XLOC_033170 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_033170
Unique NameXLOC_033170
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_214:133251..161124+

Legend: gene
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>XLOC_033170 ID=XLOC_033170|Name=XLOC_033170|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=27874bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_214:133251..161124+ (Clytia hemisphaerica)
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AACGATTTGATTGACTTCGATTCGGAGCAAAGAAGTGCGACTTTCGACTA TCACAAATGCAAATCCATACCTACTCTTGCAGTGAATGGTGAACTCAAAC GTTCATTATCTGAAAGTAGTTTACATGATATCGTTATTGAAAGTAAGTAT ATAGTGTGTTTCAAAAAAAGGGAactttatataaagtaaaattctcATAA TTTATGCGAAATTGTAATCTCAAACACCTATTTTAATCATCNtggaacaa atttttatataaagtaaaattctcATAATTTATGCGAAATTGTAATCTCA AACACTTATTTTAATCATCTTGGGGATTGAGCAAAGAATTCTAATCTTAC TCCAATCATTCTAAGACCATATCAGAAGTTTATCGTGACTTAGATCACCA GATTTaagtttggctacgtttcgagagattcttctcccatcatcgggcaa tgtGGAGGATATTTATTCCACTATTTGTACTAATTTGAATCTCGTGATCC AGCCACgttaaacttccaatatgaaaaTATCACTGGATCGATAAACTCAA ACTTATTTAGATCATTCTAAGCCCAGTTAAGATAaagagttttgaggatt ttactttttataaaaattagtTCGCtcttttgggacacactgtattttTC TTTACACCTGCCGTCATTAAGATAAAACAACAGAGAAAAAGATGTGTACA TGTATGTATTACACATCTCCAGTACTCGTAAACATCCTAACCAGTTATCA AAAATCTAACGAAATATCTTATCAATAGAAACTTTGTCGGTGAGAAAAAT CGATGGCaaagaatatttaatttttactGACGAATATTTTCTGGCAATTC TTAAGTGCTAAAATAATcaactttaaacaaaaaaatgctcaAAGTAATCA CAaatcattttgtaaaaaatattcgTCGCAGAAAAGGTCGCCGGCCTTAA GTTTCGTCACCAAGTGATTTTTTCTAACAATAAGGCAACtattgttcgtt tttttttagaTGAGCGAACAAAAAGTTTATCAGGTAGTCCATCTTCAATG GGTAAGGAATTTGTTTGTGTGTGTTTTGGGATTTAAAATATGATTTATCA TTAAAGATGTCATATCGTCTGTTTTTCCTTACTTTTTTTGTCGATTGTTG GGACCGTTCATCAACTTGAGAAAGTTGGGTTTGGGGAATGAAGGGcttta aattttccttttcagaAGATGCATCTATTAACATTTTCATATTGATACTT AACACCTTTTAGAAGAGGCAGCAAGTTTACGTCAAGAAATGGTAGATATG AAATTGGATTACGAGGAGCAGATATCGGACCTAGAGAAGAGGCTGGGTGA AGAGAAACAAGTTCAAAAACTTCTCAAAATTCGATTGGTTGATGAACAAA AAGCAAGGTTAGATATTTTGAACTCATCCATCTTTTAGTAATTTCTTTAT GACCCCTGCGGTAGTACTTCTCCTAACACCATTGCGAAAAACGTGTTTTC CTCTTCACGAACACGAAATCCTTTATCCAAATCACGCATTTAAATatagg ctgcgcgcatccccaAGATTTATTTATAGGGGATGCgttttgtgtataaa attgtagTTCGAGAGTTACCTCCGTCTTTGTAATTTTGAAGGGTATATTT TACAGAACAAGCTGAGTGAACGTTACACTTTCTATGTATCGAAAAACGAA GGAAAGTCATGTAGataccaaattttaccaaatttgTACATAAACTACGT TGTATAAGAATAGCTTTTAGACTATTCTATGTCATGATATTCTACATTTC AATTACGTGTATGGAAATCTTTTTTCATCTTCCAGGCAAGCTTTAGAAGA ACGACTTGAATTATACAGGGCAGGTATAGAAGAATACTGCAGGAAGTTTG GGCACGTTGATATATCTATCCgataaatgaacaaaaaaaatcttgaagaa AAAGGAGTGTTGTTGGAACAACTCAACAGGCAGGATACTGGTTGAAGTTT CTTCAAGCGCCGGTTGCTTTTCCCCGTTGATGTTatcattttgaaagttt gagtaTATTTCTCgatattcaaaaaattgaacaggggaATAATTTTGTCA TTGCTCTTGTTTTTGCATctaaagggaactaattttaacGAAAACTAAGT CGTAGAAAAAATAAAGTCAGTGGAcagcatttttttttcttttgggcAAA AACTGAAATTGGTAAATGACAGGGAATTTTTTTGTAGACTTAtgtaaagt ttattttcttttttgtagaaaatttatagagtatttttttctaattgtaC ATATCTATGAAATACTGTTTAATAATCGATAATTTTTATAATATTGAAAA ATTCCTATATTTTTATGATATCAGCATTTAACAAACTTTACTCTCATATT TTTCTATTAAGccctaaaattttcaaagtcagAAGTCTTTTCGTTTTCAT CCATAGTGCGACTGTGTTAAAAACTCGAGTTCTTACCGAGTGACACTACC AAGCATGTCAAGAAATCTTTCTTAGACCAACGTAGCTTGATTCTGTTACT CCTCCCTGAAAATGTTAACTTCATCAGCAAAATATTGTGtactaagaaaa tattttaatgataGCATGAGGTAAATTAATAATACATAATAATCAATATA CATTTCTATTTGTACCAACCCAAATTTACCGTTTACGGCTCATGGCTGAA GTAGGGCTAAGGATTTTCAGGATTTGAACCAAAGATCTTTATTGGTTTTA AGCCAGAATTGCTATACTAAGCAACATCCAAAATTTGGCCTTCCAACTCA TTTATTGACTAAAATGCTTCAAATTAGGCCTCTGTTAAGCATTTAGAAGC CAGCTAAAACCAAAAATACCTGATTTTTAAGTGTTTATGATTGATTTCAT AGCTAGTTTCAACGCTATGGTTTCTAGTCAAGCTACTTATATAAGTTTTG GACATTTTCAGGGCTGGGTATTAGCAATTAGGGAGGGGTATGACAGGTGG TGTGAATTAGGGCATAATAGGTATAGTTATAGTTCTATAGGTATAGTTCT TTATGACCTTTCTAAGTATGTTGTTGAAAATGGGCCGAGGACCTCTCTTT TTCATCCTACCACTTCACACCATGGCAGTGCAAGGTCTCCTGGCGGGACT TAGAAAGAATTTTAATACTTTTCATTgtaattattttcttcttcaatttg gctttttagatgaaattattatttttgtatACAATAGATTTATAGCGGCA CAGTAGGATAACTTTTTAATAGAGAAAGATTATTAGTtcataaatgaaat aaaattgtaTGTGCTTTCTTCAAACCAAAGAGAGTGTTTAGACCAGTCAT GTTGTATTTAATTggcaaaaaattacaaagtaacTTTTTTTACCTTTCAG TGACAatctttttattgatttgaattgttttgttttttttatttctaaga GTATTGTAATTAAGAGTATTGGTTTTTGGTTTAAAATATCcttcattcgc caaattaaattccttcccgatcaaattaatagttaattgttaataaaatt taattcaAGAGTAGGAAAATTCGTTTTTCATTTGTTCTTTCTTGAGTATA ATTTATGCAACGGACGGcatacaaagaaaaaagaaaacttacaaaatata aatcaaaTCAATTGTCGTGAAGTttgaatatataaaattttaaaacttta ttattcTTTTAAGagaatataatataaaattcaaaatttcttttaaagcc tttaaagtttAGGTATGTTATTATTGTCGTTTCAGGAAACAATGACAGCA AAGAAGTTTCGGATTTTAATTGTACTCCCGCTTATTATTCAGAATGTTAT CCTTGAACAATGCAGTCAAATGTCATTTCAAAGATTGGAtggaattcatt ttgaaattcttgatAGATACACAAATCTTCCTATTGACCCTTTTGCTAAC TTCCACGAAAATAGCATCGAAAATTGTCTCACTAGATGTTACCATACAAA AAACTGTATGTCTTTTCAAGTCCAAAGATTCGATAGTTATCATTTCGGTT GTTCACTTTATTGGTTTGCTACTAAACGATCTGGTACAANGTAGTTATCA TTTCGATTGTTCACTTTATTGGTTTGCTACTAAACGATCTGGTACCATAT TTACTCGAAAGGAAAACAGTACAGCCTTCATATCAGCAATTAATTTAGAA AGGCTGATTGATTTTTCAATAGTATCATCAtgcaagaataaaaaaaatga tttttatcttATGTCGTTGAAAAGTCAAACAGAAGAAAAATATCGCTACG CTCGTTGCAATGGTTTTGGTCGAGAAATCATTGGCCAACTAAAATATCCA AAAAGAGTATTTTCTCTTTCTTCAGTGAATGGAATTTTTACATCAGATTA CTGGATCGGGTTAAATGAACTCTCAGATCGAGTCCAAAATACTGACTTGC TAATCAGCTTCACTGTACCATATCCATTTGTTGAGAGTGATCTAATAGCC ATTTACAAGGACGTCACAGTAGGAAAGGAATCAGATTCGTGGGTTTTCCG TGGGACATTTGCATCAGCCACATCAACTGTCGGAGACATGATAGATCAAG TTgcttttaacaaaaaacgtGGCTGGTGGATAAAAAATGACCAAGAAAAA CCTAATAAAGATCAATTCGTTACTCAAGATGGGTGCTCTTTTGATCACGA GGGAAATTTAGGTGAAACACAGCTACCATTTTATTGGAAACTTCAAAATG GCACATATTTTTGCGCAAAAACGGTCCAAATAAGAATCTAATATATcata aaatttaacttttatcaacaaattataaaaaatatgattGCTTGTCACAT AGAGAAAGTGTCTACTTCgcatcattttcaaaacaaagttaaaacgcatg cgtatTTATAAACTGTTAGTCGTTATTTTACGCAATATacgtacagtcac tttcggtcgttCTTTTTAATGTTGCGAAGTAGGCACCTTCTCCCCCACTT GTAGTCGATATTTGCACTTTACACTGCATCACAGTttgttgaagaaaaaa aacagtcCCGTTAATAACTAATTA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00052451TCONS_00052451Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00052452TCONS_00052452Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00052453TCONS_00052453Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00052454TCONS_00052454Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00052451-proteinTCONS_00052451-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_214supercontigscaffold_214:133251..161124 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.41 3.05 0.93 0.73 10.09 7.76 9.98 10.89 9.12 9.62 7.97 7.48 9 8.71 8.3 8.68 10.03 11.47 9.71 9.48 13.25 14.11 8.93 10.51 9.74 9.9 7.19 5.83 10.18 11.15