XLOC_038848 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_038848
Unique NameXLOC_038848
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_361:103757..112372-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_038848 ID=XLOC_038848|Name=XLOC_038848|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8616bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_361:103757..112372- (Clytia hemisphaerica)
CAGAAGTGTCGATCAAATGTGGTAAAATTTTATGCAGGATGTATGAATAT AGCAATTTTAACATTACTAAACAATTAATTCGTCGTTGGTGGAAACGAAA TGGCAGATTCTACAACCTCCGTATCATTGGTATGTTTTCTAAATATAATT AAGTTGGTTTTATCTGATAAAATTTTTATAGGAATGTAGTTTACTGCCAT CACACATTTGAACTCTCTGGCGACGGAACAAAAAAATGAAGGGATTGTTG GGAATCGAAAGGACCAGTAAAAAAGCCCCTACGTTGACCCCGCTAAAACT CTTTCAAAATGGCAATAGATACTACCTCACTGTTTAAATTAGCTGAAAAG TCTGGGGAGTATTCAGATAACTCAAACTCTAATTTGTAAGAGGCTTCGTT GTCTATTTCAGGCACAGGGATATCCTCTTGGCGTCTTTTTAGACGTAGAG ATTCTGATTTCTTGACCCTGGGTTTTTTAAAGCTCGTTGAAATCGACTTT ATTTTTGTTTATATTTTGATTTTATATTTGAACGATTTCAAAATGTTTCT TTAGCAGTTGTTCTCTGTTTGTCTTATAAAGACCCAGAAAGTTCCCAAAT TTTCGCCTCCAAATTAATTCTCTACGACAGAGGGAAGTAAAGGGATTATC TTCTCCTTATATGGTCCTCTTTTGGGCTCCTTCAACGTGTAAAGTAAGTT TTTGCCTTTCCAAACGGGGGCTGAAGGTCTAAAGAAAATAAGGGTTATCA TAAACTTATATCATGAATGGTTTTAAATATTTGTTAAGATCGATGTTCCA AACTTAAGATTTTGATTGAAGTCATGTGTTATAAATTTAACTCAAACAAG TTTTATACGACCTTTCCTGACCTTTCGCGAGAACTGCTGCAATATTTAAA TTGTTTAAATTGTTGATTAATTTTTACGGAAGATGTTTAAGTTTTAGGAT TGGAGTTGCCGGGAAAAGCAAAAATCTGTTGATTTTTAATAATCGATATA ATTGAAAGCTCTTCCATGGAATTTAAACGTTTTTTAGAAACATATCTTCA ATATAGTGATAAAGCAAAGCTTTGGGTAGACATGGGTAATGAACGGTGTA CTAAATATTGAAGCAGTCCTCGAGAAATAATCAAATAAAACATGTACGGT GAATGCGGTGAACTTTACTTTTCAAATCACCATTTATATTTTGACTTCAT TTTCTTTTAGTTAATACTCCTTTACGACGGCCATGGATAAGTCAATCGAA CATGGAGGAGGGCGTAAGAAGAGTTTTGGGCGTGGTTTTGATTTCATGAT GTATAACGTGGATGATATACCGCCATGGTATTACACTATACTCCTCTCAC TTCAGGTTGGTGTAATCTGTTATAGACCTTCAATGTCAATTATAATGAAA TATTGATTTATCACTTTGCTAGATAAGCCTAGTCTCATTTGCAAAGCACG CGCTTCCTATCTCCCAAATAGGAATGAAAGTCTACCTGGAGCCATCAAGT CATCTTTATAATCAGGCTGTTTTTTAGCTTTCCTGAAAAAACTCATACTA CAAACTTTTTTGAAAATCAAAGCTTTGGAGACAAACAGCATTGCGAAGAT ATACCTTTTAAAACAGATATAAAGCTCAAGAGCCTAAGATCTAGAGCGTC AAATGTTTACATTGTTATCTAAAAAATCTTGTACCTTGAAAATATATATC ATTATTTGCACAGCATTACATGACGATGGTGGGATCAACTCTGGTCATCC CCATTCTTCTTGCTGGTCCTCTTTGTATTGGCGACAACCCTCTTGCATTG AGTGAAATCATCAGCACTGTTTTCCTGATTTCTGGGATAGCAACTATCGT CCAATCCTGTGTTGGCACCAGGTGGGTTCGCTGATTTGAACATTTATTTT TATTTTTTGGATATTAGTACCATCGGAAGAGATCATATCAGCTTCCTCCC TATTATGCTATCACTAAAATAAGTCACGAACATCACTTGCCTCGTATTCA AACAATATCCATGGTGATCACGTTCCTTAAGACATTAAATGATTTTTTAA TGAATAGAAGGTAGTTGTAATAAAATCCGCTTGGAGTTAATCACCATGGC AATAATTTCAAAACGAGGCAAGTGATGTTCATGAAGTAATTAATGAAAAG GTCTATTGGTTTAATTTATAGCGTACTTCAGTTTAAAAACAACTATGTTT AACTATGCTTTCCTTACATCTTTTTGCACTTTAAAGTTATATCATGAAAC AGCGTTGAAACGTGAAAGTATGGACTAGGCATCATCGAATTCAACTCAAA ACAAATTTATCTTCTCTCATCTTTCACTTTAATTCAGGTTACCTATTGTC CAAGGAGCTACTGTCGCATTCTTAGGACCAACCATCTCAATACTGAACCT TCCAAAATACAAATGTAACAATCCCTCGATTGTCTCAGTATTAAGCAACT CGACTGGTCCACTCAACACGACTATCAACTCGTTACTTGTCAACTCGACT ATTCTTCCCTTTTTATTCAACTCGACCATCGATCCCTTGTTATTGAACTC GATAATTTCCAACATTACCTTAAGTAATTCAACATTACTAAACACCACAA GTAAGTATTACCAGCCTTCATTATTTAGTCTTGAGAGCTTGATACATTTT CTAATTGAATTGCTTTTATCAAAATAGTTTCTTTCAAATAAGAACATTTT CCAACGTCGGAAATTTGAAGAATTCTCTAACCTACTCCCAAGCTTTTAGT TAATTAACAAAACAAATGTTATGTTGTTTAAGGGCGTTGCCCTCCTTGGA GGGTCTTTGCTCTTTGTTACACTTGACTAAACTTACTGGTTCATAATCTT AAAGTGACAAGCACGACTACAACGACAAAGACACCAACAACGATTTTCAC TACAAGCACAACAACAGCTGCTCCACTTCTGATGGTGGAACAACATGATT GGAGAGTGGGAATGCGAGAAGTGAGTATATATTGTAGGCTGTTCTTAAAT AAAAAATAAAGGATCCCTGAAGATTTTTAGCTATATTTTTTCTATTAGTA AAAAATTCATGATTAAGTATACGATGCTATGTAAGAACTTCTGTTGAGGT TCAATTTTTTGGCACTTTGAGGCTCAAATCTTTATTATTCTGCTCTTAAG GCTAATTCGAAGCCTGATATTGTTACTTGTACCTTTTGCATGTATGTTGC AATGAAATGATCTTACGTTTGCTGTGATTCTGTCTGTTGACCAGCCATAA GAAGAACCATTGGCATCCAACGGCTTATTTCTCATAAAAGGTTAACTTCA TTTTTTTCAAGATTCAAGGTTCTATCATGTTGGCATCATTATTTCAAGTT GTGATTGGAATGACTGGTATTATTGGATTTCTCATGCGATTCATTGGTCC TTTGACCATCGCTCCCACAGTCTCACTGGTTGGTATAGCTCTCTTCGAAT CTACTGGTGACTTTGCTGGCAAACAGTGGGGTATCGCTGCCTTGTAAGTT TTAGATTCTTCAAGAACATTAAGGTTTGATCCCTTTCTTTAATTTTTTAC GGTGCTTTAAAGTCTGTAGTTCTTTTGATTGATCGTTTACTTTAATAGGA TGAATTTTCGTGGGATTAAATTTTAAGATTTCGCTATTGGGAGACAATAT TTCACGATTGTGTGCCTTTTGCTTCCAAATCATACATGTTGGTTGTTGAA ATACGCATTATTAGCGCTTCTTTGATGCCAGTAAGCATTTAAAAGTAATT TATTTGACAATTTTGTGTTTTTTTTTCAATATTTTGCGGATAAGGCCTTT TCGAAATTCCATTGGGACTTAATTTCATCCCGTAGTAAGTAAGTAGTCAT CCTGAAATCTTAAGTTTAATTTTAATGCTGAGCAGTCAAAGATGTTTTTT TTTGTCTTTCCTTTACAAGACATCAAAATCTCGTTTTATAGACTTATTTG TTTATAATGGAAACATTGACTTTTTCTCATTATTTGTCATCTCGTTATAG GACGGTGTTGTGTGTCATTTTATTCTCACAAGTTCTCGGTCATCGATTCT CCTTCTTCAATTTATTCCCTGTAAGTTTACGTATATAAAATCCATGGGGT CATCCCCCCTAGGAAGATGGGGAATCAACTTTTTCCCTGGAGGGGGGGGA GTGAATATTTTCACCTTGATGGGGTACTAATGCGAATGGGGGATTTCAGG AACTTTTGGGGGTAGAAAGTGCAAAGATTAGGTATAATATTTCAAATAGA TGATTAAATGTGTCCATATTTCCAGCATTTGTCCATTTATTGCAGGAAAT NATGGGGGATTTCAGGAAATTTTGGGGGTAGAAAGTGCAAAGATTAGGTA TAATATTTCAAATAGTTAATTAAATGTGTCCATATTTCCAGCATTTGTCC ATTTATTGCAGGAAATTCTTATTTTTGTTAAAATATAGCTAATCGGTTTG TCACAAAAATATTCTTCCAACAGGTGGAACCCCGTAAAAAGGGTAGATAG GGGGAGAAGACCAAATGGGGGTGAAATCGCCATGAAATTATTATTACGAT AATTATTACGGGATAACATCAGTTTGTATAATTTGTCCCTCCTATATATT TGCTTATTTTCTACTGTTTGAATTAGTCGTCTAGCATGTAGGACCACACA TCGAATGGGGAATTGTAACACTTTTTTGCCGTATGCGAAATGTGATTTAT CCATTGTCTCCTGCATAATCTGAAGAGTTTACGAGCTTTTCAACTGTGAG AGCCTCTCGTAATTTCGTAAGATGATAATAATCAAATACTGTAATTGGTT CTTATCTTTCATTTTATTGGTTATAGTGGACTCGAAAACTTAACATCTTG ACGTCTCTAAAGTTTTTATTTTGAATTTTTCATCCAAGCAGGTGATTTTG GCGATTTTCACAGCATGGGGTGTTTCCGCTATTATTACCATTGCTGGAGG CTTTCCCGAAGACTCACCAGCACGAACGGATAAACGGATTTCCGTAGTCT ACGAAGCGGAATGGATACGCGTTCCATATCCAGGTACACAAGCTCCTTTC ATTACTTTTTTAACATCAAAAAGGTTTTTCTTGACTTCTACACATTTTTT AAGAACGTCCAAAGTTTTTGTGGCCTTCGGATTCTCTTACCTTCTTGAGT TTGAAGCCTAAAATGCTTAGAAAATGTTCTTATTTTCACCATTTTGTGAG TATCAAGGTCCAATTTTCTAAGAGATTGGATGTTTTAGAGTCCGAAAAGC CTTAATGTTCTTAACATGTTCTTATTTTTACCATCTTGTGAGTATATTTT TGTTCATTTCCCTAAGAAATTGGGTGTTTTAGAGTCTATAAAGCTGATAA AAAAAGTGAAAACTAAAAATTTAATTTTATTCATTGTTTGACGTTTCGGT GTCTTCTTTGCATCATGATCACAAGTATAGTAAAAAAAAAACAAAAATGA ATTTCAATTTACAACATTCAAAAAAAAATCACAAAATTAACCCTATTCGT ACTAGGGGGGGCTCTTTCTGTTCGGAGGTCAAACTATTGGTAATAGGTCC TGAAATAATAGAGCTTTTGCCTTGAAATTTTCTGTAAATTCCTAACTTTT ATTTAGCTTCAAAATAAAAAACAATTTGACACCTAAATATTTTCACACCT TGAGCATGATGACATTTCTGACAGTACGATGTCACAAAAATTGACACTTT TCCAATACAAATTTATTTTTAATGTCAAATATATCGTTTAAACCGTAATT TATTGAATATTTAGGATAAAATAAGCATTTTAAACTCAGGCAACTTTTTT CTAAAGCTTTTGTTAGAATACAATTGTAATTTATAAGAACAAAGGAAATT TCCGGTTTTTGCTCACTTTGGGCATGATGAGTGACGTCATCAAAAAATTC TTTTGTCAAAAGTTACCTTACGTGACAAGGATCTTGTGTGCCAAATTTCA TCCAAAAATACCCACTAGATCAAAAGTTAAGGGGTGGTACAGGAAAAGCC CCCCCCCCCTAGTTCTGAACCGCCCCTAAAAGCCTAGTTTGAATAGGGTT AAAAAATTACTACCAGGTAATTACAAGTTGTTAAATTTCACAAAGGAACG TCTATAAAGCCTTAAAATGTTCTTAACTTGCTCTTTATATTTTGCCATCG AAGCCTTTTGTTCTCTTATATAGTTTGTCCTCATAGAAAACGTGTATTTC ATTTCTTTTAACAACAACATATACTCACGATATGAAGTGAAAAAGAATTT TTCAAATGATTCAGGCCAATGGGGAATGCCGACAGCTCACGTTGCTGGTG TCTTTGGTATGATTGCAGGTGTGTTTGCCTCGATGATCGAATCAATAGGA GATTACTACGCATGCGCAAGGATAGCAGGTGTGCCTCCACCACCCAAACA TTCGGTGAATAGAGGCATTCTTTGTGAAGGATTATGTTGTATACTAGCTG GTGCATTTGGATCAGGCAATGGAACGACATCTTACAGTGAAAATATTGCA GCAATGGGTATAACAAGGGTGAGGAAATTTTCAATTCCCTTCTACTGACA CTTACCCTGNTATAACAAGGGTAAGAAAATTTTCTATTTTACAGTTGGCT CTCTAATTAAATTTTCAAGGGATAGAATCTTCTTTGAGTTTGAGATAGAT TCGGAGGAGTATTTTCTTTATCATTTTTCATGTTAAGGGACTGATGTTTC GAATTACAAATGCTCGAATATAAAGGTTCGAATTAGAAAGAGTTGATTGG ATTTCTATTGATTCCTTTCCTGCGCTTTCAACAGCATTCACCTATCTCAC CTGCCCAGTTACTTAAACCTTGTTTCCCTTCTTCACGGTAATATTTTTTC ATAACTTTAGTAGAAATCTTTTAATAAACTTTCCGTAAAAACACTCAATA AACTAGAGTTTATCGAGATGATTTGCATCAATCCAGAAAATCTTACATGG AAAATCACGGCATTGGGCTTTTCCAGAAAAAAACCGTGGACCCCCTGTTG AGGAGGTCCAACCTTTTGTGACCTACCTACCCCCTTGGAATTCCAGGCAA TATTAGGATCATACCCTCTGGAATTCCGAATTTTTACAAATTTTCAATCA TTATCCCCTTGGAATTCCGCTTATTTTTGACGGATTTTCGTCTACCCTTA TGGAATTCCGCTGCGTTTCAAACCTTACCCCCTTGGAACGGAAATGGACC TCCTCAATGCACGATTTTTTTCTGGAAAAGCCCATTGTATGCAGGGAAAA TGAAAATATGATTCATAAGATTATCAAATCAAAATAACATATCTTTCAAG GTTGCCAGTCGACGTGTTGTTCAAGTATCAGGTGTCATCATGATTCTGTT GTCCATCCTTGGCAAGTTTGGTGCAATCTTCACATTGATTCCTGACCCTG TGATTGGTGGAATGCTTTGGAGTTTGTTTGGTTTCATCATCGCTGTTGGA CTTTCCAATCTTCAATTCGTCAACTTGAATAGTTCAAGAAATCTTTTTGT TTTGGGATTCGCTTTATTCAATGGAATGGTCGTACCAACCTGGATCGTCA AAAATCAAGAAGCTATTAACAGTAAGTTAATTGAATTGTATTTTTGTTCA TTTTTGAAGTACTCTAGTAATTAAATCTAGTTAAATGAACAAGTGGTATA GGGCTTTTCTTGAAAAATTTTGTTCATTGAGGAGGGGGTGGTCTGAGTAG GTATTCACGTTTAACTTCTGCTTGTGCTTCTATGCAAACAAAAGTATGTA AATTTAATGCAATAAAATAGCATATCAACAGAGTTTGTGACCCTCCTATC ATAATATACTTTTTCTCGTCTTACAGCCGGAATTGAGGAAATCGATCAAG TCTTATTCGTTCTTCTTAAAACTAATATGGCTGTCGGAGGGTTGACAGCT GCCATCTTTGATAACTTGTTGCCAGGCAGCAAAGAAGACCGCGGCTTGTA CGCATGGAAAAGTATGCAAGGTTTTGATGGCAGTGCTTGCCGTACGTACG ATCTACCTTATATTCAAGGATTCTTAGACAGACACAGTTGGGTGAAATAC ATCCCTTTCTTACCGCACAATAAACAACGTAAAATATCAAGGTCAAGTGA ATTACAAAATTTTGATTTACAATCAGATGAAATTGCTATTTGAGGAATTT GTAAAAAAATAATTGCTGGTATGCATTCAATACACCTTTTCGACCGTAGC CGCCAATTGCCGTGCGGGCATTTTTTTGTCCGTTTTACCACCCTAAAACC GTCCCACTCTTTTATCGCACCTATAAACAATAGAAAAAGGTGTAAAAAAG AATTGGATTGAGTTTAGGGGGTACTTAAATAAGAAAGTGGTACGCGCCTG ACCCCGTGACTATGGTCGAAAAGGTGTATACTATTTAGTCATTTTTATTT TTCACTCAATTTCTTTGTACATAAGTATTTAATCATACAGTATCAGTTTT GTAAATTCCAATACCAAACCAAATACCTCCTTTTCTATGATGTGACATGA ATATTACCACTACTGGAGTACAAATTATTTTTTTATAAGCAACCCCAATA TTCGGCTCAGGGCTGAAGTTACTATGGATTTTAAGTATTTTAGTCAAAAA ATTGCTTATGGATTTT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00061968TCONS_00061968Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00061967TCONS_00061967Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00061967-proteinTCONS_00061967-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_361supercontigscaffold_361:103757..112372 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
SLC23A2PREDICTED: solute carrier family 23 member 2 isoform X1 Homo Sapiens
SLC23A1PREDICTED: solute carrier family 23 member 1 isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.83 0.91 0.45 0.31 1.07 1.03 0.87 1.2 0.63 0.93 1.14 0.99 18.79 26.99 0.68 0.73 1.41 1.27 24.05 16.98 0.61 0.84 1.05 0.96 0.76 0.74 0.76 0.7 0.95 1.06