XLOC_041767 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_041767
Unique NameXLOC_041767
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_46:295644..301892-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_041767 ID=XLOC_041767|Name=XLOC_041767|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=6249bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_46:295644..301892- (Clytia hemisphaerica)
ATTTATTGTAGTAATGTGTACAGAGTCTTATGTCTTAGCTGCCCAGTCAC
CATCAAGAACGACTTCCAGCAAAAGTTTTGATTAACAAAGACCATGGAAA
TTATCGCCAACTGGTGCTTGTGCTGTGCTGGTGCGTTTGTTTTGATTCTA
GAGAAGAGGAGAAATCTCAAACTGTCCTGAACAGTCAAACAACTTCTGCA
TTTATACCATCTGACCAAAACAAACCAGCAAACAAGAAAACCAAACAGTA
GAATAACCAGTGTCTTATTGTATCGTGAGTATTCTTAAAAATTAGAGGTG
TATAATTTATAGTTGCCTGACCCTCCTGATATATCGCTATCGGTTCTGTT
CATGACTTTGTTTTGATTTGGGAACTTTTTTTCTATGTCCATCCAGCCAG
CACCAGCATGCATCAACTATGCGGACCGTAGCAAAAATAAAGATGGCTGA
TGTAACAACCATGGAATATTTACAGAAGTTTGATTGCCATGGCAGACGTT
ATTGGGCCATTCCAGTTTTTATTGGTTACCCCCATCCCCAATGGACGACA
TGGAATTTCCGTAGCAAATTGCTTTAAAGAAAGTCCGGAATTTCCGTAAC
AAATTTACAAATTACCTATCAAAACCCTGGAATTCAGTTACTGTAACTTA
AAAAAACCATGGAATTCCAATATACTTTAATACAAAATTAAATAAAATTC
ATGGAATTCCGGTACTTTCTCTTTAACACAGTCGGGTGTTTAAGATAAAA
ACTGCAATTATTGCTCTTTTCAAAAATTATTGCCGAAAACGGCAATTTTT
TTAACGATGAAATGCTGAATCAGCAGAAAAATAAAAAAGTAAATAAATGA
AAATTGCCGTTTTTGGCAATTATTGCCGTTTTTGCAAATAAATGTTGATT
TTATTATTGAACATGTGGTATTTGACACCCTCGCGATAAGTAGGCCCACT
GTGCCTCGTTTAGTTTTGTTTTCAATTGGTTTTTGTTGGAAATGCAGATA
GCAAAATTGAGTCATATGTAAACAAATTTACAACGGGGGTTTTGTCATAT
CTTTCTTATGGCGCGCGGAAGCGCCATTAAATACGATCTTTTTAAAACAA
CACCATCTCGTTTAAAACGATACTATCTTTAGTTTAAAACGATACTATCA
CATTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TTAAAAACATACTATCTCATTTAAAAAGAAACTATCATATTTGAACCGAA
AAGATAAATTGCCGTTTTCGGCAATAATTTCCGAAAAGAGCAATAATTGC
AGTTTTTATCTTAAACACCCGACTGTTTAAAGTTTGCCTGGAATTCCGTG
CCAAAATTTATTTCAAAAATTGATGTCATACATTAGGGGGTAATTTTTTT
TTCTGGAATGGCCCATTTGAAGGGTGTAGTATGGCAGTGGGTTCGAAATC
AAAACAACCATTTGACGTTTTCTGTGGTAAGTCTGAGTTTGGAAGGCTAC
CCTTAGACAATTTACCAGTGCACTAACAACCCCAATGCACGAACGAATGT
CTTTCAACGTGAAAAAAAAACAACCAAAAACAAACTTCTATAGAATTTCC
TTTGTGCAGCAGAATCCTCAAACTATCCCTTGCAATCTGTCCAAAAATTA
AATAAACAGAGTGGGCCTACTTATCGCGAGGGTGTCAAATACCACGTGTT
CAATAATAAAATCAACATTTATTTGATATAGTACTGCTCTCATGACTTTC
AAGGCTGTTCAAAAGATTTGTCCCTCTTATCTATCCAAACGTTTCGTTCT
CTGTGGAAATGGTGGTGAGCCCGATGCGCAAGGTGTAAATACTAGAGCTG
GATCAGAAAAGAAAATTCGGATACAGAGAACAAGAAATAAATTTGATTCT
AAAACCTTTTTATACAATGCTACAAACATTTGGAATAGTTTGCCTACCGA
CCTCCGCCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCTTCGTGGAAACAATTCTCCAGCTGC
CTAAAAGCTTTTGAATTTTTCGGAGCATGCCACTTAAAACATATGTTATT
ATTATTATTATTATTATTATCAAACAACACCAAACTAATTTTGAACGAGG
CTAAGTAAAAAAATCACGAAATTCAGGATTTTTGTCAACATGGCTGATCG
CAAGAGAAAATGTTTTTTATAAGAAGATTTGCTGCCTAAGAAGAGTTCTG
AAAATGACTTTTCTCTTTTAAAAACCTGTTATCTTCCATCACACAAAATT
TCATTGAAACATGTATATAAGTTTATTAATTCAAAATCAGTAGAAACATA
TCACCAGTACCTACCGTAACTTGGTCTAATGTCGACATCCCTCTTCCAAA
TTTGACATCCTTCTTTAGAGATAATCTGAGATAATAGGAATAGTAGGAAG
GTCGGAATTACTGATGGACAGCTTGGTAAAATACGTGTGTTTTCATCATG
AGAAATACCTCGCAAGTTATCAACGACGCAAACAATTAACAAAAGAAAAA
AACGAAAGATCAAAGAGATTTTCTTTAACCAAGATTTAAGATGCCTTCGC
CAATCTTGGGAATCTCCATTTTTTTATAAGTTATTTGCGCTTTTCGTGAC
GATTACTCTCATATAAATCTTATCACCACCAGGATTGGCGAAGTTTGTGA
AGTTGAAGCACCTGAAGAATTGACTTTTTCAATCATCTGCTGTGGAGCTC
AAGTTATCTGAAATTGGAATCGTCTAAAAGACACGATGTGCAATGAATTG
TAACAAACAGTGATTGTTGATTTGAAAGACGTTAAAGATGCGAAGTAATT
ATCTTGGGAGTAAATGAACTGAAAATCAATTAAAACAATGTAACAAAAAA
GTTACAGAATTATGTCCATTATGTAAAGAAATGTGAAATATTTAGCTTAA
AAAGTCACTCACACATTAAATGTGATGTGCCGTTTTTAGTTCTCCTCTGG
GAAAACAAAACCTGCTATGCCGGTTACGATTGATTCGTTTTTTATACTAC
GATGTTCTCTACCGTTTTGACTTTTTCAGCGCCACAACTATGTGTAAGT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00066799TCONS_00066799Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00066798TCONS_00066798Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_46supercontigscaffold_46:295644..301892 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.65	0.8	1.73	1.42	4.24	3.08	3.39	2.86	1.02	1.24	1.12	0.68	0.82	0.76	0.61	1.02	1.38	0.49	0.28	1.12	0.97	0.54	0.82	1.09	1.41	0.91	1.89	0.69	1.12	0.51