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transcript sequence >TCONS_00069167 ID=TCONS_00069167|Name=TCONS_00069167|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=615bp GAGAGAAAACATTTGCttcagaaaaatctttaaaatggcTGGAGCTATCA AGATTATTTTTGCATTAGTTTTTGTTGCTGCTGTATGGAGCTTTTCTGAA GCTGCAACATGCACCGACAAAATGGCAGGCAATCTTTGCCAAAACTTGGT GACGAAACATCAATGTAAAACAAACGATTACGTCCAAAAACAATGTCCAA AATCATGTTTCAACTGTGGGCCCCCACCACCAAaACCATGTCAAAACACA TCACACAAGTGTGGTTCATGGAAGAAATATTGCCGATCCATTGGTAACGT CCGTAAAATGTGTCCTTATTCGTGTGGAATGTGTCGAAGCCAAGCTGTTT GATAATAATCGTCTGGTGTAATCATTCTCGGAAGATTGGACTATTTCATT TTTAAGCCATAAAGGGGTATTGATGAACTTTcccagattttccaaggggt ttaattgtttttgaaaatttctaaggGGGATTATTGATATTTTCCAGGGG ATCAGAGTAACTTAAAGAGAGTTTTCCAGGACCTAATTTAAGGAATTCAG TAAAAAACCCATAAGATTTTAATTTCCAGGGAGCTTGTAGCTCAATTTCC AGCTGATATTGGAAA Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00069167-protein >TCONS_00069167-protein ID=TCONS_00069167-protein|Name=TCONS_00069167-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=116bp
RENICFRKIFKMAGAIKIIFALVFVAAVWSFSEAATCTDKMAGNLCQNLV TKHQCKTNDYVQKQCPKSCFNCGPPPPKPCQNTSHKCGSWKKYCRSIGNV RKMCPYSCGMCRSQAV Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_495:128047..161264- Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00069167 ID=TCONS_00069167|Name=TCONS_00069167|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=33218bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_495:128047..161264- (Clytia hemisphaerica) GAGAGAAAACATTTGCTTCAGAAAAATCTTTAAAATGGCTGGAGCTATCA
AGATTATTTTTGCATTAGTTTTTGTTGCTGCTGTATGGAGCTTTTCTGAA
GGTATGATTTTATAAATTAGCCATACTTAGTTATACTAACTTTTTTCATA
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GCTTGGTTACGGCTTTAGACCTTCCCTACAGCCTTTAGAAGAAGTAACAA
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TAGAAGAAGTACCAACCCCTAAAATTGGCTTTCAATTTCCGCGTTTAGCC
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ACCCTACAGCCTTTAGAAGAAGTACCAACCCCTAAAATTGGCTTTCAATT
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ACGCGGGGGGTCATTTTGCTTGGTTAGGCCTTTAGACCTACCCTACAGCC
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TGATGGCCAAAATATTAAGAACAAGTTAAAAACATTTTAAGGCTTTGTGG
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AAGAGTAAACTAAAAGACTTGAATGAACGAGTATAAAATGGGTCATGATT
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GTAGTTTTAGCGGAGATTCTTAAAATGGCTATAACAACAAGAGTGCTTGC
TTTATTTTTGGTTGTTGTAGTCTGCAGCCTTTCAGCCGACGGTAAGTACT
ACTGTAGTCTTTGTAACTACATAAGTCTGTAGTTAATTCGAACTTCTATA
ATTTCGAATCTTTCTCTGATTCAAACTAGAGTTCCCGTCAAGGGGGACCC
TCCTAAAATACGCCTACTATCTATAATTTGAATCTCTCAGTAATTCGAAG
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ACCTAATATAGACACATACTTGAGAATTTTTTGAGATTCTTTAATTTTTA
GGGATTCGGAAAAGATTACTCGGCACCAGAGTAACGCAAATGAACTTTGA
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GGGATCAGAGTAACTTAAAGAGAGTTTTCCAGGACCTAATTTAAGGAATT
CAGTAAAAAACCCATAAGATTTTAATTTCCAGGGAGCTTGTAGCTCAATT
TCCAGCTGATATTGGAAA Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_495:128047..161264- >TCONS_00069167 ID=TCONS_00069167|Name=TCONS_00069167|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=1053bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_495:128047..161264- (Clytia hemisphaerica) AACCATGTCAAAACACATCACACAAGTGTGGTTCATGGAAGAAATATTGC CGATCCATTGGTAACGTCCGTAAAATGTGTCCTTATTCGTGTGGAATGTG TCGAAGCCAAGCTGTTTGACTGCAACATGCACCGACAAAATGGCAGGCAA TCTTTGCCAAAACTTGGTGACGAAACATCAATGTAAAACAAACGATTACG TCCAAAAACAATGTCCAAAATCATGTTTCAACTGTGGGCCCCCACCACCA AAGAGAAAACATTTGCTTCAGAAAAATCTTTAAAATGGCTGGAGCTATCA AGATTATTTTTGCATTAGTTTTTGTTGCTGCTGTATGGAGCTTTTCTGAA GAACCATGTCAAAACACATCACACAAGTGTGGTTCATGGAAGAAATATTG CCGATCCATTGGTAACGTCCGTAAAATGTGTCCTTATTCGTGTGGAATGT GTCGAAGCCAAGCTGTTTGACTGCAACATGCACCGACAAAATGGCAGGCA ATCTTTGCCAAAACTTGGTGACGAAACATCAATGTAAAACAAACGATTAC GTCCAAAAACAATGTCCAAAATCATGTTTCAACTGTGGGCCCCCACCACC AAAGAGAAAACATTTGCTTCAGAAAAATCTTTAAAATGGCTGGAGCTATC AAGATTATTTTTGCATTAGTTTTTGTTGCTGCTGTATGGAGCTTTTCTGA AGAACCATGTCAAAACACATCACACAAGTGTGGTTCATGGAAGAAATATT GCCGATCCATTGGTAACGTCCGTAAAATGTGTCCTTATTCGTGTGGAATG TGTCGAAGCCAAGCTGTTTGACTGCAACATGCACCGACAAAATGGCAGGC AATCTTTGCCAAAACTTGGTGACGAAACATCAATGTAAAACAAACGATTA CGTCCAAAAACAATGTCCAAAATCATGTTTCAACTGTGGGCCCCCACCAC CAAAGAGAAAACATTTGCTTCAGAAAAATCTTTAAAATGGCTGGAGCTAT CAAGATTATTTTTGCATTAGTTTTTGTTGCTGCTGTATGGAGCTTTTCTG AAG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00069167-exon-scaffold_495-1575043694:161164..161264 | TCONS_00069167-exon-scaffold_495-1575043694:161164..161264 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00069167-exon-scaffold_495-1575043694:160844..160975 | TCONS_00069167-exon-scaffold_495-1575043694:160844..160975 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00069167-exon-scaffold_495-1575043694:128047..128428 | TCONS_00069167-exon-scaffold_495-1575043694:128047..128428 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00069167-exon-scaffold_495-1510915933:161164..161264 | TCONS_00069167-exon-scaffold_495-1510915933:161164..161264 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00069167-exon-scaffold_495-1510915933:160844..160975 | TCONS_00069167-exon-scaffold_495-1510915933:160844..160975 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00069167-exon-scaffold_495-1510915933:128047..128428 | TCONS_00069167-exon-scaffold_495-1510915933:128047..128428 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00069167-exon-scaffold_495-1491911889:161164..161264 | TCONS_00069167-exon-scaffold_495-1491911889:161164..161264 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00069167-exon-scaffold_495-1491911889:160844..160975 | TCONS_00069167-exon-scaffold_495-1491911889:160844..160975 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00069167-exon-scaffold_495-1491911889:128047..128428 | TCONS_00069167-exon-scaffold_495-1491911889:128047..128428 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_495 | supercontig | scaffold_495:128047..161264 - |
Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
Term | Definition |
IPR003582 | ShKT_dom |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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