XLOC_037616 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_037616
Unique NameXLOC_037616
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_331:361174..380841+

Legend: gene
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>XLOC_037616 ID=XLOC_037616|Name=XLOC_037616|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=19668bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_331:361174..380841+ (Clytia hemisphaerica)
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ACGTCACTCAAAACCCTTGATGTGACATAAGATTATTAAATGTTGAATGA TGACTTTGCTCTTTTATTTCATCAGGGATACCAATGCTGAGTTAGATGGA TTAAAACACCAAGTACAAAATCTACACAAGGTCGGTATAATTATCAGTCA TTTTTTCattgcttaatttttttttatattttcctaattcaaattttttt ctcaacatGAATATGAGAAACTGAAAACTAGATCACCCGGCCAGCACACA ACtttattttaacgtttatctaacgttagatggacgttgtgaacgtcaGA TAAATGTTGAAACTACTTTTTGTGTAAGCAGTCCAAATAAAAGCTAAAgt tagacacccctgtctcacaaccccggtgaaactttttctcgCAAACTTTC ATGGTttaaaggctgaaaaatgcagAGTGGatgattttaaaaatgaaaat atttttatggcGAGCCAGACTTTGACATTCTCAGGTGGTTTGGATTAGAG CTCTTTTTCTGAGTTGATTTAATTTGGATCATAGACACGCtcataaaatc ttctttttctctTATCTTCACAGCAAACTTTATATCTTCGCGAAAACTTA GAAGAAGAACGAAAAGCACGCGAAAATTTCGaacgatttttcaagaaaat tgttcAACACATTTCACCTGATGTCGATCTCAACGCCGACAACCTACCGT CAAAATCAACTcctatttgatgacgtcagtactattgatgatgtcatcat tcaCCTCCTGTTTTGTATAAATTATTTGATTTATTACACGCCCAGTCTCC GCCCCTGGATCATGTTTTATTTCTGAGTTCTTGTTCTTGATCCAGAATGC TTCTGTAAgtcattacacgcttttttataagaattattttAGTAGTACAT GAGGCATAAgtatgaataaaaaaaataaaaaaaccagTAAAGAATAATCA ATGCCCCAGATTTTAGAAAtgattcagaaaattttttatagCTTTAGCGT TGAGGCCCAACCGAAATATACTGGGTCGTATAAATAAAGGTTGTATGACa tatttgtaaattaaatttatttgCAGTTTGAAACTTTAAACGTTATTTTG GCCAGTCAATGAAATGTTGCAAAAATTATTAAACGAGCAATTccgttttt gaaatgaaattattttttattccatTATCTATaatataaaatcaattttt tttgtaatattAGTCCTATTatattgtttttagtttttttttgctcttaa TTTCACACTGTTTTGCATTTTATACCTTATTTGAactttagtaatttttt ttcgaatctGTAATTTAGGTATTAAAAATTATCAAGTCTTTGTTTCGTCA ATACCTCTGttataaatttgtaaaattataATTTAGACATTTGTGCGTAA TTAcgtaagaccatgttcacacgctACCACTCGAAAaaaaaggaattgct agattctatccgtcatcaaaaatacggcgtatGTTTAAAGGCTTCACTtg ttcttgcctgagaaaggttagatattcgattctagcccttcgggcttata attCATTGAATCCCACAAAGTCATTAATCCCGGCGTCGCCCGTGGTGATT ATCATTCTCGATTTGCTT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00059791TCONS_00059791Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00059792TCONS_00059792Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00059791-proteinTCONS_00059791-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_331supercontigscaffold_331:361174..380841 +
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
ARHGEF7PREDICTED: rho guanine nucleotide exchange factor 7 isoform X2 Homo Sapiens
ARHGEF6PREDICTED: rho guanine nucleotide exchange factor 6 isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
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Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
43.5 35.35 30.23 33.45 64.32 44.25 80.76 90.4 59.87 78.53 51.99 46.64 55.92 53.69 55.11 64.71 82.98 78.5 49.63 61.76 46.5 48.57 43.2 50.55 57.21 55.88 48.41 38.76 51.46 46.87