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Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at scaffold_118:130012..144113+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_029918 ID=XLOC_029918|Name=XLOC_029918|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=14102bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_118:130012..144113+ (Clytia hemisphaerica)
TTATTCATCGATCACGGTCaaaagcatagatcaatgttttgataaGCGAG
AAGCAATAATGGCTGGTGGTAGCTGCAAGAAGAGAATTTTCCTGTTCAGA
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ggcggtgtcaatcgaactgttcgattatcgaactaatcgaacttcatcca
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ACAATGTACATTTTCCACTCTCGANTCTGCGTCAGCGTTGTCAATTTTCA
ATTGACTCAATTTTTCCCAATAATTTAATTAAGTGGTTCAACAAGGAAAT
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TTTGGGGTTGGGTTTGAAAACAATGTACATTTTCCACTCTCGATAAAACT
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TTTGGTTTACTTGGTGTGCCAGAAATAAGTTACATAGTCACTTTGTCCTG
CTGGGTATcctgtattttcaaaaattcattagAATTATGCTCAAAAGTTG
cgcaaaaatgcaaaaatacaaCCAATGACATGAGGAAAATGATTGATTAA
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TTTATTAATAGGGGGTTCTGTAAGCTGGGTTTTACAGTAACCAACTATAC
TACTTTCTTACGCAGACAATGTATGTACTCCAAATACTGATTGCGGCAGT
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TTAATTCATTCggtttttctgtaaaaaaaattactacagtctatttcaaa
ttagctggtacatgttttttttttaagaaacacacttttaagaaacatga
ggctcagaatgcctaaaatctaagaaacatctaagaaacatgctgaggct
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cttgatAAAAccagtttcttaaaaaaaaacatgtagtgtttttcaaactt
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tttgttgctttttggaCTAAATCTTTgatggaataaatttttttgaaaat
ttttttaacattaatgatgttctaagatcaaagaatcactcgtgtgaaaa
ggataattatagcacaatcattgaagaagttgatttcttcctcttcattt
tctatcttcattttctgatcttttttgagttttttctttatgacaATAAT
CCACTcttgtttgtcttttcaacaaacacaatcgctacttaattcaaatt
ctatcaaaaagttattgaggtttgaaaaaacactgccagctaatttgaaa
tagactttacaTTACTGGTATTATTTCACAAAATGTACTTGAGNCGTCTT
TTCAACAAACACAAAATcgctacttaattcaaattctatcaaaaagttat
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TGGTATTATTTCACAAAATGTACTTGAGAAACTATGAGAAAAGAACAAAT
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ATTCTTTCTTGCCTCCAGCAAGATCCATTGCATCTTTCCCAGCTTAAGTT
CAGATTCTTAAAGTCGTTTTCAATTAGTAACTTATCCATGTTTTTTTTGG
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ATTTTGCTATTTTATTAGAAATATGGGTTCGATGTAGGCTTAGGTAGGCA
ATGTCAGCTTTTTGTTGAAGAATGATGTTTGTAGCTTGTTTTTAGTGATA
ATAGTAAGGGTTCTGCGATGGTTGTTGTCCTCACTCGTATCAAGGAGGCT
GCATaggtatttgtattttttttcagagaTTGTGGTTTCTGTTTATTATA
AATTTGTCTCTATTCTTGACTGTTATGTTCTGATAGATGATCATTGACGG
TCGTTGTGATTTAGTGGTCTGGTAACTGACTTTTATTATTAAGTGGTTCA
AGAGCCTTTCCTTTGTAGTATATGTATGAATTGGGTAAGCTATAATACTT
TTTGCTGAGTATTTATCCAAAAAAATCGTTTATGTTTGAACAGcagcaaa
ataaattttaacgatgttgttgttttttttctcttactAGAACTTTACAT
CAACAGTGCAACAACCAAGATGTGATCTTCCCTCTAACTTGAAAGATTGT
AAAGATATAATGAATGTACAAGGTGAAGTGAAGGTTGGTAGTCCTCCTtg
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TTAtggtgttttattttatttcttctgTCACATTCACAGGTAGTTACGAA
TGATGCAACACTTCAAGTTCGTCCAAAAGAAGTCAAATTAAAGCTTCGAC
CAGGTAATGCATTTTGAGCACTGATTTTATGCAACTCCCATATCATCTCG
ATCATCTTTGTATCACTGTTTTCTAGCTTGGACATCAAATCAGAAACGTT
GTTCTCCTTTGGTGGNGAAAAACTTCAATAAATTTGAGTGTAAATTTatg
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CTTTTTAGAAAAGAATCAATTACTATTTGAACTAATATGCATTCGAAGAA
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GCTGCTGAAATTGGAACAATCACGACAAAATACAAGCTTGGTTTTGGCTC
TTTCGTAGACAAGACGGTTGCACCTTTTATACAAGTTAATAAAAAGTAAG
CATGGTCGTTTGTACAACCTTTTTGAACCTACCCcgatggaggtcctata
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GATATAAAAATAGTCTAAAGCATCAATGCCCAAAAATAAGGGTTCCAAAT
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atgTAATCTTTTTTCTTAGAGATCGTCCTTGTACCCGTGCAAATGACAAG
AACGGGAATTTCCAAGGGTTTTGTGTACCTACTTTTGGTTATCGACATGT
CTTCAATTTTAGTAAAGATGCTCAAGCTTTTGAGGTTAGTGATGtttgat
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AGCTAGGACAACATCAGATTATCAAACAAACTTTATAGCTTTCTTTTGCT
CTTTCAGGCTGCTGTGAAAAAGCAAATTATTTCAGGAAATTTGGACACCC
CAGAAGGAGGAATGGACGGTTTGATGCAAGTTGCTACTTGCGAAAAGGTA
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TCATCTAGATGCTCAAGGGCGCTACACTGAATCCAACACAATGGTAAGAT
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GTATTGTGAAGACTTTGGTGTATCTATCTTTCTCGTATATTTAAACATTT
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GCCAAACTGAAGGAGAACAAAATTATTCCAATCTTCGCAGTGACAGGAGA
TGTTGTTGATACGTACAACGTAAGTTTTTACTCATTGTTGTAGAATCTAT
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AGTGCACCCTCGATTCCATAATACAAAACTTGATACTCTAATTTTATGTA
ATTTATAAAGCTGTTTACATTCCCTTACTAGCAGAGCTCTCGCTATATTT
CAAGATTGAAACTCAAAACAGATGTCGTTCTCGCTTTCCTTAGAAAATCA
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TCTGACAACATCGTCAATTTGATCAGAGACAGTTATAAGGTAAAGAAGAG
AGGGAACCTTAACATTCCAGAAATTTGGATGCTTCTTAAATGAGGAATAT
CACTAGCTACTCTCGGTGTATAATATAAGTAATAAGTTGGCtatttttga
ttgaattataaCTGAACATTTGTCAAGACTGACCAAGGTGGTGCTTAACT
TACTCTTCCATATAGCCTAGCTGCTTTTAAATGAAGGTACTTTATCCTAG
TTTTCATCTCCCGTTCTCTGTCAGGCTATTCTCCAAACAGTTCGTCTATC
TAATGATCCAGTTGACAACATTCGAGTGGAGTACAAACCGAAAGTGTGCG
ACTCACCAGACGGTGATGATACATGTACAGATGTGAAGATCGAGCAAGAA
GTCGAGTTCTCCGTCACTCTCACTGCCACCCAATGTCCCATCGACCTGTC
CAAGAAAGGTGACCGAACGTAAGTTCCCTTTAACCAaagtcttttttcat
tttacaatttgtttttacttttaatttgaattttcaacGGTGGTAAAATG
ACGCATCCTCAGCCTCAAATAGCAACCGTTTGTACCAACCATTTTTAGCA
ACGTTACTTGTCCGTAATTAAGATAgtccaaattttgtttttaacttttc
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AAGTTTTCTCACACCAGAAGGATGATCTCAGAAGAGCATTTTATTTACTC
TTCTTCTTTTTAGCTTCAACATCAACATTCCTGGATTCGGCGAGGTCAAG
GTTGATGTAGAGCTCATCTGTCAATGCCCGTGTGAAACGCTACCTAACAT
GCGCGAGGAAGATTCTGTCAAATGTAACGGTACTGGCACATTCCAATGTG
GAATTTGTTATTGCCCTGAAGGACGGTATGGTGAACAATGTCAGTGTGAT
GGCTTCACAAAACTCAGCGATAAAGAGTGTAAACCAAACAACACCACAGA
GACGGTGTGTAGTGGTATGGGCAATTGCGTCTGTGGAAAATGTGTCTGTC
ATAGACAGGTAAGCTGGTGTGCTCTTCTCTCTGGctacttttcttcttct
ttttcaatttttaactcAACGTGAACCAAAAATTTATACATTCAGCAGCA
TTACAGAATCCcaagttcttgagttatgaaCGAGACAACGTATTTGTTTC
TGACTACGTACGTTGACACATTATTTGCATCTTTGTGAAAATTCTCATTC
ACTATCATGCTCACCATCCAGCTTTTCGCCTCATTTTTTTCACAGGACTT
ACCGACAAATATTGTGAGTGGTAAATATTGTCAATGTACAAACTTTGGTT
GTGATTATCATAAGGGAGAAGTTTGCGGTGGTGGTATGTGTTCAATCTTC
CtctcttcaaatatttttttcttcttattctTAATCAGGAGCACTTCCAA
ATGCGATTTAGTtgttttttgagcaaaatacGCTCAATCAAAGATTATTT
TGAATTCATCCTTTTTATTATAGCTGATCGTGGTATCTGTGTTTGTAACA
AATGTGTTTGCAACGAGCCTTTCATTGGTCAAAACTGTGGAGAAGTCAAC
TGTACAATCGCTGACAAACAATGTAGCGATAAAAATGGCGTAAGTTAGAC
TCACGCCTTGTTATCTATTCAGTCTCAGAATGACATAATTTCCTCTATCG
TATAGTGTGAATTTAAAAAGGGAGTGGTTGTTGCCCGGTTTTATAGAATT
CCGGTCTTACTAACATCGACTGTCATACCAAAATCGCCTCTAGTATCGct
ttttttccaaataagaGCGTGAATTATGTTGAAAAATATCGCATCCTACT
TTATAAAAAATAGTTATCATACTCTACCTCTTTGTATCAAAAATTGTATA
TGATTTATTTACCTTCATAGGTCGAGTGTAGTGGCAAAGGAGAATGTAAT
TGTGGTATTTGCAATTGCAACGGAGGCTATGAAGGAAAACATTGCGAAAA
ATGNTTATCtgacccgatgtagaaattttcttccgacacgctaaagctct
gaaggtcgggaaaattttcaacatctggaagaaatacattacgAAATTTC
GCCTGACCgtgtaattttttagaaaaatgggcccgagtgcaatttggaca
gggaaggtgtcatggccgacaaaatttgggtcagaaaaaacttcaaaagg
tt
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_118 | supercontig | scaffold_118:130012..144113 + |
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
| Ortholog Name | Description | Organism |
|---|
| ITGB2 | integrin beta-2 isoform 1 precursor | Homo Sapiens |
| ITGB6 | integrin beta-6 isoform a precursor | Homo Sapiens |
| ITGB7 | PREDICTED: integrin beta-7 isoform X1 | Homo Sapiens |
| ITGB5 | integrin beta-5 precursor | Homo Sapiens |
| ITGB1 | PREDICTED: integrin beta-1 isoform X1 | Homo Sapiens |
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