTTATTAAATTAAAATTTGTACGTACAACAACTTTATGTTTCTACTT TACAGGACCCTCATTAAACGAACTCGATGCTTGCCCTTTTACTAAACAAT TTTCGGTTGCTTCTTTTTACTTCCCAGGACCCTTACAAAATGGACTCGAT GCAGGATAACGTCGGCGACACGTCAAACGTTGCACAATCGGTCGTCAGTA TCATGGGCAACTCTCCCAACCCCAGTCGTCGTGGTCGTGGAAGTCTTGCG ATGAAGGACCCTAAGAAAGCTTACGAAGAATTCCAAACCAGCCGTCGGAT ACGACAATACCTGGAAAAATTGTCCGGTAAAAGTTATAATGAAAAGGAAA TGATGGAAATGTCGTATAATTGTGAACCACCCGTCAGTTGTAAGTGATCT CTCATACCAATTCTCTCTTTCTGATCTGAGTAGAAACATAGCTTGGTCTC GTTTCCAAGCAGTCTATTTAACTAACTTCTTTAGCCATTATTAAATAATT ATTTCGTTTCCAAACGAGGTCTGCTATTCATGATATGCACCATTGCAATG TCTTCTGAATTACATCACGAACCCAAAAGCTGATTGGTTGTAAGTGACGT AAATCAGTCAATACGTCACTTTCAACCAATCAGCTGTTGAGTTCGTGGAA GACATCGCAATGGTGCATATCATGAATACTATATACGTTTCGAGAAGAAT GCATTAATTTATCGCTATGTTGACATACAACATGATGATTGATTGTTGTG CTTATTGTCTAATAGTCGGATAAACACTTGTGTGAAAATCTTGTGTAGTG TGTATTCCATTTCCTTTGTTGCATTTGGAAATACCCTACAGAGCGAATAT ACGTATCCTATTACAGTCTATCTCAATAAAGTCTGTAGCATAGAAAAAAA AAGGCTTTACCCTTTGATACGATACGAATTAGATAGCGTTTTTGGGCTCG TTGAAAAGATAACCGGGAGTGGATATGATGAAATTGAAAAATAGTTAATA AAAATTAATGTAAAAAATTATATCAGAATTGCTTATAATCGCCATTTAAC AGACGTTTAAATGTGATAATTTTCGACCCGTGATTCATTCAGATGACCTT GCTTTAATGTATATACATGTTTTCATTGTCCCGTTGTTCTCACGTTTCAG CACAAAACAGTTTGGCTCGTCAAAAGAAGCCGAGTTCACCGTTACCATCA GCGGGCGATTTGAAACGTAAAGAAGAAAGATCTTCCAAATCTTCTACTGA TTCAACCAGATCAGTCGAATGTAAGTTCCTTTGTTCCTTTGTTATGACTG GCTTTGCAAGGAATTCTCATTGATCGAATCATTTAACTAGTTTTGGTTAG CCGCAAAAATCCTATGAAATTTAAATTGAGCGTGGAACATATTTTTTATC CTGGTGCAAACTGATTTTGGTGAATGGCTGGGTAAATTTGTTCTTTTTTA CCTAAAGATGAGTGCGTTTTAATTTAGACAAAAATTAGGGGTTATCTGAA ATTTCTGAATCAGCCTAACTAAATTTTCTTCTATTTCTCTTTTTAGCCAA CCTCGCAAAACAAGGTATTTAATTTCTTTCATTCTATTGAATATGGAGTA GTTTGCTTTCAGATATACTTTATGACTCAAAACAATAAGCAGATATTCAA TGGGTAAAAGTTGGTTATTGAGATTTATTAACCCGAGGTGATGTAATATT CAACGAGGCGAAACCGAGTTGAATATATATCACCGAGGGTTAATAAATCC AATAACCAACGAAAACCTATTGAATATATGTTTTATTATATACCTAGAGG CAAAAACGAAACATTATATANNNNNNNNNNNNTATACATCACCGAGGGTT AATAAATCCAATAACCAACGAAAACCTATTGAATATATGTTTTATTATAT ACCTAGAGGCAAAAACGAAACATTATATATGTCAATTGTTAAACGTTTCA CTTTAAAACACTCCCATATAATCGAACGTTCGAATGTTTTTATTTTTTAA TAATTTTCTTAATTACTTTGAGTCATAAAATGTGTTCATGAAATTGACAA TAGATTTATTTTAATGCAGGGTTGCCTAAAAAATCCTATTTTCTCCTAAA TTTTGAAAAGTCTCCTAAAATCTCCTAAAATCTCCTTAGGAAATTGAAAT TTTGAATACTTTCTCCTAAAATCTCCTAAAAAATATTTTACCAAGTTTTC AAAAATTCAATTTAGTACTCTGATTATCAAATTTTTATTGCTAAATGATC CTATTCATGGCATACATGATTATTAACAAAAGCATTTCACTCTGTATGCT TAAAGGTCTTTAAAAACATTGGAAGTTATGAAAATTTTGTAGAATTTTCT CCTCAAAAATTCAAAAATTCTTTTAAAAAGTGTGAAAATCTTCTCAAAAC TCCTAAATTTTTTCCCCGTAATTTTCAGATTCACCTAAAAAAATAGATGA AAATCACCTAAAATCTACTAAATTCTCTTAAATTTTGATCAAAACAAAAT AGTGGCAACCCTGTAATGAATTTCTTTGATATAACAACAAAAACGACAAA GAAATCAAACTTTGAGAGCAAAATTTGAAAAAAAAGTTCTACCGTGGTAT AATAGCCATGGTATATCAGGAATTATTCAGTGGCTGTTTTTGCCTACAGG TATATAATAATAACTAATACATGAGAGTCTCTTTAACTCGAACCTCTATA ACTCGAATGTCTCCTTAACTCAAACAAGTTTTCTAGTCCCTTCAATTAGC AATGCCTCATACCTTACTTCATAACACTAAATATCCTCAACTCAAACAAA TTTGTGTTCCCTGTGCATGTTCGAGTTTATAGAGACTTTACTGTAATCCA GTTGCTTATTTTCTCTCTTCAACAACAGTTATACGTTAAAACCGTTTTAC TTTTTCAATTTGCAGATAGCGAACCAAAGCAAGCCGATAGCTCCACGCCA CGAAAGAAACAAGCACCTCATCAGTGGAATGGTAAAGTATTATTATCAAT TTGATATAGTGTTTTTAAATGCCAGCGCTTTTATTTTTACTGGTTGTTTC TAAGACTTGAGCGGTTTCACTAATCAGCTGACCATAGCTATTGGTAAATG AGTCGAGTAATAAATTTAGATGGAACGATACTAGATGTTTCCCATTATTG TCAGGATTGACGAGTTGACCCACATCTCAATATATTATCTATAGTATCTA CCTAGGACAATTAGATACTACGATTCTGGAACTGGTATAGCCCACCACTA AGTTTTTTCTTACACGTCATCCTAATAACAAATCCTTTCCCTCTTCAGAC GATCACCACCCAACAGGAAGAGGACCTTTATACTCAGGTAAGGATCGAGT TTCCTTTCCTTGAAAGAAAATTTTTCTATACCTGAAGGCTTAAACAGCCA TTGAATAATCCCGTGATATACCGCTATGGTCAAAACTTTTTTCAGATTTT ATTTCGAAGTCAATTTTATTTTATAGATATTATTTTTCTGATCAAAGAAT ACTGTACTTTCTTTGCGCTCTCTGATATACATGAGACTGGTACAGAGCAC TCTAGCCCATGTTCTTTACTCGTGATAAGCATCACTGCAGTGTCTTCGAT GTAATGTTAGAAGACATTGCAATGGTGTATATCATAAATTCATAATTTTA ATCGTTCCATAACCCACCTTCGATCTTTCTTCAATGTTTTTTTTTTCTCT CATAGAATCATCGAATAGTATTTCATCGAGGAACGGCTCCTTAAAATCCA TCACTTCAATCGGCTCAAGAAGTCTTCCACCTTCCTACCAAGAATTTCGA TCTGAATCACCTCTTAATTATGACGATGGTAAGTGAATATACTTGGTGCT CAACTCCGCGTGAATGCGAAGATCTGATTTGGTTGTTCAGCCCATACAAT CAAAACAGTGTTGCTTTGTTGAAATCGACTGGGTTCTAATGTTTATGTTA ATCTTTATGATTGGCTTTTGTTTTGGCACGATTGTTTGCTTTAGCCAATT AAATATTCATCCCAAATTTGAATGAAAAAGATAAAAGCGATGCGCCATTT AGGTACAGATTCTCTTACGGAGCCACGGCTTTTAGAGCGAATAAATGCCA TGCGCGGAGTATGGAAATCTGCTTTGAAATTGTATACTATACTATAGATT ATATAAACTTGTGTTTCGCTTCTAGATGATCACCATGGACAAGTATCGAT GGTATAGCGACCTAGCAACCAATCACAATCACGTGGTTATCACGTGGTCT GGTAATTTTATAATTCGTGACGTCACGATGACGTCATTTTGTAGCGCATG ATGTAATGATAAGACTTATTGTAAGTGGACAAATTTTTATTAGTATTTTT ATTATTATTAAAAACCAGAACTCTAGAGAAACAGTTTTAGAGAGAATTTT ACCGTTGATTAGCCTGCCTGTCCAGAATTGATAATGCCTTTGACGATGCA TCGTCAAAGATGAATGCTTTCCACTCTTTTTATCTACTGAATAAAGTCGA ACCAATAAGGGTGTCTTTCAGAATCTGCGTAAAGGCCGGTCTCCACTTTC GCACGAAATGGGCGACAGTTTTTTTTAACCTTTTTTGCCTGAAGAAAAGA TTACGTCATAAAAAAGTTTTCGCTCATGTCACGCGAAAGTGGAGACCGGC CTTTAAAAGCGTTGGATGAACTTTAGGCTGTCCAAATCGTCAAAAAAACT TTCCAAAAGAACTAGGTACAAGGCTGGACCTAAATTCATTCTAACATTGT GACAAACTATAGAAATTTGACCCTTGAAGAATTTTTGGTCCTTGATAGTT ATCGCCATAAGTTAATTCAAAGCCGGTCATCCATAGTCACCTCTATTGAA GATATAGTTGACTCTCGCTAATTCGAACTCGTACGGTGAATCCAGTTTTT TCGAATTACAGAGAGATTCGAGTTGAAGAAAGACTTTCTAACGGGGACTA TAAACGAGTCCAAATTATAGAAAGGTTCGAATAAGGGAGAGTTTACTGCA GAATTTAGTAGATTGATTAATATTTTTTTAGTGGGACCTGTTATTATCTT TAGATATTTTTTCTTTAATTTGTACATAAATAACTCAATTGCTTATAAAC ACTGTTTTATTGCCCCAATTTCGTCGAATTGTAAGATTTTGTTGGAATCA CTGACCTTTATATATCCCTGGACCATGTTACTCAATCCCGGCTAACCAAA AATTTTTGATCGGAGTTTTTTTGAAATTGGTACCCTAATAGCGGCACTAC TCAATAGTGGTGAAAATGCATCGAGAGCGCTAGGTCTACTTTTCCTCAAA TACTTTTGATGATGTAGCGCCGTTAGACGTTAATTTTTAACATTGCAATG GCTTCTTCTCGGGTACCAATTCCAAAAAAACTCCGATCGAAAAGAGCGGA TATAGCTTGGTCCAGGGATATATAAAGGTCAGTGGTTGGAATGAGCTAAT CAGTCTCCTTCATTTGATACATGCTCGTGGTTCCTTTTTTGTTCGCTTAT TTTCGGTTCTTTACGGAACAGATAAAATTAATTTTCTTTCGGTCATTGAA CAAATGACAGTTTTTTATCAAATTCTTAGTGAATTTTATCTCATTTTGAG CCTTCACTGGGGACACTTTAACGGTCGTTTCGCCGGGCCTGAAGTTGGAA TTATTCAAAAATAGAGATGCTACTTTTTTCACGCACGATTGAGGAATTTT CATGCCAAAGGTTCCTTGGGATTATTTTTTTAGAATTTATAATTTTCACA ACTAAAATTTCGTCACATTCTTGTCTATTCTTTAGAATAATTTTTAATGT AAGAGTTTTTCCTCATTTGTTTTTCCCTCATCTTACGGACCTTTTATTTT CAACATACGTTTGATATTATTGCTGACTCAGCAAGAAGATTTTATTGCTG ATTGCAGTGGCAAGTCCTACTTTAATTATATTTTTGTACAGAACCAAAAA CGAATATAATACATACTTTTTTGAAAAAAATAAATACATTTATGTGTCTT TTCAATTTTTTAATCCCTCCACCGGGGGGAGAGTGGGTCAACCAACTGAC GGTAAGTGCGGAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00057575TCONS_00057575Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00057574TCONS_00057574Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00057573TCONS_00057573Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00057572TCONS_00057572Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00057574-proteinTCONS_00057574-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_293supercontigscaffold_293:103203..129165 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
RAPGEF2PREDICTED: rap guanine nucleotide exchange factor 2 isoform X1 Homo Sapiens
RAPGEF6rap guanine nucleotide exchange factor 6 isoform 1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
4.31 3.6 2.99 2.94 59.55 44.73 39.61 46.39 23.7 29.62 19.46 18.82 20.25 18.55 11.97 14.69 17.61 17.96 15.79 18.28 21.26 20.46 10.03 14.55 34.95 33.04 20.19 17.18 16.43 16.48