XLOC_036536 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_036536
Unique NameXLOC_036536
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_302:111082..135048-

Legend: gene
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>XLOC_036536 ID=XLOC_036536|Name=XLOC_036536|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=23967bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_302:111082..135048- (Clytia hemisphaerica)
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CGCACACCAGGAGAAGCAAAAACGCGATGCTGAAGAAAAAGTCAAACAAA TTCGAAAAACACTTCAAGAACAAGAGCATCTTCAAGAACGCTTACGTCAG CAGAAAGAGGAATCGGACGCTGACAACGAATGGTTGAAGAGTGAAGACGA GAAAGCGTACGTTGAAACGGCTTCACAAGGCGATCCTTCTTCACCGACTG ATCCTTCTACTACTGAGCCTTCTACTACTGATGAAGTGGACTCCAAAACG AGGCTATCAAAACGACATTCCTATAATGGGGTAAGTTGCATCATAGAGGT AATAAAAGTTAGATGGAGTAACAACTTTTCTGTAATAGCCAGAGAAGTCA TAAAACCCTTCAGAAATTTCTTTCAAATCGGCCTCCTTTTATTACCAATC CTTGATAGCAAAAATCAGTCAAGATATAGATTATAAGAACTAAAGTAAAG TTATTCTGCCCAACGAAACCTCGTATTTTTAGGTAAAATGCGAGTTTTTT TCGAGTAATGATTTCTTTATAGTTTTAAAAGAAGTTTTTATTTTATCGGG AAACTTACGAGAGGTAAACTTCTTCAAATTTTGCGAATTCTTTGTTGTTT GTGGAAGGTTCTTTGCTATAAATATCTTTAGATTTAAAATAGCAGCTGCC TCAAAATTTTTATAGAATATAGTTGAAAGATTGGCATTAGTAAATATGTA AAAATTGACAAAATTTACCGAGGATTCCCTGAGCAGCGAACATTTCAAAT TCGATGTTCTGTGCTTATTCTTGCAAGGGTTTCTTATGTTTTATCAACGA AACTGTCATCACACAATGAACAAATTAAAAATGTAGCGTGATTTTATTCA AATTCTCTTCGACTCAAGTATTCCCATGAGTGAAAGTAAAATTAATGGCT TTTTCCCAAAGCAACAAAGCAACAGTTTGCTATCAACGATACAATACAAT AGAATAGTAGGCGTGGTATCTCCATCTATATTTTTATTACCTCCATGGTT TCATCGAAATCAATTATGTATGAAATGCATAAACAAGCCCTTGTCTGATT CCTAACTTTTCATCAGAATAAACGCAAATCGAAATGCAAAAAAATGCTAT CTAGTGGGCGTATGAATGAATATTTATACCCATGATAAACAATACCCAAT ATTGTGAAAAATACGATCAAAACAGAGTTGAGCAACACTTCTAGTTTCTA ACCAACATCTTGAAAACTCGAAAGATATTGACCCTCCTCTTCTATAAACG GCACAGATGTTTATTTTTGAAGTTCACTTGGCAGTAAAAACACCGCAAAC CGCAGAAACATTTTCTTATGTTTGTTTATCAGTTTCCTTCTCCAAAATTT CCCACAAAATTTGATCCGTGTCCGCAACAAATTCGTTTACTTTATAAGCC TACTCTACGCTAAATTTCACGTTTTTCACTTAAGATTGGGTATTCAGAGC GTAGACTTCTAATTTTGATGTTTACGGTTCGCGGTCTTACCTAGAACGCT CGTATTCAACATTGAGGATGCAACGCATGCGCGCTATATCAACTTGCAGA TAAGAATTAGCCAATCTTGAGTTTACCGCGATCTTGATAACCAGCTCCTA TAGATTTTAAAGATTTGTATGGACAATTTAGTTTTTTTTTCCGCAAAATT TTTCCCAATTTTATCCTAACTTTTTATTTCTCCACTTTGGCACAAGTAGA AGAATAAGTGTTTCTTACTTCATCAATCAAGGATGAAGGTTTTTTTGGTT GGTTCTGACTTTCCTATAATCTAACAACAACCCGGAATTCTATAGCGCAT CTCCTCGCTTCATTTTAGGAGAAAACAGAATATGACAAAGACAGACTTTC CGAAGTATGGGATCGAAAAATGGAACAAACCAAAAACGCAAAATGTAAGA GTTTGGAATATTCTTTTTATAGAAGTCTTAACATGTATTCTTTAAAGTTT CTGATGAACATTTTGCCAGCTATAGAAAATTTCGATTTCTTTATGGTCGT TTGCGAGACTCAGTCAGTAATTACAAACACCGGGTTTTTTTCGTTTCCTA TTCAGAACAAACGAAATTAATTTTCTCATTTTTCCATCTTTAAGCTTTAG CCTGATTCGCAGACCTCTATGGTTATACTTCATTCTATAAGAAAATTGTC AATTGAGGATTAGCAGAAGCCAACTTGGGGTTGTTCAAAAGTGGATTAGC GGCCGATTAGCTTAATTTTTTATTAAATCTCGATTAGCGCAAAAAATTAA GCTTAAATCTGGATTAAATTTCGATTAAATAGGCCAAATTTTAATTCTGG ACCATTTTAACGTGTGTATGTGAAATAGAAAGCTCCAACACTTTAACCAT CTTCATCACCTTATAACTATAGCACTGAACCTACGACAATCGACTAACCA CCTTCGAAGAAACAGTAAGTGTCCTACTCCCACCCTTCTTCGTCACCTTC CCTCCTACCCTTCAACTCCTCTTACCTCATCATCAGCATGCTTCCACCCT CCATTATCATGCTACATACTAACCTGAACCCACTTCACATGCTGTACTTC CCTGTCTTAAACATCCAAACTCATTTCACGCAGCACATACACACTTTGCA TTCACACTACAATCTATGAACCAACCTTGACACTTTTATTTTCCATTTTC AGCACCCTTCAGAGCCAGTATGCCGCTATGGGTAAGTGTATTTTGCTCTC TCGTCCGGTTCTTTGAATTTCAAATATAAAGTCCAATAAATTTCGGGCTC CATCAAAATTCGGTAAAAAATAAAAATCTATAATATTTGGAAATCGTGAA AGATATTTTTTGGCCGATAATACCTTCTCCTAGTTAATAAACAACCGTTT TGGTAGGGCTGAATGAATATTTGTCATTTTTGTTTGAAAATTCTCATTTT TATCCAATGTTTCGCGAGAGTTATTCATAAAATATGTTTTCTTCGAATTT ACGAAAGTGATTTTTCGAATGTCTGCCCCAGAAAGTTTGCTAAAATCGAA CGTGCATCTTAATTTTTCATCAGGCACCGATGGCTTCAACAGACGAGCAA CGCCCAAAAACACAAGAAGGGCGTCCACTGCCGCCCGTTCCCTCGTCACC AACCGAAGTTGAACGCCCAACACAACCTGCGCCTCCGCTCAAAACGAAAA ACGATAACCCGCCACCACCAAAACCAGAACGATCTTTATCAAGCGAAGCG AAGGCCTCAAATTCCGACGACGAATATGCGCGCCCTCAAAAACATAAAAA CGACGACATGGACCCGGCTGCAATGAGACGCTCCAAAACGATAAGTGCTG TTGACCGGCCTAAATCACGAGACTCGCCCGGCATGCTGCGTAGAAATACG GAGACGGCACGTTCATCTCGAGCGAAAGAAGTCTTACCTGCAAATGATAT CGTTTATCAACACACGACGAGCGTTGTCAAATCCGTTATCGAGTTCAATA CGGGCGTCCAACATGCGCAACCTGAAGAATTTGTCGACCTCGTCAAGGTA TTTAGCTTCTTCATTCTCAGAGAATTTGCTTGTATAAAAACTTGGCGTAT GCTTTCAAGCTCATTATATGGAATTTTGATTAAGATAGTCTAGAGGGCCT CGTAAATTTTCAATGTTACGAGCAATGATTGAACAACTAATATAAACATG ACTTTTGANATAATACCTTCTCCTAGTTAATAAACAACCGTTTTGGTAGG GCTGAATGAATATTTGTCATTTTTGTTTGAAAATTCTCATTTTTATCCAA TGTTTCGCGAGAGTTATTCATAAAATATGTTTTCTTCGAATTTACGAAAG TGATTTTTCGACTGTCTGCCCCAGAAAGTTTGCTAAAATCGAACGTGCAT CTTAATTTTTCATCAGGCACCGATGGCTTCAACAGACGAGCAACGCCCAA AAACACAAGAAGGGCGTCCACTGCCGCCCGTTCCCTCGTCACCAACCGAA GTTGAACGCCCAACACAACCTGCGCCTCCGCTCAAAACGAAAAACGATAA CCCGCCACCACCAAAACCAGAACGATCTTTATCAAGCGAAGCGAAGGCCT CAAATTCCGACGACGAATATGCGCGCCCTCAAAAACATAAAAACGACGAC ATGGACCCGGCTGCAATGAGACGCTCCAAAACGATAAGTGCTGTTGACCG GCCTAAATCACGAGACTCGCCCGGCATGCTGCGTAGAAATACGGAGACGG CACGTTCATCTCGAGCGAAAGAAGTCTTACCTGCAAATGATATCGTTTAT CAACACACGACGAGCGTTGTCAAATCCGTTATCGAGTTCAATACGGGCGT CCAACATGCGCAACCTGAAGAATTTGTCGACCTCGTCAAGGTATTTAGCT TCTTCATTCTCAGGGAATTTGCTTGTATAAAAACTTGGCGTATGCTTTTC AAGCTCATTATATGGAATTTTGATTAAGATCTAGAGGGTCTAGAGGGCCT CGTAAATTTTCAATGTAACGAGCAATGATTGAACAACTAATATAAACATG ACTGTTGAATATTCAGGTTGTTGGATTAAATTTACGTGACCTTCTTGCTG AAGTCGATAATGGTGTCCAAAATATCCCTGAGTCAGCACAAAAAGAGGTA AGTAAACATTAGTTATAAGTAATTGCTGTAAAGAATTTATAATAAATTGA AACTATCTGATATTCTGTCGGGTTCAGCTGCTCCTACCCGTTTAGACAGC ATAGTTAGACGTAGACAATCCCCAAAACGTGGGTAAATCTACGGTCGGGT GAAATTCTGTAATACAATTCTTGTAGATTGAAAATTTTCCAGATTTTCAG AGCTTTAGCTCTACATCATATTATTATATTTTAAAACCTACCCTTTCAGA TCGAGATGGCACATAAAGTATTATCGAGTGATATGGCAGAACTCGTTGCA AAAATGAAATTGGCACAAAAATACGCAGAAACGACGTTGGGGCAAGAAAA TAAACGCCTTATGCTTGCTGCAGCGCATGCACTAGCTATTGATGCTAAAA ATCTGTATGACACTTATTCTAAAGTTAGAGAAAATAGTTTAAATAATGAG AATAATTTAAGTTAAGTTTTAAAAAGAATTATTTTTTATAATACGCGTGT AGTGATGATGTGACAAAGAAAATTGGAACTGTAAACGAGGAGAATGAAAC AAGATTTTCACCACTTCTTTGTTTAGCGGTGTACGCTGTCTAACCGTAAA TTTGAACCAATTTTCTTTCTCATTTCATCAGACCACAGTTCAAGCAACCA ATCCCTTCAATCCCACTGATAGCCTGCTTCACGTTTTCATCTTTGATAGA GATTTTTTCTTCACAATATTTTCAGAGTATCGTAGTCCTAGAAATTATTA CACAGATGTGGCCGAGATAATTTTTACCAACCTTTTTGGTTGGTCGGGAA AATGAAATTAACTATCAAAATCTTATCTTAAAATTTTGGGCAATTTCAAA CTCTCAGTGCTCTCTCAGCTAATTGCAAATCACAACATAGCACCGAGTAT GGTTGCTTGAACATTGTTTTTAGATATTTTGTGATTTTTGTCCTTTTTGT TTATTATCGAATTTTTTTATATCTCGTTTTTTTCGGGTTGCTTATTTTGT ACTTTTGATTTATGAAGCTCTTCTGAATTGAACTTTTAACTTTTAAGATA ATGAACTACTTTAAGGATTTGGTTATAGCAAAAAGCTTTTCATTAAAAAT ATTTTATTTCTGTTTGAATATGGACATAAACCATTCGAGAATGGCTTCAA AATCATCATTGTAAAATTTTTATAGATTTATCTCTCTTGCAATGGTAGAC ATCCATTTTCTGCTATCGCATGTGTAACTCTGTCCCTTTTTGGCAAACAT TATTGTAAATAAAACCTCTACTGAGAAAAGATAAGGAAATTATATTAAAG CCAAAAAAATCAAAATT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00057963TCONS_00057963Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00057962TCONS_00057962Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00057957TCONS_00057957Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00057955TCONS_00057955Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00057954TCONS_00057954Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00057953TCONS_00057953Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00057961-proteinTCONS_00057961-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_302supercontigscaffold_302:111082..135048 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
BRSK2PREDICTED: serine/threonine-protein kinase BRSK2 isoform X2 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
15.42 12.54 7.36 7.51 63.01 48.57 60.54 73.93 29.7 42 25.8 23.44 38.25 33.18 20.64 22.55 42.71 46.67 24.3 26.78 38.4 42.63 52.22 53.01 37.98 38.44 152.93 151.38 68.41 68.48