XLOC_029702 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_029702
Unique NameXLOC_029702
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_113:265734..273856-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_029702 ID=XLOC_029702|Name=XLOC_029702|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8123bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_113:265734..273856- (Clytia hemisphaerica)
TTTCTTTCAGATTTTTTTTTGAAATAATTATATTACAAAATCATAATGAG ATTGACAAATATCATAACAACAATTTGAAGATATGGGCAAGAGGGATACT AGAGTGGTAAGTCTTTTATTCACTTTCTAATCCCTTAAAAATAATAGTCC TCTAGAATAGACATAATGTCATTCGATCCCAATCAAAAATAGTGTGACAT TTTGAAAAATGCCCAAAAACAACTTTTTGTCATAGCTGATGAAGTCTTAA TCGATAAGCCTTGAAATTTTACAATGTTGTGGGAAATACTAAGATAATTA GATAAAAAATTTTTTTTTTCGTTAATTGGGCTAAAAATGTGGCTTCAACT CAAAATTTGTATCTTTTTTAGAAATGTAAGCCACACAAATTAGATAAGAG ATCTTAGAATGGGACTTTCTTAACTTGACAGAGGAAAGGTTAAATTAAAA AAAAAAAGTTAAATGCACATACCTTCTAGCTGTTAAATGTACTTGTTTGC GGCCTACTTTTCGATAATTTTTAATGTGACTTTGTAAGCCACAAAATTGT ACTTACAACAAAATTTTTGTAATTTCTTACACTTACTGGTGTTATACTTT GATGATTGAGTGCCAAAAACTTAAAAAATGTGAGACATAAAATTTCACCT ATATTTCACCTATTCACCTATATTCACCTATTCACCTATATTTCCCTTGT GTAAGCCACATTTTTGCCCACTTAACAAACTGTAAGCCACAAATCAGTGC AGCTAATGGAAAATTTAGCCCTTTGCTGGCATTGCTGAAAAAAAAGTATA TTTCTGACTGTTTCCATTATTGAGAACTCAGCCTTCAAAACTTCTTGGTA GGGTAAGCCAAATGACCAGTAAGCCACATTTTTTACCCACACTTCATTTG CTTGTAACTCCCCTTTCAGTAAGCTACAAAAATTCGCCCTTTATGCAATG GATAGCTAATTTCCTCAGCTTAACCATCAAAGCGATCCTAAGTGTAAGCC ACGTAATTTTCCCAAGTTATGGTCAATTTAGTGGCTGACAGTAAAAATGT CACAAAACAGGGGTTTATTTTTGATTGGGATCATTCCAAAGCGCATGTCA TGTATTAATTACTTTTTCTGAGTCTTTGAAAATGGAACAACTTTAGATTA GAATGAAAAACAGAATTAAAATCAGAATATTTGTATTTTTTACTTTAGGT GCAACAATTTAATTCTTAGTCTACGATTTTATTTGCTTGTTTTTTATACT GGGATACCCAGCTGGGATTTTCTTTTGACCTTTCAAAATGAACAAATTAT CTCATTTTTAGTTAATTTCGTCATTTATGCATTAATTCTCATGGTATTTA ATCAAAACATTTTTAGGCATTTGTTAACCCTGTTGCAGCTTCAAGGTCCT CAGGGCCAGCTCAGGGTGGTCCAAGTATCAAGGATTATCTCAGTCGTCCG AGACCTTCATGGTATGCAGCATAACTTTTTGATTTCTTTTATAATACTGG GATCTTTTATCTCTCTTTTTGTCTTTCTATTTTAAGAACAAGGTCCAAAA AGAAAAGTAGGGAGTGAAAACACCATCTCATGAAAAGTTTTTTCTTCTTA GAAATCTATAATGAGTTATTGTTATCTTAGGGATGAATTGAAAGAACAAA TCAAAGCAACAAGAAAAGGTTCAAGAACTCTTGAACAATTTGAAAAAGAA AGAAATATGGTATTAATGTTATCACAATTATTTATTATTTCTAAAAAAAT CATCCACTGAAAGGTAAAATTACACAACTTTCAAGATGTTGTTCCTGGAC AATTATAAGCCCCCTCTAGCGGACCCTCAATTCACGCAATTTTTTTCGAA ATTCACACATATTCATGAAGATTTTTCTCAAATTTCACTCAAATCCAATT TTCAGAAAATCAGGAAATTTTTTGGCAAATATCAGGGAAACATTTGAAAA TCTGGAAAATTGCACATAATTGGTAAACAAAGAGAAATTTATCCACACAC AAAATAGCCCAGATTCACACTTATTCATGCAATCTTGAAGTGGATTTTCA TGTCCAGGCTAATTTTTTCAATTCATGCATTCACATAACTTTTTTTTCAA TTTTCACGCATTCACGCTACTGAAAAAGTTCATTCACGCGTTCACGGAAA CCGCTGGGGGCCCCAATTATATATATCAAAACTTAGTGTATGGATATTTT AGTTGACTTGAATCGAAAATTCTGGTTCGATCTGGTTTATTATCCAAACA ATTTATCTAAAGTCACTGGCACCTTTTCCTTTAATGATCTTATTATGTTT TTTTTATGTTTTAAACTGTAGGATTACAGAGCTGAGCTTGACAGAGGCAG AGAAAAGTTTTTCAACTCTGAAAAGAAGGTATACGAGTAACTTTAATCCT AATGCTTACAGTATTTTATCAGATGATAATTAAGTCTATTGTGCAAAAGT TTAAATTTTAGCAATTATTTGAAGGTTTATCTTACTTTGTTTTTTTACAG AAAAAGAGAAAGAAAAAGCGCACCGTAAGCACATTTGATTATTTAACATG AAACTACAAGCATTTTAAAATAATTATTTTTCTTATTACAATATATTCTT TATCAATGTACAATGTTATTCTCTCTGAGAATAGATTTCCTCTCGATTAG TTATTGGACCTTGGAGGTAGCTCCAGTAATTCTGCAAACTCTGTGAGATT TGAAGAATCCCTTAGATAATTTTGTTAATTGAAGTCCATTTTCAGTAAGA GATAAATACAAAGTATTGTATTGCATTACAACATTGATAATTGTTATAAT ACCACCATTTTCATATTACACATTTAATTTGTTGTTTTTTTCTTGTTTTG CTTTTCCTTTAAGCGTTCTTCCTCTTCTTCCTCTTCTACACGTTCATCAT CAACTTCATCAACAAATTCCTCAATCAATAACAGAAGACACAAGGTAAAA GATTCCCTTTAAGATTCGAAAAATTACTAACTTTTGTGCCCCTATAGTGG ATTTTCAGTAGTGGATTTTCAAGATTTTATTAAATTGGTTGGTGCTCATT ATAATTGGCGCAAAATTTGCTTATATGTTTGGTAAGGGTTGTTTGCTTGG TAAAAAAAAACAAACATGAAAAGAGGAAATTTGGTAAAAGCTACCAAAAT ATAAAAGAATTGTCAGTGACCACCAATAAGAGTAAAGATAATGAACTCTT GAAATCAATTCTCGTTGTTGTATTTATAAAATATTGTATATAATATCAGT CTAACCTTAAGGCATAATTTAAAAGATTCTGTTAANCATGTTTGGTCAGG GTTGTTTGCTTGGTAAAAAAAAACAAACATGAAAAGAGGAAATTTGGTAA AAGCTACCAAAATATAAAAGAATTGTCAGTTACCACCAATAAGAGTAAAG ATAATTAACTCTTGAAATCAATTCTCGTTGTTGTATTTATAAAATATTGT ATATAATATCAGTCTAACCTTAAGGCATAATTTAAAAGATTCTGTTAACC ATCTTGTTTGTGACAATAAAAAATAATAAAATAAATTATTTTATTCCTTT CTTTAGAAATCCAAAAAGAAAAAGAAAAAGCATCACAATAAATCAAAGGT TTGAACTTTATTATAACTTTAGATATTTTAAATAATTATCTTGAGCTATG GATCACTTTTGGTTTCACAATTTACAAAACGAAAGTGCTTTGTATCTCAC ACGATAAAAAAACTTTCTCGGATATGCATCTTGGATGTAACTCAGCCCCT AAACTAACTTGTATATTTTCCTGCTTTCAAATTTTCAAATCATTCTACAT TTTAGAGGAAAGAGCAAAAATATGAGAAATCCGAGTCAGAATCAAGCAGT GGCGAAGACTGGGTGGAACAGGTATATCTAAATTGGTGGAAGTGAATCTA TGTATCCTTTTTTGAAAAGTTGCTATATATTGGAAAGTTTCAGTTTCTTA CTATATGCATTATTGAAAGATTGGTTCGTCTTTCAAAATGAATTTACTTT AACAAAATCACACTAAATTGTAACAAAACTTGGAGCAAAATTTAGTGGGT GTTTTCATCAAATATTGGTTTTTGAACGGTGAACCCCAGGCCTCATCTGT CTCATTAACTTAAACTTTGATTGTTTTATTAAGGAAAATCATGGACATTT GAACAGAGATGAAAGTAGAAGTAACTCAAACACAGAAAGGCATGATGAAA AGGTGTGTTGAATCTCCTTAGACTAAATTGATTTCTATTCAGGGTTCACA GTTCTACCTTCTTAGAGGGATTCCTTTCCTGCTGTAAAAAAGAGGTATTT CGGTGTCAATAAAACAGCAAGATTCTGGTCTCGAAGAATTCTGTTTTAGA AGTAAACTTGATTCAAGCACTGTACAACTTATAAATATGGTTATAAATTG ATGTAATATCCATATTTCTTTACAATTTTATAGAAAAGGAAAAAAAGGAA AAGGAAGAAACGAGAGCATTGAAAAATTGACAAATGAGACATAGTTCATG ATGCTAGTCGACTCAAACGCAATATATTACATCCAGAACCTGCCAGAACG TCTCTTGTACTGATTTTTTCATGGCTTTATTTTCTTGTCTACTTTGAAAT GGGAAGCCAATCCGAAGTGTATTGACCTTAACCATTTGTTGTCTCAATGG AAACAAGAAGATATTAATTTTCAATAACTAGAAAAATGACATAGAGCAAA GATAATCACCAAGAAGTTTGAACTTGGACAGTTTTTCATCATTTTATCTA TAATGCAAACTCCATCGTATTTTAAATAGAGATAGTTTATATATATTTTA GGATAATCTGATATAAATATTTGTGTACAAGAAAACTATATGAATTTGTT GATCAAATAAAAAAATGTATGAATTTGTATATCAAATCTGCTGAAGGTAC AACTTAAAAAAGATAAAGATAATATCAAAAATGTTTTTATGGTCATATCT TAGTATTCAAAGCTCTTCCGTCTCCAAATTTAAAAGAAATTCTGCATCGT TTGAAGAATCTTCGATAATTTGTTGTTCAAAGTCCACTGTTGTCTAAGAT AAATACTTTGCTTTGATAACTGCTGTCATCATTAGAGTGTGTAGTTTTGA CTGAATTAAAACACATGGCAGGTTCATAATGTCACAACCTGGTTCATTCG TTTATACTATCTAATCAAGTTGTCACAATTTACAATTTTTTTCGCTTCAG ATAAACAAAAACAAATGAATTATACTAAAAAGCAAAATGTTGAAATGGAT TATTAATGGAGTATGTCAATGGATCTAAGAAGTTGAACAGCTTTGTCTTA TTGTTGTCGTTATGGTAATTTCCTCTTTTGAAAGAAGTCATCAATGGAAC CTCTGGCAGATGTTTGTACAACCCCTTTTCACAAACCCACCCAAAATATC GTCCCAGTGGAAATTGTTATCTAATTTTTGTCCCCACTGAAAATAATCAA ANTAAAAAGAAAGTACTTTGTATCTCACACGATAAAAAAACTTTCTCGGA TATGCATCTTGGATGTAACTCAGCCCCTAGACTAACTTGTATATTTTCCT GCTTTCAAATTTTCAAATCATTCTACATTTTAGAGGAAAGAGCAAAAATA TGAGAAATCCGAGTCAGAATCAAGCAGTGGTGAAGACAGGGTGGAACAGG TATATCTAAATTGGTGGAAGTGAATCTATGTATCCTTTTTTGAAAAGTTG CTATATATTGGAAAGTTTCAATTTCTTACCATGCATTATTGAAAGATTGG TTCGTCTTTCAAAATGAATTTACTTTAACAAAATCACACTGAATTGTAAC AAAACTTGGAGCAAAATTTAGTGGGTGTTTTCGTCAAATATTGGTTTTTG AACGGTGAACCCAAGGCCTCGTCTATCTCATTAACTTAAACTTCGATTGT TTTATTAAGGAAAATCATGGACATTTGAACAGAGATGAGAGTAGAAATAA CTCAGACACAGAAAGGCATGGTGAAAAGGTGTGTTGAATCTCCTCAGACT AAATTGATTTCTATTCACAGTTCTACCTTCTTAGAGGGATTCCTTTCCTA CTGTAAAAAAGAGGTATTTTGGTGTCAATAAAGCAGCAAGATTCTGGTCT CGAAGAATTCTGTTTTATTAGAAGTGAACTTGATTCAAGCACTGTACAAC TCATAAATATGGTTATAAATTGATGTAATATTCACATTTCTTTACAATTT TATAGAAAAGGAAAAAAAGGAAAAGGAAGAAACTGAGCATTGAAAAATTG ACAAACGAGACATATAGTTTACAATGCTAGTCGACTCAAACGCAATATAC TACATCCAGAACGTCTCTTGTACTGATTTTTTCATGGCTTTATTTTCTTG TCTACTTTGAAATGAGAAGCCAATCTGAAGTGTATTGACCTTATCCATTT GTTGTCTCAATGGAAACAAGAAGATATTAATTTTCAATAACTAAAATCAG CGCCGAAATATTTGGCACAAAAGGGGAATTCTCTCAAAGCTTTGAAACCG CAAGTGATTTTTAAGTGCCTTGAAGTTCAGTTTGGAAGTAGAGTTTCTAA CTCCGAGTTTTAACATTAGACTTAAGACTTAAAACCTGAGAATATACCCT TGAAGCCACTTAACCCCTCCCAAATCGAAAAATCCAATGAAGCAAAGTGG AAGTACTGAAACTACAATTCTCGTCCGACCTTTAAATTCTGAAAAACGTT AAAATACCTAAAAATTGCCAATTTATTTCGACGCCGATTGTAGAAAAATG ACATAGAACAAAGATAATCACCAAGAAGTTTGAACTTTGACAGTTTTTCA TCATTTGGTCATCTATTATGGATTTAATGCAAACTCAATTGTATTTTAAA TAGAGATATATTTTAGGATAATCTAATATAAATATTTGTGTACAAGAAAA CAAATAACATAAATATGAATTTGTATATCAAATCTACTGAAGGTGCGACT TAAAAAAAGATAAAGATAATATCAAAAATGTTTTTATGGTCATATCTTAG TATTCAAAGCTCTTCCATCTCCAAATTTAAAAGAAATTCTGCATCATTTG AAGAATCTTCGATAATTTGTTGTTCAAAGTCCACTGTTGTTTAAGATAAA TACTTTGCTTTGATAACTGCTACCATCATTGACTGAATTAAAACACATGG CACATATTCATAATGTCACAACCTGGTTAATTTTTTTATACTATCTAATC AAGCTGTCACAATTTACAATTTTTTTCGCTTCAGATAAACAAAAACAAAT GAATTATACTAAAAAATAAAATGTTGAAATGGATTACTAATGGAGTTTAT GTCAATGGATCTAAGAAGTTGAACAGCTTTGTCTTATTGTTGTCGTTATG GTAGGTTCCTCTTTTGAAAGAAGTCATCAATGGAACCTCTGGCACATGTT TGTACAACCCCTTTTCACAAACCCACCCAAAATATCGTCCCAGTGGAAAT TGTTATCTAATTTTTGTCCCCACTGAAAATAATCAAATAAGCCAATCCTC GCTGCAAAATATTGTGCTAATTTTTCCTATCCTCACTGAATTTTCTGGCT CGAAAACAATGGAATTCAACCCCCAGCCATGAAAAACATCGGGTTTTGGT CCATTATTTTTCCCCTCAATGGCTCAAAAAACCCCACCGGGTCTGTAAGA AGGGGGTGTGTTTGTGATTATCCTAAAACTTTCAGCTCTCTTATATTTTT ATTCCCTGGTTAAATTTTCAAACGTAGAACTTGCTATCTGGACTTAAAAA AACTTTTAGTGNAATATTTTTATTCCCTGGTTAAATTTTCAAACGTAGAA CTTGCTATCTGATGGACTTAAAAAAACTTTTAGTGATCCTCTAAATGTAT CAAAGGTACTTTTATATTTGTTAAAAGAATAGTTAAACTTTTGTAGTTTA AATCGAAGGTTATATTTTAGATGATCAAATTTTAAGGTATAACTTTTCAA ATTTTAGTGGCCAATCTATGAGATTTGGAATTTAAAATAATTTTTTCAAA ATTTGTTAAAAAAATGAAAAGGGGAATTAATTCTCTATAATTTATCAATA AAAGAAAGGCTCATAAATTGACCGTATACGACAAGGCCATCTTAATCTTG ACAATTCTTCAGGAAAAAGTGGG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00046542TCONS_00046542Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00046541TCONS_00046541Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00046540TCONS_00046540Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00046539TCONS_00046539Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00046538TCONS_00046538Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00046538-proteinTCONS_00046538-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_113supercontigscaffold_113:265734..273856 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
25.3 25.28 9.09 4.76 38.51 28.09 29.56 28.68 27.18 19.94 19.01 21.28 13.98 15.97 17.28 15.46 29.58 28.28 13.98 12.09 22.06 18.32 38.62 37.9 15.53 17.92 24.98 17.96 25.51 27.92